MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. U288 plasmid pSTU288-1

Total Repeats: 127

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021155	T	6	6	2053	2058	0 %	100 %	0 %	0 %	482907136
2	NC_021155	A	6	6	4701	4706	100 %	0 %	0 %	0 %	482907142
3	NC_021155	T	6	6	7788	7793	0 %	100 %	0 %	0 %	482907146
4	NC_021155	C	6	6	8476	8481	0 %	0 %	0 %	100 %	482907147
5	NC_021155	T	7	7	9936	9942	0 %	100 %	0 %	0 %	482907150
6	NC_021155	A	6	6	10003	10008	100 %	0 %	0 %	0 %	482907150
7	NC_021155	T	6	6	12458	12463	0 %	100 %	0 %	0 %	482907155
8	NC_021155	C	6	6	13130	13135	0 %	0 %	0 %	100 %	482907157
9	NC_021155	T	6	6	13475	13480	0 %	100 %	0 %	0 %	482907157
10	NC_021155	A	6	6	14393	14398	100 %	0 %	0 %	0 %	482907158
11	NC_021155	T	6	6	15388	15393	0 %	100 %	0 %	0 %	482907160
12	NC_021155	T	8	8	17329	17336	0 %	100 %	0 %	0 %	482907162
13	NC_021155	C	6	6	19865	19870	0 %	0 %	0 %	100 %	482907165
14	NC_021155	C	6	6	20370	20375	0 %	0 %	0 %	100 %	482907166
15	NC_021155	A	6	6	20521	20526	100 %	0 %	0 %	0 %	482907166
16	NC_021155	T	6	6	20540	20545	0 %	100 %	0 %	0 %	482907166
17	NC_021155	T	6	6	21455	21460	0 %	100 %	0 %	0 %	482907168
18	NC_021155	T	6	6	24737	24742	0 %	100 %	0 %	0 %	482907173
19	NC_021155	A	6	6	28197	28202	100 %	0 %	0 %	0 %	482907177
20	NC_021155	G	6	6	29467	29472	0 %	0 %	100 %	0 %	482907177
21	NC_021155	G	6	6	30563	30568	0 %	0 %	100 %	0 %	482907179
22	NC_021155	T	6	6	33012	33017	0 %	100 %	0 %	0 %	482907182
23	NC_021155	T	6	6	35394	35399	0 %	100 %	0 %	0 %	482907185
24	NC_021155	T	7	7	35567	35573	0 %	100 %	0 %	0 %	482907185
25	NC_021155	T	6	6	35918	35923	0 %	100 %	0 %	0 %	482907186
26	NC_021155	A	6	6	37206	37211	100 %	0 %	0 %	0 %	482907188
27	NC_021155	A	7	7	37643	37649	100 %	0 %	0 %	0 %	482907189
28	NC_021155	T	6	6	38280	38285	0 %	100 %	0 %	0 %	482907190
29	NC_021155	T	7	7	38486	38492	0 %	100 %	0 %	0 %	482907191
30	NC_021155	T	7	7	38852	38858	0 %	100 %	0 %	0 %	482907191
31	NC_021155	A	6	6	38992	38997	100 %	0 %	0 %	0 %	482907191
32	NC_021155	A	6	6	39049	39054	100 %	0 %	0 %	0 %	482907191
33	NC_021155	T	6	6	39541	39546	0 %	100 %	0 %	0 %	482907193
34	NC_021155	T	6	6	41728	41733	0 %	100 %	0 %	0 %	482907197
35	NC_021155	C	10	10	42266	42275	0 %	0 %	0 %	100 %	482907198
36	NC_021155	T	8	8	43603	43610	0 %	100 %	0 %	0 %	482907201
37	NC_021155	A	6	6	43880	43885	100 %	0 %	0 %	0 %	482907202
38	NC_021155	G	6	6	45895	45900	0 %	0 %	100 %	0 %	482907203
39	NC_021155	A	6	6	50199	50204	100 %	0 %	0 %	0 %	482907205
40	NC_021155	A	6	6	50297	50302	100 %	0 %	0 %	0 %	482907205
41	NC_021155	G	6	6	50727	50732	0 %	0 %	100 %	0 %	482907206
42	NC_021155	T	6	6	50823	50828	0 %	100 %	0 %	0 %	482907206
43	NC_021155	T	6	6	51827	51832	0 %	100 %	0 %	0 %	482907206
44	NC_021155	T	6	6	52329	52334	0 %	100 %	0 %	0 %	482907206
45	NC_021155	A	6	6	52440	52445	100 %	0 %	0 %	0 %	482907206
46	NC_021155	T	7	7	53916	53922	0 %	100 %	0 %	0 %	482907207
47	NC_021155	T	8	8	54298	54305	0 %	100 %	0 %	0 %	482907208
48	NC_021155	T	6	6	54724	54729	0 %	100 %	0 %	0 %	482907209
49	NC_021155	C	6	6	56702	56707	0 %	0 %	0 %	100 %	482907209
50	NC_021155	A	6	6	56726	56731	100 %	0 %	0 %	0 %	482907209
51	NC_021155	C	6	6	58190	58195	0 %	0 %	0 %	100 %	482907210
52	NC_021155	A	6	6	58316	58321	100 %	0 %	0 %	0 %	482907210
53	NC_021155	T	6	6	58464	58469	0 %	100 %	0 %	0 %	482907210
54	NC_021155	A	7	7	59374	59380	100 %	0 %	0 %	0 %	482907212
55	NC_021155	T	6	6	60151	60156	0 %	100 %	0 %	0 %	482907213
56	NC_021155	C	6	6	63850	63855	0 %	0 %	0 %	100 %	482907218
57	NC_021155	T	6	6	65730	65735	0 %	100 %	0 %	0 %	482907221
58	NC_021155	A	6	6	65751	65756	100 %	0 %	0 %	0 %	482907221
59	NC_021155	T	6	6	66791	66796	0 %	100 %	0 %	0 %	482907222
60	NC_021155	T	8	8	68040	68047	0 %	100 %	0 %	0 %	482907222
61	NC_021155	T	6	6	69392	69397	0 %	100 %	0 %	0 %	482907225
62	NC_021155	A	6	6	69807	69812	100 %	0 %	0 %	0 %	482907227
63	NC_021155	T	6	6	70527	70532	0 %	100 %	0 %	0 %	482907229
64	NC_021155	C	6	6	71697	71702	0 %	0 %	0 %	100 %	482907230
65	NC_021155	T	6	6	73237	73242	0 %	100 %	0 %	0 %	482907231
66	NC_021155	A	6	6	73415	73420	100 %	0 %	0 %	0 %	482907232
67	NC_021155	T	6	6	73936	73941	0 %	100 %	0 %	0 %	482907233
68	NC_021155	A	6	6	75079	75084	100 %	0 %	0 %	0 %	482907236
69	NC_021155	A	7	7	75166	75172	100 %	0 %	0 %	0 %	482907236
70	NC_021155	G	6	6	76866	76871	0 %	0 %	100 %	0 %	482907238
71	NC_021155	T	6	6	77426	77431	0 %	100 %	0 %	0 %	482907239
72	NC_021155	A	6	6	78051	78056	100 %	0 %	0 %	0 %	482907241
73	NC_021155	T	6	6	78408	78413	0 %	100 %	0 %	0 %	482907242
74	NC_021155	A	6	6	79261	79266	100 %	0 %	0 %	0 %	482907244
75	NC_021155	A	6	6	79644	79649	100 %	0 %	0 %	0 %	482907245
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77	NC_021155	A	7	7	83488	83494	100 %	0 %	0 %	0 %	482907249
78	NC_021155	T	6	6	83556	83561	0 %	100 %	0 %	0 %	482907250
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81	NC_021155	A	6	6	85382	85387	100 %	0 %	0 %	0 %	482907253
82	NC_021155	T	6	6	87476	87481	0 %	100 %	0 %	0 %	482907257
83	NC_021155	A	7	7	89932	89938	100 %	0 %	0 %	0 %	482907262
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85	NC_021155	A	6	6	94087	94092	100 %	0 %	0 %	0 %	482907265
86	NC_021155	A	6	6	99487	99492	100 %	0 %	0 %	0 %	482907272
87	NC_021155	A	6	6	100989	100994	100 %	0 %	0 %	0 %	482907274
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91	NC_021155	T	6	6	103200	103205	0 %	100 %	0 %	0 %	482907277
92	NC_021155	A	6	6	103461	103466	100 %	0 %	0 %	0 %	482907277
93	NC_021155	A	6	6	104406	104411	100 %	0 %	0 %	0 %	482907279
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95	NC_021155	A	6	6	115862	115867	100 %	0 %	0 %	0 %	482907291
96	NC_021155	A	6	6	115964	115969	100 %	0 %	0 %	0 %	482907291
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99	NC_021155	T	6	6	117033	117038	0 %	100 %	0 %	0 %	482907292
100	NC_021155	A	6	6	118052	118057	100 %	0 %	0 %	0 %	482907294
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102	NC_021155	T	6	6	120522	120527	0 %	100 %	0 %	0 %	482907297
103	NC_021155	A	6	6	120584	120589	100 %	0 %	0 %	0 %	482907298
104	NC_021155	A	6	6	123680	123685	100 %	0 %	0 %	0 %	482907303
105	NC_021155	G	6	6	124960	124965	0 %	0 %	100 %	0 %	482907305
106	NC_021155	A	6	6	126669	126674	100 %	0 %	0 %	0 %	482907308
107	NC_021155	T	6	6	127730	127735	0 %	100 %	0 %	0 %	482907310
108	NC_021155	T	7	7	128583	128589	0 %	100 %	0 %	0 %	482907312
109	NC_021155	T	6	6	128652	128657	0 %	100 %	0 %	0 %	482907312
110	NC_021155	T	6	6	129118	129123	0 %	100 %	0 %	0 %	482907312
111	NC_021155	T	6	6	133464	133469	0 %	100 %	0 %	0 %	482907317
112	NC_021155	T	6	6	133871	133876	0 %	100 %	0 %	0 %	482907317
113	NC_021155	A	6	6	137546	137551	100 %	0 %	0 %	0 %	482907322
114	NC_021155	A	6	6	138763	138768	100 %	0 %	0 %	0 %	482907323
115	NC_021155	G	6	6	138863	138868	0 %	0 %	100 %	0 %	482907323
116	NC_021155	A	6	6	139407	139412	100 %	0 %	0 %	0 %	482907323
117	NC_021155	A	7	7	140373	140379	100 %	0 %	0 %	0 %	482907323
118	NC_021155	T	8	8	140442	140449	0 %	100 %	0 %	0 %	482907324
119	NC_021155	T	6	6	142112	142117	0 %	100 %	0 %	0 %	482907324
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121	NC_021155	T	7	7	142437	142443	0 %	100 %	0 %	0 %	482907324
122	NC_021155	T	6	6	143389	143394	0 %	100 %	0 %	0 %	482907325
123	NC_021155	A	6	6	143733	143738	100 %	0 %	0 %	0 %	482907326
124	NC_021155	A	7	7	145468	145474	100 %	0 %	0 %	0 %	482907328
125	NC_021155	T	6	6	147786	147791	0 %	100 %	0 %	0 %	482907331
126	NC_021155	T	7	7	147959	147965	0 %	100 %	0 %	0 %	482907331
127	NC_021155	T	6	6	148584	148589	0 %	100 %	0 %	0 %	482907333

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.