MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus iniae SF1

Total Repeats: 40316

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_021314	AAAGCA	2	12	308848	308859	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	508126954
5502	NC_021314	ACAA	2	8	308884	308891	75 %	0 %	0 %	25 %	508126954
5503	NC_021314	CTT	2	6	308896	308901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	508126954
5504	NC_021314	A	6	6	308953	308958	100 %	0 %	0 %	0 %	508126954
5505	NC_021314	AC	3	6	308993	308998	50 %	0 %	0 %	50 %	508126954
5506	NC_021314	CTT	2	6	309031	309036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	508126954
5507	NC_021314	AAG	2	6	309092	309097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	508126954
5508	NC_021314	AATC	2	8	309224	309231	50 %	25 %	0 %	25 %	508126954
5509	NC_021314	AGA	2	6	309258	309263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	508126954
5510	NC_021314	GAAA	2	8	309282	309289	75 %	0 %	25 %	0 %	508126954
5511	NC_021314	A	6	6	309319	309324	100 %	0 %	0 %	0 %	508126954
5512	NC_021314	TAT	2	6	309488	309493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	508126955
5513	NC_021314	TTTC	2	8	309538	309545	0 %	75 %	0 %	25 %	508126955
5514	NC_021314	TAA	2	6	309589	309594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	508126955
5515	NC_021314	GCT	2	6	309605	309610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	508126955
5516	NC_021314	TTG	2	6	309684	309689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	508126955
5517	NC_021314	GAT	2	6	309691	309696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508126955
5518	NC_021314	TA	3	6	309711	309716	50 %	50 %	0 %	0 %	508126955
5519	NC_021314	T	8	8	309761	309768	0 %	100 %	0 %	0 %	508126955
5520	NC_021314	T	7	7	309792	309798	0 %	100 %	0 %	0 %	508126955
5521	NC_021314	TAT	2	6	309836	309841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	508126955
5522	NC_021314	TTTC	2	8	309886	309893	0 %	75 %	0 %	25 %	508126955
5523	NC_021314	GTT	2	6	309929	309934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	508126955
5524	NC_021314	TTTAGT	2	12	309961	309972	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	508126955
5525	NC_021314	TCTT	2	8	309975	309982	0 %	75 %	0 %	25 %	508126955
5526	NC_021314	T	6	6	309987	309992	0 %	100 %	0 %	0 %	508126955
5527	NC_021314	ACAA	2	8	310029	310036	75 %	0 %	0 %	25 %	508126955
5528	NC_021314	GAA	2	6	310061	310066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	508126956
5529	NC_021314	TCAT	2	8	310072	310079	25 %	50 %	0 %	25 %	508126956
5530	NC_021314	TTA	2	6	310108	310113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	508126956
5531	NC_021314	ATT	2	6	310116	310121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	508126956
5532	NC_021314	T	6	6	310125	310130	0 %	100 %	0 %	0 %	508126956
5533	NC_021314	AGT	2	6	310182	310187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508126956
5534	NC_021314	CAG	2	6	310188	310193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	508126956
5535	NC_021314	TCT	2	6	310500	310505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	508126956
5536	NC_021314	ATG	2	6	310549	310554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508126956
5537	NC_021314	A	6	6	310612	310617	100 %	0 %	0 %	0 %	508126956
5538	NC_021314	GTG	2	6	310732	310737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	508126956
5539	NC_021314	AAG	2	6	310780	310785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	508126956
5540	NC_021314	TTAG	2	8	310812	310819	25 %	50 %	25 %	0 %	508126956
5541	NC_021314	TTG	2	6	310894	310899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	508126956
5542	NC_021314	ATA	2	6	310927	310932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	508126956
5543	NC_021314	ACA	2	6	310951	310956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	508126956
5544	NC_021314	AAC	2	6	310957	310962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	508126956
5545	NC_021314	AGC	2	6	311184	311189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	508126956
5546	NC_021314	A	6	6	311214	311219	100 %	0 %	0 %	0 %	508126956
5547	NC_021314	GAG	2	6	311511	311516	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	508126956
5548	NC_021314	TCAA	2	8	311539	311546	50 %	25 %	0 %	25 %	508126956
5549	NC_021314	ACT	2	6	311588	311593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	508126956
5550	NC_021314	GAG	2	6	311685	311690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	508126956
5551	NC_021314	TTG	3	9	311716	311724	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	508126957
5552	NC_021314	GAA	2	6	311772	311777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	508126957
5553	NC_021314	ATG	2	6	311943	311948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508126957
5554	NC_021314	ATT	2	6	312004	312009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	508126957
5555	NC_021314	TAA	2	6	312023	312028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	508126957
5556	NC_021314	A	6	6	312027	312032	100 %	0 %	0 %	0 %	508126957
5557	NC_021314	A	6	6	312067	312072	100 %	0 %	0 %	0 %	508126957
5558	NC_021314	AAG	2	6	312178	312183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	508126957
5559	NC_021314	TTAA	2	8	312204	312211	50 %	50 %	0 %	0 %	508126957
5560	NC_021314	TCA	2	6	312212	312217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	508126957
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5562	NC_021314	T	6	6	312331	312336	0 %	100 %	0 %	0 %	508126957
5563	NC_021314	CATT	2	8	312372	312379	25 %	50 %	0 %	25 %	508126957
5564	NC_021314	AAC	2	6	312385	312390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	508126957
5565	NC_021314	TTG	2	6	312448	312453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	508126957
5566	NC_021314	T	6	6	312498	312503	0 %	100 %	0 %	0 %	508126957
5567	NC_021314	TCATG	2	10	312506	312515	20 %	40 %	20 %	20 %	508126957
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5570	NC_021314	ATC	2	6	312568	312573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	508126957
5571	NC_021314	TAA	2	6	312659	312664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	508126957
5572	NC_021314	TAT	2	6	312686	312691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	508126957
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5575	NC_021314	A	6	6	312777	312782	100 %	0 %	0 %	0 %	508126957
5576	NC_021314	TCA	2	6	312980	312985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	508126957
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5579	NC_021314	ATA	2	6	313126	313131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	508126958
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5582	NC_021314	GAA	2	6	313218	313223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	508126958
5583	NC_021314	TTA	2	6	313233	313238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	508126958
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5591	NC_021314	T	6	6	313904	313909	0 %	100 %	0 %	0 %	508126958
5592	NC_021314	ATT	2	6	313918	313923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	508126958
5593	NC_021314	ACCAA	2	10	313946	313955	60 %	0 %	0 %	40 %	508126958
5594	NC_021314	GAA	2	6	314055	314060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	508126958
5595	NC_021314	AATGG	2	10	314127	314136	40 %	20 %	40 %	0 %	508126958
5596	NC_021314	GAA	2	6	314148	314153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	508126958
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5601	NC_021314	ATTG	2	8	314280	314287	25 %	50 %	25 %	0 %	508126958
5602	NC_021314	CGC	2	6	314355	314360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	508126958
5603	NC_021314	A	6	6	314364	314369	100 %	0 %	0 %	0 %	508126958
5604	NC_021314	AAG	2	6	314386	314391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	508126958
5605	NC_021314	GAC	2	6	314412	314417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	508126958
5606	NC_021314	A	6	6	314519	314524	100 %	0 %	0 %	0 %	508126959
5607	NC_021314	TAG	2	6	314544	314549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508126959
5608	NC_021314	AAAGC	2	10	314634	314643	60 %	0 %	20 %	20 %	508126959
5609	NC_021314	ACCA	2	8	314673	314680	50 %	0 %	0 %	50 %	508126959
5610	NC_021314	GTG	2	6	314844	314849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	508126959
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5613	NC_021314	AAAAT	2	10	315412	315421	80 %	20 %	0 %	0 %	508126961
5614	NC_021314	AAG	2	6	315449	315454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	508126961
5615	NC_021314	TGA	3	9	315461	315469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508126961
5616	NC_021314	TACTT	2	10	315576	315585	20 %	60 %	0 %	20 %	508126962
5617	NC_021314	GAA	2	6	315603	315608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	508126962
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5619	NC_021314	AAG	2	6	315715	315720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	508126962
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5621	NC_021314	GAT	2	6	315755	315760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508126962
5622	NC_021314	A	6	6	315800	315805	100 %	0 %	0 %	0 %	508126962
5623	NC_021314	AAG	2	6	315822	315827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	508126962
5624	NC_021314	GAA	2	6	315876	315881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	508126962
5625	NC_021314	TTTA	2	8	315917	315924	25 %	75 %	0 %	0 %	508126962
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5656	NC_021314	A	7	7	317095	317101	100 %	0 %	0 %	0 %	508126964
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5748	NC_021314	A	6	6	322393	322398	100 %	0 %	0 %	0 %	508126973
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5995	NC_021314	ATGA	2	8	334628	334635	50 %	25 %	25 %	0 %	508126987
5996	NC_021314	AT	3	6	334648	334653	50 %	50 %	0 %	0 %	508126987
5997	NC_021314	AAAT	2	8	334674	334681	75 %	25 %	0 %	0 %	508126987
5998	NC_021314	ATT	2	6	334721	334726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	508126987
5999	NC_021314	TCTT	2	8	334737	334744	0 %	75 %	0 %	25 %	508126987
6000	NC_021314	TGC	3	9	334757	334765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	508126987

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