MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. 41578

Total Repeats: 88435

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_021810	CGC	2	6	284719	284724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814460
5002	NC_021810	ATC	2	6	284737	284742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814460
5003	NC_021810	GC	3	6	284745	284750	0 %	0 %	50 %	50 %	525814460
5004	NC_021810	T	6	6	284884	284889	0 %	100 %	0 %	0 %	525814460
5005	NC_021810	GCG	2	6	284938	284943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814460
5006	NC_021810	AGT	2	6	285006	285011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814460
5007	NC_021810	AGAT	2	8	285193	285200	50 %	25 %	25 %	0 %	525814461
5008	NC_021810	CAG	2	6	285207	285212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814461
5009	NC_021810	GAA	2	6	285252	285257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525814461
5010	NC_021810	CGC	2	6	285281	285286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814461
5011	NC_021810	AATA	2	8	285307	285314	75 %	25 %	0 %	0 %	525814461
5012	NC_021810	CAC	2	6	285357	285362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814461
5013	NC_021810	CAC	2	6	285393	285398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814461
5014	NC_021810	TGG	2	6	285424	285429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525814461
5015	NC_021810	CGG	2	6	285462	285467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814461
5016	NC_021810	CGT	2	6	285468	285473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814461
5017	NC_021810	CTG	2	6	285508	285513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814461
5018	NC_021810	CGC	2	6	285538	285543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814461
5019	NC_021810	CGC	2	6	285558	285563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814461
5020	NC_021810	TGC	2	6	285652	285657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814461
5021	NC_021810	GCCA	2	8	285694	285701	25 %	0 %	25 %	50 %	525814461
5022	NC_021810	GCC	2	6	285833	285838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814461
5023	NC_021810	ATGAAA	2	12	285912	285923	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	525814461
5024	NC_021810	CGC	2	6	286003	286008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814461
5025	NC_021810	TCAT	2	8	286039	286046	25 %	50 %	0 %	25 %	525814461
5026	NC_021810	GTC	2	6	286289	286294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814462
5027	NC_021810	CGA	2	6	286306	286311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814462
5028	NC_021810	CT	3	6	286359	286364	0 %	50 %	0 %	50 %	525814462
5029	NC_021810	CGT	2	6	286367	286372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814462
5030	NC_021810	GCT	2	6	286373	286378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814462
5031	NC_021810	CCG	2	6	286398	286403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814462
5032	NC_021810	TTGCGT	2	12	286406	286417	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	525814462
5033	NC_021810	CTG	2	6	286442	286447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814462
5034	NC_021810	GCC	2	6	286449	286454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814462
5035	NC_021810	T	6	6	286502	286507	0 %	100 %	0 %	0 %	525814462
5036	NC_021810	AGA	2	6	286679	286684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525814463
5037	NC_021810	AC	3	6	286687	286692	50 %	0 %	0 %	50 %	525814463
5038	NC_021810	GC	3	6	286786	286791	0 %	0 %	50 %	50 %	525814463
5039	NC_021810	ATG	2	6	286795	286800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814463
5040	NC_021810	GGAC	2	8	286832	286839	25 %	0 %	50 %	25 %	525814463
5041	NC_021810	GC	3	6	286899	286904	0 %	0 %	50 %	50 %	525814463
5042	NC_021810	CGC	2	6	286985	286990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814463
5043	NC_021810	CGC	2	6	287010	287015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814463
5044	NC_021810	TCG	2	6	287077	287082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814463
5045	NC_021810	CAA	2	6	287150	287155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525814463
5046	NC_021810	TGC	2	6	287164	287169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814463
5047	NC_021810	GAC	2	6	287208	287213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814463
5048	NC_021810	TCA	2	6	287243	287248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814463
5049	NC_021810	CGC	2	6	287253	287258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814463
5050	NC_021810	GAC	2	6	287422	287427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814464
5051	NC_021810	CGA	2	6	287437	287442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814464
5052	NC_021810	AC	3	6	287451	287456	50 %	0 %	0 %	50 %	525814464
5053	NC_021810	TGT	2	6	287463	287468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525814464
5054	NC_021810	TGC	2	6	287610	287615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814464
5055	NC_021810	ATG	2	6	287616	287621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814464
5056	NC_021810	TATCGC	2	12	287645	287656	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	525814464
5057	NC_021810	T	6	6	287707	287712	0 %	100 %	0 %	0 %	525814464
5058	NC_021810	CGG	2	6	287724	287729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814464
5059	NC_021810	GTATC	2	10	287737	287746	20 %	40 %	20 %	20 %	525814464
5060	NC_021810	GTC	2	6	287747	287752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814464
5061	NC_021810	GGC	2	6	287797	287802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814464
5062	NC_021810	CCCTT	2	10	287826	287835	0 %	40 %	0 %	60 %	525814464
5063	NC_021810	TGC	2	6	287838	287843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814464
5064	NC_021810	A	6	6	287885	287890	100 %	0 %	0 %	0 %	525814464
5065	NC_021810	CGC	2	6	287931	287936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814464
5066	NC_021810	CGAG	2	8	287955	287962	25 %	0 %	50 %	25 %	525814464
5067	NC_021810	ATG	2	6	288014	288019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814464
5068	NC_021810	CGC	2	6	288046	288051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814464
5069	NC_021810	CGA	2	6	288115	288120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814464
5070	NC_021810	GATC	2	8	288163	288170	25 %	25 %	25 %	25 %	525814464
5071	NC_021810	AAT	2	6	288224	288229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525814464
5072	NC_021810	ATC	2	6	288291	288296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814464
5073	NC_021810	GCA	2	6	288301	288306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814464
5074	NC_021810	CTG	2	6	288395	288400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814464
5075	NC_021810	CGT	2	6	288433	288438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814464
5076	NC_021810	CCGC	2	8	288532	288539	0 %	0 %	25 %	75 %	525814464
5077	NC_021810	CGTC	2	8	288580	288587	0 %	25 %	25 %	50 %	525814464
5078	NC_021810	CGC	2	6	288628	288633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814464
5079	NC_021810	GTA	2	6	288653	288658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814464
5080	NC_021810	A	6	6	288804	288809	100 %	0 %	0 %	0 %	525814465
5081	NC_021810	TCA	2	6	288881	288886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814465
5082	NC_021810	AGA	2	6	288926	288931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525814465
5083	NC_021810	GTG	2	6	288957	288962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525814465
5084	NC_021810	TGG	2	6	288981	288986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525814465
5085	NC_021810	GC	3	6	288991	288996	0 %	0 %	50 %	50 %	525814465
5086	NC_021810	A	7	7	289007	289013	100 %	0 %	0 %	0 %	525814465
5087	NC_021810	GAT	2	6	289020	289025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814465
5088	NC_021810	CGG	2	6	289103	289108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814465
5089	NC_021810	A	6	6	289122	289127	100 %	0 %	0 %	0 %	525814465
5090	NC_021810	GGCGTA	2	12	289194	289205	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	525814465
5091	NC_021810	ACG	2	6	289279	289284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814465
5092	NC_021810	ATT	2	6	289465	289470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525814466
5093	NC_021810	AGA	2	6	289485	289490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525814466
5094	NC_021810	TGG	2	6	289514	289519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525814466
5095	NC_021810	TGA	2	6	289568	289573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814466
5096	NC_021810	CAG	2	6	289898	289903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814467
5097	NC_021810	CAT	2	6	289910	289915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814467
5098	NC_021810	GGC	2	6	289963	289968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814467
5099	NC_021810	GTT	2	6	290068	290073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525814467
5100	NC_021810	CGCC	2	8	290080	290087	0 %	0 %	25 %	75 %	525814467
5101	NC_021810	TCT	2	6	290091	290096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814467
5102	NC_021810	GCG	2	6	290143	290148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814467
5103	NC_021810	TTC	2	6	290172	290177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814467
5104	NC_021810	GC	3	6	290182	290187	0 %	0 %	50 %	50 %	525814467
5105	NC_021810	GC	3	6	290206	290211	0 %	0 %	50 %	50 %	525814467
5106	NC_021810	AGC	2	6	290214	290219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814467
5107	NC_021810	TCG	2	6	290292	290297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814467
5108	NC_021810	CG	3	6	290428	290433	0 %	0 %	50 %	50 %	525814467
5109	NC_021810	CAC	2	6	290558	290563	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814467
5110	NC_021810	T	7	7	290564	290570	0 %	100 %	0 %	0 %	525814467
5111	NC_021810	GCG	2	6	290571	290576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814467
5112	NC_021810	CGC	2	6	290583	290588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814467
5113	NC_021810	GC	3	6	290590	290595	0 %	0 %	50 %	50 %	525814467
5114	NC_021810	GTT	2	6	290617	290622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525814467
5115	NC_021810	CCG	2	6	290623	290628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814467
5116	NC_021810	CAC	2	6	290669	290674	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814467
5117	NC_021810	CGA	2	6	290702	290707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814467
5118	NC_021810	CCG	2	6	290791	290796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814467
5119	NC_021810	CGC	2	6	290806	290811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814467
5120	NC_021810	C	7	7	290888	290894	0 %	0 %	0 %	100 %	525814467
5121	NC_021810	CGC	2	6	290938	290943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814467
5122	NC_021810	GCT	2	6	291085	291090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814467
5123	NC_021810	GA	3	6	291172	291177	50 %	0 %	50 %	0 %	525814467
5124	NC_021810	GAA	2	6	291197	291202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525814467
5125	NC_021810	CCCCA	2	10	291374	291383	20 %	0 %	0 %	80 %	525814467
5126	NC_021810	ACC	2	6	291389	291394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814467
5127	NC_021810	CCG	2	6	291426	291431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814467
5128	NC_021810	CCG	2	6	291460	291465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814467
5129	NC_021810	GGAT	2	8	291480	291487	25 %	25 %	50 %	0 %	525814467
5130	NC_021810	CGTC	2	8	291504	291511	0 %	25 %	25 %	50 %	525814467
5131	NC_021810	TAT	2	6	291592	291597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525814467
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5138	NC_021810	GCA	2	6	292075	292080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814468
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5142	NC_021810	CCG	2	6	292183	292188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814468
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5144	NC_021810	ATC	2	6	292221	292226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814468
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5147	NC_021810	CGAG	2	8	292280	292287	25 %	0 %	50 %	25 %	525814468
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5150	NC_021810	TGG	2	6	292658	292663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525814469
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5152	NC_021810	TC	3	6	292684	292689	0 %	50 %	0 %	50 %	525814469
5153	NC_021810	CAA	2	6	292777	292782	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525814469
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5155	NC_021810	GC	3	6	292896	292901	0 %	0 %	50 %	50 %	525814469
5156	NC_021810	GATCA	2	10	292978	292987	40 %	20 %	20 %	20 %	525814469
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5196	NC_021810	ACG	2	6	295314	295319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814472
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5203	NC_021810	TTG	2	6	295599	295604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525814472
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5227	NC_021810	TTA	2	6	296903	296908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525814474
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5231	NC_021810	CAA	2	6	297072	297077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525814474
5232	NC_021810	GCT	2	6	297131	297136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814474
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5235	NC_021810	AGATC	2	10	297203	297212	40 %	20 %	20 %	20 %	525814474
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5241	NC_021810	GCTG	2	8	297556	297563	0 %	25 %	50 %	25 %	525814474
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5243	NC_021810	TGT	2	6	297610	297615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525814474
5244	NC_021810	TCT	2	6	297706	297711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814474
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5351	NC_021810	A	7	7	304895	304901	100 %	0 %	0 %	0 %	525814482
5352	NC_021810	TGC	2	6	304980	304985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814482
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5356	NC_021810	CTG	2	6	305211	305216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814483
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5362	NC_021810	CGTT	2	8	305688	305695	0 %	50 %	25 %	25 %	525814484
5363	NC_021810	GAT	2	6	305716	305721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814484
5364	NC_021810	CTTT	2	8	305740	305747	0 %	75 %	0 %	25 %	525814484
5365	NC_021810	GC	3	6	305751	305756	0 %	0 %	50 %	50 %	525814484
5366	NC_021810	GTC	2	6	305849	305854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814484
5367	NC_021810	CTG	3	9	305942	305950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814484
5368	NC_021810	CGG	2	6	306061	306066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814484
5369	NC_021810	ATT	2	6	306074	306079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525814484
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5371	NC_021810	CTG	2	6	306155	306160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814484
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5373	NC_021810	GAT	2	6	306284	306289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814485
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5377	NC_021810	GTG	2	6	306434	306439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525814485
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5379	NC_021810	ATT	2	6	306479	306484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525814485
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5381	NC_021810	CCG	2	6	306621	306626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814485
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5384	NC_021810	CGT	2	6	306929	306934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814485
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5389	NC_021810	GCC	2	6	307292	307297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814485
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5392	NC_021810	ACG	2	6	307335	307340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814485
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5430	NC_021810	GC	3	6	309414	309419	0 %	0 %	50 %	50 %	525814486
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5442	NC_021810	GCGCCT	2	12	310043	310054	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	525814487
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5454	NC_021810	CTG	2	6	310761	310766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814487
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5457	NC_021810	GCCA	2	8	310792	310799	25 %	0 %	25 %	50 %	525814487
5458	NC_021810	TCA	2	6	310820	310825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814487
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5467	NC_021810	GC	3	6	311087	311092	0 %	0 %	50 %	50 %	525814487
5468	NC_021810	CAG	2	6	311106	311111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814487
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5471	NC_021810	AGCA	2	8	311202	311209	50 %	0 %	25 %	25 %	525814487
5472	NC_021810	GCC	2	6	311237	311242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814487
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5474	NC_021810	ATC	2	6	311349	311354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814487
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5477	NC_021810	AATT	2	8	311436	311443	50 %	50 %	0 %	0 %	525814487
5478	NC_021810	CAA	2	6	311489	311494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525814487
5479	NC_021810	TCG	2	6	311548	311553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814487
5480	NC_021810	GCA	2	6	311591	311596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814487
5481	NC_021810	GAC	2	6	311606	311611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814487
5482	NC_021810	GCA	2	6	311657	311662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814487
5483	NC_021810	GCAGC	2	10	311666	311675	20 %	0 %	40 %	40 %	525814487
5484	NC_021810	AACG	2	8	311698	311705	50 %	0 %	25 %	25 %	525814487
5485	NC_021810	CCG	2	6	311728	311733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814487
5486	NC_021810	CCGC	2	8	311779	311786	0 %	0 %	25 %	75 %	525814487
5487	NC_021810	TGT	2	6	311798	311803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525814487
5488	NC_021810	ATC	2	6	311836	311841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814487
5489	NC_021810	GCG	2	6	311886	311891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814487
5490	NC_021810	GCA	2	6	311906	311911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814487
5491	NC_021810	CGT	3	9	311936	311944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814487
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5494	NC_021810	A	6	6	312147	312152	100 %	0 %	0 %	0 %	525814487
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5498	NC_021810	CG	3	6	312350	312355	0 %	0 %	50 %	50 %	525814487
5499	NC_021810	TGT	2	6	312391	312396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525814487
5500	NC_021810	CCA	2	6	312413	312418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814487

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