MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty21a

Total Repeats: 84382

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_021176	GGC	2	6	324995	325000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652844
6002	NC_021176	ATCG	2	8	325040	325047	25 %	25 %	25 %	25 %	488652844
6003	NC_021176	CGG	2	6	325048	325053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652844
6004	NC_021176	TGG	2	6	325059	325064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488652844
6005	NC_021176	TGA	2	6	325227	325232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652844
6006	NC_021176	GC	3	6	325269	325274	0 %	0 %	50 %	50 %	488652844
6007	NC_021176	CTG	2	6	325286	325291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652844
6008	NC_021176	CGG	2	6	325360	325365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652844
6009	NC_021176	TTG	2	6	325452	325457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488652844
6010	NC_021176	GCT	2	6	325525	325530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652844
6011	NC_021176	CGT	2	6	325574	325579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652845
6012	NC_021176	GTC	2	6	325580	325585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652845
6013	NC_021176	T	6	6	325586	325591	0 %	100 %	0 %	0 %	488652845
6014	NC_021176	TGGA	2	8	325596	325603	25 %	25 %	50 %	0 %	488652845
6015	NC_021176	TGC	2	6	325647	325652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652845
6016	NC_021176	GCT	2	6	325672	325677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652845
6017	NC_021176	GTT	2	6	325687	325692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488652845
6018	NC_021176	TATCGG	2	12	325699	325710	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	488652845
6019	NC_021176	ACC	2	6	325871	325876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488652845
6020	NC_021176	TTA	2	6	325908	325913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488652845
6021	NC_021176	GCCA	2	8	325985	325992	25 %	0 %	25 %	50 %	488652845
6022	NC_021176	GGC	2	6	326009	326014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652845
6023	NC_021176	GCT	2	6	326128	326133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652845
6024	NC_021176	CGC	2	6	326163	326168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652845
6025	NC_021176	GCA	2	6	326179	326184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652845
6026	NC_021176	GCC	2	6	326400	326405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652846
6027	NC_021176	AAT	2	6	326428	326433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488652846
6028	NC_021176	TG	3	6	326510	326515	0 %	50 %	50 %	0 %	488652846
6029	NC_021176	GC	4	8	326565	326572	0 %	0 %	50 %	50 %	488652846
6030	NC_021176	TGC	2	6	326610	326615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652846
6031	NC_021176	GAAT	2	8	326625	326632	50 %	25 %	25 %	0 %	488652846
6032	NC_021176	ATT	2	6	326645	326650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488652846
6033	NC_021176	GCT	2	6	326680	326685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652846
6034	NC_021176	T	6	6	326692	326697	0 %	100 %	0 %	0 %	488652846
6035	NC_021176	CGT	2	6	326705	326710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652846
6036	NC_021176	GAA	2	6	326728	326733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488652846
6037	NC_021176	CCG	2	6	326943	326948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652847
6038	NC_021176	GCTTCC	2	12	326972	326983	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	488652847
6039	NC_021176	CTTTT	2	10	326986	326995	0 %	80 %	0 %	20 %	488652847
6040	NC_021176	CCA	2	6	327009	327014	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488652847
6041	NC_021176	CATAAG	2	12	327045	327056	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	488652847
6042	NC_021176	CG	3	6	327068	327073	0 %	0 %	50 %	50 %	488652847
6043	NC_021176	GCT	2	6	327126	327131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652847
6044	NC_021176	GGC	2	6	327217	327222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652847
6045	NC_021176	CAT	2	6	327274	327279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652847
6046	NC_021176	CCG	2	6	327299	327304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652847
6047	NC_021176	CGGT	2	8	327329	327336	0 %	25 %	50 %	25 %	488652847
6048	NC_021176	CAT	2	6	327370	327375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652847
6049	NC_021176	CGC	2	6	327439	327444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652847
6050	NC_021176	CAG	2	6	327445	327450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652847
6051	NC_021176	T	6	6	327475	327480	0 %	100 %	0 %	0 %	488652847
6052	NC_021176	ATC	2	6	327553	327558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652847
6053	NC_021176	A	6	6	327620	327625	100 %	0 %	0 %	0 %	488652847
6054	NC_021176	AGC	2	6	327629	327634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652847
6055	NC_021176	GCG	2	6	327635	327640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652847
6056	NC_021176	TAT	2	6	327648	327653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488652847
6057	NC_021176	CGT	2	6	327654	327659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652847
6058	NC_021176	TGA	2	6	327786	327791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652847
6059	NC_021176	CAG	2	6	327799	327804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652847
6060	NC_021176	CGT	2	6	327805	327810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652847
6061	NC_021176	T	6	6	327817	327822	0 %	100 %	0 %	0 %	488652847
6062	NC_021176	ATC	2	6	327823	327828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652847
6063	NC_021176	ACG	2	6	327887	327892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652847
6064	NC_021176	AAT	2	6	327987	327992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488652847
6065	NC_021176	CG	4	8	328020	328027	0 %	0 %	50 %	50 %	488652847
6066	NC_021176	AAC	2	6	328085	328090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488652847
6067	NC_021176	CTG	2	6	328147	328152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652847
6068	NC_021176	T	6	6	328177	328182	0 %	100 %	0 %	0 %	488652847
6069	NC_021176	C	6	6	328236	328241	0 %	0 %	0 %	100 %	488652847
6070	NC_021176	GCT	2	6	328304	328309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652847
6071	NC_021176	CAG	3	9	328312	328320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652847
6072	NC_021176	TAAT	2	8	328343	328350	50 %	50 %	0 %	0 %	488652847
6073	NC_021176	T	6	6	328357	328362	0 %	100 %	0 %	0 %	488652847
6074	NC_021176	TGC	2	6	328415	328420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652848
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6080	NC_021176	GC	3	6	328681	328686	0 %	0 %	50 %	50 %	488652849
6081	NC_021176	AT	3	6	328715	328720	50 %	50 %	0 %	0 %	488652849
6082	NC_021176	CTG	2	6	328792	328797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652849
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6085	NC_021176	CGG	2	6	328979	328984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652849
6086	NC_021176	ATG	2	6	329023	329028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652849
6087	NC_021176	TCT	2	6	329041	329046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488652849
6088	NC_021176	CCA	2	6	329073	329078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488652849
6089	NC_021176	CTG	2	6	329107	329112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652849
6090	NC_021176	CTGGCG	2	12	329158	329169	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	488652849
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6093	NC_021176	CT	3	6	329377	329382	0 %	50 %	0 %	50 %	488652849
6094	NC_021176	TCA	2	6	329466	329471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652849
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6100	NC_021176	TGA	2	6	329571	329576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652849
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6103	NC_021176	GGCG	2	8	329859	329866	0 %	0 %	75 %	25 %	488652849
6104	NC_021176	TCG	2	6	329909	329914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652849
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6106	NC_021176	CGG	3	9	329964	329972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652849
6107	NC_021176	CGC	2	6	330055	330060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652849
6108	NC_021176	GCT	2	6	330080	330085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652849
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6110	NC_021176	GCGG	2	8	330133	330140	0 %	0 %	75 %	25 %	488652849
6111	NC_021176	TC	3	6	330141	330146	0 %	50 %	0 %	50 %	488652849
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6116	NC_021176	GAA	2	6	330364	330369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488652849
6117	NC_021176	TC	3	6	330375	330380	0 %	50 %	0 %	50 %	488652849
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6119	NC_021176	CTG	2	6	330433	330438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652849
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6121	NC_021176	A	6	6	330563	330568	100 %	0 %	0 %	0 %	488652849
6122	NC_021176	CCTT	2	8	330569	330576	0 %	50 %	0 %	50 %	488652849
6123	NC_021176	ACCGT	2	10	330590	330599	20 %	20 %	20 %	40 %	488652849
6124	NC_021176	TGG	2	6	330608	330613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488652849
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6127	NC_021176	GCT	2	6	330732	330737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652849
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6133	NC_021176	TGC	2	6	331097	331102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652849
6134	NC_021176	GATC	2	8	331104	331111	25 %	25 %	25 %	25 %	488652849
6135	NC_021176	CGTG	2	8	331188	331195	0 %	25 %	50 %	25 %	488652849
6136	NC_021176	TGC	2	6	331242	331247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652849
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6151	NC_021176	CTG	2	6	331843	331848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652849
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6153	NC_021176	GCG	2	6	331892	331897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652849
6154	NC_021176	GGGC	2	8	331922	331929	0 %	0 %	75 %	25 %	488652849
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6229	NC_021176	TGAAC	2	10	336547	336556	40 %	20 %	20 %	20 %	488652852
6230	NC_021176	ACGC	2	8	336596	336603	25 %	0 %	25 %	50 %	488652852
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6233	NC_021176	AGGT	2	8	336829	336836	25 %	25 %	50 %	0 %	488652853
6234	NC_021176	CGCGG	2	10	336903	336912	0 %	0 %	60 %	40 %	488652853
6235	NC_021176	AT	3	6	336914	336919	50 %	50 %	0 %	0 %	488652853
6236	NC_021176	GAC	2	6	336963	336968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652853
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6238	NC_021176	TCTTTG	2	12	337036	337047	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	488652853
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6240	NC_021176	GAC	2	6	337086	337091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652853
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6242	NC_021176	GGC	2	6	337275	337280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652854
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6485	NC_021176	GC	3	6	349550	349555	0 %	0 %	50 %	50 %	488652861
6486	NC_021176	GCG	2	6	349614	349619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652861
6487	NC_021176	TGG	2	6	349641	349646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488652861
6488	NC_021176	CAT	2	6	349659	349664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652861
6489	NC_021176	GAG	2	6	349755	349760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488652862
6490	NC_021176	GGC	3	9	349846	349854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652862
6491	NC_021176	GGT	2	6	349888	349893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488652862
6492	NC_021176	CCG	2	6	349953	349958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652862
6493	NC_021176	CTG	2	6	349961	349966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652862
6494	NC_021176	GGC	2	6	350014	350019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652862
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6497	NC_021176	TTA	2	6	350221	350226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488652862
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