MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pyogenes HSC5

Total Repeats: 32159

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_021807	CAT	2	6	98202	98207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525809043
1502	NC_021807	GCT	2	6	98275	98280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525809043
1503	NC_021807	TCA	2	6	98326	98331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525809043
1504	NC_021807	ATG	2	6	98393	98398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525809043
1505	NC_021807	CAC	2	6	98461	98466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525809043
1506	NC_021807	TGA	2	6	98472	98477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525809043
1507	NC_021807	TGG	2	6	98532	98537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525809043
1508	NC_021807	TGG	2	6	98550	98555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525809043
1509	NC_021807	TTC	2	6	98612	98617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525809043
1510	NC_021807	GAT	2	6	98782	98787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525809043
1511	NC_021807	TGA	2	6	98811	98816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525809043
1512	NC_021807	GAT	2	6	98827	98832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525809043
1513	NC_021807	AAG	2	6	98888	98893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525809043
1514	NC_021807	A	6	6	99094	99099	100 %	0 %	0 %	0 %	525809044
1515	NC_021807	CAA	2	6	99170	99175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525809044
1516	NC_021807	CGT	2	6	99271	99276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525809044
1517	NC_021807	GAA	2	6	99385	99390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525809044
1518	NC_021807	ATT	2	6	99453	99458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525809044
1519	NC_021807	AGA	2	6	99588	99593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525809044
1520	NC_021807	TCG	2	6	99633	99638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525809044
1521	NC_021807	ATGG	2	8	99684	99691	25 %	25 %	50 %	0 %	525809044
1522	NC_021807	CCA	2	6	99715	99720	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525809044
1523	NC_021807	TGG	2	6	99747	99752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525809044
1524	NC_021807	CGT	2	6	99787	99792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525809044
1525	NC_021807	AAC	2	6	99805	99810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525809044
1526	NC_021807	CAT	2	6	99846	99851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525809044
1527	NC_021807	AAG	2	6	99878	99883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525809044
1528	NC_021807	TGAT	2	8	99896	99903	25 %	50 %	25 %	0 %	525809044
1529	NC_021807	GTC	2	6	99908	99913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525809044
1530	NC_021807	GTC	2	6	99917	99922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525809044
1531	NC_021807	GTC	2	6	99941	99946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525809044
1532	NC_021807	CTTG	2	8	100002	100009	0 %	50 %	25 %	25 %	525809044
1533	NC_021807	TTG	2	6	100133	100138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525809044
1534	NC_021807	CGA	2	6	100191	100196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525809044
1535	NC_021807	AGA	2	6	100215	100220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525809044
1536	NC_021807	TG	4	8	100335	100342	0 %	50 %	50 %	0 %	525809044
1537	NC_021807	AGA	2	6	100398	100403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525809044
1538	NC_021807	TGCT	2	8	100430	100437	0 %	50 %	25 %	25 %	525809044
1539	NC_021807	GTT	2	6	100474	100479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525809044
1540	NC_021807	ACT	2	6	100508	100513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525809044
1541	NC_021807	CGAAGG	2	12	100539	100550	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	525809044
1542	NC_021807	CAAA	2	8	100646	100653	75 %	0 %	0 %	25 %	525809044
1543	NC_021807	CCTT	2	8	100734	100741	0 %	50 %	0 %	50 %	525809044
1544	NC_021807	AAG	2	6	100820	100825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525809044
1545	NC_021807	TGAT	2	8	100826	100833	25 %	50 %	25 %	0 %	525809044
1546	NC_021807	AAG	2	6	100858	100863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525809044
1547	NC_021807	CAT	2	6	100878	100883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525809044
1548	NC_021807	ACA	2	6	100909	100914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525809044
1549	NC_021807	CCTT	2	8	100925	100932	0 %	50 %	0 %	50 %	525809044
1550	NC_021807	TAC	2	6	100954	100959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525809044
1551	NC_021807	TGC	2	6	101034	101039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525809044
1552	NC_021807	GAA	2	6	101053	101058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525809044
1553	NC_021807	CGT	2	6	101074	101079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525809044
1554	NC_021807	TGA	2	6	101084	101089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525809044
1555	NC_021807	GAT	2	6	101092	101097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525809044
1556	NC_021807	ACA	3	9	101116	101124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525809044
1557	NC_021807	AAG	2	6	101138	101143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525809044
1558	NC_021807	ATG	3	9	101194	101202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525809044
1559	NC_021807	GCT	2	6	101266	101271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525809044
1560	NC_021807	CAT	2	6	101283	101288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525809044
1561	NC_021807	TTC	2	6	101341	101346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525809044
1562	NC_021807	TCG	2	6	101415	101420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525809044
1563	NC_021807	TCT	2	6	101481	101486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525809044
1564	NC_021807	AAG	2	6	101510	101515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525809044
1565	NC_021807	AC	3	6	101552	101557	50 %	0 %	0 %	50 %	525809044
1566	NC_021807	TTG	2	6	101639	101644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525809044
1567	NC_021807	GAA	2	6	101656	101661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525809044
1568	NC_021807	TGC	2	6	101778	101783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525809044
1569	NC_021807	GTG	2	6	101837	101842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525809044
1570	NC_021807	CA	3	6	101862	101867	50 %	0 %	0 %	50 %	525809044
1571	NC_021807	TGT	2	6	101946	101951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525809044
1572	NC_021807	GAA	2	6	101959	101964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525809044
1573	NC_021807	CGA	2	6	102063	102068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525809044
1574	NC_021807	CTT	2	6	102157	102162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525809044
1575	NC_021807	CCT	2	6	102279	102284	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525809044
1576	NC_021807	TGG	2	6	102345	102350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525809044
1577	NC_021807	CTT	2	6	102414	102419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525809044
1578	NC_021807	AAC	2	6	102441	102446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525809044
1579	NC_021807	TGC	2	6	102462	102467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525809044
1580	NC_021807	AAGA	2	8	102478	102485	75 %	0 %	25 %	0 %	525809044
1581	NC_021807	ACTT	2	8	102488	102495	25 %	50 %	0 %	25 %	525809044
1582	NC_021807	CTGGTA	2	12	102536	102547	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525809044
1583	NC_021807	GC	3	6	102550	102555	0 %	0 %	50 %	50 %	525809044
1584	NC_021807	ATGA	2	8	102580	102587	50 %	25 %	25 %	0 %	525809044
1585	NC_021807	TGAT	2	8	102596	102603	25 %	50 %	25 %	0 %	525809044
1586	NC_021807	CAG	2	6	102617	102622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525809044
1587	NC_021807	CAG	2	6	102635	102640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525809044
1588	NC_021807	AAT	2	6	102647	102652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525809044
1589	NC_021807	TGG	2	6	102842	102847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525809045
1590	NC_021807	GATG	2	8	102854	102861	25 %	25 %	50 %	0 %	525809045
1591	NC_021807	CAA	2	6	102884	102889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525809045
1592	NC_021807	AAG	2	6	102903	102908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525809045
1593	NC_021807	ATT	2	6	102915	102920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525809045
1594	NC_021807	AGA	2	6	103003	103008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525809045
1595	NC_021807	CAG	2	6	103043	103048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525809045
1596	NC_021807	AAT	2	6	103094	103099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525809045
1597	NC_021807	AAC	2	6	103116	103121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525809045
1598	NC_021807	CAC	2	6	103131	103136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525809045
1599	NC_021807	ATATTT	2	12	103319	103330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525810418
1600	NC_021807	T	7	7	103355	103361	0 %	100 %	0 %	0 %	525810418
1601	NC_021807	CTC	2	6	103415	103420	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525810418
1602	NC_021807	TTA	2	6	103421	103426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525810418
1603	NC_021807	TCA	3	9	103584	103592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525810418
1604	NC_021807	ATT	2	6	103607	103612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525810418
1605	NC_021807	TATT	2	8	103663	103670	25 %	75 %	0 %	0 %	525810418
1606	NC_021807	ATC	2	6	103727	103732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525810418
1607	NC_021807	AAG	2	6	103733	103738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525810418
1608	NC_021807	TTA	2	6	103745	103750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525810418
1609	NC_021807	AGA	2	6	103755	103760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525810418
1610	NC_021807	ATG	2	6	103805	103810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525810418
1611	NC_021807	TTA	2	6	103913	103918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525810418
1612	NC_021807	T	6	6	103943	103948	0 %	100 %	0 %	0 %	525810418
1613	NC_021807	GGA	2	6	104065	104070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525810418
1614	NC_021807	ATTG	2	8	104073	104080	25 %	50 %	25 %	0 %	525810418
1615	NC_021807	ATT	2	6	104105	104110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525810418
1616	NC_021807	CAA	2	6	104128	104133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525810418
1617	NC_021807	CTT	2	6	104143	104148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525810418
1618	NC_021807	CAAG	2	8	104169	104176	50 %	0 %	25 %	25 %	525810418
1619	NC_021807	A	6	6	104186	104191	100 %	0 %	0 %	0 %	525810418
1620	NC_021807	ATTC	2	8	104215	104222	25 %	50 %	0 %	25 %	525809046
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1622	NC_021807	AAG	2	6	104284	104289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525809046
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1992	NC_021807	CCA	2	6	124268	124273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525810426
1993	NC_021807	CTCA	2	8	124302	124309	25 %	25 %	0 %	50 %	525810426
1994	NC_021807	GAA	2	6	124373	124378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525810426
1995	NC_021807	TTA	2	6	124393	124398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525810426
1996	NC_021807	ATCA	2	8	124412	124419	50 %	25 %	0 %	25 %	525810426
1997	NC_021807	A	7	7	124464	124470	100 %	0 %	0 %	0 %	525810426
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1999	NC_021807	ATT	2	6	124501	124506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525810427
2000	NC_021807	CTT	2	6	124545	124550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525810427

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