MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty21a

Total Repeats: 84382

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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502	NC_021176	TTTA	2	8	25441	25448	25 %	75 %	0 %	0 %	488652582
503	NC_021176	TAC	2	6	25635	25640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652582
504	NC_021176	A	6	6	25671	25676	100 %	0 %	0 %	0 %	488652582
505	NC_021176	CCG	2	6	25695	25700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652582
506	NC_021176	ACG	2	6	25770	25775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652582
507	NC_021176	ATG	2	6	25799	25804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652582
508	NC_021176	GCGCCT	2	12	25891	25902	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	488652583
509	NC_021176	TCTG	2	8	25935	25942	0 %	50 %	25 %	25 %	488652583
510	NC_021176	GGC	2	6	25992	25997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652583
511	NC_021176	GAC	2	6	26073	26078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652583
512	NC_021176	GC	3	6	26087	26092	0 %	0 %	50 %	50 %	488652583
513	NC_021176	GCCT	2	8	26116	26123	0 %	25 %	25 %	50 %	488652583
514	NC_021176	GGC	3	9	26184	26192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652583
515	NC_021176	GCC	2	6	26227	26232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652583
516	NC_021176	GCA	2	6	26253	26258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652583
517	NC_021176	GGC	2	6	26283	26288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652583
518	NC_021176	GGC	2	6	26401	26406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652583
519	NC_021176	ACT	2	6	26474	26479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652583
520	NC_021176	GCG	2	6	26498	26503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652583
521	NC_021176	AGCGAC	2	12	26512	26523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652583
522	NC_021176	GCA	2	6	26526	26531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652583
523	NC_021176	ATT	2	6	26610	26615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488652583
524	NC_021176	CCTT	2	8	26622	26629	0 %	50 %	0 %	50 %	488652583
525	NC_021176	GAC	2	6	26653	26658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652583
526	NC_021176	CTG	2	6	28453	28458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652584
527	NC_021176	GT	3	6	28495	28500	0 %	50 %	50 %	0 %	488652584
528	NC_021176	ATTA	2	8	28528	28535	50 %	50 %	0 %	0 %	488652584
529	NC_021176	A	6	6	28595	28600	100 %	0 %	0 %	0 %	488652584
530	NC_021176	GT	3	6	28624	28629	0 %	50 %	50 %	0 %	488652584
531	NC_021176	CCG	2	6	28631	28636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652584
532	NC_021176	TTC	2	6	28764	28769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488652584
533	NC_021176	GGCG	2	8	28770	28777	0 %	0 %	75 %	25 %	488652584
534	NC_021176	ATG	2	6	28814	28819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652584
535	NC_021176	TCG	2	6	28895	28900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652584
536	NC_021176	CCG	2	6	28949	28954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652584
537	NC_021176	A	6	6	29122	29127	100 %	0 %	0 %	0 %	488652584
538	NC_021176	ATG	2	6	29288	29293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652584
539	NC_021176	ACA	2	6	29368	29373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488652584
540	NC_021176	GAC	2	6	29506	29511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652585
541	NC_021176	AAC	2	6	29634	29639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488652585
542	NC_021176	ATG	2	6	29816	29821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652585
543	NC_021176	AAT	2	6	29842	29847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488652585
544	NC_021176	CGG	2	6	29948	29953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652585
545	NC_021176	ATGA	2	8	29975	29982	50 %	25 %	25 %	0 %	488652585
546	NC_021176	TGC	2	6	30029	30034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652586
547	NC_021176	GGC	2	6	30036	30041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652586
548	NC_021176	CT	3	6	30109	30114	0 %	50 %	0 %	50 %	488652586
549	NC_021176	CG	3	6	30172	30177	0 %	0 %	50 %	50 %	488652586
550	NC_021176	GCG	2	6	30239	30244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652586
551	NC_021176	CG	3	6	30435	30440	0 %	0 %	50 %	50 %	488652586
552	NC_021176	GGC	2	6	30454	30459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652586
553	NC_021176	TATC	2	8	30601	30608	25 %	50 %	0 %	25 %	488652587
554	NC_021176	GTAA	2	8	30638	30645	50 %	25 %	25 %	0 %	488652587
555	NC_021176	TGG	2	6	30688	30693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488652587
556	NC_021176	CGC	2	6	30744	30749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652587
557	NC_021176	ATT	2	6	30751	30756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488652587
558	NC_021176	GC	3	6	30767	30772	0 %	0 %	50 %	50 %	488652587
559	NC_021176	GGT	2	6	30790	30795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488652587
560	NC_021176	CGG	2	6	30802	30807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652587
561	NC_021176	CCG	2	6	30816	30821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652587
562	NC_021176	CGC	2	6	30850	30855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652587
563	NC_021176	TTCG	2	8	30900	30907	0 %	50 %	25 %	25 %	488652587
564	NC_021176	GCA	2	6	30952	30957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652587
565	NC_021176	ATCTG	2	10	30969	30978	20 %	40 %	20 %	20 %	488652587
566	NC_021176	TTACG	2	10	31024	31033	20 %	40 %	20 %	20 %	488652587
567	NC_021176	TTA	2	6	31040	31045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488652587
568	NC_021176	GC	3	6	31057	31062	0 %	0 %	50 %	50 %	488652587
569	NC_021176	TAT	2	6	31274	31279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488652588
570	NC_021176	TAT	2	6	31281	31286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488652588
571	NC_021176	CGC	2	6	31355	31360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652588
572	NC_021176	CGG	2	6	31393	31398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652588
573	NC_021176	GTCA	2	8	31410	31417	25 %	25 %	25 %	25 %	488652588
574	NC_021176	GGT	2	6	31436	31441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488652588
575	NC_021176	CGC	2	6	31478	31483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652588
576	NC_021176	CAG	2	6	31506	31511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652588
577	NC_021176	CAA	2	6	31518	31523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488652588
578	NC_021176	AGC	2	6	31572	31577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652588
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580	NC_021176	GTG	2	6	31643	31648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488652588
581	NC_021176	T	6	6	31726	31731	0 %	100 %	0 %	0 %	488652588
582	NC_021176	GGC	2	6	31757	31762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652588
583	NC_021176	GGGCG	2	10	31793	31802	0 %	0 %	80 %	20 %	488652588
584	NC_021176	GCC	2	6	31914	31919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652588
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586	NC_021176	AGC	2	6	31935	31940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652588
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588	NC_021176	CTC	2	6	31959	31964	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488652588
589	NC_021176	GCA	2	6	31982	31987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652588
590	NC_021176	GTC	2	6	32016	32021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652588
591	NC_021176	TGCGT	2	10	32172	32181	0 %	40 %	40 %	20 %	488652589
592	NC_021176	ACCG	2	8	32230	32237	25 %	0 %	25 %	50 %	488652589
593	NC_021176	GTT	2	6	32261	32266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488652589
594	NC_021176	AGGC	2	8	32268	32275	25 %	0 %	50 %	25 %	488652589
595	NC_021176	TAA	2	6	32314	32319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488652589
596	NC_021176	TAT	2	6	32338	32343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488652589
597	NC_021176	ATT	2	6	32397	32402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488652589
598	NC_021176	AAAAG	2	10	32566	32575	80 %	0 %	20 %	0 %	488652590
599	NC_021176	A	7	7	32586	32592	100 %	0 %	0 %	0 %	488652590
600	NC_021176	TTA	2	6	32619	32624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488652590
601	NC_021176	CAG	2	6	32665	32670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652590
602	NC_021176	CCTG	2	8	32704	32711	0 %	25 %	25 %	50 %	488652590
603	NC_021176	TGT	2	6	32745	32750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488652590
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605	NC_021176	CAG	2	6	32762	32767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652590
606	NC_021176	AAG	2	6	32771	32776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488652590
607	NC_021176	ATC	2	6	32835	32840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652590
608	NC_021176	CGCA	2	8	32894	32901	25 %	0 %	25 %	50 %	488652590
609	NC_021176	T	6	6	32921	32926	0 %	100 %	0 %	0 %	488652590
610	NC_021176	ATT	2	6	32940	32945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488652590
611	NC_021176	TAAA	2	8	32964	32971	75 %	25 %	0 %	0 %	488652590
612	NC_021176	TTA	2	6	32976	32981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488652590
613	NC_021176	A	6	6	33379	33384	100 %	0 %	0 %	0 %	488652591
614	NC_021176	A	7	7	33389	33395	100 %	0 %	0 %	0 %	488652591
615	NC_021176	TTA	2	6	33429	33434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488652591
616	NC_021176	GCG	2	6	33482	33487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652591
617	NC_021176	TC	3	6	33489	33494	0 %	50 %	0 %	50 %	488652591
618	NC_021176	CTT	2	6	33500	33505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488652591
619	NC_021176	TTAT	2	8	33533	33540	25 %	75 %	0 %	0 %	488652591
620	NC_021176	TGA	2	6	33729	33734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652591
621	NC_021176	AT	3	6	33739	33744	50 %	50 %	0 %	0 %	488652591
622	NC_021176	A	7	7	33764	33770	100 %	0 %	0 %	0 %	488652591
623	NC_021176	ATC	2	6	33818	33823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652591
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626	NC_021176	A	6	6	33906	33911	100 %	0 %	0 %	0 %	488652591
627	NC_021176	TTGG	2	8	33917	33924	0 %	50 %	50 %	0 %	488652591
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629	NC_021176	TA	3	6	33942	33947	50 %	50 %	0 %	0 %	488652591
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