MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. U288

Total Repeats: 89429

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_021151	TGA	2	6	157000	157005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902683
3002	NC_021151	A	6	6	157019	157024	100 %	0 %	0 %	0 %	482902683
3003	NC_021151	CGAT	2	8	157134	157141	25 %	25 %	25 %	25 %	482902683
3004	NC_021151	CAG	2	6	157144	157149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902683
3005	NC_021151	GGC	2	6	157265	157270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902683
3006	NC_021151	GTT	2	6	157289	157294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482902683
3007	NC_021151	TTCG	2	8	157343	157350	0 %	50 %	25 %	25 %	482902683
3008	NC_021151	TG	3	6	157386	157391	0 %	50 %	50 %	0 %	482902683
3009	NC_021151	ATT	2	6	157400	157405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482902683
3010	NC_021151	AAT	2	6	157442	157447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482902683
3011	NC_021151	GAC	2	6	157505	157510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902683
3012	NC_021151	TTA	2	6	157896	157901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482902684
3013	NC_021151	CGC	2	6	157943	157948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902684
3014	NC_021151	GAC	2	6	157970	157975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902684
3015	NC_021151	CGT	2	6	158034	158039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902684
3016	NC_021151	CTTT	2	8	158097	158104	0 %	75 %	0 %	25 %	482902684
3017	NC_021151	CAT	2	6	158160	158165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902684
3018	NC_021151	AGG	2	6	158203	158208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482902684
3019	NC_021151	CGC	2	6	158212	158217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902684
3020	NC_021151	TCG	2	6	158228	158233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902684
3021	NC_021151	TAT	2	6	158391	158396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482902685
3022	NC_021151	ATT	2	6	158406	158411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482902685
3023	NC_021151	CGT	2	6	158449	158454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902685
3024	NC_021151	TTA	2	6	158474	158479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482902685
3025	NC_021151	AG	3	6	158574	158579	50 %	0 %	50 %	0 %	482902685
3026	NC_021151	GGT	2	6	158601	158606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902685
3027	NC_021151	GGT	2	6	158662	158667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902685
3028	NC_021151	AAC	2	6	158818	158823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482902685
3029	NC_021151	GCCA	2	8	158883	158890	25 %	0 %	25 %	50 %	482902685
3030	NC_021151	AAC	2	6	158929	158934	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482902685
3031	NC_021151	ACA	2	6	158960	158965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482902685
3032	NC_021151	TGG	2	6	159014	159019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902685
3033	NC_021151	CGC	2	6	159056	159061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902685
3034	NC_021151	CCGGC	2	10	159071	159080	0 %	0 %	40 %	60 %	482902685
3035	NC_021151	A	6	6	159103	159108	100 %	0 %	0 %	0 %	482902685
3036	NC_021151	AGA	2	6	159147	159152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482902685
3037	NC_021151	TGA	2	6	159189	159194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902685
3038	NC_021151	GC	3	6	159199	159204	0 %	0 %	50 %	50 %	482902685
3039	NC_021151	AAG	2	6	159257	159262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482902685
3040	NC_021151	CCG	2	6	159326	159331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902685
3041	NC_021151	GC	4	8	159336	159343	0 %	0 %	50 %	50 %	482902685
3042	NC_021151	TCA	2	6	159392	159397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902685
3043	NC_021151	TTG	2	6	159398	159403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482902685
3044	NC_021151	AAG	2	6	159473	159478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482902685
3045	NC_021151	ACT	2	6	159530	159535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902685
3046	NC_021151	CGG	2	6	159572	159577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902685
3047	NC_021151	CTAT	2	8	159602	159609	25 %	50 %	0 %	25 %	482902685
3048	NC_021151	CGT	2	6	159621	159626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902685
3049	NC_021151	GAT	2	6	159645	159650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902685
3050	NC_021151	A	6	6	159692	159697	100 %	0 %	0 %	0 %	482902685
3051	NC_021151	AG	3	6	159793	159798	50 %	0 %	50 %	0 %	482902685
3052	NC_021151	GCG	2	6	159886	159891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902685
3053	NC_021151	CGC	2	6	159963	159968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902685
3054	NC_021151	GAA	2	6	159985	159990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482902685
3055	NC_021151	CGG	2	6	160047	160052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902685
3056	NC_021151	CCG	2	6	160086	160091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902685
3057	NC_021151	TTC	2	6	160140	160145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482902685
3058	NC_021151	ATG	2	6	160210	160215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902685
3059	NC_021151	CTG	2	6	160327	160332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902685
3060	NC_021151	ATG	3	9	160337	160345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902685
3061	NC_021151	CTG	2	6	160390	160395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902685
3062	NC_021151	CCG	2	6	160471	160476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902685
3063	NC_021151	GAG	2	6	160588	160593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482902685
3064	NC_021151	AGA	2	6	160644	160649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482902685
3065	NC_021151	GGT	2	6	160650	160655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902685
3066	NC_021151	ATG	2	6	160666	160671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902685
3067	NC_021151	TGC	2	6	160694	160699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902685
3068	NC_021151	GGC	2	6	160731	160736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902685
3069	NC_021151	CGC	2	6	160827	160832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902685
3070	NC_021151	GCA	2	6	160956	160961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902685
3071	NC_021151	GCC	2	6	160984	160989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902685
3072	NC_021151	GCC	2	6	161005	161010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902685
3073	NC_021151	CCTTGC	2	12	161044	161055	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	482902685
3074	NC_021151	A	6	6	161255	161260	100 %	0 %	0 %	0 %	482902686
3075	NC_021151	ACG	2	6	161295	161300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902686
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3077	NC_021151	CGC	2	6	161320	161325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902686
3078	NC_021151	CGG	2	6	161359	161364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902686
3079	NC_021151	AAG	2	6	161541	161546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482902686
3080	NC_021151	CCG	2	6	161597	161602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902686
3081	NC_021151	ATT	2	6	161615	161620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482902686
3082	NC_021151	TTA	2	6	161678	161683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482902687
3083	NC_021151	GCCG	2	8	161723	161730	0 %	0 %	50 %	50 %	482902687
3084	NC_021151	CGT	2	6	161734	161739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902687
3085	NC_021151	TAT	2	6	161871	161876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482902688
3086	NC_021151	CG	3	6	161883	161888	0 %	0 %	50 %	50 %	482902688
3087	NC_021151	TATT	2	8	161911	161918	25 %	75 %	0 %	0 %	482902688
3088	NC_021151	ATT	2	6	161920	161925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482902688
3089	NC_021151	GTC	2	6	161987	161992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902689
3090	NC_021151	CGC	2	6	162007	162012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902689
3091	NC_021151	CGG	2	6	162034	162039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902689
3092	NC_021151	C	6	6	162103	162108	0 %	0 %	0 %	100 %	482902689
3093	NC_021151	GAC	2	6	162110	162115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902689
3094	NC_021151	ACG	2	6	162141	162146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902689
3095	NC_021151	GCA	2	6	162310	162315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902690
3096	NC_021151	CGT	2	6	162322	162327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902690
3097	NC_021151	GATCA	2	10	162389	162398	40 %	20 %	20 %	20 %	482902690
3098	NC_021151	TGT	2	6	162474	162479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482902690
3099	NC_021151	GCC	2	6	162524	162529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902690
3100	NC_021151	GCT	2	6	162580	162585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902690
3101	NC_021151	CCG	2	6	162619	162624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902690
3102	NC_021151	CTG	2	6	162632	162637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902690
3103	NC_021151	GCT	2	6	162700	162705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902690
3104	NC_021151	CAG	2	6	162722	162727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902690
3105	NC_021151	A	6	6	162783	162788	100 %	0 %	0 %	0 %	482902690
3106	NC_021151	TCT	2	6	162871	162876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482902690
3107	NC_021151	TTA	2	6	163007	163012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482902691
3108	NC_021151	GC	3	6	163039	163044	0 %	0 %	50 %	50 %	482902691
3109	NC_021151	CG	3	6	163086	163091	0 %	0 %	50 %	50 %	482902691
3110	NC_021151	CAT	2	6	163095	163100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902691
3111	NC_021151	CGTCA	2	10	163135	163144	20 %	20 %	20 %	40 %	482902691
3112	NC_021151	ACC	2	6	163145	163150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482902691
3113	NC_021151	CAG	2	6	163189	163194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902691
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3115	NC_021151	CTG	2	6	163252	163257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902691
3116	NC_021151	TTC	2	6	163294	163299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482902691
3117	NC_021151	A	6	6	163308	163313	100 %	0 %	0 %	0 %	482902691
3118	NC_021151	CGG	2	6	163350	163355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902691
3119	NC_021151	GGGC	2	8	163395	163402	0 %	0 %	75 %	25 %	482902691
3120	NC_021151	GC	3	6	163423	163428	0 %	0 %	50 %	50 %	482902691
3121	NC_021151	ATA	2	6	163430	163435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482902691
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3127	NC_021151	TCG	2	6	164180	164185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902692
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3134	NC_021151	CGG	2	6	164511	164516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902692
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3234	NC_021151	CTGGA	2	10	170205	170214	20 %	20 %	40 %	20 %	482902698
3235	NC_021151	GGCG	2	8	170228	170235	0 %	0 %	75 %	25 %	482902698
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3241	NC_021151	GGC	2	6	170582	170587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902699
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3243	NC_021151	TGG	2	6	170775	170780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902699
3244	NC_021151	CG	3	6	170820	170825	0 %	0 %	50 %	50 %	482902699
3245	NC_021151	TCG	2	6	170828	170833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902699
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3348	NC_021151	CG	3	6	176396	176401	0 %	0 %	50 %	50 %	482902703
3349	NC_021151	GTC	2	6	176412	176417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902703
3350	NC_021151	CT	3	6	176468	176473	0 %	50 %	0 %	50 %	482902703
3351	NC_021151	AAAC	2	8	176609	176616	75 %	0 %	0 %	25 %	482902703
3352	NC_021151	CGGCGA	2	12	176632	176643	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	482902703
3353	NC_021151	GATG	2	8	176644	176651	25 %	25 %	50 %	0 %	482902703
3354	NC_021151	GCTG	2	8	176801	176808	0 %	25 %	50 %	25 %	482902703
3355	NC_021151	CTG	2	6	176849	176854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902703
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3358	NC_021151	CTT	2	6	176956	176961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482902703
3359	NC_021151	TGG	2	6	176988	176993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902703
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3362	NC_021151	TGC	2	6	177058	177063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902703
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3364	NC_021151	GAA	2	6	177175	177180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482902703
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3483	NC_021151	GCA	2	6	182625	182630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902706
3484	NC_021151	TGA	2	6	182638	182643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902706
3485	NC_021151	CAA	2	6	182659	182664	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482902706
3486	NC_021151	GCC	2	6	182665	182670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902706
3487	NC_021151	TCA	2	6	182867	182872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902707
3488	NC_021151	GGCCA	2	10	182896	182905	20 %	0 %	40 %	40 %	482902707
3489	NC_021151	GCGCC	2	10	182909	182918	0 %	0 %	40 %	60 %	482902707
3490	NC_021151	CGT	2	6	182924	182929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902707
3491	NC_021151	ATA	2	6	182938	182943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482902707
3492	NC_021151	TTGG	2	8	183025	183032	0 %	50 %	50 %	0 %	482902707
3493	NC_021151	GTAA	2	8	183095	183102	50 %	25 %	25 %	0 %	482902707
3494	NC_021151	CTG	2	6	183108	183113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902707
3495	NC_021151	GCAT	2	8	183127	183134	25 %	25 %	25 %	25 %	482902707
3496	NC_021151	GCC	2	6	183196	183201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902707
3497	NC_021151	GCC	2	6	183216	183221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902707
3498	NC_021151	TCT	2	6	183256	183261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482902707
3499	NC_021151	CGG	2	6	183363	183368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902707
3500	NC_021151	GCC	2	6	183377	183382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902707

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