MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. U288

Total Repeats: 89429

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021151	GCA	2	6	52110	52115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902592
1002	NC_021151	TGA	2	6	52153	52158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902592
1003	NC_021151	CAT	2	6	52166	52171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902592
1004	NC_021151	GC	3	6	52218	52223	0 %	0 %	50 %	50 %	482902592
1005	NC_021151	GCA	2	6	52357	52362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902593
1006	NC_021151	GCG	2	6	52443	52448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902593
1007	NC_021151	TCT	2	6	52488	52493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482902593
1008	NC_021151	TCA	2	6	52501	52506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902593
1009	NC_021151	TTAACC	2	12	52520	52531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902593
1010	NC_021151	CATA	2	8	52595	52602	50 %	25 %	0 %	25 %	482902594
1011	NC_021151	TCAG	2	8	52606	52613	25 %	25 %	25 %	25 %	482902594
1012	NC_021151	GT	3	6	52625	52630	0 %	50 %	50 %	0 %	482902594
1013	NC_021151	GAA	2	6	52695	52700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482902594
1014	NC_021151	GGT	3	9	52721	52729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902594
1015	NC_021151	GCG	2	6	52828	52833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902594
1016	NC_021151	TGTGC	2	10	52841	52850	0 %	40 %	40 %	20 %	482902594
1017	NC_021151	CGC	2	6	52863	52868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902594
1018	NC_021151	CTG	2	6	52905	52910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902594
1019	NC_021151	GAT	2	6	52947	52952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902594
1020	NC_021151	CG	3	6	52971	52976	0 %	0 %	50 %	50 %	482902594
1021	NC_021151	TTA	2	6	52989	52994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482902594
1022	NC_021151	GGC	2	6	53052	53057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902594
1023	NC_021151	AGT	2	6	53067	53072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902594
1024	NC_021151	CTG	2	6	53124	53129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902594
1025	NC_021151	CGA	2	6	53168	53173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902594
1026	NC_021151	TGGC	2	8	53320	53327	0 %	25 %	50 %	25 %	482902594
1027	NC_021151	CAA	2	6	53334	53339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482902594
1028	NC_021151	CTG	2	6	53352	53357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902594
1029	NC_021151	AGC	2	6	53422	53427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902594
1030	NC_021151	TGA	2	6	53441	53446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902594
1031	NC_021151	T	6	6	53490	53495	0 %	100 %	0 %	0 %	482902594
1032	NC_021151	TGA	2	6	53559	53564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902595
1033	NC_021151	GCG	2	6	53613	53618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902595
1034	NC_021151	GAT	3	9	53660	53668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902595
1035	NC_021151	CAT	2	6	53677	53682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902595
1036	NC_021151	A	6	6	53693	53698	100 %	0 %	0 %	0 %	482902595
1037	NC_021151	A	7	7	53702	53708	100 %	0 %	0 %	0 %	482902595
1038	NC_021151	ATG	2	6	53721	53726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902595
1039	NC_021151	GCA	2	6	53745	53750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902595
1040	NC_021151	CAT	2	6	54052	54057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902595
1041	NC_021151	CG	3	6	54059	54064	0 %	0 %	50 %	50 %	482902595
1042	NC_021151	GCGGAA	2	12	54146	54157	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	482902595
1043	NC_021151	ACC	2	6	54281	54286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482902595
1044	NC_021151	CTG	2	6	54467	54472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902595
1045	NC_021151	CTG	2	6	54716	54721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902595
1046	NC_021151	GC	3	6	54732	54737	0 %	0 %	50 %	50 %	482902595
1047	NC_021151	A	6	6	54750	54755	100 %	0 %	0 %	0 %	482902595
1048	NC_021151	GCA	2	6	54757	54762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902595
1049	NC_021151	CG	3	6	54806	54811	0 %	0 %	50 %	50 %	482902595
1050	NC_021151	AAG	2	6	54840	54845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482902595
1051	NC_021151	GCT	2	6	55012	55017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902595
1052	NC_021151	GGC	2	6	55036	55041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902595
1053	NC_021151	GTG	2	6	55087	55092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902595
1054	NC_021151	GTTTG	2	10	55163	55172	0 %	60 %	40 %	0 %	482902595
1055	NC_021151	CCA	2	6	55182	55187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482902595
1056	NC_021151	TGC	2	6	55228	55233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902595
1057	NC_021151	TCC	2	6	55280	55285	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482902595
1058	NC_021151	TGA	2	6	55287	55292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902595
1059	NC_021151	TGA	2	6	55413	55418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902595
1060	NC_021151	TGC	2	6	55507	55512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902595
1061	NC_021151	TCG	2	6	55522	55527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902595
1062	NC_021151	CG	3	6	55540	55545	0 %	0 %	50 %	50 %	482902595
1063	NC_021151	CTG	2	6	55550	55555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902595
1064	NC_021151	TGG	2	6	55608	55613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902595
1065	NC_021151	GCA	2	6	55651	55656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902595
1066	NC_021151	GTTC	2	8	55737	55744	0 %	50 %	25 %	25 %	482902595
1067	NC_021151	CAT	2	6	55753	55758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902595
1068	NC_021151	CG	3	6	55795	55800	0 %	0 %	50 %	50 %	482902595
1069	NC_021151	TGA	2	6	55879	55884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902595
1070	NC_021151	ACG	2	6	55941	55946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902595
1071	NC_021151	GTT	2	6	55948	55953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482902595
1072	NC_021151	GAA	2	6	55970	55975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482902595
1073	NC_021151	CAA	2	6	56023	56028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482902595
1074	NC_021151	AAG	2	6	56120	56125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482902595
1075	NC_021151	G	6	6	56194	56199	0 %	0 %	100 %	0 %	482902595
1076	NC_021151	TGA	3	9	56203	56211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902595
1077	NC_021151	GCT	2	6	56286	56291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902595
1078	NC_021151	CACTA	2	10	56294	56303	40 %	20 %	0 %	40 %	482902595
1079	NC_021151	AAC	2	6	56376	56381	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482902595
1080	NC_021151	TGA	2	6	56393	56398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902595
1081	NC_021151	GTA	2	6	56440	56445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902596
1082	NC_021151	GCA	2	6	56468	56473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902596
1083	NC_021151	TCC	2	6	56483	56488	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482902596
1084	NC_021151	GCG	2	6	56585	56590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902596
1085	NC_021151	TGA	2	6	56648	56653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902596
1086	NC_021151	ATC	2	6	56704	56709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902596
1087	NC_021151	GGC	2	6	56710	56715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902596
1088	NC_021151	GC	3	6	56714	56719	0 %	0 %	50 %	50 %	482902596
1089	NC_021151	TGT	2	6	56754	56759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482902596
1090	NC_021151	CGGCG	2	10	56832	56841	0 %	0 %	60 %	40 %	482902596
1091	NC_021151	TTCAC	2	10	57087	57096	20 %	40 %	0 %	40 %	482902597
1092	NC_021151	GAT	2	6	57107	57112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902597
1093	NC_021151	CGG	2	6	57120	57125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902597
1094	NC_021151	AGCC	2	8	57147	57154	25 %	0 %	25 %	50 %	482902597
1095	NC_021151	AGC	3	9	57195	57203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902597
1096	NC_021151	AAG	2	6	57216	57221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482902597
1097	NC_021151	AAAG	2	8	57226	57233	75 %	0 %	25 %	0 %	482902597
1098	NC_021151	CGC	2	6	57253	57258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902597
1099	NC_021151	GGC	2	6	57313	57318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902597
1100	NC_021151	ATGG	2	8	57359	57366	25 %	25 %	50 %	0 %	482902597
1101	NC_021151	TTG	2	6	57563	57568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482902598
1102	NC_021151	GC	3	6	57590	57595	0 %	0 %	50 %	50 %	482902598
1103	NC_021151	GC	4	8	57820	57827	0 %	0 %	50 %	50 %	482902598
1104	NC_021151	G	6	6	57916	57921	0 %	0 %	100 %	0 %	482902598
1105	NC_021151	TGG	2	6	57929	57934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902598
1106	NC_021151	TGAT	2	8	58031	58038	25 %	50 %	25 %	0 %	482902598
1107	NC_021151	TCG	2	6	58064	58069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902598
1108	NC_021151	TGG	2	6	58154	58159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902598
1109	NC_021151	TCTAAC	2	12	58177	58188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902598
1110	NC_021151	GAA	2	6	58217	58222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482902598
1111	NC_021151	CGA	2	6	58236	58241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902598
1112	NC_021151	GCG	2	6	58243	58248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902598
1113	NC_021151	AGG	2	6	58256	58261	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482902598
1114	NC_021151	GCC	2	6	58276	58281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902598
1115	NC_021151	GGC	3	9	58357	58365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902598
1116	NC_021151	GAA	2	6	58390	58395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482902598
1117	NC_021151	AAAAT	2	10	58658	58667	80 %	20 %	0 %	0 %	482902599
1118	NC_021151	TGGA	2	8	58700	58707	25 %	25 %	50 %	0 %	482902599
1119	NC_021151	CAA	2	6	58710	58715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482902599
1120	NC_021151	CCTG	2	8	58736	58743	0 %	25 %	25 %	50 %	482902599
1121	NC_021151	CT	3	6	58810	58815	0 %	50 %	0 %	50 %	482902599
1122	NC_021151	GAA	2	6	58904	58909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482902599
1123	NC_021151	CAG	2	6	58951	58956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902599
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1125	NC_021151	CACGAA	2	12	59056	59067	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	482902599
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1376	NC_021151	GTG	2	6	70916	70921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902610
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