MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus agalactiae 09mas018883 complete genome

Total Repeats: 41464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021485	ATT	2	6	35430	35435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512538261
502	NC_021485	GCA	2	6	35439	35444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512538261
503	NC_021485	ATG	2	6	35489	35494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512538261
504	NC_021485	TAT	2	6	35529	35534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512538261
505	NC_021485	TTAT	2	8	35770	35777	25 %	75 %	0 %	0 %	512538262
506	NC_021485	CTA	2	6	35848	35853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512538262
507	NC_021485	AAT	2	6	35901	35906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512538262
508	NC_021485	TGGTG	2	10	35945	35954	0 %	40 %	60 %	0 %	512538262
509	NC_021485	A	6	6	35978	35983	100 %	0 %	0 %	0 %	512538262
510	NC_021485	A	6	6	35997	36002	100 %	0 %	0 %	0 %	512538262
511	NC_021485	ATT	2	6	36009	36014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512538262
512	NC_021485	GGT	2	6	36023	36028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512538262
513	NC_021485	CAG	2	6	36043	36048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512538262
514	NC_021485	GAA	2	6	36075	36080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512538262
515	NC_021485	TAC	2	6	36114	36119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512538262
516	NC_021485	ATG	2	6	36124	36129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512538262
517	NC_021485	ATG	2	6	36151	36156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512538262
518	NC_021485	ATG	2	6	36184	36189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512538262
519	NC_021485	GA	3	6	36211	36216	50 %	0 %	50 %	0 %	512538262
520	NC_021485	TTGA	2	8	36270	36277	25 %	50 %	25 %	0 %	512538262
521	NC_021485	ATC	2	6	36315	36320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512538262
522	NC_021485	TGA	2	6	36326	36331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512538262
523	NC_021485	TTG	2	6	36600	36605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512538263
524	NC_021485	CTT	2	6	36675	36680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512538263
525	NC_021485	ATG	2	6	36708	36713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512538263
526	NC_021485	CTT	2	6	36829	36834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512538263
527	NC_021485	TGC	2	6	36871	36876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512538263
528	NC_021485	GAT	2	6	37163	37168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512538263
529	NC_021485	ATT	2	6	37185	37190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512538263
530	NC_021485	AATC	2	8	37194	37201	50 %	25 %	0 %	25 %	512538263
531	NC_021485	ACTGAG	2	12	37214	37225	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	512538263
532	NC_021485	TACT	2	8	37240	37247	25 %	50 %	0 %	25 %	512538263
533	NC_021485	CA	3	6	37265	37270	50 %	0 %	0 %	50 %	512538263
534	NC_021485	AT	3	6	37348	37353	50 %	50 %	0 %	0 %	512538263
535	NC_021485	TGA	2	6	37363	37368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512538263
536	NC_021485	GAC	2	6	37443	37448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512538263
537	NC_021485	GAT	2	6	37451	37456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512538263
538	NC_021485	CTC	2	6	37532	37537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512538263
539	NC_021485	TGG	2	6	37585	37590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512538263
540	NC_021485	GCA	2	6	37592	37597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512538263
541	NC_021485	GGT	2	6	37607	37612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512538263
542	NC_021485	CAGGCG	2	12	37668	37679	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	512538263
543	NC_021485	GCG	2	6	37745	37750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512538263
544	NC_021485	TTC	2	6	37759	37764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512538263
545	NC_021485	TGGT	2	8	37854	37861	0 %	50 %	50 %	0 %	512538263
546	NC_021485	GGT	2	6	37925	37930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512538263
547	NC_021485	CGG	2	6	37951	37956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512538263
548	NC_021485	GAA	2	6	38036	38041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512538263
549	NC_021485	GTAATG	2	12	38064	38075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512538263
550	NC_021485	GGT	2	6	38114	38119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512538263
551	NC_021485	GTT	2	6	38246	38251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512538263
552	NC_021485	CAA	2	6	38287	38292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512538263
553	NC_021485	CTA	2	6	38319	38324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512538263
554	NC_021485	AAACC	2	10	38333	38342	60 %	0 %	0 %	40 %	512538263
555	NC_021485	TTG	2	6	38370	38375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512538263
556	NC_021485	GTT	2	6	38417	38422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512538263
557	NC_021485	CAG	2	6	38475	38480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512538263
558	NC_021485	ACC	2	6	38586	38591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512538263
559	NC_021485	CAA	2	6	38664	38669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512538263
560	NC_021485	TGC	2	6	38731	38736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512538263
561	NC_021485	CTT	2	6	38870	38875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512538263
562	NC_021485	CGG	2	6	38917	38922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512538263
563	NC_021485	GAA	2	6	38948	38953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512538263
564	NC_021485	ACA	2	6	38990	38995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512538263
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566	NC_021485	CTA	2	6	39049	39054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512538263
567	NC_021485	AGA	2	6	39076	39081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512538263
568	NC_021485	CTG	2	6	39150	39155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512538263
569	NC_021485	GGT	2	6	39173	39178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512538263
570	NC_021485	GAA	2	6	39452	39457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512538263
571	NC_021485	CTG	2	6	39462	39467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512538263
572	NC_021485	GCT	2	6	39626	39631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512538263
573	NC_021485	ATC	2	6	39680	39685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512538263
574	NC_021485	GGA	2	6	39695	39700	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512538263
575	NC_021485	CAG	2	6	39705	39710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512538263
576	NC_021485	AAG	2	6	39761	39766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512538263
577	NC_021485	ATC	2	6	39809	39814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512538263
578	NC_021485	TCT	2	6	39853	39858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512538263
579	NC_021485	TTGG	2	8	39973	39980	0 %	50 %	50 %	0 %	512538263
580	NC_021485	TGT	2	6	40039	40044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512538263
581	NC_021485	ATC	2	6	40193	40198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512538263
582	NC_021485	GAA	2	6	40570	40575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512538264
583	NC_021485	ACTT	2	8	40621	40628	25 %	50 %	0 %	25 %	512538264
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588	NC_021485	AAG	2	6	41018	41023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512538264
589	NC_021485	TGA	2	6	41060	41065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512538264
590	NC_021485	AGA	2	6	41067	41072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512538264
591	NC_021485	TGC	2	6	41082	41087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512538264
592	NC_021485	GGT	2	6	41175	41180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512538264
593	NC_021485	TGA	2	6	41262	41267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512538264
594	NC_021485	A	6	6	41355	41360	100 %	0 %	0 %	0 %	512538264
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596	NC_021485	GAA	2	6	41455	41460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512538264
597	NC_021485	A	6	6	41490	41495	100 %	0 %	0 %	0 %	512538264
598	NC_021485	GTT	2	6	41599	41604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512538264
599	NC_021485	TGAT	2	8	41606	41613	25 %	50 %	25 %	0 %	512538264
600	NC_021485	ATT	2	6	41655	41660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512538264
601	NC_021485	AATT	2	8	41756	41763	50 %	50 %	0 %	0 %	512538264
602	NC_021485	GCT	2	6	41776	41781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512538264
603	NC_021485	GT	3	6	41788	41793	0 %	50 %	50 %	0 %	512538264
604	NC_021485	ATT	2	6	41797	41802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512538264
605	NC_021485	TC	3	6	41823	41828	0 %	50 %	0 %	50 %	512538264
606	NC_021485	TTGA	2	8	41839	41846	25 %	50 %	25 %	0 %	512538264
607	NC_021485	TGG	2	6	41877	41882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512538264
608	NC_021485	CGC	2	6	41918	41923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512538264
609	NC_021485	GAA	3	9	41935	41943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512538264
610	NC_021485	AGA	2	6	41958	41963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512538264
611	NC_021485	A	6	6	41963	41968	100 %	0 %	0 %	0 %	512538264
612	NC_021485	A	7	7	42032	42038	100 %	0 %	0 %	0 %	512538265
613	NC_021485	A	7	7	42096	42102	100 %	0 %	0 %	0 %	512538265
614	NC_021485	GGT	2	6	42145	42150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512538265
615	NC_021485	TGG	2	6	42153	42158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512538265
616	NC_021485	TGCT	2	8	42236	42243	0 %	50 %	25 %	25 %	512538265
617	NC_021485	TG	3	6	42290	42295	0 %	50 %	50 %	0 %	512538265
618	NC_021485	ATT	2	6	42304	42309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512538265
619	NC_021485	GCA	2	6	42310	42315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512538265
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621	NC_021485	GAT	2	6	42475	42480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512538265
622	NC_021485	ATC	2	6	42526	42531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512538265
623	NC_021485	AAG	2	6	42548	42553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512538265
624	NC_021485	TTC	2	6	42560	42565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512538265
625	NC_021485	CGT	2	6	42613	42618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512538265
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1000	NC_021485	CTTGA	2	10	60228	60237	20 %	40 %	20 %	20 %	512538283

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