MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. 41578

Total Repeats: 88435

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021810	CGC	2	6	28308	28313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814216
502	NC_021810	ACC	2	6	28372	28377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814216
503	NC_021810	AT	3	6	28424	28429	50 %	50 %	0 %	0 %	525814216
504	NC_021810	CTT	2	6	28470	28475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814216
505	NC_021810	ATC	2	6	28546	28551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814216
506	NC_021810	CG	3	6	28675	28680	0 %	0 %	50 %	50 %	525814216
507	NC_021810	CAG	2	6	28723	28728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814216
508	NC_021810	GCC	2	6	28775	28780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814216
509	NC_021810	AGGTA	2	10	28781	28790	40 %	20 %	40 %	0 %	525814216
510	NC_021810	CCG	2	6	28892	28897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814216
511	NC_021810	CCA	2	6	28902	28907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814216
512	NC_021810	GTT	2	6	29053	29058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525814216
513	NC_021810	GCG	2	6	29059	29064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814216
514	NC_021810	ATG	2	6	29204	29209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814216
515	NC_021810	GAGG	2	8	29245	29252	25 %	0 %	75 %	0 %	525814216
516	NC_021810	AG	3	6	29273	29278	50 %	0 %	50 %	0 %	525814216
517	NC_021810	CCG	2	6	29288	29293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814216
518	NC_021810	CTT	2	6	29585	29590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814217
519	NC_021810	ACG	2	6	29661	29666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814217
520	NC_021810	CAA	2	6	29783	29788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525814217
521	NC_021810	CGA	2	6	29840	29845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814217
522	NC_021810	CGT	2	6	29856	29861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814217
523	NC_021810	T	6	6	29897	29902	0 %	100 %	0 %	0 %	525814217
524	NC_021810	GC	4	8	29903	29910	0 %	0 %	50 %	50 %	525814217
525	NC_021810	TGC	2	6	29953	29958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814217
526	NC_021810	GC	4	8	29966	29973	0 %	0 %	50 %	50 %	525814217
527	NC_021810	CTT	2	6	30008	30013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814217
528	NC_021810	TAT	2	6	30017	30022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525814217
529	NC_021810	GGC	2	6	30053	30058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814217
530	NC_021810	CTT	2	6	30110	30115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814217
531	NC_021810	ACC	2	6	30139	30144	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814217
532	NC_021810	AAC	2	6	30148	30153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525814217
533	NC_021810	CGC	2	6	30167	30172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814217
534	NC_021810	TTC	2	6	30222	30227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814217
535	NC_021810	GTA	2	6	31031	31036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814218
536	NC_021810	TTG	2	6	31067	31072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525814218
537	NC_021810	CAA	2	6	31170	31175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525814218
538	NC_021810	TGA	2	6	31298	31303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814218
539	NC_021810	TGA	2	6	31428	31433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814218
540	NC_021810	CTGG	2	8	31458	31465	0 %	25 %	50 %	25 %	525814218
541	NC_021810	GCA	2	6	31471	31476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814218
542	NC_021810	CAG	2	6	31503	31508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814218
543	NC_021810	GCC	2	6	31510	31515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814218
544	NC_021810	A	6	6	31744	31749	100 %	0 %	0 %	0 %	525814219
545	NC_021810	AAATTA	2	12	31818	31829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525814219
546	NC_021810	GCT	2	6	32050	32055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814219
547	NC_021810	ACCC	2	8	32103	32110	25 %	0 %	0 %	75 %	525814219
548	NC_021810	CAT	2	6	32137	32142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814219
549	NC_021810	ACA	2	6	32151	32156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525814219
550	NC_021810	TAA	2	6	32158	32163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525814219
551	NC_021810	TGACGA	2	12	32287	32298	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	525814219
552	NC_021810	CTA	2	6	32335	32340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814219
553	NC_021810	TGC	2	6	32460	32465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814219
554	NC_021810	GC	3	6	32507	32512	0 %	0 %	50 %	50 %	525814219
555	NC_021810	AAAGTC	2	12	32522	32533	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	525814219
556	NC_021810	GCC	2	6	32733	32738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814219
557	NC_021810	ATC	2	6	32751	32756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814219
558	NC_021810	CGG	2	6	32781	32786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814219
559	NC_021810	G	6	6	32796	32801	0 %	0 %	100 %	0 %	525814219
560	NC_021810	GGC	2	6	32825	32830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814219
561	NC_021810	GTG	2	6	32888	32893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525814219
562	NC_021810	GAC	2	6	32942	32947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814219
563	NC_021810	TGA	2	6	33007	33012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814219
564	NC_021810	ATGAGC	2	12	33065	33076	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	525814219
565	NC_021810	ATC	3	9	33099	33107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814219
566	NC_021810	A	6	6	33274	33279	100 %	0 %	0 %	0 %	525814219
567	NC_021810	GAT	2	6	33329	33334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814219
568	NC_021810	CTGT	2	8	33350	33357	0 %	50 %	25 %	25 %	525814219
569	NC_021810	GC	3	6	33489	33494	0 %	0 %	50 %	50 %	525814219
570	NC_021810	TTA	2	6	33505	33510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525814219
571	NC_021810	GC	3	6	33522	33527	0 %	0 %	50 %	50 %	525814219
572	NC_021810	GAA	2	6	33557	33562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525814219
573	NC_021810	GCG	2	6	33594	33599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814219
574	NC_021810	ACC	2	6	33611	33616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814219
575	NC_021810	GCG	2	6	33621	33626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814219
576	NC_021810	GCA	2	6	33651	33656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814219
577	NC_021810	CAAC	2	8	33723	33730	50 %	0 %	0 %	50 %	525814219
578	NC_021810	GCG	2	6	33891	33896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814219
579	NC_021810	ATG	2	6	33902	33907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814219
580	NC_021810	CAG	3	9	33971	33979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814219
581	NC_021810	TGG	2	6	33987	33992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525814219
582	NC_021810	CTGG	2	8	34009	34016	0 %	25 %	50 %	25 %	525814219
583	NC_021810	TCT	2	6	34047	34052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814219
584	NC_021810	GGCGC	2	10	34058	34067	0 %	0 %	60 %	40 %	525814219
585	NC_021810	TGC	2	6	34125	34130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814219
586	NC_021810	C	6	6	34154	34159	0 %	0 %	0 %	100 %	525814219
587	NC_021810	ACCGC	2	10	34160	34169	20 %	0 %	20 %	60 %	525814219
588	NC_021810	CTGC	2	8	34184	34191	0 %	25 %	25 %	50 %	525814219
589	NC_021810	GCTG	2	8	34276	34283	0 %	25 %	50 %	25 %	525814219
590	NC_021810	ACCA	2	8	34340	34347	50 %	0 %	0 %	50 %	525814220
591	NC_021810	GCC	2	6	34564	34569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814220
592	NC_021810	CCG	2	6	34685	34690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814220
593	NC_021810	TCA	2	6	34866	34871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814220
594	NC_021810	CTG	2	6	34919	34924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814220
595	NC_021810	CTCG	2	8	34966	34973	0 %	25 %	25 %	50 %	525814220
596	NC_021810	GGT	2	6	34984	34989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525814220
597	NC_021810	GAT	2	6	35000	35005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814220
598	NC_021810	CGG	2	6	35008	35013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814220
599	NC_021810	CTG	2	6	35021	35026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814220
600	NC_021810	A	6	6	35067	35072	100 %	0 %	0 %	0 %	525814220
601	NC_021810	GAA	2	6	35086	35091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525814220
602	NC_021810	TGC	2	6	35155	35160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814221
603	NC_021810	GTC	2	6	35229	35234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814221
604	NC_021810	ACC	2	6	35240	35245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814221
605	NC_021810	GGC	2	6	35259	35264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814221
606	NC_021810	ACC	2	6	35292	35297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814221
607	NC_021810	ACC	4	12	35391	35402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814221
608	NC_021810	CAG	2	6	35457	35462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814221
609	NC_021810	GCA	2	6	35524	35529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814221
610	NC_021810	CCCG	2	8	35728	35735	0 %	0 %	25 %	75 %	525814222
611	NC_021810	AAT	2	6	35747	35752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525814222
612	NC_021810	ATT	2	6	35786	35791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525814222
613	NC_021810	ATA	2	6	35793	35798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525814222
614	NC_021810	CAG	2	6	35848	35853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814222
615	NC_021810	ACC	2	6	35927	35932	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814222
616	NC_021810	TCC	2	6	35980	35985	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525814222
617	NC_021810	GCC	2	6	36187	36192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814223
618	NC_021810	CTG	2	6	36424	36429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814223
619	NC_021810	TCG	2	6	36442	36447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814223
620	NC_021810	AAG	2	6	36536	36541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525814223
621	NC_021810	ACC	2	6	36547	36552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814223
622	NC_021810	CAGGC	2	10	36562	36571	20 %	0 %	40 %	40 %	525814223
623	NC_021810	TAT	2	6	36716	36721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525814224
624	NC_021810	T	6	6	36721	36726	0 %	100 %	0 %	0 %	525814224
625	NC_021810	CAA	2	6	36806	36811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525814224
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627	NC_021810	TAC	2	6	36821	36826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814224
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755	NC_021810	TGG	2	6	45338	45343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525814231
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856	NC_021810	CAC	2	6	50565	50570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814234
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858	NC_021810	GAC	2	6	50691	50696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814234
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873	NC_021810	TAA	2	6	51352	51357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525814235
874	NC_021810	ATC	2	6	51405	51410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814235
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880	NC_021810	CCG	2	6	51715	51720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814235
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