MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty21a

Total Repeats: 84382

< Previous12...678910111213141516...168169Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5004	NC_021176	GAA	2	6	263505	263510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488652789
5005	NC_021176	TGCG	2	8	263521	263528	0 %	25 %	50 %	25 %	488652789
5006	NC_021176	TAT	2	6	263679	263684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488652789
5007	NC_021176	TGA	2	6	263696	263701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652789
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5009	NC_021176	GGT	2	6	263720	263725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488652789
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5012	NC_021176	ATG	2	6	263835	263840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652789
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5014	NC_021176	TGAT	2	8	263869	263876	25 %	50 %	25 %	0 %	488652790
5015	NC_021176	TTG	2	6	263959	263964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488652790
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5243	NC_021176	CGA	2	6	277423	277428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652798
5244	NC_021176	CGC	2	6	277436	277441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652798
5245	NC_021176	TGT	2	6	277442	277447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488652798
5246	NC_021176	AGC	2	6	277500	277505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652798
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5251	NC_021176	GCA	2	6	277913	277918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652800
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5283	NC_021176	GTAT	3	12	279721	279732	25 %	50 %	25 %	0 %	488652803
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5321	NC_021176	TCA	2	6	282050	282055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652805
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5329	NC_021176	T	6	6	282319	282324	0 %	100 %	0 %	0 %	488652805
5330	NC_021176	TA	3	6	282354	282359	50 %	50 %	0 %	0 %	488652805
5331	NC_021176	ATC	2	6	282380	282385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652805
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5336	NC_021176	CGT	2	6	282768	282773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652806
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5345	NC_021176	GACCA	2	10	283206	283215	40 %	0 %	20 %	40 %	488652806
5346	NC_021176	GCT	2	6	283284	283289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652806
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5349	NC_021176	GC	3	6	283427	283432	0 %	0 %	50 %	50 %	488652807
5350	NC_021176	CGC	2	6	283480	283485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652807
5351	NC_021176	AAC	2	6	283645	283650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488652807
5352	NC_021176	ATA	2	6	283692	283697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488652807
5353	NC_021176	CGC	2	6	283829	283834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652808
5354	NC_021176	TCA	2	6	283867	283872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652808
5355	NC_021176	T	6	6	283893	283898	0 %	100 %	0 %	0 %	488652808
5356	NC_021176	CTGG	2	8	284004	284011	0 %	25 %	50 %	25 %	488652808
5357	NC_021176	TGA	2	6	284024	284029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652808
5358	NC_021176	GCG	2	6	284072	284077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652808
5359	NC_021176	CAA	2	6	284087	284092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488652808
5360	NC_021176	CGA	2	6	284114	284119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652808
5361	NC_021176	GCA	4	12	284180	284191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652808
5362	NC_021176	GGTCG	2	10	284208	284217	0 %	20 %	60 %	20 %	488652808
5363	NC_021176	GATTT	2	10	284260	284269	20 %	60 %	20 %	0 %	488652808
5364	NC_021176	T	7	7	284267	284273	0 %	100 %	0 %	0 %	488652808
5365	NC_021176	TTTC	2	8	284462	284469	0 %	75 %	0 %	25 %	488652808
5366	NC_021176	TGC	2	6	284497	284502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652808
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5369	NC_021176	TCA	2	6	284752	284757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652809
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5371	NC_021176	GCC	2	6	284825	284830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652809
5372	NC_021176	ACCAG	2	10	284880	284889	40 %	0 %	20 %	40 %	488652809
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5403	NC_021176	CTTC	2	8	286162	286169	0 %	50 %	0 %	50 %	488652810
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5468	NC_021176	TG	3	6	295359	295364	0 %	50 %	50 %	0 %	488652815
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5477	NC_021176	CTTT	2	8	295715	295722	0 %	75 %	0 %	25 %	488652815
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5483	NC_021176	CAC	2	6	296006	296011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488652815
5484	NC_021176	TCA	2	6	296018	296023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652815
5485	NC_021176	ATG	2	6	296047	296052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652815
5486	NC_021176	ATC	2	6	296157	296162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652815
5487	NC_021176	GC	3	6	296318	296323	0 %	0 %	50 %	50 %	488652815
5488	NC_021176	CAG	2	6	296472	296477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652815
5489	NC_021176	CAT	2	6	296516	296521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652815
5490	NC_021176	ACTG	2	8	296524	296531	25 %	25 %	25 %	25 %	488652815
5491	NC_021176	GTT	2	6	296558	296563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488652815
5492	NC_021176	TTA	2	6	296569	296574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488652815
5493	NC_021176	ACA	2	6	296588	296593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488652815
5494	NC_021176	TCA	2	6	296716	296721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652816
5495	NC_021176	TCG	2	6	296758	296763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652816
5496	NC_021176	CAAT	2	8	296873	296880	50 %	25 %	0 %	25 %	488652816
5497	NC_021176	AACCC	2	10	296903	296912	40 %	0 %	0 %	60 %	488652816
5498	NC_021176	CG	4	8	296973	296980	0 %	0 %	50 %	50 %	488652816
5499	NC_021176	GTA	2	6	297111	297116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652816
5500	NC_021176	CGGA	2	8	297180	297187	25 %	0 %	50 %	25 %	488652816

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