MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. 41578

Total Repeats: 88435

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_021810	CCG	2	6	84420	84425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814265
1502	NC_021810	GCG	2	6	84440	84445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814265
1503	NC_021810	GCT	2	6	84492	84497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814265
1504	NC_021810	AC	3	6	84625	84630	50 %	0 %	0 %	50 %	525814265
1505	NC_021810	TCG	2	6	84638	84643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814265
1506	NC_021810	CATC	2	8	84678	84685	25 %	25 %	0 %	50 %	525814265
1507	NC_021810	GC	3	6	84714	84719	0 %	0 %	50 %	50 %	525814265
1508	NC_021810	ACG	2	6	84754	84759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814265
1509	NC_021810	GCG	2	6	84768	84773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814265
1510	NC_021810	CT	3	6	84869	84874	0 %	50 %	0 %	50 %	525814265
1511	NC_021810	ACCAG	2	10	84966	84975	40 %	0 %	20 %	40 %	525814265
1512	NC_021810	GCTG	2	8	85050	85057	0 %	25 %	50 %	25 %	525814265
1513	NC_021810	GCCA	2	8	85091	85098	25 %	0 %	25 %	50 %	525814265
1514	NC_021810	CCG	2	6	85191	85196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814265
1515	NC_021810	CAG	2	6	85201	85206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814265
1516	NC_021810	GC	3	6	85222	85227	0 %	0 %	50 %	50 %	525814265
1517	NC_021810	GC	4	8	85236	85243	0 %	0 %	50 %	50 %	525814265
1518	NC_021810	CGC	2	6	85257	85262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814265
1519	NC_021810	TCA	2	6	85322	85327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814265
1520	NC_021810	CAT	2	6	85363	85368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814265
1521	NC_021810	CCG	2	6	85540	85545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814265
1522	NC_021810	CGA	2	6	85588	85593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814265
1523	NC_021810	TCA	2	6	85602	85607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814265
1524	NC_021810	TCAT	2	8	85829	85836	25 %	50 %	0 %	25 %	525814265
1525	NC_021810	CTGA	2	8	85837	85844	25 %	25 %	25 %	25 %	525814265
1526	NC_021810	GC	3	6	85908	85913	0 %	0 %	50 %	50 %	525814265
1527	NC_021810	TGT	2	6	86048	86053	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525814265
1528	NC_021810	ATC	2	6	86078	86083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814265
1529	NC_021810	CGC	2	6	86107	86112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814265
1530	NC_021810	CGC	2	6	86124	86129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814265
1531	NC_021810	CGC	2	6	86184	86189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814265
1532	NC_021810	ACAA	2	8	86294	86301	75 %	0 %	0 %	25 %	525814265
1533	NC_021810	CGC	2	6	86319	86324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814265
1534	NC_021810	A	6	6	86345	86350	100 %	0 %	0 %	0 %	525814265
1535	NC_021810	TCT	2	6	86399	86404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814265
1536	NC_021810	CGAT	2	8	86465	86472	25 %	25 %	25 %	25 %	525814265
1537	NC_021810	GAT	2	6	86477	86482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814265
1538	NC_021810	CAC	2	6	86516	86521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814265
1539	NC_021810	TGC	2	6	86522	86527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814265
1540	NC_021810	GC	3	6	86542	86547	0 %	0 %	50 %	50 %	525814265
1541	NC_021810	TCC	2	6	86579	86584	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525814265
1542	NC_021810	GGC	2	6	86591	86596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814265
1543	NC_021810	CGAT	2	8	86630	86637	25 %	25 %	25 %	25 %	525814265
1544	NC_021810	ACC	2	6	86678	86683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814265
1545	NC_021810	CG	3	6	86694	86699	0 %	0 %	50 %	50 %	525814265
1546	NC_021810	CGC	2	6	86717	86722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814265
1547	NC_021810	CAA	2	6	86749	86754	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525814265
1548	NC_021810	ACA	2	6	86784	86789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525814265
1549	NC_021810	TAA	2	6	86881	86886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525814265
1550	NC_021810	TTC	2	6	86917	86922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814265
1551	NC_021810	GGC	2	6	87022	87027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814265
1552	NC_021810	ACC	2	6	87041	87046	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814265
1553	NC_021810	TTC	2	6	87052	87057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814265
1554	NC_021810	ACGG	2	8	87066	87073	25 %	0 %	50 %	25 %	525814265
1555	NC_021810	GCC	2	6	87088	87093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814265
1556	NC_021810	TCAA	2	8	87161	87168	50 %	25 %	0 %	25 %	525814265
1557	NC_021810	CAT	2	6	87216	87221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814265
1558	NC_021810	TGC	2	6	87252	87257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814266
1559	NC_021810	CCA	2	6	87364	87369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814266
1560	NC_021810	TGG	2	6	87375	87380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525814266
1561	NC_021810	AAG	2	6	87381	87386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525814266
1562	NC_021810	GAT	2	6	87425	87430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814266
1563	NC_021810	CTT	2	6	87490	87495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814266
1564	NC_021810	GCG	2	6	87508	87513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814266
1565	NC_021810	CTG	2	6	87539	87544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814266
1566	NC_021810	GGC	2	6	87785	87790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814266
1567	NC_021810	TCG	2	6	87801	87806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814266
1568	NC_021810	GCT	2	6	87828	87833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814266
1569	NC_021810	ACC	2	6	87891	87896	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814266
1570	NC_021810	CGC	2	6	87929	87934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814266
1571	NC_021810	AG	3	6	87960	87965	50 %	0 %	50 %	0 %	525814266
1572	NC_021810	GCA	2	6	88069	88074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814266
1573	NC_021810	TCA	2	6	88086	88091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814266
1574	NC_021810	ATC	2	6	88116	88121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814266
1575	NC_021810	CAT	2	6	88172	88177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814266
1576	NC_021810	TCC	2	6	88212	88217	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525814266
1577	NC_021810	CGT	2	6	88222	88227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814266
1578	NC_021810	TTG	2	6	88308	88313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525814266
1579	NC_021810	TAG	2	6	88318	88323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814266
1580	NC_021810	GCC	2	6	88334	88339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814266
1581	NC_021810	GCC	2	6	88344	88349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814266
1582	NC_021810	GCTGA	2	10	88355	88364	20 %	20 %	40 %	20 %	525814266
1583	NC_021810	ATC	2	6	88577	88582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814266
1584	NC_021810	TGC	2	6	88635	88640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814266
1585	NC_021810	TTA	2	6	88707	88712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525814266
1586	NC_021810	GC	3	6	88742	88747	0 %	0 %	50 %	50 %	525814266
1587	NC_021810	GCG	2	6	88753	88758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814266
1588	NC_021810	TCA	2	6	88759	88764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814266
1589	NC_021810	CGC	2	6	88814	88819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814266
1590	NC_021810	GCCA	2	8	88860	88867	25 %	0 %	25 %	50 %	525814266
1591	NC_021810	TATC	2	8	88951	88958	25 %	50 %	0 %	25 %	525814266
1592	NC_021810	CGA	2	6	88999	89004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814266
1593	NC_021810	TCA	2	6	89007	89012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814266
1594	NC_021810	CGC	2	6	89059	89064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814266
1595	NC_021810	ATCGG	2	10	89079	89088	20 %	20 %	40 %	20 %	525814266
1596	NC_021810	AG	3	6	89135	89140	50 %	0 %	50 %	0 %	525814266
1597	NC_021810	GC	3	6	89203	89208	0 %	0 %	50 %	50 %	525814266
1598	NC_021810	GCA	2	6	89236	89241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814266
1599	NC_021810	AAT	2	6	89270	89275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525814266
1600	NC_021810	TGA	2	6	89296	89301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814266
1601	NC_021810	T	6	6	89321	89326	0 %	100 %	0 %	0 %	525814266
1602	NC_021810	GCG	2	6	89358	89363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814266
1603	NC_021810	TTA	2	6	89391	89396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525814266
1604	NC_021810	TCA	2	6	89413	89418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814266
1605	NC_021810	GCC	2	6	89504	89509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814266
1606	NC_021810	GC	3	6	89585	89590	0 %	0 %	50 %	50 %	525814266
1607	NC_021810	CGTTCG	2	12	89619	89630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814266
1608	NC_021810	CGT	2	6	89698	89703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814266
1609	NC_021810	T	7	7	89807	89813	0 %	100 %	0 %	0 %	525814266
1610	NC_021810	TGA	2	6	89856	89861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814266
1611	NC_021810	CAC	2	6	89891	89896	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814266
1612	NC_021810	CGGAT	2	10	89924	89933	20 %	20 %	40 %	20 %	525814266
1613	NC_021810	ACC	2	6	89943	89948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814266
1614	NC_021810	CAATAA	2	12	90068	90079	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	525814266
1615	NC_021810	TGC	2	6	90094	90099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814266
1616	NC_021810	CTTCGC	2	12	90397	90408	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	525814267
1617	NC_021810	CAT	2	6	90416	90421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814267
1618	NC_021810	TCA	2	6	90471	90476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814267
1619	NC_021810	CAT	2	6	90490	90495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814267
1620	NC_021810	GCC	2	6	90527	90532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814267
1621	NC_021810	AGG	2	6	90626	90631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525814267
1622	NC_021810	CGC	2	6	90682	90687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814267
1623	NC_021810	AAT	2	6	90762	90767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525814267
1624	NC_021810	TCC	2	6	90771	90776	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525814267
1625	NC_021810	AGCC	2	8	90789	90796	25 %	0 %	25 %	50 %	525814267
1626	NC_021810	TGC	2	6	90879	90884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814267
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1654	NC_021810	CCG	2	6	92327	92332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814267
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1658	NC_021810	CAG	2	6	92474	92479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814267
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1732	NC_021810	CAT	2	6	96432	96437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814274
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1735	NC_021810	TGTAC	2	10	96488	96497	20 %	40 %	20 %	20 %	525814274
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1746	NC_021810	AATA	2	8	96988	96995	75 %	25 %	0 %	0 %	525814274
1747	NC_021810	C	6	6	97051	97056	0 %	0 %	0 %	100 %	525814274
1748	NC_021810	CCA	2	6	97169	97174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814274
1749	NC_021810	AATC	2	8	97496	97503	50 %	25 %	0 %	25 %	525814275
1750	NC_021810	C	6	6	97503	97508	0 %	0 %	0 %	100 %	525814275
1751	NC_021810	CGC	2	6	97529	97534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814275
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1755	NC_021810	CGC	2	6	97720	97725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814275
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1760	NC_021810	CCGA	2	8	97875	97882	25 %	0 %	25 %	50 %	525814275
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1870	NC_021810	CGG	2	6	104587	104592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814281
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1983	NC_021810	GGC	2	6	111209	111214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814285
1984	NC_021810	CGG	2	6	111226	111231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814285
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1992	NC_021810	TAA	2	6	111510	111515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525814285
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1994	NC_021810	GCG	2	6	111716	111721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814286
1995	NC_021810	GCT	2	6	111724	111729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814286
1996	NC_021810	GCG	2	6	111896	111901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814286
1997	NC_021810	CT	3	6	111932	111937	0 %	50 %	0 %	50 %	525814286
1998	NC_021810	GCCT	2	8	111941	111948	0 %	25 %	25 %	50 %	525814286
1999	NC_021810	GCC	2	6	111973	111978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814286
2000	NC_021810	CTA	2	6	111980	111985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814286

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