MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus CA-347

Total Repeats: 55959

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_021554	TAA	2	6	249646	249651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514065180
5002	NC_021554	T	6	6	249674	249679	0 %	100 %	0 %	0 %	514065180
5003	NC_021554	TCA	2	6	249687	249692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514065180
5004	NC_021554	TAT	2	6	249799	249804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514065180
5005	NC_021554	TACT	2	8	249950	249957	25 %	50 %	0 %	25 %	514065180
5006	NC_021554	AC	3	6	250063	250068	50 %	0 %	0 %	50 %	514065180
5007	NC_021554	GGTT	2	8	250078	250085	0 %	50 %	50 %	0 %	514065180
5008	NC_021554	TTA	2	6	250143	250148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514065180
5009	NC_021554	TTG	2	6	250170	250175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514065180
5010	NC_021554	ATT	2	6	250214	250219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514065180
5011	NC_021554	GTC	2	6	250232	250237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514065180
5012	NC_021554	CAT	2	6	250287	250292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514065180
5013	NC_021554	ATG	2	6	250326	250331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514065180
5014	NC_021554	ATAA	2	8	250343	250350	75 %	25 %	0 %	0 %	514065180
5015	NC_021554	AT	3	6	250353	250358	50 %	50 %	0 %	0 %	514065180
5016	NC_021554	TTA	2	6	250367	250372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514065180
5017	NC_021554	TCA	2	6	250493	250498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514065180
5018	NC_021554	AGC	2	6	250510	250515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514065180
5019	NC_021554	ATGG	2	8	250520	250527	25 %	25 %	50 %	0 %	514065180
5020	NC_021554	AAT	2	6	250622	250627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514065180
5021	NC_021554	TTAT	2	8	250635	250642	25 %	75 %	0 %	0 %	514065180
5022	NC_021554	TAA	2	6	250648	250653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514065180
5023	NC_021554	GGT	2	6	250655	250660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514065180
5024	NC_021554	CCA	2	6	250661	250666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514065180
5025	NC_021554	GTA	2	6	250686	250691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514065180
5026	NC_021554	AAC	2	6	250736	250741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514065180
5027	NC_021554	ATTA	2	8	250765	250772	50 %	50 %	0 %	0 %	514065180
5028	NC_021554	TTG	2	6	250782	250787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514065180
5029	NC_021554	ATTCA	2	10	250802	250811	40 %	40 %	0 %	20 %	514065180
5030	NC_021554	GAGG	2	8	250835	250842	25 %	0 %	75 %	0 %	514065180
5031	NC_021554	AGA	2	6	250858	250863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514065181
5032	NC_021554	GAT	2	6	250904	250909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514065181
5033	NC_021554	TCA	2	6	250915	250920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514065181
5034	NC_021554	ACT	2	6	250931	250936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514065181
5035	NC_021554	AGT	2	6	251043	251048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514065181
5036	NC_021554	TTG	2	6	251155	251160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514065181
5037	NC_021554	ATT	2	6	251255	251260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514065181
5038	NC_021554	TA	3	6	251287	251292	50 %	50 %	0 %	0 %	514065181
5039	NC_021554	TGG	2	6	251294	251299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514065181
5040	NC_021554	TGA	2	6	251360	251365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514065181
5041	NC_021554	CGCT	2	8	251422	251429	0 %	25 %	25 %	50 %	514065181
5042	NC_021554	GTT	2	6	251445	251450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514065181
5043	NC_021554	AAG	2	6	251507	251512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514065181
5044	NC_021554	TTA	2	6	251551	251556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514065181
5045	NC_021554	AAT	2	6	251571	251576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514065181
5046	NC_021554	GCA	2	6	251589	251594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514065181
5047	NC_021554	TTCTTG	2	12	251631	251642	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	514065181
5048	NC_021554	AAC	2	6	251666	251671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514065181
5049	NC_021554	ATG	2	6	251957	251962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514065182
5050	NC_021554	GTG	2	6	251988	251993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514065182
5051	NC_021554	AGC	2	6	252079	252084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514065182
5052	NC_021554	ATG	2	6	252126	252131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514065182
5053	NC_021554	ATGTG	2	10	252237	252246	20 %	40 %	40 %	0 %	514065182
5054	NC_021554	CAG	2	6	252270	252275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514065182
5055	NC_021554	A	6	6	252282	252287	100 %	0 %	0 %	0 %	514065182
5056	NC_021554	GATA	2	8	252289	252296	50 %	25 %	25 %	0 %	514065182
5057	NC_021554	A	6	6	252314	252319	100 %	0 %	0 %	0 %	514065182
5058	NC_021554	TA	3	6	252366	252371	50 %	50 %	0 %	0 %	514065182
5059	NC_021554	ATTT	2	8	252401	252408	25 %	75 %	0 %	0 %	514065182
5060	NC_021554	TCG	3	9	252427	252435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514065182
5061	NC_021554	TCTT	2	8	252456	252463	0 %	75 %	0 %	25 %	514065182
5062	NC_021554	GAA	2	6	252467	252472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514065182
5063	NC_021554	GGA	2	6	252482	252487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	514065182
5064	NC_021554	AC	3	6	252506	252511	50 %	0 %	0 %	50 %	514065182
5065	NC_021554	GAT	2	6	252532	252537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514065182
5066	NC_021554	TAAAT	2	10	252580	252589	60 %	40 %	0 %	0 %	514065182
5067	NC_021554	ATG	2	6	252597	252602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514065182
5068	NC_021554	TTA	2	6	252666	252671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514065182
5069	NC_021554	GAA	2	6	252676	252681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514065182
5070	NC_021554	CGA	2	6	252687	252692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514065182
5071	NC_021554	GAA	3	9	252893	252901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514065182
5072	NC_021554	CAT	2	6	253057	253062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514065183
5073	NC_021554	TGG	2	6	253093	253098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514065183
5074	NC_021554	GAT	2	6	253186	253191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514065183
5075	NC_021554	TTG	2	6	253254	253259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514065183
5076	NC_021554	GGT	2	6	253264	253269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514065183
5077	NC_021554	TAA	2	6	253282	253287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514065183
5078	NC_021554	TG	3	6	253338	253343	0 %	50 %	50 %	0 %	514065183
5079	NC_021554	GAC	2	6	253360	253365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514065183
5080	NC_021554	GAA	2	6	253367	253372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514065183
5081	NC_021554	TAA	2	6	253396	253401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514065183
5082	NC_021554	ATT	2	6	253411	253416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514065183
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5084	NC_021554	TGGT	2	8	253485	253492	0 %	50 %	50 %	0 %	514065183
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5087	NC_021554	TAA	2	6	253558	253563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514065183
5088	NC_021554	CTA	2	6	253628	253633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514065183
5089	NC_021554	AAC	2	6	253689	253694	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514065183
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5091	NC_021554	AGCA	2	8	253783	253790	50 %	0 %	25 %	25 %	514065183
5092	NC_021554	ATTT	2	8	253872	253879	25 %	75 %	0 %	0 %	514065183
5093	NC_021554	AT	3	6	253889	253894	50 %	50 %	0 %	0 %	514065183
5094	NC_021554	AAAGC	2	10	253920	253929	60 %	0 %	20 %	20 %	514065183
5095	NC_021554	GA	3	6	253961	253966	50 %	0 %	50 %	0 %	514065183
5096	NC_021554	AGA	2	6	254002	254007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514065183
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5099	NC_021554	TGGAT	2	10	254230	254239	20 %	40 %	40 %	0 %	514065184
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5101	NC_021554	GTT	2	6	254296	254301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514065184
5102	NC_021554	CAGA	2	8	254343	254350	50 %	0 %	25 %	25 %	514065184
5103	NC_021554	AAG	2	6	254415	254420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514065184
5104	NC_021554	GTT	2	6	254474	254479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514065184
5105	NC_021554	GAT	2	6	254507	254512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514065184
5106	NC_021554	TGCA	2	8	254661	254668	25 %	25 %	25 %	25 %	514065184
5107	NC_021554	AT	3	6	254725	254730	50 %	50 %	0 %	0 %	514065184
5108	NC_021554	TGG	2	6	254759	254764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514065184
5109	NC_021554	TGC	2	6	254782	254787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514065184
5110	NC_021554	TCA	2	6	254818	254823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514065184
5111	NC_021554	CAA	2	6	254907	254912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514065184
5112	NC_021554	TTA	3	9	254982	254990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514065184
5113	NC_021554	TAT	2	6	255031	255036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514065184
5114	NC_021554	AGA	2	6	255043	255048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514065184
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5116	NC_021554	TGG	2	6	255113	255118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514065184
5117	NC_021554	ATA	2	6	255121	255126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514065184
5118	NC_021554	TCT	2	6	255501	255506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514065185
5119	NC_021554	TAA	2	6	255545	255550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514065185
5120	NC_021554	GT	3	6	255569	255574	0 %	50 %	50 %	0 %	514065185
5121	NC_021554	TAA	3	9	255575	255583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514065185
5122	NC_021554	AAT	2	6	255602	255607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514065185
5123	NC_021554	AAG	2	6	255612	255617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514065185
5124	NC_021554	TA	3	6	255640	255645	50 %	50 %	0 %	0 %	514065185
5125	NC_021554	TAA	2	6	255655	255660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514065185
5126	NC_021554	AAT	2	6	255681	255686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514065185
5127	NC_021554	ACC	2	6	255701	255706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514065185
5128	NC_021554	TAA	2	6	255715	255720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514065185
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5130	NC_021554	TAA	2	6	255796	255801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514065185
5131	NC_021554	GT	3	6	255836	255841	0 %	50 %	50 %	0 %	514065185
5132	NC_021554	ATAG	2	8	255963	255970	50 %	25 %	25 %	0 %	514065185
5133	NC_021554	ATG	2	6	255975	255980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514065185
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5139	NC_021554	CTTA	2	8	256505	256512	25 %	50 %	0 %	25 %	514065186
5140	NC_021554	ATT	2	6	256577	256582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514065186
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5143	NC_021554	GGT	2	6	256716	256721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514065186
5144	NC_021554	GGT	2	6	256731	256736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514065186
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5153	NC_021554	GTC	2	6	257170	257175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514065186
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5165	NC_021554	T	6	6	257992	257997	0 %	100 %	0 %	0 %	514065187
5166	NC_021554	AAT	2	6	258111	258116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514065187
5167	NC_021554	TCGCA	2	10	258151	258160	20 %	20 %	20 %	40 %	514065187
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5178	NC_021554	ATA	2	6	258465	258470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514065187
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5183	NC_021554	TCA	3	9	258677	258685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514065187
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5194	NC_021554	ATT	2	6	259394	259399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514065188
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5201	NC_021554	AAC	2	6	259578	259583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514065188
5202	NC_021554	AAT	2	6	259622	259627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514065188
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5215	NC_021554	TCA	2	6	260100	260105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514065188
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5219	NC_021554	ATC	2	6	260258	260263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514065189
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5224	NC_021554	TAA	2	6	260773	260778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514065189
5225	NC_021554	ACT	2	6	260825	260830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514065189
5226	NC_021554	TCT	2	6	260930	260935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514065189
5227	NC_021554	GAT	2	6	260937	260942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514065189
5228	NC_021554	ACA	2	6	260955	260960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514065189
5229	NC_021554	CAC	2	6	260961	260966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514065189
5230	NC_021554	CAC	2	6	260979	260984	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514065189
5231	NC_021554	TGAT	2	8	261103	261110	25 %	50 %	25 %	0 %	514065189
5232	NC_021554	A	7	7	261176	261182	100 %	0 %	0 %	0 %	514065189
5233	NC_021554	ATA	2	6	261189	261194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514065189
5234	NC_021554	AGA	2	6	261995	262000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514065190
5235	NC_021554	GGC	2	6	262011	262016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	514065190
5236	NC_021554	CAA	2	6	262045	262050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514065190
5237	NC_021554	ATG	2	6	262060	262065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514065190
5238	NC_021554	GGT	2	6	262146	262151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514065190
5239	NC_021554	GAA	2	6	262200	262205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514065190
5240	NC_021554	A	6	6	262210	262215	100 %	0 %	0 %	0 %	514065190
5241	NC_021554	GGACGT	2	12	262326	262337	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	514065190
5242	NC_021554	TCG	2	6	262352	262357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514065190
5243	NC_021554	GAA	2	6	262389	262394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514065190
5244	NC_021554	A	6	6	262393	262398	100 %	0 %	0 %	0 %	514065190
5245	NC_021554	AGA	2	6	262433	262438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514065190
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5366	NC_021554	GAA	2	6	268646	268651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514065195
5367	NC_021554	CAA	2	6	268788	268793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514065195
5368	NC_021554	ACA	2	6	269009	269014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514065195
5369	NC_021554	CAA	2	6	269143	269148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514065195
5370	NC_021554	AAAC	2	8	269157	269164	75 %	0 %	0 %	25 %	514065195
5371	NC_021554	CAAGC	2	10	269227	269236	40 %	0 %	20 %	40 %	514065195
5372	NC_021554	AAC	2	6	269257	269262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514065195
5373	NC_021554	AGC	2	6	269916	269921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514065196
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5375	NC_021554	CCA	2	6	270055	270060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514065196
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5377	NC_021554	CTT	2	6	270092	270097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514065196
5378	NC_021554	AGAT	2	8	270162	270169	50 %	25 %	25 %	0 %	514065196
5379	NC_021554	TG	3	6	270450	270455	0 %	50 %	50 %	0 %	514065196
5380	NC_021554	AAT	2	6	270504	270509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514065196
5381	NC_021554	TGA	2	6	270553	270558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514065196
5382	NC_021554	CAG	2	6	270620	270625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514065196
5383	NC_021554	ATC	2	6	270654	270659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514065196
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5385	NC_021554	TCA	2	6	270713	270718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514065196
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5387	NC_021554	TGA	2	6	270798	270803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514065196
5388	NC_021554	GCAAT	2	10	270854	270863	40 %	20 %	20 %	20 %	514065196
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5390	NC_021554	CAT	2	6	270992	270997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514065196
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5392	NC_021554	TTGCT	2	10	271023	271032	0 %	60 %	20 %	20 %	514065196
5393	NC_021554	CTT	2	6	271070	271075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514065196
5394	NC_021554	T	6	6	271163	271168	0 %	100 %	0 %	0 %	514065197
5395	NC_021554	TTGA	2	8	271220	271227	25 %	50 %	25 %	0 %	514065197
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5399	NC_021554	GTTT	2	8	271403	271410	0 %	75 %	25 %	0 %	514065197
5400	NC_021554	GTTGT	2	10	271450	271459	0 %	60 %	40 %	0 %	514065197
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5404	NC_021554	TAA	2	6	271643	271648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514065197
5405	NC_021554	CAA	2	6	271663	271668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514065197
5406	NC_021554	AT	3	6	271674	271679	50 %	50 %	0 %	0 %	514065197
5407	NC_021554	ACA	2	6	271695	271700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514065197
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5410	NC_021554	CAT	2	6	271831	271836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514065197
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5413	NC_021554	AATC	2	8	271948	271955	50 %	25 %	0 %	25 %	514065197
5414	NC_021554	ATT	2	6	271994	271999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514065197
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5425	NC_021554	CAT	2	6	272812	272817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514065197
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5451	NC_021554	AAAGC	2	10	274332	274341	60 %	0 %	20 %	20 %	514065198
5452	NC_021554	TGA	2	6	274434	274439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514065198
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5454	NC_021554	TAATT	2	10	274563	274572	40 %	60 %	0 %	0 %	514065198
5455	NC_021554	TACT	2	8	274641	274648	25 %	50 %	0 %	25 %	514065198
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5459	NC_021554	TACA	2	8	274973	274980	50 %	25 %	0 %	25 %	514065199
5460	NC_021554	GCA	2	6	275073	275078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514065199
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5467	NC_021554	TCG	2	6	275235	275240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514065199
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5480	NC_021554	TTGAA	2	10	275815	275824	40 %	40 %	20 %	0 %	514065199
5481	NC_021554	TGC	2	6	275924	275929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514065199
5482	NC_021554	TCA	2	6	275991	275996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514065199
5483	NC_021554	GTGA	2	8	276045	276052	25 %	25 %	50 %	0 %	514065199
5484	NC_021554	AGA	2	6	276073	276078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514065199
5485	NC_021554	GCC	2	6	276130	276135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	514065199
5486	NC_021554	A	7	7	276147	276153	100 %	0 %	0 %	0 %	514065199
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