MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. U288 plasmid pSTU288-1

Total Repeats: 2592

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_021155	GT	3	6	82589	82594	0 %	50 %	50 %	0 %	482907248
1502	NC_021155	CCTG	2	8	82611	82618	0 %	25 %	25 %	50 %	482907248
1503	NC_021155	GACC	2	8	82707	82714	25 %	0 %	25 %	50 %	482907248
1504	NC_021155	TGC	2	6	82738	82743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482907248
1505	NC_021155	GCA	2	6	83297	83302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482907249
1506	NC_021155	CAG	3	9	83364	83372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482907249
1507	NC_021155	GAACAG	11	66	83376	83441	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	482907249
1508	NC_021155	TAT	2	6	83448	83453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482907249
1509	NC_021155	GAA	2	6	83463	83468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482907249
1510	NC_021155	CA	3	6	83472	83477	50 %	0 %	0 %	50 %	482907249
1511	NC_021155	A	7	7	83488	83494	100 %	0 %	0 %	0 %	482907249
1512	NC_021155	T	6	6	83556	83561	0 %	100 %	0 %	0 %	482907250
1513	NC_021155	CT	3	6	83642	83647	0 %	50 %	0 %	50 %	482907250
1514	NC_021155	GAC	2	6	83669	83674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482907250
1515	NC_021155	ACC	2	6	83685	83690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482907250
1516	NC_021155	CTTT	2	8	83703	83710	0 %	75 %	0 %	25 %	482907250
1517	NC_021155	CTT	2	6	83758	83763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482907250
1518	NC_021155	GTT	2	6	83766	83771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482907250
1519	NC_021155	GCC	2	6	83772	83777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482907250
1520	NC_021155	ACATC	2	10	83791	83800	40 %	20 %	0 %	40 %	482907250
1521	NC_021155	AGT	2	6	84032	84037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482907251
1522	NC_021155	TCT	2	6	84106	84111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482907251
1523	NC_021155	CAG	2	6	84113	84118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482907251
1524	NC_021155	GCA	2	6	84182	84187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482907251
1525	NC_021155	CAA	2	6	84251	84256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482907251
1526	NC_021155	GC	3	6	84310	84315	0 %	0 %	50 %	50 %	482907251
1527	NC_021155	TCA	2	6	84331	84336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482907251
1528	NC_021155	GAT	2	6	84387	84392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482907251
1529	NC_021155	T	6	6	84401	84406	0 %	100 %	0 %	0 %	482907251
1530	NC_021155	GCA	2	6	84435	84440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482907251
1531	NC_021155	GCG	2	6	84541	84546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482907252
1532	NC_021155	GCA	2	6	84602	84607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482907252
1533	NC_021155	CGG	2	6	84658	84663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482907252
1534	NC_021155	GCGA	2	8	84670	84677	25 %	0 %	50 %	25 %	482907252
1535	NC_021155	AAT	2	6	84684	84689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482907252
1536	NC_021155	CAT	2	6	84765	84770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482907252
1537	NC_021155	CCG	2	6	84775	84780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482907252
1538	NC_021155	ACC	2	6	84810	84815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482907252
1539	NC_021155	T	6	6	84834	84839	0 %	100 %	0 %	0 %	482907252
1540	NC_021155	CAGC	2	8	84863	84870	25 %	0 %	25 %	50 %	482907252
1541	NC_021155	TTC	2	6	84918	84923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482907252
1542	NC_021155	TAA	2	6	84929	84934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482907252
1543	NC_021155	GAAG	2	8	85150	85157	50 %	0 %	50 %	0 %	482907253
1544	NC_021155	CCG	2	6	85168	85173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482907253
1545	NC_021155	GATG	2	8	85212	85219	25 %	25 %	50 %	0 %	482907253
1546	NC_021155	CGGC	2	8	85275	85282	0 %	0 %	50 %	50 %	482907253
1547	NC_021155	GTC	2	6	85342	85347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482907253
1548	NC_021155	TCG	2	6	85355	85360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482907253
1549	NC_021155	A	6	6	85382	85387	100 %	0 %	0 %	0 %	482907253
1550	NC_021155	TCTTT	2	10	85408	85417	0 %	80 %	0 %	20 %	482907253
1551	NC_021155	CA	3	6	85449	85454	50 %	0 %	0 %	50 %	482907253
1552	NC_021155	CAC	2	6	85497	85502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482907254
1553	NC_021155	CGG	2	6	85516	85521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482907254
1554	NC_021155	GCG	2	6	85530	85535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482907254
1555	NC_021155	CGG	2	6	85577	85582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482907254
1556	NC_021155	TCC	2	6	85594	85599	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482907254
1557	NC_021155	CAG	2	6	85617	85622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482907254
1558	NC_021155	GTCC	2	8	85676	85683	0 %	25 %	25 %	50 %	482907254
1559	NC_021155	GCC	2	6	85789	85794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482907254
1560	NC_021155	CAG	2	6	85860	85865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482907254
1561	NC_021155	CAG	2	6	86016	86021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482907254
1562	NC_021155	CGT	2	6	86058	86063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482907254
1563	NC_021155	GCA	2	6	86080	86085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482907254
1564	NC_021155	GCCA	2	8	86104	86111	25 %	0 %	25 %	50 %	482907254
1565	NC_021155	CAC	2	6	86118	86123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482907254
1566	NC_021155	CGC	2	6	86300	86305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482907255
1567	NC_021155	AGGCC	2	10	86378	86387	20 %	0 %	40 %	40 %	482907255
1568	NC_021155	TCC	2	6	86394	86399	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482907255
1569	NC_021155	GCCC	2	8	86409	86416	0 %	0 %	25 %	75 %	482907255
1570	NC_021155	CAG	2	6	86438	86443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482907255
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1572	NC_021155	CAG	2	6	86633	86638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482907255
1573	NC_021155	TCG	2	6	86649	86654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482907255
1574	NC_021155	AGTTC	2	10	86680	86689	20 %	40 %	20 %	20 %	482907255
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1582	NC_021155	GC	3	6	87036	87041	0 %	0 %	50 %	50 %	482907257
1583	NC_021155	AT	3	6	87102	87107	50 %	50 %	0 %	0 %	482907257
1584	NC_021155	GT	4	8	87180	87187	0 %	50 %	50 %	0 %	482907257
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1588	NC_021155	CAG	2	6	87464	87469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482907257
1589	NC_021155	T	6	6	87476	87481	0 %	100 %	0 %	0 %	482907257
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1591	NC_021155	GGTC	2	8	87586	87593	0 %	25 %	50 %	25 %	482907257
1592	NC_021155	GC	3	6	87609	87614	0 %	0 %	50 %	50 %	482907257
1593	NC_021155	ATA	2	6	87630	87635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482907257
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1598	NC_021155	ATT	2	6	88394	88399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482907258
1599	NC_021155	CAT	2	6	88463	88468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482907259
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1601	NC_021155	GCCA	2	8	88546	88553	25 %	0 %	25 %	50 %	482907259
1602	NC_021155	GCA	2	6	88563	88568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482907259
1603	NC_021155	CAT	2	6	88574	88579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482907259
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1608	NC_021155	TA	3	6	89347	89352	50 %	50 %	0 %	0 %	482907260
1609	NC_021155	CGG	2	6	89449	89454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482907261
1610	NC_021155	GCCG	2	8	89465	89472	0 %	0 %	50 %	50 %	482907261
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1620	NC_021155	A	7	7	89932	89938	100 %	0 %	0 %	0 %	482907262
1621	NC_021155	CGTT	2	8	90178	90185	0 %	50 %	25 %	25 %	482907262
1622	NC_021155	GACC	2	8	90219	90226	25 %	0 %	25 %	50 %	482907262
1623	NC_021155	GC	3	6	90243	90248	0 %	0 %	50 %	50 %	482907262
1624	NC_021155	AACG	2	8	90312	90319	50 %	0 %	25 %	25 %	482907262
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1626	NC_021155	GGA	2	6	90346	90351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482907262
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1631	NC_021155	GA	3	6	90470	90475	50 %	0 %	50 %	0 %	482907262
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1665	NC_021155	GGCT	2	8	92466	92473	0 %	25 %	50 %	25 %	482907264
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1994	NC_021155	GAG	2	6	113965	113970	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482907289
1995	NC_021155	CGG	2	6	113984	113989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482907289
1996	NC_021155	CGCGC	2	10	114039	114048	0 %	0 %	40 %	60 %	482907289
1997	NC_021155	GCC	2	6	114094	114099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482907289
1998	NC_021155	GAT	2	6	114117	114122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482907289
1999	NC_021155	CGG	2	6	114123	114128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482907289
2000	NC_021155	CGC	3	9	114337	114345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482907289

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