MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. 41578

Total Repeats: 88435

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_021810	AG	3	6	259583	259588	50 %	0 %	50 %	0 %	525814435
4502	NC_021810	GT	3	6	259621	259626	0 %	50 %	50 %	0 %	525814435
4503	NC_021810	TGGAT	2	10	259696	259705	20 %	40 %	40 %	0 %	525814435
4504	NC_021810	GCG	2	6	259724	259729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814435
4505	NC_021810	TAG	2	6	259749	259754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814435
4506	NC_021810	TGC	2	6	259762	259767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814435
4507	NC_021810	ACG	2	6	259786	259791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814435
4508	NC_021810	TGA	2	6	259809	259814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814435
4509	NC_021810	TAT	2	6	259818	259823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525814435
4510	NC_021810	AAG	2	6	260051	260056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525814436
4511	NC_021810	GT	3	6	260188	260193	0 %	50 %	50 %	0 %	525814436
4512	NC_021810	CAGAA	2	10	260223	260232	60 %	0 %	20 %	20 %	525814436
4513	NC_021810	ATG	2	6	260242	260247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814436
4514	NC_021810	ATT	2	6	260302	260307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525814436
4515	NC_021810	TCA	2	6	260411	260416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814437
4516	NC_021810	GTT	2	6	260478	260483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525814437
4517	NC_021810	CTG	2	6	260509	260514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814437
4518	NC_021810	TCC	2	6	260531	260536	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525814437
4519	NC_021810	GCC	2	6	260558	260563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814437
4520	NC_021810	GCG	2	6	260585	260590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814437
4521	NC_021810	TTG	2	6	260593	260598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525814437
4522	NC_021810	CGCCA	2	10	260623	260632	20 %	0 %	20 %	60 %	525814437
4523	NC_021810	TTC	2	6	260656	260661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814437
4524	NC_021810	TCG	2	6	260688	260693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814437
4525	NC_021810	CGC	2	6	260706	260711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814437
4526	NC_021810	TCG	2	6	260727	260732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814437
4527	NC_021810	GC	3	6	260754	260759	0 %	0 %	50 %	50 %	525814437
4528	NC_021810	TTTC	2	8	260802	260809	0 %	75 %	0 %	25 %	525814437
4529	NC_021810	GCC	2	6	260810	260815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814437
4530	NC_021810	ACC	2	6	260855	260860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814437
4531	NC_021810	GTA	2	6	260954	260959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814437
4532	NC_021810	CTG	2	6	260971	260976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814437
4533	NC_021810	GGC	2	6	261052	261057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814437
4534	NC_021810	GGC	2	6	261130	261135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814437
4535	NC_021810	CAGCG	2	10	261145	261154	20 %	0 %	40 %	40 %	525814437
4536	NC_021810	TTC	2	6	261160	261165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814437
4537	NC_021810	AG	3	6	261175	261180	50 %	0 %	50 %	0 %	525814437
4538	NC_021810	TTA	2	6	261185	261190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525814437
4539	NC_021810	CGCGC	2	10	261208	261217	0 %	0 %	40 %	60 %	525814437
4540	NC_021810	CG	3	6	261277	261282	0 %	0 %	50 %	50 %	525814437
4541	NC_021810	GGCT	2	8	261332	261339	0 %	25 %	50 %	25 %	525814437
4542	NC_021810	TTG	2	6	261367	261372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525814437
4543	NC_021810	CAT	2	6	261397	261402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814437
4544	NC_021810	CCG	2	6	261453	261458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814437
4545	NC_021810	CG	3	6	261565	261570	0 %	0 %	50 %	50 %	525814437
4546	NC_021810	TGC	2	6	261626	261631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814437
4547	NC_021810	ACG	2	6	261650	261655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814437
4548	NC_021810	TCC	2	6	261740	261745	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525814437
4549	NC_021810	CGGG	2	8	261776	261783	0 %	0 %	75 %	25 %	525814437
4550	NC_021810	GCC	3	9	261799	261807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814437
4551	NC_021810	CATC	2	8	261816	261823	25 %	25 %	0 %	50 %	525814437
4552	NC_021810	TTCC	2	8	261915	261922	0 %	50 %	0 %	50 %	525814437
4553	NC_021810	ACCCC	2	10	261954	261963	20 %	0 %	0 %	80 %	525814437
4554	NC_021810	A	6	6	261978	261983	100 %	0 %	0 %	0 %	525814437
4555	NC_021810	GCA	2	6	262026	262031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814437
4556	NC_021810	GATG	2	8	262410	262417	25 %	25 %	50 %	0 %	525814438
4557	NC_021810	GCC	2	6	262508	262513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814438
4558	NC_021810	T	6	6	262520	262525	0 %	100 %	0 %	0 %	525814438
4559	NC_021810	CCAG	2	8	262548	262555	25 %	0 %	25 %	50 %	525814438
4560	NC_021810	GA	3	6	262590	262595	50 %	0 %	50 %	0 %	525814438
4561	NC_021810	CCG	2	6	262637	262642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814438
4562	NC_021810	AG	3	6	262768	262773	50 %	0 %	50 %	0 %	525814438
4563	NC_021810	AGC	2	6	262793	262798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814438
4564	NC_021810	TACAT	2	10	262811	262820	40 %	40 %	0 %	20 %	525814438
4565	NC_021810	CTT	2	6	263066	263071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814439
4566	NC_021810	ACG	2	6	263117	263122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814439
4567	NC_021810	AAT	2	6	263133	263138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525814439
4568	NC_021810	TTCA	2	8	263147	263154	25 %	50 %	0 %	25 %	525814439
4569	NC_021810	GTCATT	2	12	263160	263171	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	525814439
4570	NC_021810	AT	3	6	263199	263204	50 %	50 %	0 %	0 %	525814439
4571	NC_021810	CCA	2	6	263319	263324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814439
4572	NC_021810	T	6	6	263330	263335	0 %	100 %	0 %	0 %	525814439
4573	NC_021810	ATA	2	6	263385	263390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525814439
4574	NC_021810	A	6	6	263398	263403	100 %	0 %	0 %	0 %	525814439
4575	NC_021810	CGC	2	6	263560	263565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814440
4576	NC_021810	TAT	2	6	263677	263682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525814440
4577	NC_021810	GAA	2	6	263685	263690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525814440
4578	NC_021810	TG	3	6	263721	263726	0 %	50 %	50 %	0 %	525814440
4579	NC_021810	TTAAT	2	10	263857	263866	40 %	60 %	0 %	0 %	525814440
4580	NC_021810	AAG	2	6	263918	263923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525814440
4581	NC_021810	TGA	2	6	263967	263972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814441
4582	NC_021810	AGG	2	6	264041	264046	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525814441
4583	NC_021810	CGG	2	6	264059	264064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814441
4584	NC_021810	CGA	2	6	264091	264096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814441
4585	NC_021810	GA	3	6	264095	264100	50 %	0 %	50 %	0 %	525814441
4586	NC_021810	TAT	2	6	264150	264155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525814441
4587	NC_021810	AGC	2	6	264158	264163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814441
4588	NC_021810	GCA	2	6	264210	264215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814441
4589	NC_021810	CTG	2	6	264217	264222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814441
4590	NC_021810	CAC	2	6	264291	264296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814441
4591	NC_021810	A	6	6	264554	264559	100 %	0 %	0 %	0 %	525814442
4592	NC_021810	GC	3	6	264627	264632	0 %	0 %	50 %	50 %	525814442
4593	NC_021810	CG	3	6	264648	264653	0 %	0 %	50 %	50 %	525814442
4594	NC_021810	GAA	2	6	264691	264696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525814442
4595	NC_021810	CAG	2	6	264706	264711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814442
4596	NC_021810	GAG	2	6	264727	264732	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525814442
4597	NC_021810	CGA	2	6	264771	264776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814442
4598	NC_021810	GGGC	2	8	264819	264826	0 %	0 %	75 %	25 %	525814442
4599	NC_021810	AAAC	2	8	264853	264860	75 %	0 %	0 %	25 %	525814442
4600	NC_021810	GCT	2	6	264960	264965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814442
4601	NC_021810	TAT	2	6	264981	264986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525814442
4602	NC_021810	ACG	2	6	264988	264993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814442
4603	NC_021810	CTG	2	6	265027	265032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814442
4604	NC_021810	GGC	2	6	265050	265055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814442
4605	NC_021810	CGG	2	6	265158	265163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814442
4606	NC_021810	CAG	2	6	265195	265200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814442
4607	NC_021810	GGCC	2	8	265215	265222	0 %	0 %	50 %	50 %	525814442
4608	NC_021810	GTTAC	2	10	265274	265283	20 %	40 %	20 %	20 %	525814442
4609	NC_021810	GCG	2	6	265304	265309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814442
4610	NC_021810	TTTCGC	2	12	265442	265453	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	525814443
4611	NC_021810	GACCA	2	10	265466	265475	40 %	0 %	20 %	40 %	525814443
4612	NC_021810	GCA	2	6	265498	265503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814443
4613	NC_021810	TCA	2	6	265516	265521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814443
4614	NC_021810	CG	3	6	265547	265552	0 %	0 %	50 %	50 %	525814443
4615	NC_021810	GAA	2	6	265553	265558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525814443
4616	NC_021810	GTA	2	6	265563	265568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814443
4617	NC_021810	ATC	2	6	265605	265610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814443
4618	NC_021810	ATC	2	6	265613	265618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814443
4619	NC_021810	GCG	2	6	265747	265752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814443
4620	NC_021810	CCA	2	6	265756	265761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814443
4621	NC_021810	CAG	2	6	265772	265777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814443
4622	NC_021810	TACCC	2	10	265872	265881	20 %	20 %	0 %	60 %	525814444
4623	NC_021810	GCGCG	2	10	265891	265900	0 %	0 %	60 %	40 %	525814444
4624	NC_021810	GCA	3	9	265948	265956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814444
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4626	NC_021810	TGT	2	6	266017	266022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525814444
4627	NC_021810	GAC	2	6	266027	266032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814444
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4631	NC_021810	CGA	2	6	266176	266181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814444
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4635	NC_021810	TGA	2	6	266341	266346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814444
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4653	NC_021810	GGC	2	6	267082	267087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814446
4654	NC_021810	GC	3	6	267095	267100	0 %	0 %	50 %	50 %	525814446
4655	NC_021810	GCG	2	6	267110	267115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814446
4656	NC_021810	CGG	3	9	267116	267124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814446
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4737	NC_021810	ATCG	2	8	271392	271399	25 %	25 %	25 %	25 %	525814450
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4741	NC_021810	A	6	6	271547	271552	100 %	0 %	0 %	0 %	525814450
4742	NC_021810	GCG	2	6	271842	271847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814450
4743	NC_021810	CGCC	2	8	271902	271909	0 %	0 %	25 %	75 %	525814450
4744	NC_021810	GTC	2	6	271946	271951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814450
4745	NC_021810	CGG	2	6	272086	272091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814450
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4747	NC_021810	CGC	2	6	272351	272356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814451
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4752	NC_021810	CGGT	2	8	272470	272477	0 %	25 %	50 %	25 %	525814451
4753	NC_021810	TGC	2	6	272510	272515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814451
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4764	NC_021810	CTG	2	6	272916	272921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814451
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4776	NC_021810	GCT	2	6	273308	273313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814451
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4861	NC_021810	GCA	2	6	278254	278259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814455
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4863	NC_021810	TGT	2	6	278329	278334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525814455
4864	NC_021810	TGA	2	6	278380	278385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814455
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4866	NC_021810	TGC	2	6	278528	278533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814456
4867	NC_021810	TAT	2	6	278536	278541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525814456
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4885	NC_021810	AT	3	6	278990	278995	50 %	50 %	0 %	0 %	525814457
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4983	NC_021810	T	6	6	284100	284105	0 %	100 %	0 %	0 %	525814460
4984	NC_021810	GGT	2	6	284113	284118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525814460
4985	NC_021810	TCA	2	6	284133	284138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814460
4986	NC_021810	CCA	2	6	284223	284228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814460
4987	NC_021810	T	6	6	284236	284241	0 %	100 %	0 %	0 %	525814460
4988	NC_021810	GCA	2	6	284255	284260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814460
4989	NC_021810	TCT	2	6	284324	284329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814460
4990	NC_021810	CG	3	6	284341	284346	0 %	0 %	50 %	50 %	525814460
4991	NC_021810	CCCG	2	8	284361	284368	0 %	0 %	25 %	75 %	525814460
4992	NC_021810	TCGG	2	8	284417	284424	0 %	25 %	50 %	25 %	525814460
4993	NC_021810	CGT	2	6	284464	284469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814460
4994	NC_021810	GCT	2	6	284475	284480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814460
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4998	NC_021810	CAG	2	6	284572	284577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814460
4999	NC_021810	CCG	2	6	284646	284651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814460
5000	NC_021810	CAG	2	6	284674	284679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814460

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