MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. U288

Total Repeats: 89429

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_021151	TCGG	2	8	77890	77897	0 %	25 %	50 %	25 %	482902616
1502	NC_021151	CGCA	2	8	77917	77924	25 %	0 %	25 %	50 %	482902616
1503	NC_021151	CGA	2	6	77997	78002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902616
1504	NC_021151	CCG	2	6	78024	78029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902616
1505	NC_021151	GGCG	2	8	78267	78274	0 %	0 %	75 %	25 %	482902616
1506	NC_021151	GCG	2	6	78349	78354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902616
1507	NC_021151	GCGAA	2	10	78404	78413	40 %	0 %	40 %	20 %	482902616
1508	NC_021151	CGG	3	9	78447	78455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902616
1509	NC_021151	ACT	2	6	78488	78493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902616
1510	NC_021151	CGG	2	6	78678	78683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902616
1511	NC_021151	CGC	2	6	78689	78694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902616
1512	NC_021151	GC	5	10	78703	78712	0 %	0 %	50 %	50 %	482902616
1513	NC_021151	CG	3	6	78763	78768	0 %	0 %	50 %	50 %	482902616
1514	NC_021151	CTGAAG	2	12	78805	78816	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	482902616
1515	NC_021151	TGG	2	6	78887	78892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902616
1516	NC_021151	CTT	2	6	78899	78904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482902616
1517	NC_021151	CGG	2	6	78971	78976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902616
1518	NC_021151	TGC	2	6	79001	79006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902616
1519	NC_021151	TGA	2	6	79020	79025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902616
1520	NC_021151	GTGGAC	2	12	79036	79047	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	482902616
1521	NC_021151	GGC	2	6	79078	79083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902616
1522	NC_021151	GGCG	2	8	79104	79111	0 %	0 %	75 %	25 %	482902616
1523	NC_021151	CAG	2	6	79183	79188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902616
1524	NC_021151	TGA	2	6	79226	79231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902616
1525	NC_021151	GCG	2	6	79288	79293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902616
1526	NC_021151	CGTAC	2	10	79294	79303	20 %	20 %	20 %	40 %	482902616
1527	NC_021151	GGC	2	6	79344	79349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902616
1528	NC_021151	GC	3	6	79348	79353	0 %	0 %	50 %	50 %	482902616
1529	NC_021151	TAC	2	6	79411	79416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902616
1530	NC_021151	GTG	2	6	79429	79434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902616
1531	NC_021151	CAA	2	6	79443	79448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482902616
1532	NC_021151	CCA	2	6	79562	79567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482902616
1533	NC_021151	GAA	2	6	79569	79574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482902616
1534	NC_021151	GCT	2	6	79587	79592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902616
1535	NC_021151	TCCG	2	8	79594	79601	0 %	25 %	25 %	50 %	482902616
1536	NC_021151	GTG	2	6	79621	79626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902616
1537	NC_021151	CGC	2	6	79632	79637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902616
1538	NC_021151	GCT	2	6	79641	79646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902616
1539	NC_021151	CCAC	2	8	79670	79677	25 %	0 %	0 %	75 %	482902616
1540	NC_021151	GTC	2	6	79742	79747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902616
1541	NC_021151	TAT	2	6	79788	79793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482902616
1542	NC_021151	ACC	2	6	79798	79803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482902616
1543	NC_021151	CGC	2	6	79810	79815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902616
1544	NC_021151	CGC	2	6	79840	79845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902616
1545	NC_021151	GC	3	6	79847	79852	0 %	0 %	50 %	50 %	482902616
1546	NC_021151	CGG	2	6	79887	79892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902616
1547	NC_021151	ACG	2	6	79900	79905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902616
1548	NC_021151	TG	3	6	80255	80260	0 %	50 %	50 %	0 %	482902617
1549	NC_021151	GAT	2	6	80304	80309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902617
1550	NC_021151	TTGT	2	8	80417	80424	0 %	75 %	25 %	0 %	482902617
1551	NC_021151	GAT	2	6	80433	80438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902617
1552	NC_021151	TGCCAG	2	12	80464	80475	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	482902617
1553	NC_021151	GAAA	2	8	80539	80546	75 %	0 %	25 %	0 %	482902617
1554	NC_021151	C	6	6	80584	80589	0 %	0 %	0 %	100 %	482902617
1555	NC_021151	GAT	2	6	80619	80624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902617
1556	NC_021151	CGTC	2	8	80749	80756	0 %	25 %	25 %	50 %	482902618
1557	NC_021151	CGGT	2	8	80771	80778	0 %	25 %	50 %	25 %	482902618
1558	NC_021151	TTC	2	6	80780	80785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482902618
1559	NC_021151	GTA	2	6	80899	80904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902618
1560	NC_021151	CG	3	6	80905	80910	0 %	0 %	50 %	50 %	482902618
1561	NC_021151	CCA	2	6	80920	80925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482902618
1562	NC_021151	TTGCC	2	10	80930	80939	0 %	40 %	20 %	40 %	482902618
1563	NC_021151	GGC	2	6	80972	80977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902618
1564	NC_021151	CT	3	6	80985	80990	0 %	50 %	0 %	50 %	482902618
1565	NC_021151	CGTCC	2	10	81040	81049	0 %	20 %	20 %	60 %	482902618
1566	NC_021151	CAC	2	6	81050	81055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482902618
1567	NC_021151	GGTATC	2	12	81107	81118	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	482902618
1568	NC_021151	GCCT	2	8	81158	81165	0 %	25 %	25 %	50 %	482902618
1569	NC_021151	CAC	2	6	81284	81289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482902618
1570	NC_021151	TCT	2	6	81492	81497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482902619
1571	NC_021151	GCA	2	6	81502	81507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902619
1572	NC_021151	CGC	2	6	81529	81534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902619
1573	NC_021151	CTT	2	6	81553	81558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482902619
1574	NC_021151	CG	3	6	81578	81583	0 %	0 %	50 %	50 %	482902619
1575	NC_021151	GTT	2	6	81631	81636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482902619
1576	NC_021151	CG	3	6	81646	81651	0 %	0 %	50 %	50 %	482902619
1577	NC_021151	CTT	2	6	81709	81714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482902619
1578	NC_021151	GCA	2	6	81766	81771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902619
1579	NC_021151	CGC	3	9	81790	81798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902619
1580	NC_021151	CCG	2	6	81868	81873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902619
1581	NC_021151	CCG	2	6	81891	81896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902619
1582	NC_021151	GCC	2	6	81968	81973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902619
1583	NC_021151	CAGC	2	8	82026	82033	25 %	0 %	25 %	50 %	482902619
1584	NC_021151	CGC	2	6	82051	82056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902619
1585	NC_021151	GGTC	2	8	82155	82162	0 %	25 %	50 %	25 %	482902619
1586	NC_021151	ACTC	2	8	82207	82214	25 %	25 %	0 %	50 %	482902619
1587	NC_021151	T	8	8	82280	82287	0 %	100 %	0 %	0 %	482902620
1588	NC_021151	ATT	2	6	82289	82294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482902620
1589	NC_021151	TCA	2	6	82442	82447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902620
1590	NC_021151	ACCA	2	8	82465	82472	50 %	0 %	0 %	50 %	482902620
1591	NC_021151	ATA	2	6	82505	82510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482902620
1592	NC_021151	CCG	2	6	82541	82546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902620
1593	NC_021151	CGA	2	6	82572	82577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902620
1594	NC_021151	CATCCT	2	12	82590	82601	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	482902620
1595	NC_021151	CGG	2	6	82734	82739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902620
1596	NC_021151	TCG	2	6	82757	82762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902620
1597	NC_021151	AAT	2	6	82837	82842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482902620
1598	NC_021151	CAG	2	6	82876	82881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902620
1599	NC_021151	TGC	2	6	82961	82966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902620
1600	NC_021151	GCG	2	6	82979	82984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902620
1601	NC_021151	ATC	3	9	83006	83014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902620
1602	NC_021151	AGC	2	6	83087	83092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902620
1603	NC_021151	TGC	2	6	83100	83105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902620
1604	NC_021151	CGG	2	6	83106	83111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902620
1605	NC_021151	GCG	2	6	83126	83131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902620
1606	NC_021151	TCA	2	6	83180	83185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902620
1607	NC_021151	AGT	2	6	83211	83216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902620
1608	NC_021151	ACC	2	6	83249	83254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482902620
1609	NC_021151	GGT	2	6	83269	83274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902620
1610	NC_021151	CCG	2	6	83295	83300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902620
1611	NC_021151	CGT	2	6	83379	83384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902620
1612	NC_021151	GCT	2	6	83394	83399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902620
1613	NC_021151	CAGA	2	8	83407	83414	50 %	0 %	25 %	25 %	482902620
1614	NC_021151	CAG	2	6	83485	83490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902620
1615	NC_021151	TTC	2	6	83524	83529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482902620
1616	NC_021151	A	6	6	83661	83666	100 %	0 %	0 %	0 %	482902620
1617	NC_021151	GTC	2	6	83779	83784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902620
1618	NC_021151	GGC	2	6	83964	83969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902621
1619	NC_021151	GTT	2	6	84015	84020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482902621
1620	NC_021151	ATG	2	6	84034	84039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902621
1621	NC_021151	TTCAG	2	10	84157	84166	20 %	40 %	20 %	20 %	482902621
1622	NC_021151	GT	4	8	84193	84200	0 %	50 %	50 %	0 %	482902621
1623	NC_021151	GCCA	2	8	84202	84209	25 %	0 %	25 %	50 %	482902621
1624	NC_021151	CGA	2	6	84227	84232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902621
1625	NC_021151	GATG	2	8	84257	84264	25 %	25 %	50 %	0 %	482902621
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1751	NC_021151	GTT	2	6	90566	90571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482902627
1752	NC_021151	CTG	2	6	90659	90664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902627
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1755	NC_021151	AAC	2	6	90856	90861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482902627
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1760	NC_021151	TGG	2	6	91041	91046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902627
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1775	NC_021151	CG	3	6	91700	91705	0 %	0 %	50 %	50 %	482902628
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1868	NC_021151	ATCT	2	8	98514	98521	25 %	50 %	0 %	25 %	482902635
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1876	NC_021151	TCTGT	2	10	98789	98798	0 %	60 %	20 %	20 %	482902635
1877	NC_021151	AATG	2	8	98882	98889	50 %	25 %	25 %	0 %	482902635
1878	NC_021151	TGG	2	6	98968	98973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902635
1879	NC_021151	GAT	2	6	98975	98980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902635
1880	NC_021151	GCT	2	6	98984	98989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902635
1881	NC_021151	GCC	2	6	98991	98996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902635
1882	NC_021151	GCG	2	6	98998	99003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902635
1883	NC_021151	CCA	2	6	99007	99012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482902635
1884	NC_021151	TGG	2	6	99064	99069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902635
1885	NC_021151	GCGCT	2	10	99099	99108	0 %	20 %	40 %	40 %	482902635
1886	NC_021151	CG	3	6	99113	99118	0 %	0 %	50 %	50 %	482902635
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1891	NC_021151	TGG	2	6	99349	99354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902635
1892	NC_021151	CTG	2	6	99372	99377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902635
1893	NC_021151	TTG	2	6	99378	99383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482902635
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1896	NC_021151	GGC	2	6	99587	99592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902635
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1909	NC_021151	TGG	2	6	100144	100149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902635
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1996	NC_021151	CCTG	2	8	105293	105300	0 %	25 %	25 %	50 %	482902641
1997	NC_021151	ACG	2	6	105353	105358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902641
1998	NC_021151	ATT	2	6	105361	105366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482902641
1999	NC_021151	GAC	2	6	105367	105372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902641
2000	NC_021151	G	6	6	105396	105401	0 %	0 %	100 %	0 %	482902641

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