MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty21a

Total Repeats: 84382

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_021176	GCT	2	6	211497	211502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652747
4002	NC_021176	GTC	2	6	211513	211518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652747
4003	NC_021176	T	6	6	211538	211543	0 %	100 %	0 %	0 %	488652747
4004	NC_021176	GCA	2	6	211588	211593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652747
4005	NC_021176	GTG	2	6	211637	211642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488652747
4006	NC_021176	GGT	2	6	211647	211652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488652747
4007	NC_021176	CAC	2	6	211659	211664	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488652747
4008	NC_021176	CCA	2	6	211681	211686	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488652747
4009	NC_021176	TTG	2	6	211716	211721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488652747
4010	NC_021176	GTG	2	6	211748	211753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488652747
4011	NC_021176	C	7	7	211827	211833	0 %	0 %	0 %	100 %	488652747
4012	NC_021176	GGCG	2	8	211872	211879	0 %	0 %	75 %	25 %	488652747
4013	NC_021176	TGG	2	6	211883	211888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488652747
4014	NC_021176	ATCT	2	8	211911	211918	25 %	50 %	0 %	25 %	488652747
4015	NC_021176	GGT	2	6	212084	212089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488652748
4016	NC_021176	CCG	2	6	212130	212135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652748
4017	NC_021176	CAT	2	6	212147	212152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652748
4018	NC_021176	GTT	2	6	212178	212183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488652748
4019	NC_021176	CAG	2	6	212226	212231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652748
4020	NC_021176	GTC	2	6	212268	212273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652748
4021	NC_021176	TGC	2	6	212294	212299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652748
4022	NC_021176	TGT	2	6	212303	212308	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488652748
4023	NC_021176	GCT	2	6	212345	212350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652748
4024	NC_021176	ATT	2	6	212366	212371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488652748
4025	NC_021176	T	6	6	212393	212398	0 %	100 %	0 %	0 %	488652748
4026	NC_021176	TTTTA	2	10	212441	212450	20 %	80 %	0 %	0 %	488652748
4027	NC_021176	ACG	2	6	212646	212651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652748
4028	NC_021176	TGC	2	6	212788	212793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652749
4029	NC_021176	GC	3	6	212792	212797	0 %	0 %	50 %	50 %	488652749
4030	NC_021176	TCG	2	6	212798	212803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652749
4031	NC_021176	TGAGCC	2	12	212818	212829	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	488652749
4032	NC_021176	TGG	2	6	212886	212891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488652749
4033	NC_021176	GTG	3	9	212957	212965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488652749
4034	NC_021176	T	7	7	213031	213037	0 %	100 %	0 %	0 %	488652749
4035	NC_021176	TGG	2	6	213084	213089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488652749
4036	NC_021176	CGC	2	6	213118	213123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652749
4037	NC_021176	TGC	2	6	213132	213137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652749
4038	NC_021176	GCT	2	6	213224	213229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652749
4039	NC_021176	TATT	2	8	213236	213243	25 %	75 %	0 %	0 %	488652749
4040	NC_021176	TTA	2	6	213276	213281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488652750
4041	NC_021176	CTGG	2	8	213314	213321	0 %	25 %	50 %	25 %	488652750
4042	NC_021176	GTTGC	2	10	213334	213343	0 %	40 %	40 %	20 %	488652750
4043	NC_021176	GCTG	2	8	213372	213379	0 %	25 %	50 %	25 %	488652750
4044	NC_021176	TTC	2	6	213383	213388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488652750
4045	NC_021176	TGT	2	6	213457	213462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488652750
4046	NC_021176	TCG	2	6	213691	213696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652750
4047	NC_021176	CGAT	2	8	213711	213718	25 %	25 %	25 %	25 %	488652750
4048	NC_021176	GCC	2	6	213728	213733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652750
4049	NC_021176	GC	4	8	213740	213747	0 %	0 %	50 %	50 %	488652750
4050	NC_021176	GCGA	2	8	213852	213859	25 %	0 %	50 %	25 %	488652750
4051	NC_021176	GCT	2	6	213869	213874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652750
4052	NC_021176	ATT	2	6	213878	213883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488652750
4053	NC_021176	CTG	2	6	214017	214022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652750
4054	NC_021176	CCG	2	6	214050	214055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652750
4055	NC_021176	CCG	2	6	214110	214115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652750
4056	NC_021176	CAG	2	6	214118	214123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652750
4057	NC_021176	ATC	2	6	214160	214165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652750
4058	NC_021176	AGT	2	6	214276	214281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652750
4059	NC_021176	GGTT	2	8	214338	214345	0 %	50 %	50 %	0 %	488652750
4060	NC_021176	TCA	2	6	214425	214430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652750
4061	NC_021176	CAT	2	6	214444	214449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652750
4062	NC_021176	AGG	2	6	214498	214503	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488652750
4063	NC_021176	TTA	2	6	214659	214664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488652750
4064	NC_021176	TTA	2	6	214701	214706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488652750
4065	NC_021176	GTA	2	6	214712	214717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652750
4066	NC_021176	TTCAC	2	10	214764	214773	20 %	40 %	0 %	40 %	488652750
4067	NC_021176	CTGCAT	2	12	214808	214819	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	488652750
4068	NC_021176	GAG	2	6	214824	214829	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488652750
4069	NC_021176	TGGC	2	8	214832	214839	0 %	25 %	50 %	25 %	488652750
4070	NC_021176	CCT	2	6	214864	214869	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488652750
4071	NC_021176	GCC	2	6	214964	214969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652750
4072	NC_021176	CGC	2	6	215005	215010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652750
4073	NC_021176	AAT	2	6	215012	215017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488652750
4074	NC_021176	ACA	2	6	215127	215132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488652750
4075	NC_021176	CGC	2	6	215270	215275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652750
4076	NC_021176	ATAC	2	8	215276	215283	50 %	25 %	0 %	25 %	488652750
4077	NC_021176	TCT	2	6	215502	215507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488652750
4078	NC_021176	TCC	2	6	215508	215513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488652750
4079	NC_021176	T	6	6	215516	215521	0 %	100 %	0 %	0 %	488652750
4080	NC_021176	T	7	7	215577	215583	0 %	100 %	0 %	0 %	488652750
4081	NC_021176	CAGG	2	8	215588	215595	25 %	0 %	50 %	25 %	488652750
4082	NC_021176	TCAA	2	8	215924	215931	50 %	25 %	0 %	25 %	488652751
4083	NC_021176	GAT	2	6	216005	216010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652751
4084	NC_021176	TGG	2	6	216030	216035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488652751
4085	NC_021176	GTAG	2	8	216067	216074	25 %	25 %	50 %	0 %	488652751
4086	NC_021176	GAGTT	2	10	216099	216108	20 %	40 %	40 %	0 %	488652751
4087	NC_021176	GTA	2	6	216117	216122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652751
4088	NC_021176	TCGC	2	8	216137	216144	0 %	25 %	25 %	50 %	488652751
4089	NC_021176	GTT	2	6	216159	216164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488652751
4090	NC_021176	CAG	2	6	216174	216179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652751
4091	NC_021176	TCT	2	6	216257	216262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488652751
4092	NC_021176	AGA	2	6	216306	216311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488652751
4093	NC_021176	GC	3	6	216333	216338	0 %	0 %	50 %	50 %	488652751
4094	NC_021176	G	7	7	216398	216404	0 %	0 %	100 %	0 %	488652751
4095	NC_021176	TCG	2	6	216437	216442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652751
4096	NC_021176	TAA	2	6	216475	216480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488652751
4097	NC_021176	T	6	6	216520	216525	0 %	100 %	0 %	0 %	488652751
4098	NC_021176	ATA	3	9	216557	216565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488652751
4099	NC_021176	T	8	8	216621	216628	0 %	100 %	0 %	0 %	488652751
4100	NC_021176	ACA	2	6	216633	216638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488652751
4101	NC_021176	GTAA	2	8	216824	216831	50 %	25 %	25 %	0 %	488652752
4102	NC_021176	CTT	2	6	216871	216876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488652752
4103	NC_021176	CAT	2	6	216991	216996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652752
4104	NC_021176	GTG	2	6	217047	217052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488652752
4105	NC_021176	GAT	2	6	217151	217156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652752
4106	NC_021176	GC	3	6	217174	217179	0 %	0 %	50 %	50 %	488652752
4107	NC_021176	AGC	2	6	217190	217195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652752
4108	NC_021176	GCT	2	6	217221	217226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652752
4109	NC_021176	ACT	2	6	217278	217283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652752
4110	NC_021176	GTT	2	6	217293	217298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488652752
4111	NC_021176	GCC	2	6	217328	217333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652752
4112	NC_021176	T	6	6	217394	217399	0 %	100 %	0 %	0 %	488652752
4113	NC_021176	CAG	2	6	217842	217847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652753
4114	NC_021176	TCG	2	6	217855	217860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652753
4115	NC_021176	CGGT	2	8	217945	217952	0 %	25 %	50 %	25 %	488652753
4116	NC_021176	TTC	2	6	218070	218075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488652753
4117	NC_021176	GCG	3	9	218141	218149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652753
4118	NC_021176	GAA	2	6	218161	218166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488652753
4119	NC_021176	CGA	2	6	218171	218176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652753
4120	NC_021176	GGC	2	6	218211	218216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652753
4121	NC_021176	CGCGG	2	10	218287	218296	0 %	0 %	60 %	40 %	488652754
4122	NC_021176	CG	3	6	218297	218302	0 %	0 %	50 %	50 %	488652754
4123	NC_021176	ACG	2	6	218318	218323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652754
4124	NC_021176	GCG	2	6	218324	218329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652754
4125	NC_021176	TCG	2	6	218340	218345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652754
4126	NC_021176	CGG	2	6	218375	218380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652754
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4130	NC_021176	CGCGG	2	10	218471	218480	0 %	0 %	60 %	40 %	488652754
4131	NC_021176	TCAT	2	8	218619	218626	25 %	50 %	0 %	25 %	488652754
4132	NC_021176	T	6	6	218674	218679	0 %	100 %	0 %	0 %	488652754
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4139	NC_021176	GTT	2	6	218875	218880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488652754
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4144	NC_021176	CTT	2	6	219103	219108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488652754
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4241	NC_021176	GC	3	6	223966	223971	0 %	0 %	50 %	50 %	488652759
4242	NC_021176	GGC	2	6	223985	223990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652759
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4244	NC_021176	CGA	2	6	224033	224038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652759
4245	NC_021176	GCC	2	6	224049	224054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652759
4246	NC_021176	GCC	2	6	224058	224063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652759
4247	NC_021176	CGC	2	6	224089	224094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652759
4248	NC_021176	GGC	2	6	224097	224102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652759
4249	NC_021176	GCA	2	6	224147	224152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652759
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4254	NC_021176	CGC	2	6	224353	224358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652759
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4264	NC_021176	CAGCG	2	10	225022	225031	20 %	0 %	40 %	40 %	488652759
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4273	NC_021176	A	6	6	225573	225578	100 %	0 %	0 %	0 %	488652760
4274	NC_021176	CGG	3	9	225615	225623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652760
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4352	NC_021176	CGG	2	6	231141	231146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652761
4353	NC_021176	GCGCC	2	10	231147	231156	0 %	0 %	40 %	60 %	488652761
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4360	NC_021176	TGAT	2	8	231407	231414	25 %	50 %	25 %	0 %	488652762
4361	NC_021176	CTG	2	6	231445	231450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652762
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4363	NC_021176	CGCT	2	8	231580	231587	0 %	25 %	25 %	50 %	488652762
4364	NC_021176	GCCA	2	8	231661	231668	25 %	0 %	25 %	50 %	488652762
4365	NC_021176	CCG	2	6	231684	231689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652762
4366	NC_021176	TGA	2	6	231707	231712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652762
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4368	NC_021176	CGG	2	6	231833	231838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652762
4369	NC_021176	ATCG	2	8	231844	231851	25 %	25 %	25 %	25 %	488652762
4370	NC_021176	AAG	2	6	231866	231871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488652762
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4372	NC_021176	CCG	2	6	231983	231988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652762
4373	NC_021176	GTTG	2	8	232184	232191	0 %	50 %	50 %	0 %	488652763
4374	NC_021176	CTG	2	6	232196	232201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652763
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4381	NC_021176	GC	3	6	232474	232479	0 %	0 %	50 %	50 %	488652763
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4385	NC_021176	GGCGT	2	10	232536	232545	0 %	20 %	60 %	20 %	488652763
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4393	NC_021176	GCT	2	6	232922	232927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652763
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4397	NC_021176	GC	3	6	233080	233085	0 %	0 %	50 %	50 %	488652763
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4433	NC_021176	TG	3	6	234269	234274	0 %	50 %	50 %	0 %	488652764
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4449	NC_021176	GTA	2	6	234729	234734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652764
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4471	NC_021176	GGA	2	6	236007	236012	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488652765
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4473	NC_021176	CGG	2	6	236058	236063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652765
4474	NC_021176	CGGCG	2	10	236199	236208	0 %	0 %	60 %	40 %	488652765
4475	NC_021176	CT	3	6	236215	236220	0 %	50 %	0 %	50 %	488652765
4476	NC_021176	GCG	2	6	236221	236226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652765
4477	NC_021176	CGC	2	6	236234	236239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652765
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4480	NC_021176	ATT	2	6	236371	236376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488652765
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4482	NC_021176	TGC	2	6	236477	236482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652765
4483	NC_021176	GGC	2	6	236512	236517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652765
4484	NC_021176	A	6	6	236524	236529	100 %	0 %	0 %	0 %	488652765
4485	NC_021176	GCG	2	6	236543	236548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652765
4486	NC_021176	CGG	2	6	236553	236558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652765
4487	NC_021176	TTGA	2	8	236578	236585	25 %	50 %	25 %	0 %	488652765
4488	NC_021176	CGGCAG	2	12	236588	236599	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	488652765
4489	NC_021176	GCG	2	6	236600	236605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652765
4490	NC_021176	CGC	2	6	236625	236630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652765
4491	NC_021176	CTG	2	6	236656	236661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652765
4492	NC_021176	TTA	2	6	236669	236674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488652765
4493	NC_021176	ACG	2	6	236686	236691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652765
4494	NC_021176	TGCTT	2	10	236693	236702	0 %	60 %	20 %	20 %	488652765
4495	NC_021176	TTC	2	6	236703	236708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488652765
4496	NC_021176	GC	3	6	236711	236716	0 %	0 %	50 %	50 %	488652765
4497	NC_021176	G	6	6	236718	236723	0 %	0 %	100 %	0 %	488652765
4498	NC_021176	GCT	2	6	236754	236759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652765
4499	NC_021176	GGC	3	9	236778	236786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652765
4500	NC_021176	GGC	2	6	236853	236858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652765

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