MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. 41578

Total Repeats: 88435

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_021810	ATG	2	6	312451	312456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814487
5502	NC_021810	CGA	3	9	312457	312465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814487
5503	NC_021810	A	6	6	312465	312470	100 %	0 %	0 %	0 %	525814487
5504	NC_021810	CGT	2	6	312494	312499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814487
5505	NC_021810	CCT	2	6	312518	312523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525814487
5506	NC_021810	CCAG	2	8	312528	312535	25 %	0 %	25 %	50 %	525814487
5507	NC_021810	TCA	2	6	312550	312555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814487
5508	NC_021810	GCG	2	6	312560	312565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814487
5509	NC_021810	GC	3	6	312653	312658	0 %	0 %	50 %	50 %	525814487
5510	NC_021810	CAA	2	6	312695	312700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525814487
5511	NC_021810	AG	3	6	312729	312734	50 %	0 %	50 %	0 %	525814487
5512	NC_021810	GCT	2	6	312890	312895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814488
5513	NC_021810	TTCAAT	2	12	312921	312932	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	525814488
5514	NC_021810	CAT	2	6	313001	313006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814488
5515	NC_021810	CAG	2	6	313017	313022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814488
5516	NC_021810	T	7	7	313098	313104	0 %	100 %	0 %	0 %	525814488
5517	NC_021810	CAG	2	6	313109	313114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814488
5518	NC_021810	CGG	2	6	313271	313276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814488
5519	NC_021810	TCG	2	6	313292	313297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814488
5520	NC_021810	CCA	2	6	313354	313359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814488
5521	NC_021810	TCG	2	6	313420	313425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814488
5522	NC_021810	CGG	2	6	313514	313519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814488
5523	NC_021810	TC	3	6	313544	313549	0 %	50 %	0 %	50 %	525814488
5524	NC_021810	GCG	2	6	313550	313555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814488
5525	NC_021810	CGC	2	6	313584	313589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814488
5526	NC_021810	CAG	2	6	313626	313631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814488
5527	NC_021810	GC	3	6	313654	313659	0 %	0 %	50 %	50 %	525814488
5528	NC_021810	CGC	2	6	313664	313669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814488
5529	NC_021810	CTG	2	6	313753	313758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814488
5530	NC_021810	GCCAG	2	10	313825	313834	20 %	0 %	40 %	40 %	525814488
5531	NC_021810	CCG	2	6	313862	313867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814488
5532	NC_021810	GCCC	2	8	313931	313938	0 %	0 %	25 %	75 %	525814488
5533	NC_021810	CGGC	2	8	313945	313952	0 %	0 %	50 %	50 %	525814488
5534	NC_021810	CAC	2	6	313985	313990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814488
5535	NC_021810	GGC	2	6	314012	314017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814488
5536	NC_021810	CTGG	2	8	314058	314065	0 %	25 %	50 %	25 %	525814488
5537	NC_021810	ATG	2	6	314070	314075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814488
5538	NC_021810	CGC	2	6	314078	314083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814488
5539	NC_021810	GAT	2	6	314096	314101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814488
5540	NC_021810	CGT	2	6	314120	314125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814488
5541	NC_021810	CCG	2	6	314453	314458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814489
5542	NC_021810	TC	3	6	314459	314464	0 %	50 %	0 %	50 %	525814489
5543	NC_021810	TGA	2	6	314490	314495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814489
5544	NC_021810	CAA	2	6	314724	314729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525814489
5545	NC_021810	CCG	2	6	314756	314761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814489
5546	NC_021810	GCA	2	6	314766	314771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814489
5547	NC_021810	TCA	2	6	314795	314800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814489
5548	NC_021810	AGA	2	6	314811	314816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525814489
5549	NC_021810	A	6	6	314854	314859	100 %	0 %	0 %	0 %	525814489
5550	NC_021810	ATT	2	6	314902	314907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525814489
5551	NC_021810	TATG	2	8	314919	314926	25 %	50 %	25 %	0 %	525814489
5552	NC_021810	GCG	3	9	314927	314935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814489
5553	NC_021810	TGC	2	6	314966	314971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814489
5554	NC_021810	GGT	2	6	315099	315104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525814490
5555	NC_021810	GTT	2	6	315119	315124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525814490
5556	NC_021810	TAAAGA	2	12	315137	315148	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	525814490
5557	NC_021810	CGC	2	6	315169	315174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814490
5558	NC_021810	CAG	2	6	315198	315203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814490
5559	NC_021810	GAA	2	6	315246	315251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525814490
5560	NC_021810	GC	3	6	315375	315380	0 %	0 %	50 %	50 %	525814490
5561	NC_021810	TC	3	6	315451	315456	0 %	50 %	0 %	50 %	525814490
5562	NC_021810	GCC	2	6	315504	315509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814490
5563	NC_021810	ACC	2	6	315636	315641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814490
5564	NC_021810	GCG	2	6	315679	315684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814490
5565	NC_021810	TGA	2	6	315778	315783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814490
5566	NC_021810	GCC	2	6	315795	315800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814490
5567	NC_021810	CAT	2	6	315888	315893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814490
5568	NC_021810	CGG	2	6	315904	315909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814490
5569	NC_021810	TGATC	2	10	315995	316004	20 %	40 %	20 %	20 %	525814490
5570	NC_021810	GCTG	2	8	316162	316169	0 %	25 %	50 %	25 %	525814490
5571	NC_021810	CGA	2	6	316201	316206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814490
5572	NC_021810	GGT	2	6	316211	316216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525814490
5573	NC_021810	GAG	2	6	316248	316253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525814490
5574	NC_021810	CGA	2	6	316263	316268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814490
5575	NC_021810	ATC	2	6	316423	316428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814491
5576	NC_021810	AGA	3	9	316429	316437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525814491
5577	NC_021810	GCC	2	6	316452	316457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814491
5578	NC_021810	CCA	2	6	316537	316542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814491
5579	NC_021810	CAT	3	9	316634	316642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814491
5580	NC_021810	GGC	2	6	316673	316678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814491
5581	NC_021810	ATC	2	6	316796	316801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814491
5582	NC_021810	GC	4	8	316810	316817	0 %	0 %	50 %	50 %	525814491
5583	NC_021810	CGG	2	6	316840	316845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814491
5584	NC_021810	ACC	2	6	316866	316871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814491
5585	NC_021810	CAC	2	6	316937	316942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814491
5586	NC_021810	CAG	2	6	316958	316963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814491
5587	NC_021810	GCGG	2	8	317011	317018	0 %	0 %	75 %	25 %	525814491
5588	NC_021810	CCG	2	6	317048	317053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814491
5589	NC_021810	CAC	2	6	317063	317068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814491
5590	NC_021810	CAC	2	6	317096	317101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814491
5591	NC_021810	CAG	2	6	317135	317140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814491
5592	NC_021810	AAT	2	6	317150	317155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525814491
5593	NC_021810	CAG	2	6	317225	317230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814491
5594	NC_021810	TCA	2	6	317245	317250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814491
5595	NC_021810	ATT	2	6	317355	317360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525814492
5596	NC_021810	AAT	2	6	317370	317375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525814492
5597	NC_021810	CGC	2	6	317388	317393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814492
5598	NC_021810	GC	4	8	317392	317399	0 %	0 %	50 %	50 %	525814492
5599	NC_021810	AGC	2	6	317455	317460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814492
5600	NC_021810	CGCC	2	8	317503	317510	0 %	0 %	25 %	75 %	525814492
5601	NC_021810	CAT	2	6	317567	317572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814492
5602	NC_021810	GTG	2	6	317665	317670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525814492
5603	NC_021810	CGA	2	6	317939	317944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814493
5604	NC_021810	CTGG	2	8	318054	318061	0 %	25 %	50 %	25 %	525814493
5605	NC_021810	TATCGC	2	12	318066	318077	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	525814493
5606	NC_021810	T	6	6	318106	318111	0 %	100 %	0 %	0 %	525814493
5607	NC_021810	GGCA	2	8	318189	318196	25 %	0 %	50 %	25 %	525814493
5608	NC_021810	GCT	2	6	318201	318206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814493
5609	NC_021810	TGG	2	6	318277	318282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525814493
5610	NC_021810	TGC	2	6	318332	318337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814493
5611	NC_021810	CAT	2	6	318340	318345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814493
5612	NC_021810	ACA	2	6	318347	318352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525814493
5613	NC_021810	GAGCTG	2	12	318422	318433	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	525814493
5614	NC_021810	CGC	2	6	318677	318682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814494
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5616	NC_021810	CGCC	2	8	318739	318746	0 %	0 %	25 %	75 %	525814494
5617	NC_021810	ATC	2	6	318774	318779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814494
5618	NC_021810	CGC	2	6	318823	318828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814494
5619	NC_021810	CAT	2	6	318839	318844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814494
5620	NC_021810	CG	3	6	318857	318862	0 %	0 %	50 %	50 %	525814494
5621	NC_021810	CGC	2	6	318883	318888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814494
5622	NC_021810	GC	4	8	318925	318932	0 %	0 %	50 %	50 %	525814494
5623	NC_021810	ATC	2	6	318942	318947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814494
5624	NC_021810	GC	4	8	318975	318982	0 %	0 %	50 %	50 %	525814494
5625	NC_021810	TCG	2	6	319002	319007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814494
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5634	NC_021810	CAG	2	6	319421	319426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814494
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5653	NC_021810	TGA	2	6	320721	320726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814496
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5662	NC_021810	GTC	2	6	321173	321178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814496
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5865	NC_021810	TAC	2	6	332155	332160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814504
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5984	NC_021810	CGTA	2	8	338714	338721	25 %	25 %	25 %	25 %	525814509
5985	NC_021810	CTG	2	6	338730	338735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814509
5986	NC_021810	CGC	2	6	338743	338748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814509
5987	NC_021810	TGC	2	6	338749	338754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814509
5988	NC_021810	CAC	2	6	338825	338830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814509
5989	NC_021810	GC	3	6	338879	338884	0 %	0 %	50 %	50 %	525814509
5990	NC_021810	CTG	2	6	338895	338900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814509
5991	NC_021810	TCG	2	6	338980	338985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814509
5992	NC_021810	AAT	2	6	339100	339105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525814509
5993	NC_021810	GCTT	2	8	339489	339496	0 %	50 %	25 %	25 %	525814510
5994	NC_021810	TCG	2	6	339507	339512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814510
5995	NC_021810	ACC	2	6	339573	339578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814510
5996	NC_021810	A	6	6	339588	339593	100 %	0 %	0 %	0 %	525814510
5997	NC_021810	TCTT	2	8	339612	339619	0 %	75 %	0 %	25 %	525814510
5998	NC_021810	GGC	2	6	339649	339654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814510
5999	NC_021810	CCTTC	2	10	339672	339681	0 %	40 %	0 %	60 %	525814510
6000	NC_021810	GCC	2	6	339718	339723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814510

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