MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus aureus CA-347

Total Repeats: 1303

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021554	GTTGAA	2	12	3218	3229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514064968
2	NC_021554	TGGCGG	2	12	5397	5408	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	514064971
3	NC_021554	GTTATC	2	12	7325	7336	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	514064972
4	NC_021554	CAGATA	2	12	8234	8245	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	514064972
5	NC_021554	CAAGCT	2	12	8293	8304	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	514064972
6	NC_021554	GTAATG	2	12	9281	9292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514064972
7	NC_021554	ACAATT	2	12	11281	11292	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	514064974
8	NC_021554	TAGCAT	2	12	11376	11387	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	514064974
9	NC_021554	GCTTTA	2	12	17467	17478	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	514064979
10	NC_021554	TTTGAA	2	12	18288	18299	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	514064979
11	NC_021554	TAAAGG	2	12	20335	20346	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	514064981
12	NC_021554	TTGAAG	2	12	20532	20543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514064981
13	NC_021554	TGATTG	2	12	21736	21747	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	514064982
14	NC_021554	AAGGAA	2	12	22505	22516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514064983
15	NC_021554	TGAATT	2	12	25420	25431	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	514064984
16	NC_021554	ATTTCA	2	12	27904	27915	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	514064986
17	NC_021554	GTTCTG	2	12	29203	29214	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	514064987
18	NC_021554	AAAAGA	2	12	33842	33853	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	514064991
19	NC_021554	ACATCT	2	12	35496	35507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514064992
20	NC_021554	GTTTAA	2	12	36639	36650	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	514064994
21	NC_021554	ATTTAT	2	12	37485	37496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514064996
22	NC_021554	GTTTAA	2	12	41985	41996	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	514065000
23	NC_021554	AATGAA	2	12	43915	43926	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	514065002
24	NC_021554	ACAACT	2	12	45980	45991	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	514065003
25	NC_021554	TTTTCT	2	12	56839	56850	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	514065015
26	NC_021554	AATTAA	2	12	57029	57040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514065015
27	NC_021554	GGCATG	2	12	57660	57671	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	514065016
28	NC_021554	TAAAAA	2	12	58822	58833	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	514065016
29	NC_021554	CATTAA	2	12	59458	59469	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	514065017
30	NC_021554	ATAAGA	2	12	71567	71578	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	514065031
31	NC_021554	AAATAA	2	12	73232	73243	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	514065033
32	NC_021554	TTTAAT	2	12	84299	84310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514065040
33	NC_021554	TTAAAA	2	12	92126	92137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514065045
34	NC_021554	CCAAAC	2	12	95444	95455	50 %	0 %	0 %	50 %	514065051
35	NC_021554	TATAGA	2	12	97925	97936	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	514065053
36	NC_021554	ACCCTT	2	12	98814	98825	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	514065054
37	NC_021554	GTAGTC	2	12	101256	101267	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	514065056
38	NC_021554	TCACCA	2	12	102671	102682	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	514065058
39	NC_021554	ATTAAA	2	12	103412	103423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514065059
40	NC_021554	TAAATG	2	12	106937	106948	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	514065061
41	NC_021554	TCAAAA	2	12	109796	109807	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	514065065
42	NC_021554	GATGTC	2	12	112523	112534	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	514065068
43	NC_021554	TTTAGC	2	12	113749	113760	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	514065069
44	NC_021554	AAATAA	2	12	113800	113811	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	514065069
45	NC_021554	TTTTAA	2	12	117117	117128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514065073
46	NC_021554	GCTAAA	2	12	118349	118360	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	514065074
47	NC_021554	GTAGAA	2	12	122204	122215	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	514065077
48	NC_021554	AACCAC	2	12	123039	123050	50 %	0 %	0 %	50 %	514065077
49	NC_021554	AACCGA	2	12	126352	126363	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	514065079
50	NC_021554	AGCAAA	2	12	130813	130824	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	514065082
51	NC_021554	ATAGAT	2	12	131253	131264	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	514065082
52	NC_021554	TATCAT	2	12	132020	132031	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	514065083
53	NC_021554	TTTATT	2	12	132428	132439	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	514065084
54	NC_021554	TATTTG	2	12	132514	132525	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	514065084
55	NC_021554	TAAATA	2	12	133947	133958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514065084
56	NC_021554	TTTTTC	2	12	135765	135776	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	514065085
57	NC_021554	TAAGCC	2	12	137626	137637	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	514065087
58	NC_021554	TTTGAA	2	12	139872	139883	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	514065089
59	NC_021554	TGAAGA	2	12	149664	149675	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	514065096
60	NC_021554	TTTCAT	2	12	150345	150356	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	514065097
61	NC_021554	CATGAA	2	12	151961	151972	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	514065099
62	NC_021554	TGTTTA	2	12	155504	155515	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	514065103
63	NC_021554	TCGAAA	2	12	157016	157027	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	514065105
64	NC_021554	CTATTG	2	12	159602	159613	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	514065107
65	NC_021554	CATATG	2	12	160805	160816	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	514065108
66	NC_021554	CAGATT	2	12	166448	166459	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	514065113
67	NC_021554	AGATAT	2	12	173847	173858	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	514065120
68	NC_021554	GATATG	2	12	181303	181314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514065126
69	NC_021554	ATTTGA	2	12	185209	185220	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	514065129
70	NC_021554	ACAAAG	2	12	194423	194434	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	514065139
71	NC_021554	TGTAAT	2	12	195447	195458	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	514065140
72	NC_021554	AAAGAT	2	12	196436	196447	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	514065142
73	NC_021554	CAATAT	2	12	198907	198918	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	514065144
74	NC_021554	AATTAG	2	12	201636	201647	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	514065148
75	NC_021554	TTGGTA	2	12	202763	202774	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	514065149
76	NC_021554	GCGATT	2	12	202783	202794	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	514065149
77	NC_021554	AAATTT	2	12	202881	202892	50 %	50 %	0 %	0 %	514065149
78	NC_021554	CTATTA	2	12	208916	208927	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	514065152
79	NC_021554	TATGAT	2	12	210450	210461	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	514065152
80	NC_021554	ATTGAA	2	12	210901	210912	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	514065152
81	NC_021554	ATTTGC	2	12	216949	216960	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	514065156
82	NC_021554	CACCTT	2	12	218905	218916	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	514065158
83	NC_021554	CCTTTA	2	12	219411	219422	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	514065158
84	NC_021554	GTAAAT	2	12	223649	223660	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	514065161
85	NC_021554	ATTTTA	2	12	225243	225254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514065163
86	NC_021554	TATCTT	2	12	229857	229868	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	514065166
87	NC_021554	ATTTGG	2	12	230870	230881	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	514065167
88	NC_021554	CCCTGA	2	12	236724	236735	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	514065170
89	NC_021554	TCCTGA	2	12	237543	237554	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	514065170
90	NC_021554	TCAATT	2	12	239694	239705	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	514065172
91	NC_021554	AATATG	2	12	240994	241005	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	514065173
92	NC_021554	AAAAAT	2	12	244501	244512	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	514065175
93	NC_021554	AAAGGA	2	12	246362	246373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514065177
94	NC_021554	ACATTT	2	12	246700	246711	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	514065177
95	NC_021554	TTCTTG	2	12	251631	251642	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	514065181
96	NC_021554	GGACGT	2	12	262326	262337	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	514065190
97	NC_021554	CATAAA	2	12	268436	268447	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	514065195
98	NC_021554	AAAACT	2	12	268511	268522	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	514065195
99	NC_021554	AACGCA	2	12	279196	279207	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	514065202
100	NC_021554	TGGTAT	2	12	294868	294879	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	514065216
101	NC_021554	TATAGA	2	12	298222	298233	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	514065220
102	NC_021554	ACGATG	2	12	304851	304862	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	514065225
103	NC_021554	AGAATC	2	12	312410	312421	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	514065230
104	NC_021554	ATAAAG	2	12	316812	316823	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	514065236
105	NC_021554	GACATT	2	12	318479	318490	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	514065237
106	NC_021554	GATTTC	2	12	320298	320309	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	514065239
107	NC_021554	TTCATA	2	12	320868	320879	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	514065240
108	NC_021554	GATTAT	2	12	324859	324870	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	514065244
109	NC_021554	ATGGTG	2	12	324992	325003	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	514065244
110	NC_021554	CAGCAA	2	12	325379	325390	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	514065244
111	NC_021554	TCTTCA	2	12	330958	330969	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	514065249
112	NC_021554	TTATCT	2	12	331054	331065	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	514065249
113	NC_021554	TTATTT	2	12	332124	332135	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	514065250
114	NC_021554	CTAAAG	2	12	333519	333530	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	514065252
115	NC_021554	GAAAAA	2	12	334673	334684	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	514065254
116	NC_021554	GATACA	2	12	335838	335849	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	514065254
117	NC_021554	TAATTA	2	12	338165	338176	50 %	50 %	0 %	0 %	514065256
118	NC_021554	ACAAGA	2	12	339005	339016	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	514065257
119	NC_021554	AGGACA	2	12	339383	339394	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	514065257
120	NC_021554	ATTATC	2	12	340693	340704	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	514065258
121	NC_021554	TAAATT	2	12	342233	342244	50 %	50 %	0 %	0 %	514065258
122	NC_021554	TGAAGA	2	12	342494	342505	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	514065258
123	NC_021554	TATAAA	2	12	348184	348195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514065264
124	NC_021554	TAAAAC	2	12	348949	348960	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	514065265
125	NC_021554	TAAAGA	2	12	351526	351537	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	514065269
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127	NC_021554	CTGAAT	2	12	359587	359598	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	514065282
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138	NC_021554	TGCAAT	2	12	386983	386994	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	514065307
139	NC_021554	AATTTT	2	12	390426	390437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514065310
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141	NC_021554	TTTAAA	2	12	402012	402023	50 %	50 %	0 %	0 %	514065321
142	NC_021554	AAGTAC	2	12	403213	403224	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	514065324
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145	NC_021554	AGGACA	2	12	408419	408430	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	514065330
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147	NC_021554	GCAAAA	2	12	415279	415290	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	514065335
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149	NC_021554	TGCAAA	2	12	421770	421781	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	514065343
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187	NC_021554	CAAGAA	2	12	514712	514723	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	514065436
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213	NC_021554	AATGTT	2	12	578096	578107	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	514065485
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217	NC_021554	GCTGAA	2	12	587667	587678	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	514065497
218	NC_021554	AGCTAA	2	12	588002	588013	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	514065497
219	NC_021554	CAGTAG	2	12	589031	589042	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	514065499
220	NC_021554	ACGATG	2	12	593274	593285	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	514065501
221	NC_021554	GTTTAG	2	12	593697	593708	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	514065501
222	NC_021554	AAGTTG	2	12	596722	596733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514065502
223	NC_021554	CTGGTA	2	12	597505	597516	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	514065502
224	NC_021554	TTGTAC	2	12	598362	598373	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	514065504
225	NC_021554	ACGACT	2	12	599229	599240	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	514065506
226	NC_021554	AACGTG	2	12	600202	600213	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	514065506
227	NC_021554	TTCGAA	2	12	600723	600734	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	514065506
228	NC_021554	TACAGC	2	12	602971	602982	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	514065508
229	NC_021554	TTGCTA	2	12	603252	603263	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	514065508
230	NC_021554	AAATCA	2	12	604375	604386	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	514065509
231	NC_021554	TGATGT	2	12	605973	605984	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	514065510
232	NC_021554	TTATGA	2	12	609980	609991	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	514065513
233	NC_021554	GAAGGT	2	12	610260	610271	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	514065513
234	NC_021554	TTTCTT	2	12	613176	613187	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	514065516
235	NC_021554	AAGCAC	2	12	614104	614115	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	514065518
236	NC_021554	ATATTG	2	12	616399	616410	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	514065520
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240	NC_021554	GATTCA	2	12	618054	618065	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	514065520
241	NC_021554	GACTCA	2	12	618090	618101	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	514065520
242	NC_021554	GATTCA	2	12	618108	618119	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	514065520
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251	NC_021554	TCAGAC	2	12	618363	618374	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	514065520
252	NC_021554	GATTCA	2	12	618396	618407	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	514065520
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259	NC_021554	GACTCA	2	12	622406	622417	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	514065521
260	NC_021554	TCAGAT	2	12	622493	622504	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	514065521
261	NC_021554	GATTCA	2	12	622526	622537	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	514065521
262	NC_021554	GATTCA	2	12	622544	622555	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	514065521
263	NC_021554	GACTCA	2	12	622562	622573	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	514065521
264	NC_021554	TCAGAC	2	12	622583	622594	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	514065521
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299	NC_021554	TCAGAT	2	12	626973	626984	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	514065522
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324	NC_021554	GTCAAC	2	12	704306	704317	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	514065600
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326	NC_021554	TTTGCA	2	12	705191	705202	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	514065601
327	NC_021554	CAATTA	2	12	710179	710190	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	514065605
328	NC_021554	GTAGCA	2	12	710442	710453	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	514065605
329	NC_021554	TGGTGA	2	12	712023	712034	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	514065607
330	NC_021554	AACATT	2	12	714692	714703	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	514065611
331	NC_021554	ATAAAG	2	12	719710	719721	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	514065617
332	NC_021554	AATGAA	2	12	721138	721149	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	514065618
333	NC_021554	TTATAA	2	12	722372	722383	50 %	50 %	0 %	0 %	514065619
334	NC_021554	CATTGC	2	12	726409	726420	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	514065622
335	NC_021554	GTAAAA	2	12	728679	728690	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	514065624
336	NC_021554	ATTTAT	2	12	731139	731150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514065625
337	NC_021554	AATTGA	2	12	731218	731229	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	514065625
338	NC_021554	AGATGT	2	12	731870	731881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514065626
339	NC_021554	ATATTT	2	12	732750	732761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514065628
340	NC_021554	AGATGA	2	12	733319	733330	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	514065629
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342	NC_021554	CTTAAT	2	12	737377	737388	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	514065633
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455	NC_021554	TTCAGT	2	12	921475	921486	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	514065816
456	NC_021554	ATGCAA	2	12	939011	939022	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	514065829
457	NC_021554	TTAAAT	2	12	939129	939140	50 %	50 %	0 %	0 %	514065829
458	NC_021554	ACTAGA	2	12	942232	942243	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	514065830
459	NC_021554	TTACAT	2	12	944650	944661	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	514065832
460	NC_021554	TTGCAC	2	12	946314	946325	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	514065833
461	NC_021554	ATACAG	2	12	946386	946397	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	514065833
462	NC_021554	CGACTA	2	12	946644	946655	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	514065833
463	NC_021554	TGAAAG	2	12	950679	950690	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	514065837
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467	NC_021554	ATTTAG	2	12	955277	955288	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	514065840
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