MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Strawberry lethal yellows phytoplasma (CPA) str. NZSb11

Total Repeats: 23700

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_021236	ATC	2	6	45648	45653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501675924
1003	NC_021236	AATA	2	8	45664	45671	75 %	25 %	0 %	0 %	501675924
1004	NC_021236	A	6	6	45711	45716	100 %	0 %	0 %	0 %	501675925
1005	NC_021236	GTT	2	6	45749	45754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501675925
1006	NC_021236	ATT	3	9	45759	45767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501675925
1007	NC_021236	ATAA	2	8	45772	45779	75 %	25 %	0 %	0 %	501675925
1008	NC_021236	AAT	2	6	45799	45804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501675925
1009	NC_021236	GAA	2	6	45814	45819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501675925
1010	NC_021236	AGA	2	6	45840	45845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501675925
1011	NC_021236	GAA	2	6	45850	45855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501675925
1012	NC_021236	AAC	2	6	45858	45863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501675925
1013	NC_021236	ACA	2	6	45879	45884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501675925
1014	NC_021236	AATT	2	8	45977	45984	50 %	50 %	0 %	0 %	501675925
1015	NC_021236	TAC	2	6	46011	46016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501675925
1016	NC_021236	AGA	2	6	46035	46040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501675925
1017	NC_021236	ATTT	2	8	46052	46059	25 %	75 %	0 %	0 %	501675925
1018	NC_021236	A	6	6	46094	46099	100 %	0 %	0 %	0 %	501675925
1019	NC_021236	ATG	2	6	46142	46147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501675925
1020	NC_021236	AT	3	6	46173	46178	50 %	50 %	0 %	0 %	501675925
1021	NC_021236	A	6	6	46184	46189	100 %	0 %	0 %	0 %	501675925
1022	NC_021236	TCA	2	6	46213	46218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501675925
1023	NC_021236	TAAAA	2	10	46245	46254	80 %	20 %	0 %	0 %	501675925
1024	NC_021236	CAA	2	6	46264	46269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501675925
1025	NC_021236	A	6	6	46268	46273	100 %	0 %	0 %	0 %	501675925
1026	NC_021236	CAA	2	6	46288	46293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501675925
1027	NC_021236	TGA	2	6	46320	46325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501675925
1028	NC_021236	ATT	2	6	46326	46331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501675925
1029	NC_021236	ACAAAA	2	12	46332	46343	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	501675925
1030	NC_021236	TAA	2	6	46382	46387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501675925
1031	NC_021236	A	8	8	46390	46397	100 %	0 %	0 %	0 %	501675925
1032	NC_021236	A	6	6	46407	46412	100 %	0 %	0 %	0 %	501675925
1033	NC_021236	AATC	2	8	46432	46439	50 %	25 %	0 %	25 %	501675925
1034	NC_021236	ATA	2	6	46445	46450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501675925
1035	NC_021236	A	6	6	46484	46489	100 %	0 %	0 %	0 %	501675925
1036	NC_021236	CAA	2	6	46986	46991	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501675926
1037	NC_021236	AAAAC	2	10	47085	47094	80 %	0 %	0 %	20 %	501675926
1038	NC_021236	AAC	2	6	47125	47130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501675926
1039	NC_021236	TGA	2	6	47183	47188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501675926
1040	NC_021236	TAAAA	2	10	47222	47231	80 %	20 %	0 %	0 %	501675926
1041	NC_021236	AAT	2	6	47285	47290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501675926
1042	NC_021236	GAA	2	6	47304	47309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501675926
1043	NC_021236	ACA	2	6	47321	47326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501675926
1044	NC_021236	AGA	2	6	47345	47350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501675926
1045	NC_021236	CTG	2	6	47365	47370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501675926
1046	NC_021236	ACA	2	6	47399	47404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501675926
1047	NC_021236	CAA	2	6	47418	47423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501675926
1048	NC_021236	AGT	2	6	47457	47462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501675926
1049	NC_021236	ATA	2	6	47476	47481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501675926
1050	NC_021236	TGC	2	6	47488	47493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501675926
1051	NC_021236	TAA	2	6	47501	47506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501675926
1052	NC_021236	AGA	2	6	47525	47530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501675926
1053	NC_021236	CAA	2	6	47548	47553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501675926
1054	NC_021236	A	7	7	47566	47572	100 %	0 %	0 %	0 %	501675926
1055	NC_021236	TTG	2	6	47575	47580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501675926
1056	NC_021236	A	7	7	47585	47591	100 %	0 %	0 %	0 %	501675926
1057	NC_021236	A	8	8	47634	47641	100 %	0 %	0 %	0 %	501675926
1058	NC_021236	TGC	2	6	47672	47677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501675926
1059	NC_021236	T	6	6	47717	47722	0 %	100 %	0 %	0 %	501675926
1060	NC_021236	T	8	8	47728	47735	0 %	100 %	0 %	0 %	501675926
1061	NC_021236	AT	3	6	47754	47759	50 %	50 %	0 %	0 %	501675926
1062	NC_021236	ATA	2	6	47779	47784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501675926
1063	NC_021236	AAT	2	6	47790	47795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501675926
1064	NC_021236	GGAA	2	8	47985	47992	50 %	0 %	50 %	0 %	501675927
1065	NC_021236	A	6	6	48004	48009	100 %	0 %	0 %	0 %	501675927
1066	NC_021236	TA	3	6	48042	48047	50 %	50 %	0 %	0 %	501675927
1067	NC_021236	TAA	2	6	48059	48064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501675927
1068	NC_021236	GGT	2	6	48082	48087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501675927
1069	NC_021236	AATA	2	8	48103	48110	75 %	25 %	0 %	0 %	501675927
1070	NC_021236	TTGAAT	2	12	48167	48178	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	501675927
1071	NC_021236	AATA	2	8	48222	48229	75 %	25 %	0 %	0 %	501675927
1072	NC_021236	A	6	6	48238	48243	100 %	0 %	0 %	0 %	501675927
1073	NC_021236	GAA	2	6	48253	48258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501675927
1074	NC_021236	ATGG	2	8	48298	48305	25 %	25 %	50 %	0 %	501675927
1075	NC_021236	GAG	2	6	48313	48318	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	501675927
1076	NC_021236	CAG	2	6	48453	48458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501675927
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1078	NC_021236	TGA	2	6	48498	48503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501675927
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1080	NC_021236	CAA	2	6	48528	48533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501675927
1081	NC_021236	GAA	2	6	48586	48591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501675927
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1083	NC_021236	AGTT	2	8	48615	48622	25 %	50 %	25 %	0 %	501675927
1084	NC_021236	GAAAA	2	10	48664	48673	80 %	0 %	20 %	0 %	501675927
1085	NC_021236	ACT	2	6	48674	48679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501675927
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1089	NC_021236	AAT	2	6	48751	48756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501675927
1090	NC_021236	A	7	7	48912	48918	100 %	0 %	0 %	0 %	501675928
1091	NC_021236	TTAAA	2	10	48940	48949	60 %	40 %	0 %	0 %	501675928
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1094	NC_021236	CAAT	2	8	49077	49084	50 %	25 %	0 %	25 %	501675928
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1098	NC_021236	AT	3	6	49349	49354	50 %	50 %	0 %	0 %	501675928
1099	NC_021236	AAAAGA	2	12	49368	49379	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	501675928
1100	NC_021236	TCA	2	6	49400	49405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501675928
1101	NC_021236	AATT	2	8	49408	49415	50 %	50 %	0 %	0 %	501675928
1102	NC_021236	TTA	2	6	49473	49478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501675928
1103	NC_021236	ATT	2	6	49507	49512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501675928
1104	NC_021236	A	6	6	49544	49549	100 %	0 %	0 %	0 %	501675928
1105	NC_021236	TA	3	6	49611	49616	50 %	50 %	0 %	0 %	501675928
1106	NC_021236	ATT	2	6	49640	49645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501675928
1107	NC_021236	GAT	2	6	49655	49660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501675928
1108	NC_021236	ATT	2	6	49680	49685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501675928
1109	NC_021236	ACA	2	6	49690	49695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501675928
1110	NC_021236	TAAT	2	8	49723	49730	50 %	50 %	0 %	0 %	501675928
1111	NC_021236	TAA	2	6	49753	49758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501675928
1112	NC_021236	TTC	2	6	49768	49773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501675928
1113	NC_021236	GGC	2	6	49834	49839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501675928
1114	NC_021236	AAG	2	6	49841	49846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501675928
1115	NC_021236	ATA	2	6	50435	50440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501675929
1116	NC_021236	A	6	6	50505	50510	100 %	0 %	0 %	0 %	501675929
1117	NC_021236	A	6	6	50523	50528	100 %	0 %	0 %	0 %	501675929
1118	NC_021236	GAAT	2	8	50543	50550	50 %	25 %	25 %	0 %	501675929
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1120	NC_021236	CAA	2	6	50682	50687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501675929
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1122	NC_021236	ATAAAA	2	12	50732	50743	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	501675929
1123	NC_021236	AAT	2	6	50778	50783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501675929
1124	NC_021236	AAC	2	6	50798	50803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501675929
1125	NC_021236	TCT	2	6	50828	50833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501675929
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1128	NC_021236	TA	3	6	50917	50922	50 %	50 %	0 %	0 %	501675929
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