MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. U288 plasmid pSTU288-1

Total Repeats: 1804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021155	TCA	2	6	81	86	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482907134
2	NC_021155	TTC	2	6	97	102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482907134
3	NC_021155	TGC	2	6	141	146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482907134
4	NC_021155	CTG	2	6	204	209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482907134
5	NC_021155	CTG	2	6	216	221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482907134
6	NC_021155	CTG	2	6	228	233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482907134
7	NC_021155	CTG	2	6	240	245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482907134
8	NC_021155	TGC	2	6	307	312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482907134
9	NC_021155	TCA	2	6	476	481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482907134
10	NC_021155	TCA	2	6	526	531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482907134
11	NC_021155	TGC	2	6	685	690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482907134
12	NC_021155	CGC	2	6	708	713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482907134
13	NC_021155	GGT	2	6	804	809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482907134
14	NC_021155	CAA	2	6	857	862	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482907134
15	NC_021155	CAT	2	6	983	988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482907134
16	NC_021155	GCG	2	6	989	994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482907134
17	NC_021155	TCT	2	6	1013	1018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482907134
18	NC_021155	CGG	2	6	1326	1331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482907135
19	NC_021155	CTG	2	6	2107	2112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482907136
20	NC_021155	GGC	2	6	2174	2179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482907136
21	NC_021155	GCG	2	6	2262	2267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482907137
22	NC_021155	CGG	2	6	2345	2350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482907137
23	NC_021155	CAG	2	6	2367	2372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482907137
24	NC_021155	GAC	2	6	2394	2399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482907137
25	NC_021155	GCC	2	6	2405	2410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482907137
26	NC_021155	AAC	2	6	2453	2458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482907137
27	NC_021155	CCT	2	6	2526	2531	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482907138
28	NC_021155	CGG	2	6	2567	2572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482907138
29	NC_021155	CCT	2	6	2757	2762	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482907139
30	NC_021155	CCA	2	6	2779	2784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482907139
31	NC_021155	ATC	2	6	2821	2826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482907139
32	NC_021155	GGC	2	6	2992	2997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482907139
33	NC_021155	TCA	3	9	3011	3019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482907139
34	NC_021155	CAG	2	6	3090	3095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482907139
35	NC_021155	CAA	2	6	3099	3104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482907139
36	NC_021155	AGG	2	6	3303	3308	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482907140
37	NC_021155	GCG	2	6	3324	3329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482907140
38	NC_021155	ACG	2	6	3389	3394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482907140
39	NC_021155	CAC	2	6	3637	3642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482907141
40	NC_021155	GAT	2	6	3671	3676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482907141
41	NC_021155	CGG	2	6	3733	3738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482907141
42	NC_021155	GGC	2	6	3802	3807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482907141
43	NC_021155	CTT	2	6	3927	3932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482907141
44	NC_021155	GCA	2	6	3990	3995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482907141
45	NC_021155	GGT	2	6	4054	4059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482907141
46	NC_021155	CAG	2	6	4072	4077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482907141
47	NC_021155	TCC	2	6	4079	4084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482907141
48	NC_021155	ACC	2	6	4093	4098	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482907141
49	NC_021155	TCA	2	6	4164	4169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482907141
50	NC_021155	ATC	2	6	4195	4200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482907142
51	NC_021155	CAC	2	6	4232	4237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482907142
52	NC_021155	GCC	2	6	4265	4270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482907142
53	NC_021155	TCC	2	6	4279	4284	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482907142
54	NC_021155	ATG	2	6	4304	4309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482907142
55	NC_021155	CAC	2	6	4330	4335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482907142
56	NC_021155	CTC	2	6	4362	4367	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482907142
57	NC_021155	AAC	2	6	4368	4373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482907142
58	NC_021155	CGT	2	6	4471	4476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482907142
59	NC_021155	GGC	2	6	4496	4501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482907142
60	NC_021155	GAC	2	6	4532	4537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482907142
61	NC_021155	GAA	2	6	4601	4606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482907142
62	NC_021155	TCC	2	6	4678	4683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482907142
63	NC_021155	GAC	3	9	4796	4804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482907142
64	NC_021155	GTT	2	6	4805	4810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482907142
65	NC_021155	GGC	2	6	4833	4838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482907142
66	NC_021155	CCT	2	6	4893	4898	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482907143
67	NC_021155	GAT	2	6	4916	4921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482907143
68	NC_021155	ACG	2	6	5013	5018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482907143
69	NC_021155	CCA	2	6	5031	5036	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482907143
70	NC_021155	TCA	2	6	5173	5178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482907143
71	NC_021155	GCA	2	6	5247	5252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482907143
72	NC_021155	TCA	2	6	5314	5319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482907143
73	NC_021155	GGC	2	6	5375	5380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482907144
74	NC_021155	TCT	2	6	5506	5511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482907144
75	NC_021155	CAT	2	6	5542	5547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482907144
76	NC_021155	GAA	2	6	5585	5590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482907144
77	NC_021155	TCG	2	6	5599	5604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482907144
78	NC_021155	CCA	2	6	5609	5614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482907144
79	NC_021155	CCT	2	6	5743	5748	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482907144
80	NC_021155	CGT	2	6	5765	5770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482907144
81	NC_021155	AAT	2	6	5881	5886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482907144
82	NC_021155	GCT	2	6	5986	5991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482907144
83	NC_021155	GCC	2	6	6000	6005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482907144
84	NC_021155	TCC	2	6	6060	6065	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482907144
85	NC_021155	CGT	2	6	6103	6108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482907144
86	NC_021155	CAT	2	6	6115	6120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482907144
87	NC_021155	CAC	2	6	6139	6144	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482907144
88	NC_021155	ACC	2	6	6177	6182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482907144
89	NC_021155	CAG	2	6	6260	6265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482907144
90	NC_021155	CGT	2	6	6295	6300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482907144
91	NC_021155	TCA	2	6	6307	6312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482907144
92	NC_021155	CAG	2	6	6482	6487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482907144
93	NC_021155	GGC	2	6	6488	6493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482907144
94	NC_021155	GGT	2	6	6749	6754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482907144
95	NC_021155	CAG	2	6	6842	6847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482907144
96	NC_021155	CGA	2	6	6927	6932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482907144
97	NC_021155	ACC	2	6	7055	7060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482907144
98	NC_021155	GCG	2	6	7062	7067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482907144
99	NC_021155	TCC	2	6	7227	7232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482907144
100	NC_021155	CAG	2	6	7241	7246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482907144
101	NC_021155	GGT	2	6	7298	7303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482907144
102	NC_021155	TTA	2	6	7480	7485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482907145
103	NC_021155	GTC	2	6	7692	7697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482907146
104	NC_021155	TCC	2	6	7711	7716	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482907146
105	NC_021155	CTG	2	6	7824	7829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482907146
106	NC_021155	CTG	2	6	7854	7859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482907146
107	NC_021155	GTC	2	6	7935	7940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482907146
108	NC_021155	CGA	2	6	8171	8176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482907146
109	NC_021155	TTG	2	6	8185	8190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482907146
110	NC_021155	GGC	2	6	8516	8521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482907147
111	NC_021155	AGG	2	6	8522	8527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482907147
112	NC_021155	CTG	2	6	8533	8538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482907147
113	NC_021155	CTG	2	6	8987	8992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482907148
114	NC_021155	ACC	2	6	9010	9015	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482907148
115	NC_021155	CTG	2	6	9028	9033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482907148
116	NC_021155	CAC	2	6	9037	9042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482907148
117	NC_021155	TCA	2	6	9056	9061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482907148
118	NC_021155	GTG	2	6	9074	9079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482907148
119	NC_021155	ACG	2	6	9100	9105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482907148
120	NC_021155	TTC	2	6	9219	9224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482907149
121	NC_021155	CCA	2	6	9302	9307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482907149
122	NC_021155	CCG	2	6	9323	9328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482907149
123	NC_021155	TTC	2	6	9357	9362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482907149
124	NC_021155	AAC	2	6	9375	9380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482907149
125	NC_021155	AAC	2	6	9387	9392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482907149
126	NC_021155	CAC	2	6	9507	9512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482907149
127	NC_021155	ATG	2	6	9788	9793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482907150
128	NC_021155	CAT	2	6	9868	9873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482907150
129	NC_021155	GCC	2	6	9877	9882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482907150
130	NC_021155	CAT	2	6	9931	9936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482907150
131	NC_021155	ATG	2	6	10058	10063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482907150
132	NC_021155	AGG	2	6	10252	10257	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482907151
133	NC_021155	GCG	2	6	10273	10278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482907151
134	NC_021155	TCA	2	6	10474	10479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482907152
135	NC_021155	TGC	2	6	10509	10514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482907152
136	NC_021155	ACC	2	6	10538	10543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482907152
137	NC_021155	GCG	2	6	10570	10575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482907152
138	NC_021155	GCA	2	6	10596	10601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482907152
139	NC_021155	CGA	2	6	10666	10671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482907152
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142	NC_021155	GCG	2	6	10777	10782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482907152
143	NC_021155	GGT	3	9	10810	10818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482907152
144	NC_021155	CGC	2	6	10835	10840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482907152
145	NC_021155	TCT	2	6	10844	10849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482907152
146	NC_021155	GCG	2	6	11055	11060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482907152
147	NC_021155	CGC	2	6	11067	11072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482907152
148	NC_021155	CAG	3	9	11194	11202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482907152
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151	NC_021155	CAG	2	6	11325	11330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482907153
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153	NC_021155	GGC	2	6	11400	11405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482907153
154	NC_021155	CAG	2	6	11454	11459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482907153
155	NC_021155	CAG	2	6	11462	11467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482907153
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162	NC_021155	CTG	2	6	12008	12013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482907155
163	NC_021155	CGG	2	6	12028	12033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482907155
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239	NC_021155	CCA	2	6	19700	19705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482907165
240	NC_021155	CTG	2	6	19761	19766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482907165
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242	NC_021155	TTC	2	6	19778	19783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482907165
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244	NC_021155	CAG	2	6	19923	19928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482907165
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246	NC_021155	CAG	2	6	19983	19988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482907165
247	NC_021155	TCA	2	6	20002	20007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482907165
248	NC_021155	TGG	2	6	20086	20091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482907165
249	NC_021155	TGC	2	6	20107	20112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482907165
250	NC_021155	ACA	2	6	20213	20218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482907166
251	NC_021155	GTT	2	6	20233	20238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482907166
252	NC_021155	TGA	3	9	20352	20360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482907166
253	NC_021155	AGC	2	6	20414	20419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482907166
254	NC_021155	ATC	2	6	20754	20759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482907167
255	NC_021155	GCG	2	6	20783	20788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482907167
256	NC_021155	ACA	2	6	20811	20816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482907167
257	NC_021155	TCA	2	6	20824	20829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482907167
258	NC_021155	ATG	2	6	21215	21220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482907168
259	NC_021155	GCA	3	9	21301	21309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482907168
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262	NC_021155	TTA	2	6	21410	21415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482907168
263	NC_021155	GAT	2	6	21491	21496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482907168
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270	NC_021155	TGC	3	9	23428	23436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482907171
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274	NC_021155	CTT	2	6	23787	23792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482907171
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283	NC_021155	ATT	3	9	25843	25851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482907174
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378	NC_021155	TCA	2	6	33969	33974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482907183
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