MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty21a

Total Repeats: 59108

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021176	CGG	2	6	354	359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652560
2	NC_021176	TGG	2	6	476	481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488652560
3	NC_021176	GAT	2	6	483	488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652560
4	NC_021176	CGG	2	6	501	506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652560
5	NC_021176	CTG	2	6	664	669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652560
6	NC_021176	CGC	2	6	693	698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652560
7	NC_021176	CTG	2	6	796	801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652560
8	NC_021176	CGC	2	6	858	863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652560
9	NC_021176	TGG	2	6	932	937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488652560
10	NC_021176	CCG	3	9	965	973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652560
11	NC_021176	GCC	2	6	979	984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652560
12	NC_021176	CTG	2	6	999	1004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652560
13	NC_021176	CGA	2	6	1233	1238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652560
14	NC_021176	AAC	2	6	1273	1278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488652560
15	NC_021176	GAT	2	6	1317	1322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652560
16	NC_021176	GGC	2	6	1329	1334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652560
17	NC_021176	CGC	2	6	1344	1349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652560
18	NC_021176	GGT	2	6	1371	1376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488652560
19	NC_021176	TCC	2	6	1390	1395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488652560
20	NC_021176	CCG	2	6	1446	1451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652560
21	NC_021176	GCT	2	6	1491	1496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652560
22	NC_021176	TGT	2	6	1536	1541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488652560
23	NC_021176	TTC	2	6	1582	1587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488652560
24	NC_021176	TCT	2	6	1636	1641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488652560
25	NC_021176	TGG	2	6	1658	1663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488652560
26	NC_021176	ACG	2	6	1670	1675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652560
27	NC_021176	CCA	2	6	1679	1684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488652560
28	NC_021176	CGG	2	6	1755	1760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652560
29	NC_021176	CGG	2	6	1764	1769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652560
30	NC_021176	GAA	2	6	1809	1814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488652560
31	NC_021176	GCG	2	6	1838	1843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652560
32	NC_021176	ATC	2	6	1967	1972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652560
33	NC_021176	TTG	2	6	1988	1993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488652560
34	NC_021176	TCG	2	6	2086	2091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652560
35	NC_021176	ACT	2	6	2096	2101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652560
36	NC_021176	CGC	3	9	2118	2126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652560
37	NC_021176	CTG	2	6	2200	2205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652560
38	NC_021176	TGA	2	6	2214	2219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652560
39	NC_021176	GAC	2	6	2512	2517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652560
40	NC_021176	GCC	2	6	2524	2529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652560
41	NC_021176	TGA	2	6	2547	2552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652560
42	NC_021176	ATT	2	6	2684	2689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488652560
43	NC_021176	TGC	2	6	2708	2713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652560
44	NC_021176	ATG	2	6	2732	2737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652560
45	NC_021176	CGG	3	9	2741	2749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652560
46	NC_021176	AGC	2	6	2917	2922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652561
47	NC_021176	GCC	2	6	2968	2973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652561
48	NC_021176	CGT	2	6	3106	3111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652561
49	NC_021176	CGC	2	6	3112	3117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652561
50	NC_021176	GCA	2	6	3207	3212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652561
51	NC_021176	TGA	2	6	3258	3263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652561
52	NC_021176	GAA	2	6	3266	3271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488652561
53	NC_021176	ATT	2	6	3278	3283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488652561
54	NC_021176	CAG	2	6	3287	3292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652561
55	NC_021176	TGA	2	6	3304	3309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652561
56	NC_021176	GCC	2	6	3464	3469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652561
57	NC_021176	TGA	2	6	3474	3479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652561
58	NC_021176	CGG	2	6	3705	3710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652561
59	NC_021176	AGT	2	6	3718	3723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652561
60	NC_021176	CAG	2	6	3809	3814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652562
61	NC_021176	TGA	2	6	3862	3867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652562
62	NC_021176	GCA	2	6	3937	3942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652562
63	NC_021176	CGG	2	6	4060	4065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652562
64	NC_021176	GCG	2	6	4098	4103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652562
65	NC_021176	GTC	2	6	4190	4195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652562
66	NC_021176	GGC	2	6	4253	4258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652562
67	NC_021176	TGA	2	6	4324	4329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652562
68	NC_021176	GAA	2	6	4331	4336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488652562
69	NC_021176	GCC	2	6	4383	4388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652562
70	NC_021176	CTA	2	6	4405	4410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652562
71	NC_021176	CTG	2	6	4502	4507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652562
72	NC_021176	CGC	2	6	4543	4548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652562
73	NC_021176	GGA	2	6	4669	4674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488652562
74	NC_021176	CCG	2	6	4681	4686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652562
75	NC_021176	GCG	2	6	4718	4723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652562
76	NC_021176	ACA	2	6	4741	4746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488652562
77	NC_021176	GCG	2	6	4793	4798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652562
78	NC_021176	CAT	2	6	4964	4969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652562
79	NC_021176	GCC	2	6	4985	4990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652562
80	NC_021176	ATG	2	6	5003	5008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652562
81	NC_021176	TCA	2	6	5163	5168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652563
82	NC_021176	AAT	2	6	5228	5233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488652563
83	NC_021176	TCA	2	6	5242	5247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652563
84	NC_021176	ACC	2	6	5277	5282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488652563
85	NC_021176	TCA	2	6	5301	5306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652563
86	NC_021176	TTC	2	6	5340	5345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488652563
87	NC_021176	CAC	3	9	5384	5392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488652563
88	NC_021176	TGT	2	6	5568	5573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488652563
89	NC_021176	CGT	2	6	5593	5598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652563
90	NC_021176	GCG	2	6	5755	5760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652563
91	NC_021176	GCT	2	6	5788	5793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652563
92	NC_021176	ACC	2	6	6096	6101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488652564
93	NC_021176	CAA	2	6	6110	6115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488652564
94	NC_021176	CGA	2	6	6301	6306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652564
95	NC_021176	CAG	2	6	6437	6442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652564
96	NC_021176	ATC	2	6	6447	6452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652564
97	NC_021176	GAT	2	6	6467	6472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652564
98	NC_021176	ACG	2	6	6535	6540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652564
99	NC_021176	GAT	2	6	6815	6820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652564
100	NC_021176	GCG	2	6	6862	6867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652564
101	NC_021176	CGA	2	6	6940	6945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652564
102	NC_021176	GCC	2	6	7013	7018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652564
103	NC_021176	AGG	2	6	7078	7083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488652564
104	NC_021176	ATG	2	6	7095	7100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652564
105	NC_021176	GCG	2	6	7140	7145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652564
106	NC_021176	GCC	2	6	7226	7231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652564
107	NC_021176	AGC	2	6	7332	7337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652564
108	NC_021176	TAA	2	6	7372	7377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488652564
109	NC_021176	CAC	2	6	7697	7702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488652565
110	NC_021176	CAG	2	6	7845	7850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652565
111	NC_021176	AGC	2	6	7851	7856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652565
112	NC_021176	CAG	2	6	7866	7871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652565
113	NC_021176	GTT	2	6	7872	7877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488652565
114	NC_021176	ATG	2	6	8023	8028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652565
115	NC_021176	AAG	2	6	8107	8112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488652565
116	NC_021176	GCT	2	6	8132	8137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652565
117	NC_021176	TAC	2	6	8298	8303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652565
118	NC_021176	CGT	2	6	8324	8329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652565
119	NC_021176	GCA	2	6	8513	8518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652565
120	NC_021176	CTG	2	6	8610	8615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652565
121	NC_021176	GCG	2	6	8778	8783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652566
122	NC_021176	ACC	2	6	8837	8842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488652566
123	NC_021176	ATC	2	6	8885	8890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652566
124	NC_021176	TGA	2	6	8914	8919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652566
125	NC_021176	GCT	2	6	9229	9234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652566
126	NC_021176	GTC	2	6	9310	9315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652566
127	NC_021176	CAG	2	6	9529	9534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652567
128	NC_021176	GGC	2	6	9580	9585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652567
129	NC_021176	GAA	2	6	9598	9603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488652567
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254	NC_021176	CGT	2	6	18208	18213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652577
255	NC_021176	CGG	2	6	18439	18444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652577
256	NC_021176	CCG	2	6	18474	18479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652577
257	NC_021176	GTG	2	6	18515	18520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488652577
258	NC_021176	AGA	2	6	18610	18615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488652577
259	NC_021176	GCT	2	6	18631	18636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652577
260	NC_021176	GCT	2	6	18752	18757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652577
261	NC_021176	TGA	2	6	18777	18782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652577
262	NC_021176	CTT	2	6	18790	18795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488652577
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268	NC_021176	CGA	2	6	19393	19398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652577
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271	NC_021176	TGA	2	6	19489	19494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652577
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274	NC_021176	GAA	2	6	19751	19756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488652577
275	NC_021176	GAT	2	6	19775	19780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652577
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282	NC_021176	AAC	2	6	20286	20291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488652578
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285	NC_021176	CTT	2	6	20319	20324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488652578
286	NC_021176	CCG	2	6	20389	20394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652578
287	NC_021176	CGC	2	6	20474	20479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652578
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289	NC_021176	CCG	2	6	20491	20496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652578
290	NC_021176	GAA	2	6	20753	20758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488652578
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292	NC_021176	GCC	2	6	20832	20837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652578
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373	NC_021176	GAC	2	6	26653	26658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652583
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