MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty21a

Total Repeats: 84382

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_021176	GAAA	2	8	80637	80644	75 %	0 %	25 %	0 %	488652628
1502	NC_021176	C	6	6	80682	80687	0 %	0 %	0 %	100 %	488652628
1503	NC_021176	GAT	2	6	80717	80722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652628
1504	NC_021176	CGTC	2	8	80848	80855	0 %	25 %	25 %	50 %	488652629
1505	NC_021176	CGGT	2	8	80870	80877	0 %	25 %	50 %	25 %	488652629
1506	NC_021176	TTC	2	6	80879	80884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488652629
1507	NC_021176	GTA	2	6	80998	81003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652629
1508	NC_021176	CG	3	6	81004	81009	0 %	0 %	50 %	50 %	488652629
1509	NC_021176	CAG	2	6	81023	81028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652629
1510	NC_021176	TTGCC	2	10	81029	81038	0 %	40 %	20 %	40 %	488652629
1511	NC_021176	GGC	2	6	81071	81076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652629
1512	NC_021176	CT	3	6	81084	81089	0 %	50 %	0 %	50 %	488652629
1513	NC_021176	CAC	2	6	81149	81154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488652629
1514	NC_021176	GGTATC	2	12	81206	81217	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	488652629
1515	NC_021176	GCCT	2	8	81257	81264	0 %	25 %	25 %	50 %	488652629
1516	NC_021176	CAC	2	6	81383	81388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488652629
1517	NC_021176	TCT	2	6	81594	81599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488652630
1518	NC_021176	CGC	2	6	81631	81636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652630
1519	NC_021176	CTT	2	6	81655	81660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488652630
1520	NC_021176	CG	3	6	81680	81685	0 %	0 %	50 %	50 %	488652630
1521	NC_021176	GTT	2	6	81733	81738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488652630
1522	NC_021176	CG	4	8	81748	81755	0 %	0 %	50 %	50 %	488652630
1523	NC_021176	CTT	2	6	81811	81816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488652630
1524	NC_021176	GCA	2	6	81868	81873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652630
1525	NC_021176	CGC	3	9	81892	81900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652630
1526	NC_021176	GCC	2	6	81972	81977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652630
1527	NC_021176	CCA	2	6	81996	82001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488652630
1528	NC_021176	GCC	2	6	82070	82075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652630
1529	NC_021176	CGC	2	6	82153	82158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652630
1530	NC_021176	GTC	2	6	82187	82192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652630
1531	NC_021176	GGTC	2	8	82257	82264	0 %	25 %	50 %	25 %	488652630
1532	NC_021176	ACTC	2	8	82309	82316	25 %	25 %	0 %	50 %	488652630
1533	NC_021176	T	8	8	82382	82389	0 %	100 %	0 %	0 %	488652631
1534	NC_021176	ATT	2	6	82391	82396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488652631
1535	NC_021176	TCA	2	6	82544	82549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652631
1536	NC_021176	ACC	2	6	82571	82576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488652631
1537	NC_021176	ATA	2	6	82607	82612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488652631
1538	NC_021176	CGC	2	6	82644	82649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652631
1539	NC_021176	CATCCT	2	12	82692	82703	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	488652631
1540	NC_021176	CGG	2	6	82836	82841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652631
1541	NC_021176	TCG	2	6	82859	82864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652631
1542	NC_021176	CGT	2	6	82913	82918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652631
1543	NC_021176	AAT	2	6	82939	82944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488652631
1544	NC_021176	CAG	2	6	82978	82983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652631
1545	NC_021176	GAT	2	6	83058	83063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652631
1546	NC_021176	TGGCG	2	10	83077	83086	0 %	20 %	60 %	20 %	488652631
1547	NC_021176	ATC	3	9	83108	83116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652631
1548	NC_021176	TGC	2	6	83202	83207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652631
1549	NC_021176	CGG	2	6	83208	83213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652631
1550	NC_021176	GCG	2	6	83228	83233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652631
1551	NC_021176	TCA	2	6	83282	83287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652631
1552	NC_021176	CAC	2	6	83350	83355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488652631
1553	NC_021176	GGT	2	6	83371	83376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488652631
1554	NC_021176	CCG	2	6	83397	83402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652631
1555	NC_021176	CGT	2	6	83481	83486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652631
1556	NC_021176	GCT	2	6	83496	83501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652631
1557	NC_021176	CAGA	2	8	83509	83516	50 %	0 %	25 %	25 %	488652631
1558	NC_021176	CAG	2	6	83587	83592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652631
1559	NC_021176	TTC	2	6	83626	83631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488652631
1560	NC_021176	TAA	2	6	83759	83764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488652631
1561	NC_021176	A	6	6	83763	83768	100 %	0 %	0 %	0 %	488652631
1562	NC_021176	GTC	2	6	83881	83886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652631
1563	NC_021176	GGC	2	6	84066	84071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652632
1564	NC_021176	GTT	2	6	84117	84122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488652632
1565	NC_021176	ATG	2	6	84136	84141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652632
1566	NC_021176	TCAGC	2	10	84260	84269	20 %	20 %	20 %	40 %	488652632
1567	NC_021176	TGC	2	6	84300	84305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652632
1568	NC_021176	CGA	2	6	84329	84334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652632
1569	NC_021176	GATG	2	8	84359	84366	25 %	25 %	50 %	0 %	488652632
1570	NC_021176	GTA	2	6	84507	84512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652632
1571	NC_021176	CGC	2	6	84548	84553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652632
1572	NC_021176	AGT	2	6	84560	84565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652632
1573	NC_021176	CAT	2	6	84567	84572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652632
1574	NC_021176	GCA	2	6	84590	84595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652632
1575	NC_021176	GTC	2	6	84673	84678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652632
1576	NC_021176	CGG	2	6	84701	84706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652632
1577	NC_021176	CTC	2	6	84807	84812	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488652632
1578	NC_021176	TCA	2	6	84880	84885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652632
1579	NC_021176	CGG	2	6	84895	84900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652632
1580	NC_021176	GGT	2	6	84939	84944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488652632
1581	NC_021176	GCG	2	6	85014	85019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652632
1582	NC_021176	A	6	6	85148	85153	100 %	0 %	0 %	0 %	488652632
1583	NC_021176	ACC	2	6	85374	85379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488652633
1584	NC_021176	GGT	2	6	85424	85429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488652633
1585	NC_021176	CAG	2	6	85566	85571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652633
1586	NC_021176	CGA	2	6	85727	85732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652633
1587	NC_021176	CTT	2	6	85754	85759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488652633
1588	NC_021176	CCGA	2	8	85785	85792	25 %	0 %	25 %	50 %	488652633
1589	NC_021176	CGT	2	6	85817	85822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652633
1590	NC_021176	CAG	2	6	85837	85842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652633
1591	NC_021176	TTG	2	6	85873	85878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488652633
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1593	NC_021176	ACA	2	6	86198	86203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488652633
1594	NC_021176	GC	3	6	86213	86218	0 %	0 %	50 %	50 %	488652633
1595	NC_021176	TCCA	2	8	86233	86240	25 %	25 %	0 %	50 %	488652633
1596	NC_021176	CGG	2	6	86243	86248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652633
1597	NC_021176	CCG	2	6	86275	86280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652633
1598	NC_021176	TTC	2	6	86283	86288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488652633
1599	NC_021176	CAG	2	6	86295	86300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652633
1600	NC_021176	TAA	2	6	86526	86531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488652634
1601	NC_021176	GAA	2	6	86557	86562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488652634
1602	NC_021176	TCC	2	6	86572	86577	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488652634
1603	NC_021176	ACCC	2	8	86607	86614	25 %	0 %	0 %	75 %	488652634
1604	NC_021176	CAG	2	6	86620	86625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652634
1605	NC_021176	GAT	2	6	86635	86640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652634
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1607	NC_021176	GAA	2	6	86776	86781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488652634
1608	NC_021176	TGG	2	6	86790	86795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488652634
1609	NC_021176	GC	4	8	86834	86841	0 %	0 %	50 %	50 %	488652634
1610	NC_021176	CAG	3	9	86893	86901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652634
1611	NC_021176	GTACG	2	10	86979	86988	20 %	20 %	40 %	20 %	488652634
1612	NC_021176	CAC	2	6	87041	87046	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488652634
1613	NC_021176	GCC	2	6	87079	87084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652634
1614	NC_021176	AGT	2	6	87156	87161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652634
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1616	NC_021176	CAG	2	6	87296	87301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652634
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1618	NC_021176	CCA	2	6	87417	87422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488652634
1619	NC_021176	CGA	2	6	87435	87440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652634
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1621	NC_021176	CGA	2	6	87474	87479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652634
1622	NC_021176	CATC	2	8	87510	87517	25 %	25 %	0 %	50 %	488652634
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1874	NC_021176	ACGC	2	8	101888	101895	25 %	0 %	25 %	50 %	488652650
1875	NC_021176	TAA	2	6	102008	102013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488652650
1876	NC_021176	TCG	2	6	102024	102029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652650
1877	NC_021176	GCG	2	6	102182	102187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652651
1878	NC_021176	CGC	2	6	102200	102205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652651
1879	NC_021176	AACGT	2	10	102372	102381	40 %	20 %	20 %	20 %	488652651
1880	NC_021176	AC	3	6	102432	102437	50 %	0 %	0 %	50 %	488652651
1881	NC_021176	CG	3	6	102533	102538	0 %	0 %	50 %	50 %	488652652
1882	NC_021176	GGT	2	6	102635	102640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488652652
1883	NC_021176	CAC	2	6	102704	102709	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488652652
1884	NC_021176	GCG	3	9	102727	102735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652652
1885	NC_021176	GGC	2	6	102747	102752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652652
1886	NC_021176	CTT	2	6	102850	102855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488652652
1887	NC_021176	TAT	2	6	102928	102933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488652652
1888	NC_021176	AC	3	6	102949	102954	50 %	0 %	0 %	50 %	488652652
1889	NC_021176	TCATGG	2	12	102994	103005	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	488652652
1890	NC_021176	CTG	2	6	103010	103015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652652
1891	NC_021176	CGC	2	6	103061	103066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652652
1892	NC_021176	GCC	2	6	103131	103136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652652
1893	NC_021176	ATT	2	6	103271	103276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488652652
1894	NC_021176	TAA	2	6	103320	103325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488652653
1895	NC_021176	CCGA	2	8	103426	103433	25 %	0 %	25 %	50 %	488652653
1896	NC_021176	CAG	2	6	103527	103532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652653
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1902	NC_021176	CGT	2	6	103881	103886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652653
1903	NC_021176	TAA	2	6	103887	103892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488652653
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1905	NC_021176	GCG	2	6	104064	104069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652653
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1910	NC_021176	GAC	2	6	104197	104202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652653
1911	NC_021176	CGG	2	6	104220	104225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652653
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1918	NC_021176	CCCAA	2	10	104522	104531	40 %	0 %	0 %	60 %	488652654
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1982	NC_021176	TGA	2	6	108253	108258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652656
1983	NC_021176	GCG	2	6	108262	108267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652656
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1986	NC_021176	CCA	2	6	108379	108384	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488652656
1987	NC_021176	CAGT	2	8	108452	108459	25 %	25 %	25 %	25 %	488652656
1988	NC_021176	TGATC	2	10	108590	108599	20 %	40 %	20 %	20 %	488652656
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1991	NC_021176	GCG	2	6	108742	108747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652656
1992	NC_021176	GGC	2	6	108756	108761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652656
1993	NC_021176	ATC	2	6	108766	108771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652656
1994	NC_021176	CGG	3	9	108779	108787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652656
1995	NC_021176	GCA	2	6	108791	108796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652656
1996	NC_021176	ACC	2	6	108849	108854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488652656
1997	NC_021176	GAT	2	6	108855	108860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652656
1998	NC_021176	ACC	2	6	108864	108869	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488652656
1999	NC_021176	TGA	2	6	108892	108897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652656
2000	NC_021176	CAT	2	6	108903	108908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652656

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