MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty21a

Total Repeats: 84382

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_021176	CGC	2	6	159646	159651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652700
3002	NC_021176	GAC	2	6	159673	159678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652700
3003	NC_021176	CGT	2	6	159737	159742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652700
3004	NC_021176	CTTT	2	8	159800	159807	0 %	75 %	0 %	25 %	488652700
3005	NC_021176	CAT	2	6	159863	159868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652700
3006	NC_021176	AGG	2	6	159906	159911	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488652700
3007	NC_021176	CGC	2	6	159915	159920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652700
3008	NC_021176	CGC	2	6	159932	159937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652700
3009	NC_021176	TAT	2	6	160094	160099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488652701
3010	NC_021176	ATT	2	6	160109	160114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488652701
3011	NC_021176	CGT	2	6	160152	160157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652701
3012	NC_021176	TTA	2	6	160177	160182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488652701
3013	NC_021176	AG	3	6	160277	160282	50 %	0 %	50 %	0 %	488652701
3014	NC_021176	GGT	2	6	160304	160309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488652701
3015	NC_021176	AAC	2	6	160521	160526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488652701
3016	NC_021176	GCCA	2	8	160586	160593	25 %	0 %	25 %	50 %	488652701
3017	NC_021176	AAC	2	6	160632	160637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488652701
3018	NC_021176	ACA	2	6	160663	160668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488652701
3019	NC_021176	TGG	2	6	160717	160722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488652701
3020	NC_021176	CGC	2	6	160759	160764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652701
3021	NC_021176	ATT	2	6	160767	160772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488652701
3022	NC_021176	CCGGC	2	10	160774	160783	0 %	0 %	40 %	60 %	488652701
3023	NC_021176	A	6	6	160806	160811	100 %	0 %	0 %	0 %	488652701
3024	NC_021176	AGA	2	6	160850	160855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488652701
3025	NC_021176	TGA	2	6	160892	160897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652701
3026	NC_021176	GC	3	6	160902	160907	0 %	0 %	50 %	50 %	488652701
3027	NC_021176	AAG	2	6	160960	160965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488652701
3028	NC_021176	CCG	2	6	161029	161034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652701
3029	NC_021176	GC	4	8	161039	161046	0 %	0 %	50 %	50 %	488652701
3030	NC_021176	TCA	2	6	161095	161100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652701
3031	NC_021176	TTG	2	6	161101	161106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488652701
3032	NC_021176	AAG	2	6	161176	161181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488652701
3033	NC_021176	ACT	2	6	161233	161238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652701
3034	NC_021176	CGG	2	6	161275	161280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652701
3035	NC_021176	TCTA	2	8	161304	161311	25 %	50 %	0 %	25 %	488652701
3036	NC_021176	CGT	2	6	161324	161329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652701
3037	NC_021176	GAT	2	6	161348	161353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652701
3038	NC_021176	A	6	6	161395	161400	100 %	0 %	0 %	0 %	488652701
3039	NC_021176	AG	3	6	161496	161501	50 %	0 %	50 %	0 %	488652701
3040	NC_021176	GCG	2	6	161589	161594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652701
3041	NC_021176	CGCTG	2	10	161666	161675	0 %	20 %	40 %	40 %	488652701
3042	NC_021176	GAA	2	6	161688	161693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488652701
3043	NC_021176	CGG	2	6	161750	161755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652701
3044	NC_021176	CCG	2	6	161789	161794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652701
3045	NC_021176	TTC	2	6	161843	161848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488652701
3046	NC_021176	ATG	2	6	161913	161918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652701
3047	NC_021176	CTG	2	6	162030	162035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652701
3048	NC_021176	ATG	3	9	162040	162048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652701
3049	NC_021176	CTG	2	6	162093	162098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652701
3050	NC_021176	CCG	2	6	162174	162179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652701
3051	NC_021176	GAG	2	6	162291	162296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488652701
3052	NC_021176	AGA	2	6	162347	162352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488652701
3053	NC_021176	GGT	2	6	162353	162358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488652701
3054	NC_021176	ATG	2	6	162369	162374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652701
3055	NC_021176	TGC	2	6	162397	162402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652701
3056	NC_021176	GGC	2	6	162434	162439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652701
3057	NC_021176	CGC	2	6	162530	162535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652701
3058	NC_021176	GCA	2	6	162659	162664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652701
3059	NC_021176	GCC	2	6	162687	162692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652701
3060	NC_021176	GCC	2	6	162708	162713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652701
3061	NC_021176	A	6	6	162962	162967	100 %	0 %	0 %	0 %	488652702
3062	NC_021176	ACG	2	6	163002	163007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652702
3063	NC_021176	TTA	2	6	163014	163019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488652702
3064	NC_021176	CGC	2	6	163027	163032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652702
3065	NC_021176	CGG	2	6	163066	163071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652702
3066	NC_021176	ATT	2	6	163156	163161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488652702
3067	NC_021176	AAG	2	6	163248	163253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488652702
3068	NC_021176	CCG	2	6	163304	163309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652702
3069	NC_021176	ATT	2	6	163322	163327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488652702
3070	NC_021176	TTA	2	6	163385	163390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488652703
3071	NC_021176	GCG	2	6	163437	163442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652703
3072	NC_021176	GCC	2	6	163467	163472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652703
3073	NC_021176	CAG	2	6	163574	163579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652703
3074	NC_021176	GCA	2	6	163710	163715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652703
3075	NC_021176	TCT	2	6	163719	163724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488652703
3076	NC_021176	CGA	2	6	163774	163779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652703
3077	NC_021176	TCT	2	6	163974	163979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488652703
3078	NC_021176	TCG	2	6	164137	164142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652703
3079	NC_021176	CGA	2	6	164160	164165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652703
3080	NC_021176	CATA	2	8	164209	164216	50 %	25 %	0 %	25 %	488652703
3081	NC_021176	GTC	2	6	164282	164287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652703
3082	NC_021176	GGCT	2	8	164468	164475	0 %	25 %	50 %	25 %	488652704
3083	NC_021176	TAA	2	6	164476	164481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488652704
3084	NC_021176	ATG	2	6	164488	164493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652704
3085	NC_021176	GCG	2	6	164553	164558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652704
3086	NC_021176	GGA	2	6	164606	164611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488652704
3087	NC_021176	ATT	2	6	164627	164632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488652704
3088	NC_021176	GAACC	2	10	164633	164642	40 %	0 %	20 %	40 %	488652704
3089	NC_021176	TGA	2	6	164714	164719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652704
3090	NC_021176	TGCC	2	8	164732	164739	0 %	25 %	25 %	50 %	488652704
3091	NC_021176	CGG	2	6	164788	164793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652704
3092	NC_021176	AACG	2	8	164892	164899	50 %	0 %	25 %	25 %	488652704
3093	NC_021176	CGC	2	6	165019	165024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652704
3094	NC_021176	TCA	2	6	165040	165045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652704
3095	NC_021176	TC	3	6	165173	165178	0 %	50 %	0 %	50 %	488652704
3096	NC_021176	CGC	2	6	165179	165184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652704
3097	NC_021176	GAG	2	6	165267	165272	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488652704
3098	NC_021176	CTGC	2	8	165276	165283	0 %	25 %	25 %	50 %	488652704
3099	NC_021176	TAT	2	6	165303	165308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488652704
3100	NC_021176	CG	3	6	165315	165320	0 %	0 %	50 %	50 %	488652704
3101	NC_021176	TATT	2	8	165343	165350	25 %	75 %	0 %	0 %	488652704
3102	NC_021176	ATT	2	6	165352	165357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488652704
3103	NC_021176	GTC	2	6	165419	165424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652705
3104	NC_021176	CGC	2	6	165439	165444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652705
3105	NC_021176	CGG	2	6	165466	165471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652705
3106	NC_021176	C	6	6	165535	165540	0 %	0 %	0 %	100 %	488652705
3107	NC_021176	GAC	2	6	165542	165547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652705
3108	NC_021176	ACG	2	6	165573	165578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652705
3109	NC_021176	GCA	2	6	165742	165747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652706
3110	NC_021176	CGT	2	6	165754	165759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652706
3111	NC_021176	GATCA	2	10	165821	165830	40 %	20 %	20 %	20 %	488652706
3112	NC_021176	TGT	2	6	165906	165911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488652706
3113	NC_021176	GCC	2	6	165956	165961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652706
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3117	NC_021176	GCT	2	6	166132	166137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652706
3118	NC_021176	CAG	2	6	166154	166159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652706
3119	NC_021176	A	6	6	166215	166220	100 %	0 %	0 %	0 %	488652706
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3121	NC_021176	TTA	2	6	166439	166444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488652707
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3365	NC_021176	GCTG	2	8	180233	180240	0 %	25 %	50 %	25 %	488652720
3366	NC_021176	CTG	2	6	180281	180286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652720
3367	NC_021176	TGA	2	6	180318	180323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652720
3368	NC_021176	CGTG	2	8	180376	180383	0 %	25 %	50 %	25 %	488652720
3369	NC_021176	CTT	2	6	180388	180393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488652720
3370	NC_021176	CCG	2	6	180411	180416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652720
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3372	NC_021176	GACTG	2	10	180428	180437	20 %	20 %	40 %	20 %	488652720
3373	NC_021176	GTG	2	6	180462	180467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488652720
3374	NC_021176	GAA	2	6	180478	180483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488652720
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3377	NC_021176	GAA	2	6	180716	180721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488652720
3378	NC_021176	GC	3	6	180825	180830	0 %	0 %	50 %	50 %	488652720
3379	NC_021176	CGTG	2	8	180874	180881	0 %	25 %	50 %	25 %	488652720
3380	NC_021176	GAA	2	6	180898	180903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488652720
3381	NC_021176	ATC	2	6	180932	180937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652720
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3386	NC_021176	CTGG	2	8	181111	181118	0 %	25 %	50 %	25 %	488652720
3387	NC_021176	GCG	2	6	181121	181126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652720
3388	NC_021176	GAT	2	6	181153	181158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652720
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3403	NC_021176	TGA	2	6	181752	181757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652720
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3482	NC_021176	GGC	2	6	185508	185513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652722
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3484	NC_021176	AT	3	6	185856	185861	50 %	50 %	0 %	0 %	488652723
3485	NC_021176	GGCAT	2	10	185908	185917	20 %	20 %	40 %	20 %	488652723
3486	NC_021176	GCG	2	6	185954	185959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652723
3487	NC_021176	GCA	2	6	186006	186011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652723
3488	NC_021176	CAG	2	6	186013	186018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652723
3489	NC_021176	GGC	2	6	186045	186050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652723
3490	NC_021176	GCA	2	6	186059	186064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652723
3491	NC_021176	TGA	2	6	186072	186077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652723
3492	NC_021176	CAA	2	6	186093	186098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488652723
3493	NC_021176	GCC	2	6	186099	186104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652723
3494	NC_021176	TCA	2	6	186301	186306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652724
3495	NC_021176	GGCCA	2	10	186330	186339	20 %	0 %	40 %	40 %	488652724
3496	NC_021176	CGT	2	6	186358	186363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652724
3497	NC_021176	ATA	2	6	186372	186377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488652724
3498	NC_021176	TTGG	2	8	186459	186466	0 %	50 %	50 %	0 %	488652724
3499	NC_021176	GTAA	2	8	186529	186536	50 %	25 %	25 %	0 %	488652724
3500	NC_021176	CTG	2	6	186542	186547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652724

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