MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. U288

Total Repeats: 89429

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_021151	ACA	2	6	319349	319354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482902821
6002	NC_021151	GGGGCT	2	12	319364	319375	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	482902821
6003	NC_021151	CGA	2	6	319461	319466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902821
6004	NC_021151	GC	3	6	319474	319479	0 %	0 %	50 %	50 %	482902821
6005	NC_021151	CGG	3	9	319482	319490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902821
6006	NC_021151	GAT	2	6	319496	319501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902821
6007	NC_021151	CGG	2	6	319591	319596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902821
6008	NC_021151	TAG	2	6	319620	319625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902821
6009	NC_021151	AAT	2	6	319638	319643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482902821
6010	NC_021151	AGA	2	6	319670	319675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482902821
6011	NC_021151	ATC	2	6	319705	319710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902821
6012	NC_021151	TGA	2	6	319741	319746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902821
6013	NC_021151	CTTTG	2	10	319750	319759	0 %	60 %	20 %	20 %	482902821
6014	NC_021151	ATGG	2	8	319921	319928	25 %	25 %	50 %	0 %	482902822
6015	NC_021151	AGC	2	6	320015	320020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902822
6016	NC_021151	TTA	2	6	320111	320116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482902822
6017	NC_021151	TTTCA	2	10	320212	320221	20 %	60 %	0 %	20 %	482902822
6018	NC_021151	T	6	6	320704	320709	0 %	100 %	0 %	0 %	482902823
6019	NC_021151	GTT	2	6	320734	320739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482902823
6020	NC_021151	CAG	2	6	320743	320748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902823
6021	NC_021151	GGA	2	6	320760	320765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482902823
6022	NC_021151	GGA	2	6	320778	320783	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482902823
6023	NC_021151	TTGA	2	8	320812	320819	25 %	50 %	25 %	0 %	482902823
6024	NC_021151	TCT	2	6	320837	320842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482902823
6025	NC_021151	TCA	2	6	320846	320851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902823
6026	NC_021151	GAA	2	6	320908	320913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482902823
6027	NC_021151	CCG	2	6	320937	320942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902823
6028	NC_021151	TG	3	6	321004	321009	0 %	50 %	50 %	0 %	482902823
6029	NC_021151	AAAATC	2	12	321246	321257	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	482902824
6030	NC_021151	TCC	2	6	321344	321349	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482902824
6031	NC_021151	CTC	2	6	321394	321399	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482902824
6032	NC_021151	CAG	2	6	321412	321417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902824
6033	NC_021151	ACCCAA	2	12	321421	321432	50 %	0 %	0 %	50 %	482902824
6034	NC_021151	CCAAG	2	10	321444	321453	40 %	0 %	20 %	40 %	482902824
6035	NC_021151	CAG	2	6	321737	321742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902825
6036	NC_021151	A	6	6	322093	322098	100 %	0 %	0 %	0 %	482902826
6037	NC_021151	ACA	2	6	322135	322140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482902826
6038	NC_021151	CAT	2	6	322191	322196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902826
6039	NC_021151	TGA	3	9	322302	322310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902826
6040	NC_021151	ATT	2	6	322324	322329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482902826
6041	NC_021151	ATT	2	6	322510	322515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482902826
6042	NC_021151	TGC	2	6	322611	322616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902826
6043	NC_021151	TCA	2	6	322742	322747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902826
6044	NC_021151	CCAG	2	8	322935	322942	25 %	0 %	25 %	50 %	482902827
6045	NC_021151	CTG	2	6	322963	322968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902827
6046	NC_021151	GGT	2	6	323205	323210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902827
6047	NC_021151	GCG	2	6	323235	323240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902827
6048	NC_021151	ATC	2	6	323251	323256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902827
6049	NC_021151	CGG	2	6	323264	323269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902827
6050	NC_021151	TGG	2	6	323281	323286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902827
6051	NC_021151	CCTGA	2	10	323295	323304	20 %	20 %	20 %	40 %	482902827
6052	NC_021151	ACG	2	6	323326	323331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902827
6053	NC_021151	TGA	2	6	323357	323362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902827
6054	NC_021151	CTG	2	6	323379	323384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902827
6055	NC_021151	GTG	2	6	323419	323424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902827
6056	NC_021151	ATCG	2	8	323448	323455	25 %	25 %	25 %	25 %	482902827
6057	NC_021151	TC	3	6	323459	323464	0 %	50 %	0 %	50 %	482902827
6058	NC_021151	ATCG	2	8	323538	323545	25 %	25 %	25 %	25 %	482902827
6059	NC_021151	GAT	2	6	323670	323675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902828
6060	NC_021151	ACG	2	6	323722	323727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902828
6061	NC_021151	ACG	2	6	323729	323734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902828
6062	NC_021151	CGG	2	6	323765	323770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902828
6063	NC_021151	GGC	2	6	323800	323805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902828
6064	NC_021151	TGAT	2	8	323852	323859	25 %	50 %	25 %	0 %	482902828
6065	NC_021151	CAG	2	6	323877	323882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902828
6066	NC_021151	CAA	2	6	323967	323972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482902828
6067	NC_021151	G	6	6	323973	323978	0 %	0 %	100 %	0 %	482902828
6068	NC_021151	TCA	2	6	324057	324062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902829
6069	NC_021151	GAA	2	6	324105	324110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482902829
6070	NC_021151	GCC	2	6	324156	324161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902829
6071	NC_021151	GCT	2	6	324185	324190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902829
6072	NC_021151	GCA	2	6	324273	324278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902829
6073	NC_021151	CAG	2	6	324282	324287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902829
6074	NC_021151	GAA	2	6	324416	324421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482902830
6075	NC_021151	TAA	2	6	324478	324483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482902830
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6077	NC_021151	A	6	6	324572	324577	100 %	0 %	0 %	0 %	482902830
6078	NC_021151	TGA	2	6	324607	324612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902830
6079	NC_021151	AATT	2	8	325026	325033	50 %	50 %	0 %	0 %	482902831
6080	NC_021151	TCG	2	6	325104	325109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902831
6081	NC_021151	TGC	2	6	325111	325116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902831
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6083	NC_021151	GAC	2	6	325172	325177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902831
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6086	NC_021151	TGG	2	6	325711	325716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902832
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6088	NC_021151	CGG	2	6	325802	325807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902832
6089	NC_021151	CCG	2	6	325928	325933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902832
6090	NC_021151	GCA	2	6	326053	326058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902832
6091	NC_021151	CAG	2	6	326091	326096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902832
6092	NC_021151	CGC	3	9	326174	326182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902832
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6094	NC_021151	CAAA	2	8	326444	326451	75 %	0 %	0 %	25 %	482902834
6095	NC_021151	GCC	2	6	326456	326461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902834
6096	NC_021151	GC	3	6	326583	326588	0 %	0 %	50 %	50 %	482902834
6097	NC_021151	A	6	6	326596	326601	100 %	0 %	0 %	0 %	482902834
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6099	NC_021151	TTGAC	2	10	326657	326666	20 %	40 %	20 %	20 %	482902834
6100	NC_021151	GC	3	6	326670	326675	0 %	0 %	50 %	50 %	482902834
6101	NC_021151	GCATG	2	10	326752	326761	20 %	20 %	40 %	20 %	482902834
6102	NC_021151	GCC	3	9	326782	326790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902834
6103	NC_021151	CATC	2	8	326817	326824	25 %	25 %	0 %	50 %	482902834
6104	NC_021151	GGC	2	6	326904	326909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902834
6105	NC_021151	GAG	2	6	326956	326961	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482902834
6106	NC_021151	TGCG	2	8	326996	327003	0 %	25 %	50 %	25 %	482902834
6107	NC_021151	A	6	6	327006	327011	100 %	0 %	0 %	0 %	482902834
6108	NC_021151	ATG	2	6	327202	327207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902835
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6110	NC_021151	TACT	2	8	327278	327285	25 %	50 %	0 %	25 %	482902835
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6112	NC_021151	ATC	2	6	327349	327354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902835
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6119	NC_021151	GT	3	6	327661	327666	0 %	50 %	50 %	0 %	482902835
6120	NC_021151	AATG	2	8	327697	327704	50 %	25 %	25 %	0 %	482902835
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6122	NC_021151	A	6	6	327772	327777	100 %	0 %	0 %	0 %	482902835
6123	NC_021151	TGG	2	6	327893	327898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902835
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6490	NC_021151	CGAAC	2	10	346429	346438	40 %	0 %	20 %	40 %	482902858
6491	NC_021151	TACAGG	2	12	346491	346502	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	482902858
6492	NC_021151	CCCG	2	8	346533	346540	0 %	0 %	25 %	75 %	482902858
6493	NC_021151	GTT	2	6	346547	346552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482902858
6494	NC_021151	TGGTC	2	10	346564	346573	0 %	40 %	40 %	20 %	482902858
6495	NC_021151	GGA	2	6	346585	346590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482902858
6496	NC_021151	TCG	2	6	346602	346607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902858
6497	NC_021151	AGG	2	6	346695	346700	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482902858
6498	NC_021151	GC	3	6	346706	346711	0 %	0 %	50 %	50 %	482902858
6499	NC_021151	TCA	2	6	346742	346747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902858
6500	NC_021151	ATT	2	6	346757	346762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482902858

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