MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. 41578

Total Repeats: 88435

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_021810	TGC	2	6	143771	143776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814319
2502	NC_021810	T	6	6	143789	143794	0 %	100 %	0 %	0 %	525814319
2503	NC_021810	ATT	2	6	143817	143822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525814319
2504	NC_021810	GTAAT	2	10	143854	143863	40 %	40 %	20 %	0 %	525814319
2505	NC_021810	ATG	2	6	143881	143886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814319
2506	NC_021810	CGC	2	6	143940	143945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814319
2507	NC_021810	CG	4	8	143960	143967	0 %	0 %	50 %	50 %	525814319
2508	NC_021810	CAA	2	6	144046	144051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525814319
2509	NC_021810	CGG	2	6	144063	144068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814319
2510	NC_021810	AGG	2	6	144071	144076	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525814319
2511	NC_021810	GCA	2	6	144106	144111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814319
2512	NC_021810	TTG	2	6	144116	144121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525814319
2513	NC_021810	GC	3	6	144259	144264	0 %	0 %	50 %	50 %	525814319
2514	NC_021810	CGC	2	6	144284	144289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814319
2515	NC_021810	CAG	2	6	144354	144359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814319
2516	NC_021810	CTG	2	6	144797	144802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814320
2517	NC_021810	ACG	2	6	144836	144841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814320
2518	NC_021810	CAA	2	6	144900	144905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525814320
2519	NC_021810	ACC	2	6	144912	144917	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814320
2520	NC_021810	ATC	2	6	144927	144932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814320
2521	NC_021810	CG	3	6	145055	145060	0 %	0 %	50 %	50 %	525814320
2522	NC_021810	GT	3	6	145069	145074	0 %	50 %	50 %	0 %	525814320
2523	NC_021810	CGG	2	6	145416	145421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814321
2524	NC_021810	TCG	2	6	145453	145458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814321
2525	NC_021810	TCG	3	9	145471	145479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814321
2526	NC_021810	CGC	2	6	145482	145487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814321
2527	NC_021810	GCC	2	6	145569	145574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814321
2528	NC_021810	CAT	2	6	145613	145618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814321
2529	NC_021810	ACG	2	6	145620	145625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814321
2530	NC_021810	TGA	2	6	145658	145663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814321
2531	NC_021810	TCA	2	6	145882	145887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814321
2532	NC_021810	GTG	2	6	145903	145908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525814321
2533	NC_021810	CAT	2	6	145995	146000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814321
2534	NC_021810	GCC	2	6	146076	146081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814321
2535	NC_021810	ACC	2	6	146083	146088	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814321
2536	NC_021810	ACGG	2	8	146162	146169	25 %	0 %	50 %	25 %	525814321
2537	NC_021810	CGC	2	6	146177	146182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814321
2538	NC_021810	CAT	2	6	146196	146201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814321
2539	NC_021810	GC	3	6	146331	146336	0 %	0 %	50 %	50 %	525814321
2540	NC_021810	CAG	2	6	146391	146396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814321
2541	NC_021810	GGTTTT	2	12	146430	146441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525814321
2542	NC_021810	CTT	2	6	146484	146489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814321
2543	NC_021810	ATC	2	6	146520	146525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814321
2544	NC_021810	GC	3	6	146526	146531	0 %	0 %	50 %	50 %	525814321
2545	NC_021810	GCC	2	6	146550	146555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814321
2546	NC_021810	ATA	2	6	146590	146595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525814321
2547	NC_021810	TCA	2	6	146603	146608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814321
2548	NC_021810	TTC	2	6	146649	146654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814321
2549	NC_021810	CTT	2	6	146657	146662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814321
2550	NC_021810	ACG	2	6	146703	146708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814321
2551	NC_021810	CAGC	2	8	146747	146754	25 %	0 %	25 %	50 %	525814321
2552	NC_021810	TTCAT	2	10	146770	146779	20 %	60 %	0 %	20 %	525814321
2553	NC_021810	ATC	2	6	148056	148061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814322
2554	NC_021810	ATA	2	6	148063	148068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525814322
2555	NC_021810	GCC	3	9	148194	148202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814322
2556	NC_021810	CCA	2	6	148211	148216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814322
2557	NC_021810	CCA	2	6	148238	148243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814322
2558	NC_021810	GCT	2	6	148247	148252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814322
2559	NC_021810	CCG	2	6	148349	148354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814322
2560	NC_021810	CGC	2	6	148476	148481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814322
2561	NC_021810	GCC	2	6	148491	148496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814322
2562	NC_021810	ATC	2	6	148504	148509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814322
2563	NC_021810	ATCG	2	8	148567	148574	25 %	25 %	25 %	25 %	525814322
2564	NC_021810	GAT	2	6	148688	148693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814322
2565	NC_021810	ACT	2	6	148722	148727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814322
2566	NC_021810	ACGCC	2	10	148859	148868	20 %	0 %	20 %	60 %	525814322
2567	NC_021810	ATC	2	6	148878	148883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814322
2568	NC_021810	CGG	2	6	148892	148897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814322
2569	NC_021810	GGC	2	6	148935	148940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814322
2570	NC_021810	GCT	2	6	148943	148948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814322
2571	NC_021810	GTT	2	6	149043	149048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525814322
2572	NC_021810	CAG	2	6	149097	149102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814322
2573	NC_021810	CGG	2	6	149115	149120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814322
2574	NC_021810	TCG	2	6	149134	149139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814322
2575	NC_021810	ACGCC	2	10	149189	149198	20 %	0 %	20 %	60 %	525814322
2576	NC_021810	CGCC	2	8	149201	149208	0 %	0 %	25 %	75 %	525814322
2577	NC_021810	TAA	2	6	149249	149254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525814322
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2579	NC_021810	GC	3	6	149384	149389	0 %	0 %	50 %	50 %	525814322
2580	NC_021810	CG	3	6	149390	149395	0 %	0 %	50 %	50 %	525814322
2581	NC_021810	TGT	2	6	149468	149473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525814322
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2583	NC_021810	CAA	3	9	149543	149551	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525814322
2584	NC_021810	GCA	2	6	149627	149632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814322
2585	NC_021810	CGT	2	6	149692	149697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814322
2586	NC_021810	GGA	2	6	149704	149709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525814322
2587	NC_021810	CGG	2	6	149714	149719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814322
2588	NC_021810	CCG	2	6	149726	149731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814322
2589	NC_021810	TCA	2	6	149734	149739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814322
2590	NC_021810	CGA	2	6	149749	149754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814322
2591	NC_021810	TGT	2	6	149764	149769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525814322
2592	NC_021810	TAT	2	6	149778	149783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525814323
2593	NC_021810	TCA	2	6	149808	149813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814323
2594	NC_021810	CAC	2	6	149852	149857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814323
2595	NC_021810	TGGC	2	8	149878	149885	0 %	25 %	50 %	25 %	525814323
2596	NC_021810	TCA	2	6	149979	149984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814323
2597	NC_021810	AGAT	2	8	150013	150020	50 %	25 %	25 %	0 %	525814323
2598	NC_021810	ATC	2	6	150195	150200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814323
2599	NC_021810	TCA	2	6	150226	150231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814323
2600	NC_021810	GC	3	6	150259	150264	0 %	0 %	50 %	50 %	525814323
2601	NC_021810	AAT	2	6	150290	150295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525814323
2602	NC_021810	TCA	2	6	150306	150311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814323
2603	NC_021810	CGC	2	6	150325	150330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814323
2604	NC_021810	TGAG	2	8	150333	150340	25 %	25 %	50 %	0 %	525814323
2605	NC_021810	CAT	2	6	150424	150429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814323
2606	NC_021810	CGC	3	9	150452	150460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814323
2607	NC_021810	CAT	2	6	150473	150478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814323
2608	NC_021810	TGA	2	6	150539	150544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814324
2609	NC_021810	GTC	2	6	150587	150592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814324
2610	NC_021810	GCG	2	6	150684	150689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814324
2611	NC_021810	CCAG	2	8	150710	150717	25 %	0 %	25 %	50 %	525814324
2612	NC_021810	CTG	2	6	150763	150768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814324
2613	NC_021810	GCTG	2	8	150774	150781	0 %	25 %	50 %	25 %	525814324
2614	NC_021810	AAT	2	6	150785	150790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525814324
2615	NC_021810	CCA	2	6	150954	150959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814324
2616	NC_021810	GCG	2	6	151038	151043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814324
2617	NC_021810	GC	3	6	151119	151124	0 %	0 %	50 %	50 %	525814324
2618	NC_021810	ATC	2	6	151129	151134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814324
2619	NC_021810	GAA	2	6	151165	151170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525814324
2620	NC_021810	CAGC	2	8	151233	151240	25 %	0 %	25 %	50 %	525814324
2621	NC_021810	ATC	2	6	151252	151257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814324
2622	NC_021810	GAT	2	6	151287	151292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814324
2623	NC_021810	CGA	2	6	151322	151327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814324
2624	NC_021810	T	6	6	151539	151544	0 %	100 %	0 %	0 %	525814325
2625	NC_021810	ACG	2	6	151662	151667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814325
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2627	NC_021810	GCT	2	6	152120	152125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814326
2628	NC_021810	CTT	2	6	152159	152164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814326
2629	NC_021810	CCG	2	6	152174	152179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814326
2630	NC_021810	TGA	2	6	152194	152199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814326
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2632	NC_021810	TC	3	6	152315	152320	0 %	50 %	0 %	50 %	525814326
2633	NC_021810	AGT	2	6	152377	152382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814326
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2637	NC_021810	TAAA	2	8	152595	152602	75 %	25 %	0 %	0 %	525814327
2638	NC_021810	TCA	2	6	152609	152614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814327
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2640	NC_021810	TCA	2	6	152648	152653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814327
2641	NC_021810	A	6	6	152677	152682	100 %	0 %	0 %	0 %	525814327
2642	NC_021810	ATG	2	6	152687	152692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814327
2643	NC_021810	CGA	2	6	152717	152722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814327
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2645	NC_021810	GTT	2	6	152815	152820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525814328
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2649	NC_021810	GAC	2	6	153082	153087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814329
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2652	NC_021810	CG	3	6	153385	153390	0 %	0 %	50 %	50 %	525814329
2653	NC_021810	GGT	2	6	153435	153440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525814329
2654	NC_021810	GCT	2	6	153459	153464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814329
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2657	NC_021810	GCT	2	6	153689	153694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814329
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2685	NC_021810	TGC	2	6	155446	155451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814332
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2730	NC_021810	CATT	2	8	157722	157729	25 %	50 %	0 %	25 %	525814333
2731	NC_021810	ATT	2	6	157772	157777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525814333
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2734	NC_021810	GCATC	2	10	158477	158486	20 %	20 %	20 %	40 %	525814334
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2740	NC_021810	CA	3	6	159098	159103	50 %	0 %	0 %	50 %	525814334
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2742	NC_021810	GTGG	2	8	159132	159139	0 %	25 %	75 %	0 %	525814334
2743	NC_021810	ATG	2	6	159154	159159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814334
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2745	NC_021810	GCA	2	6	159172	159177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814334
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2862	NC_021810	GAT	2	6	165609	165614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814338
2863	NC_021810	ACTGA	2	10	165667	165676	40 %	20 %	20 %	20 %	525814338
2864	NC_021810	GA	3	6	165675	165680	50 %	0 %	50 %	0 %	525814338
2865	NC_021810	GCCAGC	2	12	165683	165694	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	525814338
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2867	NC_021810	TGC	2	6	165736	165741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814339
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2870	NC_021810	CAT	2	6	165968	165973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814339
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2873	NC_021810	ATG	2	6	166093	166098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814339
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2880	NC_021810	GC	3	6	166478	166483	0 %	0 %	50 %	50 %	525814339
2881	NC_021810	CGGCG	2	10	166493	166502	0 %	0 %	60 %	40 %	525814339
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2883	NC_021810	TGG	2	6	166571	166576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525814339
2884	NC_021810	TCG	2	6	166639	166644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814339
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2894	NC_021810	TCG	2	6	167369	167374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814340
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2971	NC_021810	GCG	2	6	172087	172092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814345
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2975	NC_021810	GCT	2	6	172237	172242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814345
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2982	NC_021810	GAT	2	6	172513	172518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814345
2983	NC_021810	GCT	2	6	172537	172542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814345
2984	NC_021810	TGC	2	6	172560	172565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814345
2985	NC_021810	GGC	2	6	172854	172859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814346
2986	NC_021810	TCG	2	6	172915	172920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814346
2987	NC_021810	GCT	2	6	172934	172939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814346
2988	NC_021810	GCA	2	6	172966	172971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814346
2989	NC_021810	TCA	2	6	172982	172987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814346
2990	NC_021810	CAC	2	6	172992	172997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814346
2991	NC_021810	AACG	2	8	173027	173034	50 %	0 %	25 %	25 %	525814346
2992	NC_021810	TGA	2	6	173086	173091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814346
2993	NC_021810	TCA	2	6	173098	173103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814346
2994	NC_021810	GGC	2	6	173106	173111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814346
2995	NC_021810	CGAA	2	8	173163	173170	50 %	0 %	25 %	25 %	525814346
2996	NC_021810	GC	3	6	173192	173197	0 %	0 %	50 %	50 %	525814346
2997	NC_021810	CAG	2	6	173202	173207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814346
2998	NC_021810	CG	3	6	173256	173261	0 %	0 %	50 %	50 %	525814346
2999	NC_021810	TGCG	2	8	173308	173315	0 %	25 %	50 %	25 %	525814346
3000	NC_021810	T	6	6	173337	173342	0 %	100 %	0 %	0 %	525814346

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