MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. U288

Total Repeats: 89429

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_021151	CAG	2	6	130705	130710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902660
2502	NC_021151	CGTTT	2	10	130714	130723	0 %	60 %	20 %	20 %	482902660
2503	NC_021151	AAT	2	6	130751	130756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482902660
2504	NC_021151	ATA	2	6	130810	130815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482902661
2505	NC_021151	ACTG	2	8	130833	130840	25 %	25 %	25 %	25 %	482902661
2506	NC_021151	GCA	3	9	130946	130954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902661
2507	NC_021151	GCC	2	6	131019	131024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902661
2508	NC_021151	TCG	2	6	131107	131112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902661
2509	NC_021151	CAG	2	6	131142	131147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902661
2510	NC_021151	TGG	2	6	131183	131188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902661
2511	NC_021151	CAT	2	6	131240	131245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902661
2512	NC_021151	CGG	2	6	131311	131316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902661
2513	NC_021151	CCG	2	6	131446	131451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902661
2514	NC_021151	CGCA	2	8	131461	131468	25 %	0 %	25 %	50 %	482902661
2515	NC_021151	GCG	2	6	131488	131493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902661
2516	NC_021151	GC	3	6	131500	131505	0 %	0 %	50 %	50 %	482902661
2517	NC_021151	AAT	2	6	131560	131565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482902661
2518	NC_021151	GCA	2	6	131585	131590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902661
2519	NC_021151	GGCT	2	8	131605	131612	0 %	25 %	50 %	25 %	482902661
2520	NC_021151	GCC	2	6	131640	131645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902661
2521	NC_021151	CCG	2	6	131734	131739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902661
2522	NC_021151	TGG	2	6	131753	131758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902661
2523	NC_021151	TTC	2	6	131863	131868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482902661
2524	NC_021151	TTG	2	6	131886	131891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482902662
2525	NC_021151	CGG	2	6	131935	131940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902662
2526	NC_021151	GGA	2	6	131981	131986	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482902662
2527	NC_021151	CGA	2	6	131989	131994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902662
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2529	NC_021151	ATG	2	6	132032	132037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902662
2530	NC_021151	ACG	2	6	132042	132047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902662
2531	NC_021151	CGT	2	6	132115	132120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902662
2532	NC_021151	GACCG	2	10	132158	132167	20 %	0 %	40 %	40 %	482902662
2533	NC_021151	CGC	2	6	132176	132181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902662
2534	NC_021151	CAC	2	6	132199	132204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482902662
2535	NC_021151	TTC	2	6	132284	132289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482902662
2536	NC_021151	TAA	2	6	132301	132306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482902662
2537	NC_021151	T	6	6	132344	132349	0 %	100 %	0 %	0 %	482902662
2538	NC_021151	CGT	2	6	132370	132375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902662
2539	NC_021151	GGT	2	6	132379	132384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902662
2540	NC_021151	TGT	2	6	132388	132393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482902662
2541	NC_021151	CGG	2	6	132436	132441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902662
2542	NC_021151	TGG	2	6	132543	132548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902662
2543	NC_021151	TTG	2	6	132591	132596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482902662
2544	NC_021151	CTGG	2	8	132632	132639	0 %	25 %	50 %	25 %	482902662
2545	NC_021151	GTG	2	6	132653	132658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902662
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2547	NC_021151	ATG	2	6	132681	132686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902662
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2549	NC_021151	CG	3	6	132777	132782	0 %	0 %	50 %	50 %	482902662
2550	NC_021151	GCC	2	6	132795	132800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902662
2551	NC_021151	TCG	2	6	132828	132833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902662
2552	NC_021151	GAT	2	6	132848	132853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902662
2553	NC_021151	CCA	2	6	132979	132984	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482902662
2554	NC_021151	CG	3	6	132985	132990	0 %	0 %	50 %	50 %	482902662
2555	NC_021151	TCA	2	6	133041	133046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902662
2556	NC_021151	CG	3	6	133079	133084	0 %	0 %	50 %	50 %	482902662
2557	NC_021151	TGC	2	6	133105	133110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902662
2558	NC_021151	TGG	2	6	133117	133122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902662
2559	NC_021151	AAT	2	6	133424	133429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482902662
2560	NC_021151	ATG	2	6	133443	133448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902662
2561	NC_021151	GCC	2	6	133544	133549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902663
2562	NC_021151	AGT	3	9	133581	133589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902663
2563	NC_021151	ACGA	2	8	133601	133608	50 %	0 %	25 %	25 %	482902663
2564	NC_021151	CG	3	6	134393	134398	0 %	0 %	50 %	50 %	482902664
2565	NC_021151	CAG	2	6	134598	134603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902664
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2568	NC_021151	CGT	2	6	134714	134719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902664
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2572	NC_021151	AAC	2	6	134900	134905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482902664
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2574	NC_021151	GCTG	2	8	135056	135063	0 %	25 %	50 %	25 %	482902664
2575	NC_021151	ATGG	2	8	135180	135187	25 %	25 %	50 %	0 %	482902664
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2581	NC_021151	ATTG	2	8	135858	135865	25 %	50 %	25 %	0 %	482902665
2582	NC_021151	ATG	2	6	135869	135874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902665
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2588	NC_021151	A	6	6	136158	136163	100 %	0 %	0 %	0 %	482902665
2589	NC_021151	GGT	2	6	136167	136172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902665
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2595	NC_021151	GGT	2	6	136497	136502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902665
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2599	NC_021151	AG	3	6	136602	136607	50 %	0 %	50 %	0 %	482902665
2600	NC_021151	GC	3	6	136611	136616	0 %	0 %	50 %	50 %	482902665
2601	NC_021151	GAAAGC	2	12	136642	136653	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	482902665
2602	NC_021151	ACA	2	6	136728	136733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482902665
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2604	NC_021151	CGG	2	6	136791	136796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902665
2605	NC_021151	GAAA	2	8	136854	136861	75 %	0 %	25 %	0 %	482902665
2606	NC_021151	TGG	2	6	136862	136867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902665
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2608	NC_021151	TAA	2	6	137148	137153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482902665
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2611	NC_021151	ATA	2	6	137350	137355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482902666
2612	NC_021151	TGC	2	6	137476	137481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902666
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2618	NC_021151	AAAGC	2	10	138112	138121	60 %	0 %	20 %	20 %	482902667
2619	NC_021151	CTG	2	6	138322	138327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902667
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2621	NC_021151	TCG	2	6	138473	138478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902667
2622	NC_021151	CG	3	6	138487	138492	0 %	0 %	50 %	50 %	482902667
2623	NC_021151	GAT	2	6	138535	138540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902667
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2626	NC_021151	CCGCA	2	10	138645	138654	20 %	0 %	20 %	60 %	482902667
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2744	NC_021151	CGT	2	6	144561	144566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902672
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2862	NC_021151	TGGC	2	8	150068	150075	0 %	25 %	50 %	25 %	482902677
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2984	NC_021151	GC	4	8	156155	156162	0 %	0 %	50 %	50 %	482902682
2985	NC_021151	ACG	2	6	156296	156301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902682
2986	NC_021151	GTT	2	6	156316	156321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482902682
2987	NC_021151	GCA	2	6	156381	156386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902682
2988	NC_021151	CAG	2	6	156406	156411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902682
2989	NC_021151	A	6	6	156440	156445	100 %	0 %	0 %	0 %	482902682
2990	NC_021151	GGC	2	6	156480	156485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902682
2991	NC_021151	AAGC	2	8	156526	156533	50 %	0 %	25 %	25 %	482902682
2992	NC_021151	GAT	2	6	156640	156645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902683
2993	NC_021151	CAAA	2	8	156646	156653	75 %	0 %	0 %	25 %	482902683
2994	NC_021151	AC	3	6	156694	156699	50 %	0 %	0 %	50 %	482902683
2995	NC_021151	A	6	6	156704	156709	100 %	0 %	0 %	0 %	482902683
2996	NC_021151	TCG	2	6	156757	156762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902683
2997	NC_021151	ATG	2	6	156849	156854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902683
2998	NC_021151	TGC	2	6	156883	156888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902683
2999	NC_021151	ATGG	2	8	156950	156957	25 %	25 %	50 %	0 %	482902683
3000	NC_021151	CTG	2	6	156980	156985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902683

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