MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Streptococcus agalactiae ILRI005 complete genome

Total Repeats: 753

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021486	ATTTAC	2	12	351	362	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	512543720
2	NC_021486	TGCTTA	2	12	9004	9015	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	512543727
3	NC_021486	AGAAAA	2	12	10762	10773	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	512543731
4	NC_021486	GTATTG	2	12	12225	12236	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	512543733
5	NC_021486	GGCGGT	2	12	14403	14414	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	512543735
6	NC_021486	GAAAGA	2	12	15249	15260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512543735
7	NC_021486	ACTGAG	2	12	37164	37175	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	512543745
8	NC_021486	CAGGCG	2	12	37618	37629	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	512543746
9	NC_021486	AATGAA	2	12	47293	47304	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	512543753
10	NC_021486	CAAATA	2	12	48459	48470	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	512543753
11	NC_021486	TTTTTG	2	12	51043	51054	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	512543756
12	NC_021486	ATTTAG	2	12	52756	52767	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	512543758
13	NC_021486	AGGTAG	2	12	52966	52977	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	512543758
14	NC_021486	ACCAAA	2	12	55914	55925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512543762
15	NC_021486	CTTTGC	2	12	58321	58332	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	512543766
16	NC_021486	CGTGGT	2	12	59440	59451	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	512543767
17	NC_021486	ATATTT	2	12	64488	64499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512543773
18	NC_021486	CGTACC	2	12	66137	66148	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	512543774
19	NC_021486	GGTAAA	2	12	66972	66983	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	512543776
20	NC_021486	CAGTAT	2	12	74353	74364	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	512543780
21	NC_021486	AAAGGT	2	12	76985	76996	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	512543783
22	NC_021486	CGCAAT	2	12	79566	79577	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	512543788
23	NC_021486	ATTGAA	2	12	79978	79989	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	512543789
24	NC_021486	ACATCA	2	12	80114	80125	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	512543789
25	NC_021486	ATCGTT	2	12	82655	82666	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	512543795
26	NC_021486	TAAAGG	2	12	84071	84082	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	512543798
27	NC_021486	ATAAAA	2	12	84254	84265	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	512543799
28	NC_021486	TTTCTG	2	12	85085	85096	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	512543800
29	NC_021486	AAATTA	2	12	85129	85140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512543801
30	NC_021486	ATTGAA	2	12	88058	88069	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	512543805
31	NC_021486	GTAAAG	2	12	88743	88754	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	512543807
32	NC_021486	TTGATA	2	12	98983	98994	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	512543813
33	NC_021486	AATTAC	2	12	104306	104317	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	512543822
34	NC_021486	TTTTCT	2	12	104938	104949	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	512543823
35	NC_021486	ACTGAA	2	12	106734	106745	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	512543825
36	NC_021486	AACTCA	2	12	108137	108148	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	512543826
37	NC_021486	TTGTCA	2	12	108294	108305	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	512543826
38	NC_021486	GATATT	2	12	112351	112362	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	512543829
39	NC_021486	TAACGA	2	12	115398	115409	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	512543833
40	NC_021486	TGACCT	2	12	118189	118200	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	512543836
41	NC_021486	CACCGT	2	12	119363	119374	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	512543836
42	NC_021486	GAGGAA	2	12	124167	124178	50 %	0 %	50 %	0 %	512543841
43	NC_021486	CAATGG	2	12	124798	124809	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	512543841
44	NC_021486	GCTTTT	2	12	127059	127070	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	512543843
45	NC_021486	TCAGGT	2	12	133719	133730	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	512543851
46	NC_021486	CAAAGA	2	12	133821	133832	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	512543851
47	NC_021486	TAGTAT	2	12	135171	135182	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	512543853
48	NC_021486	GTTAAC	2	12	139620	139631	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	512543856
49	NC_021486	GTTCAT	2	12	142605	142616	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	512543860
50	NC_021486	GTTGAA	2	12	142722	142733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512543860
51	NC_021486	ACAAAA	2	12	143775	143786	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	512543861
52	NC_021486	CAGAAG	2	12	144163	144174	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	512543861
53	NC_021486	TTGATA	2	12	146611	146622	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	512543865
54	NC_021486	TTTGAT	2	12	151450	151461	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	512543869
55	NC_021486	TTTAGA	2	12	155572	155583	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	512543873
56	NC_021486	TTTCTA	2	12	156268	156279	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	512543873
57	NC_021486	TTTGGT	2	12	158530	158541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512543876
58	NC_021486	TCTGTT	2	12	159254	159265	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	512543876
59	NC_021486	TTTATC	2	12	160124	160135	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	512543877
60	NC_021486	AAATCA	2	12	166336	166347	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	512543882
61	NC_021486	GACAAC	2	12	166436	166447	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	512543882
62	NC_021486	ATAATG	2	12	172625	172636	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	512543883
63	NC_021486	TATTGC	2	12	175072	175083	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	512543886
64	NC_021486	TACGGT	2	12	185525	185536	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	512543891
65	NC_021486	GTGAAG	2	12	186570	186581	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	512543891
66	NC_021486	GTGTAT	2	12	193594	193605	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	512543899
67	NC_021486	GCTTGT	2	12	197045	197056	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	512543904
68	NC_021486	TCAGTT	2	12	200053	200064	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	512543909
69	NC_021486	GCTTTG	2	12	201810	201821	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	512543911
70	NC_021486	TCAAAA	2	12	206067	206078	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	512543916
71	NC_021486	AGCTAA	2	12	207030	207041	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	512543916
72	NC_021486	GTCATG	2	12	207560	207571	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	512543916
73	NC_021486	AAGGTA	2	12	211366	211377	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	512543921
74	NC_021486	GTTGAA	2	12	217474	217485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512543924
75	NC_021486	AAATCA	2	12	218278	218289	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	512543925
76	NC_021486	ACAAGA	2	12	223413	223424	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	512543930
77	NC_021486	ATTGAT	2	12	224686	224697	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	512543930
78	NC_021486	AGCTAG	2	12	231194	231205	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	512543940
79	NC_021486	GCACAA	2	12	231985	231996	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	512543942
80	NC_021486	TTAATT	2	12	234809	234820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512543945
81	NC_021486	ATGTGA	2	12	239672	239683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512543954
82	NC_021486	AGGATT	2	12	241382	241393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512543955
83	NC_021486	TTCCAA	2	12	243464	243475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512543958
84	NC_021486	AGCAGA	2	12	253354	253365	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	512543961
85	NC_021486	TTCTTT	2	12	257075	257086	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	512543967
86	NC_021486	TTTTCC	2	12	257893	257904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512543967
87	NC_021486	TTAAAT	2	12	260525	260536	50 %	50 %	0 %	0 %	512543971
88	NC_021486	CATAAG	2	12	262670	262681	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	512543974
89	NC_021486	TTAGAC	2	12	276388	276399	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	512543987
90	NC_021486	TAGCAG	2	12	280512	280523	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	512543990
91	NC_021486	GTTCAG	2	12	287930	287941	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	512543997
92	NC_021486	ATTTTA	2	12	290836	290847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512543999
93	NC_021486	AACGTA	2	12	291661	291672	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	512543999
94	NC_021486	TATTGA	2	12	291737	291748	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	512543999
95	NC_021486	GAAAAA	3	18	292025	292042	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	512543999
96	NC_021486	AATTGA	2	12	294184	294195	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	512544002
97	NC_021486	TGAAAT	2	12	297407	297418	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	512544005
98	NC_021486	ACTTAT	2	12	297429	297440	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	512544005
99	NC_021486	TAGTAA	2	12	299967	299978	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	512544007
100	NC_021486	TTACCA	2	12	300044	300055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512544008
101	NC_021486	AGTACC	2	12	300613	300624	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	512544008
102	NC_021486	TTTTCT	2	12	302779	302790	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	512544009
103	NC_021486	CAAGAA	2	12	305906	305917	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	512544014
104	NC_021486	AGTTCT	2	12	306143	306154	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	512544014
105	NC_021486	AATGGT	2	12	306893	306904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512544014
106	NC_021486	AATGAA	2	12	308198	308209	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	512544016
107	NC_021486	AAAGAA	2	12	316291	316302	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	512544026
108	NC_021486	GAGCTA	2	12	317670	317681	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	512544027
109	NC_021486	AATTGG	2	12	320609	320620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512544029
110	NC_021486	GTATCG	2	12	321474	321485	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	512544030
111	NC_021486	TTTTAT	2	12	324055	324066	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	512544032
112	NC_021486	ATATTA	2	12	324357	324368	50 %	50 %	0 %	0 %	512544032
113	NC_021486	TAGATG	2	12	327933	327944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512544036
114	NC_021486	CAAATT	2	12	328631	328642	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	512544037
115	NC_021486	AAATCA	2	12	331648	331659	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	512544041
116	NC_021486	TGCTTA	2	12	332044	332055	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	512544042
117	NC_021486	GATTTA	2	12	333878	333889	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	512544043
118	NC_021486	GAATAC	2	12	338952	338963	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	512544047
119	NC_021486	AATTTA	2	12	355438	355449	50 %	50 %	0 %	0 %	512544060
120	NC_021486	GACTGT	2	12	356653	356664	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	512544061
121	NC_021486	CGGTGG	2	12	357844	357855	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	512544063
122	NC_021486	TTAGCT	2	12	360068	360079	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	512544065
123	NC_021486	TGGTAT	2	12	363806	363817	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	512544068
124	NC_021486	ACTTTA	2	12	363827	363838	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	512544068
125	NC_021486	ATATTA	2	12	364156	364167	50 %	50 %	0 %	0 %	512544068
126	NC_021486	ATTGAA	2	12	372319	372330	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	512544078
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136	NC_021486	GCTATG	2	12	400212	400223	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	512544106
137	NC_021486	TTGGAT	2	12	401500	401511	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	512544109
138	NC_021486	TATTGG	2	12	403140	403151	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	512544112
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153	NC_021486	TGCTAT	2	12	455861	455872	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	512544162
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219	NC_021486	CGATAT	2	12	617031	617042	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	512544331
220	NC_021486	AAAAGA	2	12	623348	623359	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	512544340
221	NC_021486	AATTGA	2	12	626205	626216	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	512544347
222	NC_021486	AGGATA	2	12	634106	634117	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	512544368
223	NC_021486	TCAACC	2	12	637309	637320	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	512544374
224	NC_021486	AAACTT	2	12	640694	640705	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	512544380
225	NC_021486	GATTGT	2	12	641567	641578	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	512544381
226	NC_021486	AAAGAA	2	12	649201	649212	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	512544390
227	NC_021486	CAAAAA	2	12	654857	654868	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	512544399
228	NC_021486	CAAAAA	2	12	659398	659409	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	512544401
229	NC_021486	AGAGGA	2	12	664164	664175	50 %	0 %	50 %	0 %	512544406
230	NC_021486	TCTCTA	4	24	668077	668100	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	512544413
231	NC_021486	TATTGC	2	12	669022	669033	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	512544415
232	NC_021486	TGAAGA	2	12	677705	677716	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	512544433
233	NC_021486	CAGATA	2	12	686020	686031	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	512544444
234	NC_021486	CATTAT	2	12	689832	689843	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	512544446
235	NC_021486	TTAAAT	2	12	696226	696237	50 %	50 %	0 %	0 %	512544449
236	NC_021486	AGCAGG	2	12	696497	696508	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	512544449
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332	NC_021486	GCTAAA	2	12	965929	965940	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	512544705
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342	NC_021486	GCTCCT	2	12	993680	993691	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	512544729
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345	NC_021486	ATTTTG	2	12	998475	998486	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	512544734
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347	NC_021486	ATTAAA	2	12	999827	999838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512544735
348	NC_021486	TTGCTT	2	12	1001272	1001283	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	512544735
349	NC_021486	ATTGAA	2	12	1004610	1004621	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	512544739
350	NC_021486	AAATCA	2	12	1005772	1005783	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	512544740
351	NC_021486	CATTTT	2	12	1006805	1006816	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	512544741
352	NC_021486	ATCAAA	2	12	1010004	1010015	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	512544746
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454	NC_021486	TATCCA	2	12	1283469	1283480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512545024
455	NC_021486	CCAGAA	2	12	1293073	1293084	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	512545033
456	NC_021486	GTCATT	2	12	1293456	1293467	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	512545033
457	NC_021486	TCAACT	2	12	1296969	1296980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512545038
458	NC_021486	ACCAGA	2	12	1297301	1297312	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	512545038
459	NC_021486	AATGTC	2	12	1297614	1297625	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	512545038
460	NC_021486	AGCTAA	2	12	1297883	1297894	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	512545038
461	NC_021486	TTGATT	2	12	1301236	1301247	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	512545044
462	NC_021486	GCTTCT	2	12	1304178	1304189	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	512545048
463	NC_021486	TAGCTT	2	12	1304230	1304241	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	512545048
464	NC_021486	AGCCTC	2	12	1308091	1308102	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	512545051
465	NC_021486	CGATGG	2	12	1308167	1308178	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	512545051
466	NC_021486	CCCAAG	2	12	1309488	1309499	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	512545052
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468	NC_021486	TGCAAA	2	12	1311105	1311116	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	512545054
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470	NC_021486	TATTGC	2	12	1319044	1319055	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	512545065
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473	NC_021486	TAAATG	2	12	1325605	1325616	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	512545073
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475	NC_021486	TGCTAA	2	12	1347858	1347869	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	512545092
476	NC_021486	AAATGC	2	12	1348011	1348022	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	512545092
477	NC_021486	GCAATC	2	12	1348123	1348134	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	512545092
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479	NC_021486	TGCTAT	2	12	1348631	1348642	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	512545092
480	NC_021486	AGCAAT	2	12	1355336	1355347	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	512545098
481	NC_021486	TAACAA	2	12	1359309	1359320	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	512545102
482	NC_021486	TTTATA	2	12	1363390	1363401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512545107
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485	NC_021486	TCAACT	2	12	1367556	1367567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512545110
486	NC_021486	TTTGTA	2	12	1371176	1371187	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	512545116
487	NC_021486	TTTGCT	2	12	1371768	1371779	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	512545117
488	NC_021486	AAAATA	2	12	1372713	1372724	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	512545117
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493	NC_021486	TAGTTT	2	12	1386883	1386894	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	512545132
494	NC_021486	CGATAA	2	12	1389399	1389410	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	512545136
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