MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. U288

Total Repeats: 89429

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_021151	CGTTT	2	10	183411	183420	0 %	60 %	20 %	20 %	482902707
3502	NC_021151	T	6	6	183418	183423	0 %	100 %	0 %	0 %	482902707
3503	NC_021151	CCG	2	6	183431	183436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902707
3504	NC_021151	GGC	2	6	183450	183455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902707
3505	NC_021151	GGGGA	2	10	183463	183472	20 %	0 %	80 %	0 %	482902707
3506	NC_021151	ATG	2	6	183570	183575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902708
3507	NC_021151	CG	3	6	183592	183597	0 %	0 %	50 %	50 %	482902708
3508	NC_021151	GCG	3	9	183595	183603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902708
3509	NC_021151	GCT	2	6	183734	183739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902708
3510	NC_021151	GCG	2	6	183740	183745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902708
3511	NC_021151	GGCG	2	8	183764	183771	0 %	0 %	75 %	25 %	482902708
3512	NC_021151	TC	3	6	183775	183780	0 %	50 %	0 %	50 %	482902708
3513	NC_021151	TGT	2	6	183784	183789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482902708
3514	NC_021151	TGC	2	6	183799	183804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902708
3515	NC_021151	TGC	3	9	183832	183840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902708
3516	NC_021151	GTG	2	6	183841	183846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902708
3517	NC_021151	CTG	2	6	183861	183866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902708
3518	NC_021151	CGC	2	6	183867	183872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902708
3519	NC_021151	CGA	2	6	183877	183882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902708
3520	NC_021151	CTG	2	6	183883	183888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902708
3521	NC_021151	ATT	2	6	183915	183920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482902708
3522	NC_021151	CTG	2	6	183942	183947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902708
3523	NC_021151	GCC	2	6	183952	183957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902708
3524	NC_021151	AAG	2	6	183992	183997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482902708
3525	NC_021151	GCC	2	6	184036	184041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902708
3526	NC_021151	TGC	2	6	184072	184077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902708
3527	NC_021151	CGC	2	6	184091	184096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902708
3528	NC_021151	TGG	2	6	184103	184108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902708
3529	NC_021151	TAT	2	6	184130	184135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482902708
3530	NC_021151	TGC	2	6	184171	184176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902708
3531	NC_021151	ATT	2	6	184224	184229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482902708
3532	NC_021151	ACC	2	6	184272	184277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482902708
3533	NC_021151	ATG	2	6	184278	184283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902708
3534	NC_021151	ATC	3	9	184287	184295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902708
3535	NC_021151	TGG	2	6	184297	184302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902708
3536	NC_021151	TCG	2	6	184303	184308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902708
3537	NC_021151	TGG	2	6	184312	184317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902708
3538	NC_021151	TGA	2	6	184318	184323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902708
3539	NC_021151	TCA	2	6	184327	184332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902708
3540	NC_021151	TGC	2	6	184343	184348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902708
3541	NC_021151	AAC	2	6	184351	184356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482902708
3542	NC_021151	GGT	2	6	184362	184367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902708
3543	NC_021151	CTG	2	6	184416	184421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902708
3544	NC_021151	CGG	2	6	184446	184451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902708
3545	NC_021151	ACC	2	6	184510	184515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482902708
3546	NC_021151	TGG	2	6	184577	184582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902708
3547	NC_021151	GTC	2	6	184585	184590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902708
3548	NC_021151	CGG	2	6	184595	184600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902708
3549	NC_021151	GAGC	2	8	184670	184677	25 %	0 %	50 %	25 %	482902708
3550	NC_021151	CATC	2	8	184697	184704	25 %	25 %	0 %	50 %	482902708
3551	NC_021151	TGGC	2	8	184825	184832	0 %	25 %	50 %	25 %	482902708
3552	NC_021151	CG	3	6	184874	184879	0 %	0 %	50 %	50 %	482902708
3553	NC_021151	GCC	2	6	185059	185064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902708
3554	NC_021151	CA	3	6	185134	185139	50 %	0 %	0 %	50 %	482902708
3555	NC_021151	TCG	2	6	185558	185563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902709
3556	NC_021151	AGA	2	6	185568	185573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482902709
3557	NC_021151	TGC	2	6	185598	185603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902709
3558	NC_021151	GCT	2	6	185658	185663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902709
3559	NC_021151	GAA	3	9	185683	185691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482902709
3560	NC_021151	TCC	2	6	185721	185726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482902709
3561	NC_021151	GCT	2	6	185767	185772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902709
3562	NC_021151	ACC	2	6	185788	185793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482902709
3563	NC_021151	CTG	2	6	185827	185832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902709
3564	NC_021151	ACA	2	6	185852	185857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482902709
3565	NC_021151	TGAT	2	8	185867	185874	25 %	50 %	25 %	0 %	482902709
3566	NC_021151	TGC	2	6	185904	185909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902709
3567	NC_021151	CTG	2	6	185929	185934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902709
3568	NC_021151	ACG	2	6	185951	185956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902709
3569	NC_021151	AGA	2	6	185958	185963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482902709
3570	NC_021151	CCG	2	6	186040	186045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902709
3571	NC_021151	A	6	6	186053	186058	100 %	0 %	0 %	0 %	482902709
3572	NC_021151	TCACCG	2	12	186059	186070	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	482902709
3573	NC_021151	CGA	2	6	186099	186104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902709
3574	NC_021151	TC	4	8	186105	186112	0 %	50 %	0 %	50 %	482902709
3575	NC_021151	CAAA	2	8	186222	186229	75 %	0 %	0 %	25 %	482902709
3576	NC_021151	A	6	6	186244	186249	100 %	0 %	0 %	0 %	482902709
3577	NC_021151	GTG	2	6	186277	186282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902709
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3579	NC_021151	GCG	3	9	186365	186373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902709
3580	NC_021151	CGG	2	6	186384	186389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902709
3581	NC_021151	TCT	2	6	186404	186409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482902709
3582	NC_021151	GC	3	6	186431	186436	0 %	0 %	50 %	50 %	482902709
3583	NC_021151	GTGC	2	8	186577	186584	0 %	25 %	50 %	25 %	482902709
3584	NC_021151	GGT	2	6	186586	186591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902709
3585	NC_021151	ACC	2	6	186622	186627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482902709
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3587	NC_021151	GGTC	2	8	186726	186733	0 %	25 %	50 %	25 %	482902709
3588	NC_021151	TCCG	2	8	186755	186762	0 %	25 %	25 %	50 %	482902709
3589	NC_021151	TAC	2	6	186807	186812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902709
3590	NC_021151	CGA	2	6	186828	186833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902709
3591	NC_021151	CCG	2	6	186863	186868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902709
3592	NC_021151	CAC	2	6	186924	186929	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482902709
3593	NC_021151	CAC	2	6	186931	186936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482902709
3594	NC_021151	TC	3	6	186971	186976	0 %	50 %	0 %	50 %	482902709
3595	NC_021151	TGC	3	9	187019	187027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902709
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3598	NC_021151	TCTGG	2	10	187096	187105	0 %	40 %	40 %	20 %	482902709
3599	NC_021151	GCC	2	6	187114	187119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902709
3600	NC_021151	CTG	2	6	187246	187251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902709
3601	NC_021151	GAA	2	6	187260	187265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482902709
3602	NC_021151	TCT	2	6	187280	187285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482902709
3603	NC_021151	CCG	2	6	187358	187363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902709
3604	NC_021151	TTG	2	6	187409	187414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482902709
3605	NC_021151	CTG	2	6	187438	187443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902709
3606	NC_021151	GAT	2	6	187449	187454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902709
3607	NC_021151	CCG	2	6	187473	187478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902709
3608	NC_021151	CGT	2	6	187489	187494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902709
3609	NC_021151	TGGC	2	8	187513	187520	0 %	25 %	50 %	25 %	482902709
3610	NC_021151	GCT	2	6	187530	187535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902709
3611	NC_021151	CGG	2	6	187562	187567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902709
3612	NC_021151	GAC	2	6	187627	187632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902709
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3614	NC_021151	CGA	2	6	187668	187673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902709
3615	NC_021151	GCT	2	6	187728	187733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902709
3616	NC_021151	GCC	2	6	187776	187781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902709
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3618	NC_021151	GAA	2	6	187810	187815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482902709
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3620	NC_021151	GGT	2	6	187914	187919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902709
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3863	NC_021151	CCG	2	6	201471	201476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902722
3864	NC_021151	ATA	2	6	201498	201503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482902722
3865	NC_021151	GA	3	6	201543	201548	50 %	0 %	50 %	0 %	482902722
3866	NC_021151	AACA	2	8	201593	201600	75 %	0 %	0 %	25 %	482902722
3867	NC_021151	ATCCA	2	10	201655	201664	40 %	20 %	0 %	40 %	482902722
3868	NC_021151	TTGCGC	2	12	201680	201691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902722
3869	NC_021151	A	6	6	201701	201706	100 %	0 %	0 %	0 %	482902722
3870	NC_021151	CCA	2	6	201721	201726	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482902722
3871	NC_021151	TTG	2	6	201747	201752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482902722
3872	NC_021151	TGA	2	6	201754	201759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902722
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3874	NC_021151	A	7	7	201917	201923	100 %	0 %	0 %	0 %	482902723
3875	NC_021151	CGG	2	6	201931	201936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902723
3876	NC_021151	ACC	2	6	202022	202027	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482902723
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3881	NC_021151	CG	4	8	202283	202290	0 %	0 %	50 %	50 %	482902723
3882	NC_021151	GCC	2	6	202314	202319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902723
3883	NC_021151	TGA	2	6	202320	202325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902723
3884	NC_021151	CG	3	6	202331	202336	0 %	0 %	50 %	50 %	482902723
3885	NC_021151	CGG	2	6	202377	202382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902723
3886	NC_021151	CAC	2	6	202444	202449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482902723
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3888	NC_021151	ACC	2	6	202460	202465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482902723
3889	NC_021151	TAT	2	6	202507	202512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482902723
3890	NC_021151	TGG	2	6	202527	202532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902723
3891	NC_021151	TGG	2	6	202641	202646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902723
3892	NC_021151	GAGC	2	8	202711	202718	25 %	0 %	50 %	25 %	482902723
3893	NC_021151	TAA	2	6	202744	202749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482902723
3894	NC_021151	GAA	2	6	202763	202768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482902723
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3899	NC_021151	ATG	2	6	203011	203016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902724
3900	NC_021151	CGT	2	6	203048	203053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902724
3901	NC_021151	T	6	6	203056	203061	0 %	100 %	0 %	0 %	482902724
3902	NC_021151	CTG	2	6	203092	203097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902724
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3981	NC_021151	GTT	2	6	206864	206869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482902726
3982	NC_021151	GCTG	2	8	206926	206933	0 %	25 %	50 %	25 %	482902726
3983	NC_021151	TATTGA	2	12	207112	207123	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	482902726
3984	NC_021151	CG	3	6	207238	207243	0 %	0 %	50 %	50 %	482902726
3985	NC_021151	GT	3	6	207254	207259	0 %	50 %	50 %	0 %	482902726
3986	NC_021151	TGC	2	6	207265	207270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902726
3987	NC_021151	AC	3	6	207281	207286	50 %	0 %	0 %	50 %	482902726
3988	NC_021151	AGCGC	2	10	207287	207296	20 %	0 %	40 %	40 %	482902726
3989	NC_021151	ATAA	2	8	207298	207305	75 %	25 %	0 %	0 %	482902726
3990	NC_021151	GTTT	2	8	207365	207372	0 %	75 %	25 %	0 %	482902727
3991	NC_021151	TGA	2	6	207402	207407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902727
3992	NC_021151	GGC	3	9	207430	207438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902727
3993	NC_021151	ATA	2	6	207529	207534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482902727
3994	NC_021151	TTC	2	6	207545	207550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482902727
3995	NC_021151	GT	3	6	207669	207674	0 %	50 %	50 %	0 %	482902727
3996	NC_021151	TGC	2	6	207693	207698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902727
3997	NC_021151	CCAG	2	8	207717	207724	25 %	0 %	25 %	50 %	482902727
3998	NC_021151	GCC	2	6	207754	207759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902727
3999	NC_021151	GTA	2	6	207774	207779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902727
4000	NC_021151	GCG	2	6	207810	207815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902727

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