MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. U288

Total Repeats: 89429

< Previous12345678910111213...178179Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_021151	TTC	2	6	105455	105460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482902641
2003	NC_021151	GTT	2	6	105638	105643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482902642
2004	NC_021151	AGC	2	6	105695	105700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902642
2005	NC_021151	AGT	2	6	105758	105763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902642
2006	NC_021151	TGAT	2	8	105820	105827	25 %	50 %	25 %	0 %	482902642
2007	NC_021151	AAT	2	6	105854	105859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482902642
2008	NC_021151	AT	3	6	105880	105885	50 %	50 %	0 %	0 %	482902642
2009	NC_021151	GCT	4	12	105948	105959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902642
2010	NC_021151	GTC	2	6	106068	106073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902642
2011	NC_021151	TGT	2	6	106088	106093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482902642
2012	NC_021151	TAG	2	6	106120	106125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902642
2013	NC_021151	CGG	2	6	106157	106162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902642
2014	NC_021151	CAT	3	9	106163	106171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902642
2015	NC_021151	GCA	2	6	106271	106276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902642
2016	NC_021151	AAG	2	6	106277	106282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482902642
2017	NC_021151	GCTTC	2	10	106520	106529	0 %	40 %	20 %	40 %	482902642
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2019	NC_021151	GCT	2	6	106716	106721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902642
2020	NC_021151	TGCGT	2	10	106807	106816	0 %	40 %	40 %	20 %	482902642
2021	NC_021151	TACT	2	8	106837	106844	25 %	50 %	0 %	25 %	482902642
2022	NC_021151	TGC	2	6	106927	106932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902642
2023	NC_021151	GCCT	2	8	107028	107035	0 %	25 %	25 %	50 %	482902642
2024	NC_021151	ATA	2	6	107065	107070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482902642
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2030	NC_021151	CGC	2	6	107402	107407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902642
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2036	NC_021151	TGA	2	6	107815	107820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902642
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2040	NC_021151	TGA	2	6	108170	108175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902643
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2044	NC_021151	CCA	2	6	108296	108301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482902643
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2046	NC_021151	TGATC	2	10	108507	108516	20 %	40 %	20 %	20 %	482902643
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2052	NC_021151	CGG	3	9	108696	108704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902643
2053	NC_021151	GCA	2	6	108708	108713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902643
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2055	NC_021151	ACC	2	6	108781	108786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482902643
2056	NC_021151	TGA	2	6	108809	108814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902643
2057	NC_021151	CAT	2	6	108820	108825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902643
2058	NC_021151	TGG	2	6	108836	108841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902643
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2063	NC_021151	TAT	2	6	109252	109257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482902644
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2069	NC_021151	CG	3	6	109399	109404	0 %	0 %	50 %	50 %	482902644
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2092	NC_021151	CGA	2	6	110436	110441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902645
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2105	NC_021151	CGG	2	6	111018	111023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902645
2106	NC_021151	TTCGCG	2	12	111034	111045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902645
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2118	NC_021151	TGGCG	2	10	111667	111676	0 %	20 %	60 %	20 %	482902645
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2120	NC_021151	AT	3	6	111725	111730	50 %	50 %	0 %	0 %	482902645
2121	NC_021151	GAT	2	6	111762	111767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902645
2122	NC_021151	TCG	2	6	111773	111778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902645
2123	NC_021151	ACC	2	6	111779	111784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482902645
2124	NC_021151	GCT	2	6	111822	111827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902645
2125	NC_021151	CGG	2	6	111833	111838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902645
2126	NC_021151	GTT	2	6	111864	111869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482902645
2127	NC_021151	CGT	2	6	111891	111896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902645
2128	NC_021151	GCA	2	6	111954	111959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902645
2129	NC_021151	GAT	2	6	111997	112002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902645
2130	NC_021151	CCG	2	6	112014	112019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902645
2131	NC_021151	ATA	2	6	112026	112031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482902645
2132	NC_021151	ATC	2	6	112046	112051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902645
2133	NC_021151	CAG	2	6	112090	112095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902645
2134	NC_021151	CG	3	6	112098	112103	0 %	0 %	50 %	50 %	482902645
2135	NC_021151	CGA	2	6	112112	112117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902645
2136	NC_021151	CAT	2	6	112122	112127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902645
2137	NC_021151	GCTC	2	8	112200	112207	0 %	25 %	25 %	50 %	482902645
2138	NC_021151	AGCGC	2	10	112227	112236	20 %	0 %	40 %	40 %	482902645
2139	NC_021151	TCGA	2	8	112249	112256	25 %	25 %	25 %	25 %	482902645
2140	NC_021151	TCT	2	6	112385	112390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482902645
2141	NC_021151	GC	3	6	112480	112485	0 %	0 %	50 %	50 %	482902645
2142	NC_021151	CATC	2	8	112536	112543	25 %	25 %	0 %	50 %	482902645
2143	NC_021151	CAA	2	6	112545	112550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482902645
2144	NC_021151	AGT	2	6	112813	112818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902646
2145	NC_021151	GAA	2	6	112844	112849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482902646
2146	NC_021151	TTCC	2	8	112850	112857	0 %	50 %	0 %	50 %	482902646
2147	NC_021151	GCG	2	6	112901	112906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902646
2148	NC_021151	CTG	2	6	112908	112913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902646
2149	NC_021151	GAC	2	6	112985	112990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902646
2150	NC_021151	GCG	2	6	113023	113028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902646
2151	NC_021151	GCG	2	6	113036	113041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902646
2152	NC_021151	ACGTT	2	10	113044	113053	20 %	40 %	20 %	20 %	482902646
2153	NC_021151	CGCC	2	8	113111	113118	0 %	0 %	25 %	75 %	482902646
2154	NC_021151	GCG	2	6	113210	113215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902646
2155	NC_021151	GCTG	2	8	113258	113265	0 %	25 %	50 %	25 %	482902646
2156	NC_021151	T	6	6	113295	113300	0 %	100 %	0 %	0 %	482902646
2157	NC_021151	CCGCG	2	10	113312	113321	0 %	0 %	40 %	60 %	482902646
2158	NC_021151	CTCCAG	2	12	113361	113372	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	482902646
2159	NC_021151	TGT	2	6	113392	113397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482902646
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2162	NC_021151	GC	4	8	113471	113478	0 %	0 %	50 %	50 %	482902646
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2168	NC_021151	GCC	2	6	113934	113939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902646
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2193	NC_021151	CCTG	2	8	115126	115133	0 %	25 %	25 %	50 %	482902646
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2206	NC_021151	CTGA	2	8	115705	115712	25 %	25 %	25 %	25 %	482902647
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2214	NC_021151	A	6	6	116710	116715	100 %	0 %	0 %	0 %	482902648
2215	NC_021151	ATT	2	6	116732	116737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482902648
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2230	NC_021151	CAA	2	6	117192	117197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482902649
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2232	NC_021151	GT	3	6	117356	117361	0 %	50 %	50 %	0 %	482902649
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2235	NC_021151	GAC	2	6	117419	117424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902649
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2237	NC_021151	CGC	2	6	117531	117536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902649
2238	NC_021151	TCT	2	6	117632	117637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482902649
2239	NC_021151	CAGCG	2	10	117814	117823	20 %	0 %	40 %	40 %	482902650
2240	NC_021151	ATCA	2	8	117855	117862	50 %	25 %	0 %	25 %	482902650
2241	NC_021151	GC	3	6	117941	117946	0 %	0 %	50 %	50 %	482902650
2242	NC_021151	GCCA	2	8	117948	117955	25 %	0 %	25 %	50 %	482902650
2243	NC_021151	GCG	2	6	118037	118042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902650
2244	NC_021151	CAG	2	6	118068	118073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902650
2245	NC_021151	CGA	2	6	118106	118111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902650
2246	NC_021151	GCCGG	2	10	118114	118123	0 %	0 %	60 %	40 %	482902650
2247	NC_021151	GCC	2	6	118161	118166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902650
2248	NC_021151	GGAC	2	8	118215	118222	25 %	0 %	50 %	25 %	482902650
2249	NC_021151	AC	3	6	118221	118226	50 %	0 %	0 %	50 %	482902650
2250	NC_021151	CGAGC	2	10	118239	118248	20 %	0 %	40 %	40 %	482902650
2251	NC_021151	TCC	2	6	118285	118290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482902650
2252	NC_021151	GCC	2	6	118302	118307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902650
2253	NC_021151	GCG	2	6	118348	118353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902650
2254	NC_021151	TGC	2	6	118390	118395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902650
2255	NC_021151	GTA	2	6	118453	118458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902650
2256	NC_021151	GCC	2	6	118473	118478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902650
2257	NC_021151	CGC	2	6	118515	118520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902650
2258	NC_021151	GGCG	2	8	118560	118567	0 %	0 %	75 %	25 %	482902650
2259	NC_021151	GCT	2	6	118578	118583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902650
2260	NC_021151	TCGCCG	2	12	118612	118623	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	482902650
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2262	NC_021151	ATTTG	2	10	118682	118691	20 %	60 %	20 %	0 %	482902650
2263	NC_021151	GTCA	2	8	118710	118717	25 %	25 %	25 %	25 %	482902650
2264	NC_021151	GAC	2	6	118845	118850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902650
2265	NC_021151	TGC	2	6	118855	118860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902650
2266	NC_021151	CG	3	6	118870	118875	0 %	0 %	50 %	50 %	482902650
2267	NC_021151	CCG	2	6	118897	118902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902650
2268	NC_021151	GGTTCA	2	12	118913	118924	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	482902650
2269	NC_021151	GCG	2	6	118957	118962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902650
2270	NC_021151	AGT	2	6	118984	118989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902650
2271	NC_021151	ACC	2	6	119053	119058	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482902650
2272	NC_021151	GCTG	2	8	119237	119244	0 %	25 %	50 %	25 %	482902650
2273	NC_021151	TGT	2	6	119360	119365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482902651
2274	NC_021151	CTG	2	6	119383	119388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902651
2275	NC_021151	GCG	2	6	119392	119397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902651
2276	NC_021151	GGC	2	6	119476	119481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902651
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2278	NC_021151	GCG	2	6	119525	119530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902651
2279	NC_021151	CGA	2	6	119556	119561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902651
2280	NC_021151	GCA	2	6	119587	119592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902651
2281	NC_021151	GCC	2	6	119626	119631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902651
2282	NC_021151	GC	5	10	119687	119696	0 %	0 %	50 %	50 %	482902651
2283	NC_021151	GCG	2	6	119800	119805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902651
2284	NC_021151	CAC	2	6	119824	119829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482902651
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2286	NC_021151	CTGG	2	8	119893	119900	0 %	25 %	50 %	25 %	482902651
2287	NC_021151	TGC	2	6	119927	119932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902651
2288	NC_021151	CAC	2	6	120031	120036	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482902651
2289	NC_021151	CGC	2	6	120192	120197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902651
2290	NC_021151	CGG	2	6	120270	120275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902651
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2302	NC_021151	GCG	2	6	120782	120787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902651
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2310	NC_021151	CAATTG	2	12	120990	121001	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	482902651
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2312	NC_021151	ATCG	2	8	121451	121458	25 %	25 %	25 %	25 %	482902652
2313	NC_021151	AT	3	6	121477	121482	50 %	50 %	0 %	0 %	482902652
2314	NC_021151	TAA	3	9	121516	121524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482902652
2315	NC_021151	TGTC	2	8	121537	121544	0 %	50 %	25 %	25 %	482902652
2316	NC_021151	AT	3	6	121554	121559	50 %	50 %	0 %	0 %	482902652
2317	NC_021151	CCG	2	6	121568	121573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902652
2318	NC_021151	TCA	2	6	121582	121587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902652
2319	NC_021151	GC	3	6	121718	121723	0 %	0 %	50 %	50 %	482902652
2320	NC_021151	ATC	2	6	121754	121759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902652
2321	NC_021151	CTG	2	6	121808	121813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902652
2322	NC_021151	GTT	2	6	121819	121824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482902652
2323	NC_021151	TAAT	2	8	121842	121849	50 %	50 %	0 %	0 %	482902652
2324	NC_021151	CCG	2	6	121862	121867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902652
2325	NC_021151	TGCC	2	8	121888	121895	0 %	25 %	25 %	50 %	482902652
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2328	NC_021151	CTG	2	6	122319	122324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902653
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2331	NC_021151	GCG	2	6	122461	122466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902653
2332	NC_021151	CTGG	2	8	122486	122493	0 %	25 %	50 %	25 %	482902653
2333	NC_021151	TAT	2	6	122498	122503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482902653
2334	NC_021151	CTGG	2	8	122534	122541	0 %	25 %	50 %	25 %	482902653
2335	NC_021151	GCT	2	6	122597	122602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902653
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2340	NC_021151	GCT	3	9	122846	122854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902653
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2342	NC_021151	GGCT	2	8	122883	122890	0 %	25 %	50 %	25 %	482902653
2343	NC_021151	GGC	2	6	122896	122901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902653
2344	NC_021151	TGG	2	6	123007	123012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902653
2345	NC_021151	TA	3	6	123040	123045	50 %	50 %	0 %	0 %	482902653
2346	NC_021151	TAG	2	6	123170	123175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902654
2347	NC_021151	TTGCC	2	10	123186	123195	0 %	40 %	20 %	40 %	482902654
2348	NC_021151	ACG	2	6	123216	123221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902654
2349	NC_021151	CGC	2	6	123242	123247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902654
2350	NC_021151	TCGC	2	8	123287	123294	0 %	25 %	25 %	50 %	482902654
2351	NC_021151	CAG	3	9	123365	123373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902654
2352	NC_021151	GC	3	6	123398	123403	0 %	0 %	50 %	50 %	482902654
2353	NC_021151	GCC	2	6	123425	123430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902654
2354	NC_021151	TCA	2	6	123454	123459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902654
2355	NC_021151	GCTG	2	8	123505	123512	0 %	25 %	50 %	25 %	482902654
2356	NC_021151	TGC	2	6	123555	123560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902654
2357	NC_021151	ATT	2	6	123581	123586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482902654
2358	NC_021151	GCG	2	6	123622	123627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902654
2359	NC_021151	TCG	2	6	123639	123644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902654
2360	NC_021151	CAA	2	6	123698	123703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482902654
2361	NC_021151	CGC	2	6	123718	123723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902654
2362	NC_021151	CGC	2	6	123748	123753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902654
2363	NC_021151	ATG	2	6	123785	123790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902654
2364	NC_021151	ATCA	2	8	123806	123813	50 %	25 %	0 %	25 %	482902654
2365	NC_021151	AGCAG	2	10	123863	123872	40 %	0 %	40 %	20 %	482902655
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2485	NC_021151	CG	3	6	129709	129714	0 %	0 %	50 %	50 %	482902660
2486	NC_021151	GC	3	6	129830	129835	0 %	0 %	50 %	50 %	482902660
2487	NC_021151	AGG	2	6	129852	129857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482902660
2488	NC_021151	GAT	2	6	129868	129873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902660
2489	NC_021151	GCG	2	6	129921	129926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902660
2490	NC_021151	TCT	2	6	129932	129937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482902660
2491	NC_021151	CGA	2	6	129948	129953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902660
2492	NC_021151	GC	3	6	130149	130154	0 %	0 %	50 %	50 %	482902660
2493	NC_021151	CGC	2	6	130164	130169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902660
2494	NC_021151	GCC	2	6	130192	130197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902660
2495	NC_021151	GAT	2	6	130216	130221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902660
2496	NC_021151	CGGCG	2	10	130252	130261	0 %	0 %	60 %	40 %	482902660
2497	NC_021151	TGCCGA	2	12	130344	130355	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	482902660
2498	NC_021151	GTGG	2	8	130378	130385	0 %	25 %	75 %	0 %	482902660
2499	NC_021151	CGC	2	6	130398	130403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902660
2500	NC_021151	GC	4	8	130641	130648	0 %	0 %	50 %	50 %	482902660

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