MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Strawberry lethal yellows phytoplasma (CPA) str. NZSb11

Total Repeats: 11860

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021236	ATT	2	6	8	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501675885
2	NC_021236	GAA	2	6	28	33	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501675885
3	NC_021236	AGA	2	6	39	44	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501675885
4	NC_021236	GAA	2	6	112	117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501675885
5	NC_021236	TTA	2	6	125	130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501675885
6	NC_021236	AAT	2	6	195	200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501675885
7	NC_021236	ATT	2	6	235	240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501675885
8	NC_021236	AGA	3	9	420	428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501675885
9	NC_021236	GAA	2	6	565	570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501675885
10	NC_021236	TGA	2	6	645	650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501675885
11	NC_021236	ATT	2	6	736	741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501675885
12	NC_021236	TAT	2	6	774	779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501675885
13	NC_021236	AGG	2	6	804	809	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	501675885
14	NC_021236	ACC	2	6	842	847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501675885
15	NC_021236	AAC	2	6	889	894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501675885
16	NC_021236	AAG	2	6	911	916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501675885
17	NC_021236	ATA	2	6	947	952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501675885
18	NC_021236	ATT	2	6	981	986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501675885
19	NC_021236	ATT	2	6	1237	1242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501675885
20	NC_021236	AAT	2	6	1360	1365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501675885
21	NC_021236	TAA	2	6	1432	1437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501675886
22	NC_021236	AAC	2	6	1452	1457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501675886
23	NC_021236	AAG	2	6	1614	1619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501675886
24	NC_021236	TCT	2	6	1823	1828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501675886
25	NC_021236	AAG	2	6	1845	1850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501675886
26	NC_021236	GAT	2	6	2084	2089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501675886
27	NC_021236	TGT	2	6	2191	2196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501675886
28	NC_021236	GAT	2	6	2210	2215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501675886
29	NC_021236	AGA	2	6	2257	2262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501675886
30	NC_021236	CTT	2	6	2439	2444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501675886
31	NC_021236	TAC	2	6	2491	2496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501675886
32	NC_021236	AGA	3	9	2500	2508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501675886
33	NC_021236	AAC	2	6	3383	3388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501675887
34	NC_021236	ATT	2	6	3395	3400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501675887
35	NC_021236	ATG	2	6	3404	3409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501675887
36	NC_021236	CTT	2	6	4464	4469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501675888
37	NC_021236	GAT	2	6	5813	5818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501675889
38	NC_021236	TTA	2	6	5843	5848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501675889
39	NC_021236	GAT	2	6	5855	5860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501675889
40	NC_021236	AGA	2	6	5875	5880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501675889
41	NC_021236	ATA	2	6	6030	6035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501675889
42	NC_021236	ATT	2	6	6148	6153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501675889
43	NC_021236	TAA	2	6	6196	6201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501675889
44	NC_021236	TTA	2	6	6256	6261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501675889
45	NC_021236	AGA	2	6	6361	6366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501675889
46	NC_021236	TAA	2	6	6438	6443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501675889
47	NC_021236	AGT	2	6	6449	6454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501675889
48	NC_021236	TAA	2	6	6472	6477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501675889
49	NC_021236	ACT	2	6	6549	6554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501675889
50	NC_021236	TTG	2	6	6564	6569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501675889
51	NC_021236	TTA	2	6	6657	6662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501675889
52	NC_021236	AGT	2	6	6722	6727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501675889
53	NC_021236	ATA	2	6	6846	6851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501675889
54	NC_021236	GGT	2	6	8333	8338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501675890
55	NC_021236	TAT	2	6	8392	8397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501675890
56	NC_021236	TTA	2	6	8547	8552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501675890
57	NC_021236	CTT	2	6	8577	8582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501675890
58	NC_021236	TTC	2	6	8673	8678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501675890
59	NC_021236	CAA	2	6	8852	8857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501675890
60	NC_021236	ATT	2	6	8898	8903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501675890
61	NC_021236	ATG	2	6	8907	8912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501675890
62	NC_021236	AAT	2	6	8921	8926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501675890
63	NC_021236	ATT	2	6	8946	8951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501675890
64	NC_021236	TCA	2	6	8952	8957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501675890
65	NC_021236	ATT	2	6	8958	8963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501675890
66	NC_021236	GTT	2	6	8987	8992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501675890
67	NC_021236	ATT	2	6	9092	9097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501675890
68	NC_021236	TAG	2	6	9189	9194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501675890
69	NC_021236	CAA	2	6	9236	9241	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501675890
70	NC_021236	ATA	2	6	9363	9368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501675890
71	NC_021236	AAT	2	6	9433	9438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501675890
72	NC_021236	CAT	2	6	9463	9468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501675890
73	NC_021236	TTA	2	6	9551	9556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501675890
74	NC_021236	CCT	2	6	9579	9584	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	501675890
75	NC_021236	TTG	2	6	9600	9605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501675890
76	NC_021236	TAT	2	6	9673	9678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501675890
77	NC_021236	GTT	2	6	9710	9715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501675890
78	NC_021236	TAA	2	6	9805	9810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501675890
79	NC_021236	TGA	2	6	9838	9843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501675890
80	NC_021236	CTA	2	6	10363	10368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501675891
81	NC_021236	ATT	3	9	10378	10386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501675891
82	NC_021236	CAA	2	6	10491	10496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501675891
83	NC_021236	TTC	2	6	10507	10512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501675891
84	NC_021236	AAC	2	6	10595	10600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501675891
85	NC_021236	ATT	2	6	10635	10640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501675891
86	NC_021236	ATT	2	6	10739	10744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501675891
87	NC_021236	AGA	2	6	10763	10768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501675891
88	NC_021236	TTA	2	6	10771	10776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501675891
89	NC_021236	TAA	2	6	10961	10966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501675891
90	NC_021236	GAT	2	6	11061	11066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501675891
91	NC_021236	TTA	2	6	11106	11111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501675891
92	NC_021236	TAA	2	6	11150	11155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501675891
93	NC_021236	ATG	2	6	11836	11841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501675892
94	NC_021236	TTC	2	6	11869	11874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501675892
95	NC_021236	ATC	2	6	11938	11943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501675892
96	NC_021236	AAT	2	6	11975	11980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501675892
97	NC_021236	TTC	2	6	11986	11991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501675892
98	NC_021236	CTT	2	6	11999	12004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501675892
99	NC_021236	AAT	2	6	13201	13206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501675893
100	NC_021236	AGG	2	6	13257	13262	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	501675893
101	NC_021236	TTG	2	6	13319	13324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501675893
102	NC_021236	CGG	2	6	13455	13460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501675893
103	NC_021236	TTA	2	6	13525	13530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501675893
104	NC_021236	ATT	2	6	13539	13544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501675893
105	NC_021236	CCA	2	6	13570	13575	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501675893
106	NC_021236	TTA	2	6	13631	13636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501675893
107	NC_021236	AAG	2	6	13778	13783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501675893
108	NC_021236	AAG	2	6	13823	13828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501675893
109	NC_021236	AGT	2	6	13830	13835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501675893
110	NC_021236	TGA	2	6	13866	13871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501675893
111	NC_021236	ATT	2	6	13897	13902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501675893
112	NC_021236	TTG	2	6	13943	13948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501675893
113	NC_021236	GTA	2	6	13991	13996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501675893
114	NC_021236	ATA	2	6	14069	14074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501675893
115	NC_021236	ATT	2	6	14092	14097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501675893
116	NC_021236	TTA	2	6	14098	14103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501675893
117	NC_021236	TAT	2	6	14193	14198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501675893
118	NC_021236	CTT	2	6	14204	14209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501675893
119	NC_021236	TAA	2	6	14238	14243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501675893
120	NC_021236	CTT	2	6	14254	14259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501675893
121	NC_021236	TTA	2	6	14279	14284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501675893
122	NC_021236	CGT	2	6	14395	14400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501675893
123	NC_021236	AGA	2	6	14445	14450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501675893
124	NC_021236	TGA	2	6	14496	14501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501675893
125	NC_021236	CGT	2	6	14590	14595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501675893
126	NC_021236	AAG	2	6	14606	14611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501675893
127	NC_021236	GTT	2	6	14623	14628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501675893
128	NC_021236	CAA	2	6	14669	14674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501675893
129	NC_021236	AAG	2	6	14786	14791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501675893
130	NC_021236	ATC	2	6	14803	14808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501675893
131	NC_021236	TAT	3	9	14856	14864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501675893
132	NC_021236	TAT	2	6	14868	14873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501675893
133	NC_021236	ACA	2	6	15214	15219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501675894
134	NC_021236	CAA	2	6	15263	15268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501675894
135	NC_021236	TGA	2	6	15310	15315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501675894
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138	NC_021236	AAG	2	6	15381	15386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501675894
139	NC_021236	ATG	2	6	15525	15530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501675894
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152	NC_021236	ATT	2	6	18222	18227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501675895
153	NC_021236	ATT	2	6	18255	18260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501675895
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161	NC_021236	TAT	2	6	18546	18551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501675896
162	NC_021236	ATA	2	6	19437	19442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501675898
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164	NC_021236	ACT	2	6	19499	19504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501675898
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172	NC_021236	ATT	2	6	19933	19938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501675898
173	NC_021236	TAA	2	6	19945	19950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501675898
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250	NC_021236	TCT	2	6	25995	26000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501675904
251	NC_021236	GAT	2	6	26026	26031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501675904
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253	NC_021236	GCA	2	6	26064	26069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501675904
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