MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Strawberry lethal yellows phytoplasma (CPA) str. NZSb11

Total Repeats: 1013

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021236	AAAAG	2	10	208	217	80 %	0 %	20 %	0 %	501675885
2	NC_021236	AAATT	2	10	308	317	60 %	40 %	0 %	0 %	501675885
3	NC_021236	TCTAA	2	10	1898	1907	40 %	40 %	0 %	20 %	501675886
4	NC_021236	AATTT	2	10	2166	2175	40 %	60 %	0 %	0 %	501675886
5	NC_021236	TTGTT	2	10	2277	2286	0 %	80 %	20 %	0 %	501675886
6	NC_021236	AGTTC	2	10	2510	2519	20 %	40 %	20 %	20 %	501675886
7	NC_021236	AATAT	2	10	4537	4546	60 %	40 %	0 %	0 %	501675888
8	NC_021236	AAATA	2	10	6798	6807	80 %	20 %	0 %	0 %	501675889
9	NC_021236	TTAAA	2	10	9147	9156	60 %	40 %	0 %	0 %	501675890
10	NC_021236	GATTT	2	10	9284	9293	20 %	60 %	20 %	0 %	501675890
11	NC_021236	AAATT	3	15	12011	12025	60 %	40 %	0 %	0 %	501675892
12	NC_021236	TTTTA	2	10	14457	14466	20 %	80 %	0 %	0 %	501675893
13	NC_021236	GAATT	2	10	15222	15231	40 %	40 %	20 %	0 %	501675894
14	NC_021236	AATTG	2	10	21589	21598	40 %	40 %	20 %	0 %	501675901
15	NC_021236	TTCTT	2	10	22341	22350	0 %	80 %	0 %	20 %	501675901
16	NC_021236	TTAAA	2	10	23353	23362	60 %	40 %	0 %	0 %	501675902
17	NC_021236	CTTTT	2	10	23459	23468	0 %	80 %	0 %	20 %	501675902
18	NC_021236	AATTA	2	10	24659	24668	60 %	40 %	0 %	0 %	501675903
19	NC_021236	AAATA	2	10	24851	24860	80 %	20 %	0 %	0 %	501675903
20	NC_021236	TAAAA	2	10	25310	25319	80 %	20 %	0 %	0 %	501675903
21	NC_021236	CAAAA	2	10	26281	26290	80 %	0 %	0 %	20 %	501675904
22	NC_021236	ATAAA	2	10	27209	27218	80 %	20 %	0 %	0 %	501675905
23	NC_021236	AATCC	2	10	27313	27322	40 %	20 %	0 %	40 %	501675905
24	NC_021236	AAAAT	2	10	27927	27936	80 %	20 %	0 %	0 %	501675905
25	NC_021236	AAATA	2	10	28295	28304	80 %	20 %	0 %	0 %	501675905
26	NC_021236	CTTTT	2	10	29198	29207	0 %	80 %	0 %	20 %	501675906
27	NC_021236	TTCAT	2	10	29236	29245	20 %	60 %	0 %	20 %	501675906
28	NC_021236	AAAGG	2	10	30969	30978	60 %	0 %	40 %	0 %	501675908
29	NC_021236	GACTT	2	10	31259	31268	20 %	40 %	20 %	20 %	501675908
30	NC_021236	TTTAA	2	10	36004	36013	40 %	60 %	0 %	0 %	501675913
31	NC_021236	TATGA	2	10	36789	36798	40 %	40 %	20 %	0 %	501675916
32	NC_021236	TTTTG	2	10	37606	37615	0 %	80 %	20 %	0 %	501675917
33	NC_021236	CCAGT	2	10	37880	37889	20 %	20 %	20 %	40 %	501675917
34	NC_021236	TATTC	2	10	38475	38484	20 %	60 %	0 %	20 %	501675917
35	NC_021236	ATGTA	2	10	38622	38631	40 %	40 %	20 %	0 %	501675917
36	NC_021236	TTTAA	2	10	40135	40144	40 %	60 %	0 %	0 %	501675918
37	NC_021236	TTAAA	2	10	42135	42144	60 %	40 %	0 %	0 %	501675921
38	NC_021236	GAAAT	2	10	45610	45619	60 %	20 %	20 %	0 %	501675924
39	NC_021236	TAAAA	2	10	46245	46254	80 %	20 %	0 %	0 %	501675925
40	NC_021236	AAAAC	2	10	47085	47094	80 %	0 %	0 %	20 %	501675926
41	NC_021236	TAAAA	2	10	47222	47231	80 %	20 %	0 %	0 %	501675926
42	NC_021236	GAAAA	2	10	48664	48673	80 %	0 %	20 %	0 %	501675927
43	NC_021236	TTAAA	2	10	48940	48949	60 %	40 %	0 %	0 %	501675928
44	NC_021236	AAAAG	2	10	49092	49101	80 %	0 %	20 %	0 %	501675928
45	NC_021236	TTACA	2	10	51130	51139	40 %	40 %	0 %	20 %	501675929
46	NC_021236	GAATA	2	10	51278	51287	60 %	20 %	20 %	0 %	501675929
47	NC_021236	ACTGG	2	10	51873	51882	20 %	20 %	40 %	20 %	501675929
48	NC_021236	CAAAA	2	10	52147	52156	80 %	0 %	0 %	20 %	501675929
49	NC_021236	AAACC	2	10	54158	54167	60 %	0 %	0 %	40 %	501675933
50	NC_021236	TGGGA	2	10	54193	54202	20 %	20 %	60 %	0 %	501675933
51	NC_021236	TTTAG	2	10	54284	54293	20 %	60 %	20 %	0 %	501675933
52	NC_021236	TTAAT	2	10	55507	55516	40 %	60 %	0 %	0 %	501675934
53	NC_021236	AAATT	2	10	55634	55643	60 %	40 %	0 %	0 %	501675935
54	NC_021236	CAAAG	2	10	55843	55852	60 %	0 %	20 %	20 %	501675935
55	NC_021236	TTAAA	2	10	58157	58166	60 %	40 %	0 %	0 %	501675938
56	NC_021236	TAATT	2	10	58413	58422	40 %	60 %	0 %	0 %	501675939
57	NC_021236	AAACC	2	10	58900	58909	60 %	0 %	0 %	40 %	501675940
58	NC_021236	CCAAA	2	10	59820	59829	60 %	0 %	0 %	40 %	501675943
59	NC_021236	AAAAG	2	10	59839	59848	80 %	0 %	20 %	0 %	501675943
60	NC_021236	TAATT	2	10	60181	60190	40 %	60 %	0 %	0 %	501675944
61	NC_021236	AAATT	2	10	60707	60716	60 %	40 %	0 %	0 %	501675945
62	NC_021236	AACAA	2	10	60719	60728	80 %	0 %	0 %	20 %	501675945
63	NC_021236	ATTTT	2	10	60965	60974	20 %	80 %	0 %	0 %	501675947
64	NC_021236	CAAAA	2	10	62741	62750	80 %	0 %	0 %	20 %	501675948
65	NC_021236	AAATC	2	10	62835	62844	60 %	20 %	0 %	20 %	501675948
66	NC_021236	CAAAA	2	10	63287	63296	80 %	0 %	0 %	20 %	501675949
67	NC_021236	AAATT	2	10	63300	63309	60 %	40 %	0 %	0 %	501675949
68	NC_021236	ACCCA	2	10	63347	63356	40 %	0 %	0 %	60 %	501675949
69	NC_021236	GGTTG	2	10	68881	68890	0 %	40 %	60 %	0 %	501675955
70	NC_021236	AATTA	2	10	71080	71089	60 %	40 %	0 %	0 %	501675957
71	NC_021236	TTGTC	2	10	73184	73193	0 %	60 %	20 %	20 %	501675961
72	NC_021236	AACAA	2	10	75109	75118	80 %	0 %	0 %	20 %	501675962
73	NC_021236	ATTAA	2	10	75186	75195	60 %	40 %	0 %	0 %	501675962
74	NC_021236	AAAAG	2	10	75320	75329	80 %	0 %	20 %	0 %	501675962
75	NC_021236	TTTTC	2	10	78599	78608	0 %	80 %	0 %	20 %	501675967
76	NC_021236	TTTTA	2	10	78660	78669	20 %	80 %	0 %	0 %	501675967
77	NC_021236	CCAAA	2	10	79960	79969	60 %	0 %	0 %	40 %	501675968
78	NC_021236	TTTTA	2	10	80459	80468	20 %	80 %	0 %	0 %	501675970
79	NC_021236	AAATT	2	10	80836	80845	60 %	40 %	0 %	0 %	501675970
80	NC_021236	AAATC	2	10	81143	81152	60 %	20 %	0 %	20 %	501675970
81	NC_021236	TTAAT	2	10	81300	81309	40 %	60 %	0 %	0 %	501675971
82	NC_021236	CCAAG	2	10	82925	82934	40 %	0 %	20 %	40 %	501675974
83	NC_021236	TTTTA	2	10	83081	83090	20 %	80 %	0 %	0 %	501675974
84	NC_021236	TATTT	2	10	85278	85287	20 %	80 %	0 %	0 %	501675976
85	NC_021236	ATTTA	2	10	86519	86528	40 %	60 %	0 %	0 %	501675976
86	NC_021236	CCAAC	2	10	88042	88051	40 %	0 %	0 %	60 %	501675978
87	NC_021236	CTTTA	2	10	88114	88123	20 %	60 %	0 %	20 %	501675978
88	NC_021236	TCAAA	2	10	89933	89942	60 %	20 %	0 %	20 %	501675982
89	NC_021236	AAACA	2	10	90504	90513	80 %	0 %	0 %	20 %	501675982
90	NC_021236	TTTTG	2	10	91923	91932	0 %	80 %	20 %	0 %	501675983
91	NC_021236	AGAAA	2	10	93466	93475	80 %	0 %	20 %	0 %	501675984
92	NC_021236	ATTTA	2	10	94172	94181	40 %	60 %	0 %	0 %	501675985
93	NC_021236	GATAA	2	10	94739	94748	60 %	20 %	20 %	0 %	501675986
94	NC_021236	TAATT	2	10	96590	96599	40 %	60 %	0 %	0 %	501675988
95	NC_021236	ATATC	2	10	96806	96815	40 %	40 %	0 %	20 %	501675988
96	NC_021236	TGGGT	2	10	97602	97611	0 %	40 %	60 %	0 %	501675988
97	NC_021236	TAATT	2	10	97648	97657	40 %	60 %	0 %	0 %	501675988
98	NC_021236	GTTTT	2	10	97661	97670	0 %	80 %	20 %	0 %	501675988
99	NC_021236	TAATT	2	10	101913	101922	40 %	60 %	0 %	0 %	501675992
100	NC_021236	TTAAT	2	10	102257	102266	40 %	60 %	0 %	0 %	501675992
101	NC_021236	AATTA	2	10	102440	102449	60 %	40 %	0 %	0 %	501675993
102	NC_021236	CTTTT	2	10	102782	102791	0 %	80 %	0 %	20 %	501675994
103	NC_021236	GGTTT	2	10	103721	103730	0 %	60 %	40 %	0 %	501675997
104	NC_021236	AATTA	2	10	104208	104217	60 %	40 %	0 %	0 %	501675998
105	NC_021236	TTTAA	2	10	104484	104493	40 %	60 %	0 %	0 %	501675999
106	NC_021236	TGATT	2	10	106087	106096	20 %	60 %	20 %	0 %	501676002
107	NC_021236	CTTTG	2	10	106220	106229	0 %	60 %	20 %	20 %	501676002
108	NC_021236	AATTA	2	10	106555	106564	60 %	40 %	0 %	0 %	501676003
109	NC_021236	CTAAA	2	10	107779	107788	60 %	20 %	0 %	20 %	501676004
110	NC_021236	TCCCA	2	10	107870	107879	20 %	20 %	0 %	60 %	501676004
111	NC_021236	TTGCT	2	10	109050	109059	0 %	60 %	20 %	20 %	501676006
112	NC_021236	GTTAA	2	10	110579	110588	40 %	40 %	20 %	0 %	501676007
113	NC_021236	TCATA	2	10	111902	111911	40 %	40 %	0 %	20 %	501676009
114	NC_021236	CTTCA	2	10	111960	111969	20 %	40 %	0 %	40 %	501676009
115	NC_021236	AAATT	2	10	112206	112215	60 %	40 %	0 %	0 %	501676010
116	NC_021236	TTAAA	2	10	112565	112574	60 %	40 %	0 %	0 %	501676011
117	NC_021236	TTTTG	2	10	115364	115373	0 %	80 %	20 %	0 %	501676016
118	NC_021236	TAAAA	2	10	115390	115399	80 %	20 %	0 %	0 %	501676016
119	NC_021236	TATAA	2	10	115438	115447	60 %	40 %	0 %	0 %	501676016
120	NC_021236	TTGTT	2	10	115845	115854	0 %	80 %	20 %	0 %	501676016
121	NC_021236	ATTTT	2	10	116751	116760	20 %	80 %	0 %	0 %	501676017
122	NC_021236	ATTAA	2	10	117949	117958	60 %	40 %	0 %	0 %	501676018
123	NC_021236	TTGCA	2	10	118107	118116	20 %	40 %	20 %	20 %	501676018
124	NC_021236	TTTGT	2	10	118188	118197	0 %	80 %	20 %	0 %	501676018
125	NC_021236	TAATA	2	10	120759	120768	60 %	40 %	0 %	0 %	501676020
126	NC_021236	TAATC	2	10	121839	121848	40 %	40 %	0 %	20 %	501676021
127	NC_021236	CAAAA	2	10	122905	122914	80 %	0 %	0 %	20 %	501676022
128	NC_021236	AAATA	2	10	123334	123343	80 %	20 %	0 %	0 %	501676022
129	NC_021236	TTTAA	2	10	124484	124493	40 %	60 %	0 %	0 %	501676023
130	NC_021236	TGAAG	2	10	125068	125077	40 %	20 %	40 %	0 %	501676025
131	NC_021236	TTTCA	2	10	125087	125096	20 %	60 %	0 %	20 %	501676025
132	NC_021236	AAAAG	2	10	129456	129465	80 %	0 %	20 %	0 %	501676029
133	NC_021236	ATCAC	2	10	130847	130856	40 %	20 %	0 %	40 %	501676031
134	NC_021236	GAAAA	2	10	131822	131831	80 %	0 %	20 %	0 %	501676032
135	NC_021236	CTTCA	2	10	131840	131849	20 %	40 %	0 %	40 %	501676032
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137	NC_021236	CAAAA	2	10	132009	132018	80 %	0 %	0 %	20 %	501676033
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