MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. 41578

Total Repeats: 88435

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021810	TGGC	2	8	58977	58984	0 %	25 %	50 %	25 %	525814242
1002	NC_021810	ATC	2	6	59022	59027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814242
1003	NC_021810	TCC	2	6	59028	59033	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525814242
1004	NC_021810	GAA	2	6	59075	59080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525814242
1005	NC_021810	CAT	2	6	59108	59113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814242
1006	NC_021810	TTC	2	6	59133	59138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814242
1007	NC_021810	ATC	2	6	59241	59246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814242
1008	NC_021810	GAT	2	6	59270	59275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814242
1009	NC_021810	TCCT	2	8	59289	59296	0 %	50 %	0 %	50 %	525814242
1010	NC_021810	GC	3	6	59311	59316	0 %	0 %	50 %	50 %	525814242
1011	NC_021810	GGTAAA	2	12	59355	59366	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	525814242
1012	NC_021810	CAA	2	6	59378	59383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525814242
1013	NC_021810	CAC	2	6	59417	59422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814242
1014	NC_021810	GGC	2	6	59475	59480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814242
1015	NC_021810	ATC	2	6	59484	59489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814242
1016	NC_021810	GAT	2	6	59492	59497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814242
1017	NC_021810	CGT	2	6	59823	59828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814243
1018	NC_021810	CT	3	6	59844	59849	0 %	50 %	0 %	50 %	525814243
1019	NC_021810	CCA	2	6	59868	59873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814243
1020	NC_021810	ATT	2	6	59887	59892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525814243
1021	NC_021810	TAC	2	6	59978	59983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814243
1022	NC_021810	GCA	2	6	59994	59999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814243
1023	NC_021810	GGCG	2	8	60087	60094	0 %	0 %	75 %	25 %	525814243
1024	NC_021810	CTA	2	6	60117	60122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814243
1025	NC_021810	CGG	3	9	60129	60137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814243
1026	NC_021810	TCG	2	6	60143	60148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814243
1027	NC_021810	CGTAC	2	10	60189	60198	20 %	20 %	20 %	40 %	525814243
1028	NC_021810	CCG	2	6	60209	60214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814243
1029	NC_021810	TGA	2	6	60263	60268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814243
1030	NC_021810	AAG	2	6	60296	60301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525814243
1031	NC_021810	AGC	2	6	60308	60313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814243
1032	NC_021810	CAC	2	6	60363	60368	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814243
1033	NC_021810	CG	3	6	60406	60411	0 %	0 %	50 %	50 %	525814243
1034	NC_021810	GCG	3	9	60409	60417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814243
1035	NC_021810	GTCA	2	8	60433	60440	25 %	25 %	25 %	25 %	525814243
1036	NC_021810	ACC	2	6	60451	60456	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814243
1037	NC_021810	GTC	2	6	60469	60474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814243
1038	NC_021810	AGT	2	6	60531	60536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814243
1039	NC_021810	CGG	2	6	60572	60577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814243
1040	NC_021810	GGC	2	6	60738	60743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814243
1041	NC_021810	GCT	2	6	60759	60764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814243
1042	NC_021810	GT	3	6	60784	60789	0 %	50 %	50 %	0 %	525814243
1043	NC_021810	CGC	2	6	60792	60797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814243
1044	NC_021810	CGC	2	6	60906	60911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814243
1045	NC_021810	CG	3	6	61019	61024	0 %	0 %	50 %	50 %	525814243
1046	NC_021810	GCT	2	6	61233	61238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814244
1047	NC_021810	TCG	2	6	61249	61254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814244
1048	NC_021810	TG	3	6	61302	61307	0 %	50 %	50 %	0 %	525814244
1049	NC_021810	ATT	2	6	61338	61343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525814244
1050	NC_021810	CAGC	2	8	61346	61353	25 %	0 %	25 %	50 %	525814244
1051	NC_021810	TGA	2	6	61376	61381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814244
1052	NC_021810	CG	3	6	61385	61390	0 %	0 %	50 %	50 %	525814244
1053	NC_021810	CAG	2	6	61391	61396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814244
1054	NC_021810	TCA	2	6	61406	61411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814244
1055	NC_021810	CCG	2	6	61440	61445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814244
1056	NC_021810	GCCC	2	8	61472	61479	0 %	0 %	25 %	75 %	525814244
1057	NC_021810	CGC	2	6	61484	61489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814244
1058	NC_021810	GCG	2	6	61501	61506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814244
1059	NC_021810	GGC	2	6	61547	61552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814244
1060	NC_021810	CT	3	6	61629	61634	0 %	50 %	0 %	50 %	525814244
1061	NC_021810	ACT	2	6	61654	61659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814244
1062	NC_021810	GCTG	2	8	61669	61676	0 %	25 %	50 %	25 %	525814244
1063	NC_021810	AGT	2	6	61752	61757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814244
1064	NC_021810	CAG	2	6	61962	61967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814244
1065	NC_021810	GCC	2	6	62134	62139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814245
1066	NC_021810	CAT	2	6	62148	62153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814245
1067	NC_021810	CGC	2	6	62158	62163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814245
1068	NC_021810	GCG	2	6	62400	62405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814245
1069	NC_021810	TGT	2	6	62406	62411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525814245
1070	NC_021810	GC	3	6	62544	62549	0 %	0 %	50 %	50 %	525814245
1071	NC_021810	AAT	2	6	62554	62559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525814245
1072	NC_021810	CAT	2	6	62683	62688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814245
1073	NC_021810	GCC	2	6	62705	62710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814245
1074	NC_021810	CCG	2	6	62790	62795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814245
1075	NC_021810	CCG	2	6	62802	62807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814245
1076	NC_021810	ATA	2	6	62900	62905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525814245
1077	NC_021810	CCG	2	6	62936	62941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814245
1078	NC_021810	TTCA	2	8	63199	63206	25 %	50 %	0 %	25 %	525814245
1079	NC_021810	GTACCG	2	12	63310	63321	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	525814246
1080	NC_021810	CACTTC	2	12	63362	63373	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	525814246
1081	NC_021810	GCCA	2	8	63378	63385	25 %	0 %	25 %	50 %	525814246
1082	NC_021810	TTC	2	6	63404	63409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814246
1083	NC_021810	GC	3	6	63511	63516	0 %	0 %	50 %	50 %	525814246
1084	NC_021810	C	6	6	63531	63536	0 %	0 %	0 %	100 %	525814246
1085	NC_021810	GCG	2	6	63537	63542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814246
1086	NC_021810	GCC	2	6	63651	63656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814246
1087	NC_021810	AAT	2	6	63857	63862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525814246
1088	NC_021810	ATT	2	6	63888	63893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525814246
1089	NC_021810	AATT	2	8	64041	64048	50 %	50 %	0 %	0 %	525814247
1090	NC_021810	GAC	2	6	64064	64069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814247
1091	NC_021810	TC	3	6	64077	64082	0 %	50 %	0 %	50 %	525814247
1092	NC_021810	TAA	2	6	64102	64107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525814247
1093	NC_021810	AAT	2	6	64164	64169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525814247
1094	NC_021810	T	6	6	64194	64199	0 %	100 %	0 %	0 %	525814247
1095	NC_021810	ACA	2	6	64454	64459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525814248
1096	NC_021810	AGCAA	2	10	64494	64503	60 %	0 %	20 %	20 %	525814248
1097	NC_021810	AAGC	2	8	64504	64511	50 %	0 %	25 %	25 %	525814248
1098	NC_021810	ATT	2	6	64517	64522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525814248
1099	NC_021810	T	6	6	64547	64552	0 %	100 %	0 %	0 %	525814248
1100	NC_021810	AAT	2	6	64568	64573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525814248
1101	NC_021810	TTA	2	6	64586	64591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525814248
1102	NC_021810	CAA	2	6	64601	64606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525814248
1103	NC_021810	CTAA	2	8	64616	64623	50 %	25 %	0 %	25 %	525814248
1104	NC_021810	TCAG	2	8	64642	64649	25 %	25 %	25 %	25 %	525814248
1105	NC_021810	TGA	2	6	64695	64700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814248
1106	NC_021810	A	6	6	64700	64705	100 %	0 %	0 %	0 %	525814248
1107	NC_021810	T	7	7	64737	64743	0 %	100 %	0 %	0 %	525814248
1108	NC_021810	ATT	2	6	64762	64767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525814248
1109	NC_021810	GCC	2	6	64775	64780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814248
1110	NC_021810	ATT	2	6	64798	64803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525814248
1111	NC_021810	ATC	2	6	64820	64825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814248
1112	NC_021810	GCC	2	6	64826	64831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814248
1113	NC_021810	GCG	2	6	64890	64895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814248
1114	NC_021810	TAT	2	6	64942	64947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525814248
1115	NC_021810	AAG	2	6	65001	65006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525814248
1116	NC_021810	TCG	2	6	65088	65093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814248
1117	NC_021810	TAG	2	6	65103	65108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814248
1118	NC_021810	GCT	2	6	65113	65118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814248
1119	NC_021810	TCT	2	6	65189	65194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814248
1120	NC_021810	CT	3	6	65193	65198	0 %	50 %	0 %	50 %	525814248
1121	NC_021810	CTG	2	6	65272	65277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814248
1122	NC_021810	GAG	2	6	65303	65308	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525814248
1123	NC_021810	CGC	2	6	65332	65337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814248
1124	NC_021810	CTT	2	6	65365	65370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814248
1125	NC_021810	CGC	2	6	65412	65417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814248
1126	NC_021810	GCC	2	6	65429	65434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814248
1127	NC_021810	CTG	2	6	65495	65500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814248
1128	NC_021810	TCT	2	6	65547	65552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814248
1129	NC_021810	GGACA	2	10	65573	65582	40 %	0 %	40 %	20 %	525814248
1130	NC_021810	ATT	2	6	65615	65620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525814248
1131	NC_021810	GGC	2	6	65621	65626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814248
1132	NC_021810	CGC	2	6	65662	65667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814248
1133	NC_021810	CCG	2	6	65682	65687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814248
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1142	NC_021810	GGC	2	6	66167	66172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814249
1143	NC_021810	CGA	2	6	66230	66235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814249
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1145	NC_021810	CTG	2	6	66267	66272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814249
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1154	NC_021810	CTG	2	6	66582	66587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814249
1155	NC_021810	ATG	2	6	66609	66614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814249
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1158	NC_021810	GCC	2	6	66678	66683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814249
1159	NC_021810	CCG	2	6	66733	66738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814249
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1230	NC_021810	CGG	3	9	70099	70107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814252
1231	NC_021810	TAT	2	6	70179	70184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525814252
1232	NC_021810	TGAT	2	8	70185	70192	25 %	50 %	25 %	0 %	525814252
1233	NC_021810	GC	3	6	70220	70225	0 %	0 %	50 %	50 %	525814252
1234	NC_021810	TGACG	2	10	70240	70249	20 %	20 %	40 %	20 %	525814252
1235	NC_021810	TCG	2	6	70345	70350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814253
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1238	NC_021810	T	6	6	70506	70511	0 %	100 %	0 %	0 %	525814253
1239	NC_021810	CCA	2	6	70601	70606	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814253
1240	NC_021810	CCAT	2	8	70616	70623	25 %	25 %	0 %	50 %	525814253
1241	NC_021810	ATT	2	6	70629	70634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525814253
1242	NC_021810	CCG	2	6	70768	70773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814253
1243	NC_021810	CGAA	2	8	70946	70953	50 %	0 %	25 %	25 %	525814253
1244	NC_021810	AGC	2	6	70964	70969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814253
1245	NC_021810	A	6	6	70983	70988	100 %	0 %	0 %	0 %	525814253
1246	NC_021810	CG	3	6	71052	71057	0 %	0 %	50 %	50 %	525814253
1247	NC_021810	TCA	2	6	71087	71092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814253
1248	NC_021810	CGC	2	6	71135	71140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814253
1249	NC_021810	CGG	2	6	71193	71198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814253
1250	NC_021810	GCA	2	6	71207	71212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814253
1251	NC_021810	CACC	2	8	71216	71223	25 %	0 %	0 %	75 %	525814253
1252	NC_021810	GGCG	2	8	71234	71241	0 %	0 %	75 %	25 %	525814253
1253	NC_021810	GCCCA	2	10	71486	71495	20 %	0 %	20 %	60 %	525814254
1254	NC_021810	CGC	2	6	71508	71513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814254
1255	NC_021810	GCT	2	6	71608	71613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814254
1256	NC_021810	TAAA	2	8	71777	71784	75 %	25 %	0 %	0 %	525814254
1257	NC_021810	GCG	2	6	71795	71800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814254
1258	NC_021810	TGGTCA	2	12	71820	71831	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525814254
1259	NC_021810	ATT	2	6	71844	71849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525814255
1260	NC_021810	CGC	2	6	71884	71889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814255
1261	NC_021810	GGC	2	6	71914	71919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814255
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1264	NC_021810	GT	3	6	72194	72199	0 %	50 %	50 %	0 %	525814255
1265	NC_021810	TAA	2	6	72244	72249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525814255
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1267	NC_021810	CGACAT	2	12	72333	72344	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525814255
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1270	NC_021810	GCG	3	9	72595	72603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814255
1271	NC_021810	A	6	6	72620	72625	100 %	0 %	0 %	0 %	525814255
1272	NC_021810	TGG	2	6	72644	72649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525814255
1273	NC_021810	TTC	2	6	72676	72681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814255
1274	NC_021810	GCT	2	6	72683	72688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814255
1275	NC_021810	GC	3	6	72706	72711	0 %	0 %	50 %	50 %	525814255
1276	NC_021810	GCA	2	6	72713	72718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814255
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1284	NC_021810	GCC	2	6	73604	73609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814257
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1291	NC_021810	CAA	2	6	73919	73924	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525814257
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1374	NC_021810	CGAT	2	8	77777	77784	25 %	25 %	25 %	25 %	525814261
1375	NC_021810	AAG	2	6	77837	77842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525814261
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