MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty21a

Total Repeats: 84382

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4502	NC_021176	TGCTGG	2	12	236888	236899	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	488652765
4503	NC_021176	GC	3	6	237007	237012	0 %	0 %	50 %	50 %	488652765
4504	NC_021176	GGC	2	6	237039	237044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652765
4505	NC_021176	TGA	2	6	237168	237173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652766
4506	NC_021176	GCA	2	6	237202	237207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652766
4507	NC_021176	CGG	2	6	237276	237281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652766
4508	NC_021176	TGG	2	6	237368	237373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488652766
4509	NC_021176	TGG	2	6	237398	237403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488652766
4510	NC_021176	AACC	2	8	237453	237460	50 %	0 %	0 %	50 %	488652766
4511	NC_021176	CTTC	2	8	237491	237498	0 %	50 %	0 %	50 %	488652766
4512	NC_021176	GCC	2	6	237663	237668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652767
4513	NC_021176	GAC	2	6	237686	237691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652767
4514	NC_021176	CAT	2	6	237698	237703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652767
4515	NC_021176	ATA	2	6	237765	237770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488652767
4516	NC_021176	AAT	2	6	237833	237838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488652767
4517	NC_021176	CGC	2	6	237841	237846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652767
4518	NC_021176	CAG	2	6	237998	238003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652767
4519	NC_021176	CGA	2	6	238030	238035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652767
4520	NC_021176	CGC	2	6	238102	238107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652767
4521	NC_021176	ACG	2	6	238119	238124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652767
4522	NC_021176	GTT	2	6	238297	238302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488652768
4523	NC_021176	GCG	2	6	238305	238310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652768
4524	NC_021176	ATA	2	6	238314	238319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488652768
4525	NC_021176	CCG	2	6	238515	238520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652768
4526	NC_021176	GTC	2	6	238524	238529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652768
4527	NC_021176	GAA	2	6	238588	238593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488652768
4528	NC_021176	GCG	2	6	238635	238640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652768
4529	NC_021176	CTGC	2	8	238663	238670	0 %	25 %	25 %	50 %	488652768
4530	NC_021176	GGC	2	6	238697	238702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652768
4531	NC_021176	CCAC	2	8	238747	238754	25 %	0 %	0 %	75 %	488652768
4532	NC_021176	CCG	2	6	238806	238811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652768
4533	NC_021176	CGA	2	6	238819	238824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652768
4534	NC_021176	ATTC	2	8	238859	238866	25 %	50 %	0 %	25 %	488652768
4535	NC_021176	T	6	6	238891	238896	0 %	100 %	0 %	0 %	488652768
4536	NC_021176	CGGG	2	8	238903	238910	0 %	0 %	75 %	25 %	488652768
4537	NC_021176	GCT	2	6	238922	238927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652768
4538	NC_021176	CGG	2	6	238948	238953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652768
4539	NC_021176	AAGC	2	8	238957	238964	50 %	0 %	25 %	25 %	488652768
4540	NC_021176	GA	3	6	238978	238983	50 %	0 %	50 %	0 %	488652768
4541	NC_021176	CG	3	6	238993	238998	0 %	0 %	50 %	50 %	488652768
4542	NC_021176	AGC	2	6	239028	239033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652768
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4544	NC_021176	ACC	2	6	239185	239190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488652769
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4547	NC_021176	CGG	2	6	239375	239380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652769
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4550	NC_021176	CGT	2	6	239462	239467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652769
4551	NC_021176	GAC	2	6	239487	239492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652769
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4553	NC_021176	GCC	2	6	239593	239598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652769
4554	NC_021176	GCC	2	6	239670	239675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652769
4555	NC_021176	GCA	2	6	239711	239716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652769
4556	NC_021176	CTT	3	9	239723	239731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488652769
4557	NC_021176	ATG	2	6	239743	239748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652769
4558	NC_021176	ATCG	2	8	239849	239856	25 %	25 %	25 %	25 %	488652770
4559	NC_021176	TCG	2	6	239882	239887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652770
4560	NC_021176	GCA	2	6	239987	239992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652770
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4562	NC_021176	GCA	2	6	240062	240067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652770
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4564	NC_021176	GGA	2	6	240125	240130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488652770
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4566	NC_021176	GGC	2	6	240230	240235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652770
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4592	NC_021176	CGC	2	6	241687	241692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652771
4593	NC_021176	GCG	2	6	241783	241788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652771
4594	NC_021176	CGG	2	6	241793	241798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652771
4595	NC_021176	CGG	2	6	241802	241807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652771
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4604	NC_021176	CGG	2	6	242201	242206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652771
4605	NC_021176	CGG	2	6	242267	242272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652771
4606	NC_021176	TGG	2	6	242332	242337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488652771
4607	NC_021176	CTGAG	2	10	242380	242389	20 %	20 %	40 %	20 %	488652771
4608	NC_021176	CAG	2	6	242525	242530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652771
4609	NC_021176	GCG	2	6	242535	242540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652771
4610	NC_021176	GC	3	6	242543	242548	0 %	0 %	50 %	50 %	488652771
4611	NC_021176	GCA	2	6	242572	242577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652771
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4619	NC_021176	CAG	2	6	242805	242810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652771
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4986	NC_021176	TAC	2	6	262550	262555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652788
4987	NC_021176	TGAT	2	8	262591	262598	25 %	50 %	25 %	0 %	488652788
4988	NC_021176	TCG	2	6	262699	262704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652788
4989	NC_021176	A	6	6	262706	262711	100 %	0 %	0 %	0 %	488652788
4990	NC_021176	TCCAG	2	10	262792	262801	20 %	20 %	20 %	40 %	488652788
4991	NC_021176	ATT	2	6	262881	262886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488652788
4992	NC_021176	ACC	2	6	262914	262919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488652788
4993	NC_021176	GAT	2	6	262938	262943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652788
4994	NC_021176	ATT	2	6	262965	262970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488652788
4995	NC_021176	CGT	2	6	262997	263002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652788
4996	NC_021176	GGC	2	6	263079	263084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652788
4997	NC_021176	CTC	2	6	263180	263185	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488652788
4998	NC_021176	CAA	2	6	263204	263209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488652788
4999	NC_021176	CTG	2	6	263224	263229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652788
5000	NC_021176	TGA	2	6	263236	263241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652788

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