MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. U288

Total Repeats: 89429

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_021151	CGC	2	6	285247	285252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902795
5502	NC_021151	TCA	2	6	285285	285290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902795
5503	NC_021151	T	6	6	285311	285316	0 %	100 %	0 %	0 %	482902795
5504	NC_021151	CAA	2	6	285385	285390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482902795
5505	NC_021151	CTGG	2	8	285422	285429	0 %	25 %	50 %	25 %	482902795
5506	NC_021151	TGA	2	6	285442	285447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902795
5507	NC_021151	GCG	2	6	285490	285495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902795
5508	NC_021151	CAA	2	6	285505	285510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482902795
5509	NC_021151	GCA	4	12	285598	285609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902795
5510	NC_021151	GGTCG	2	10	285626	285635	0 %	20 %	60 %	20 %	482902795
5511	NC_021151	GATTT	2	10	285678	285687	20 %	60 %	20 %	0 %	482902795
5512	NC_021151	T	7	7	285685	285691	0 %	100 %	0 %	0 %	482902795
5513	NC_021151	TTTC	2	8	285880	285887	0 %	75 %	0 %	25 %	482902795
5514	NC_021151	TGC	2	6	285915	285920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902795
5515	NC_021151	TTTGAA	2	12	286028	286039	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	482902795
5516	NC_021151	TAAA	2	8	286132	286139	75 %	25 %	0 %	0 %	482902796
5517	NC_021151	TCA	2	6	286170	286175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902796
5518	NC_021151	GCC	2	6	286243	286248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902796
5519	NC_021151	ACCAG	2	10	286298	286307	40 %	0 %	20 %	40 %	482902796
5520	NC_021151	GCG	2	6	286347	286352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902796
5521	NC_021151	AAC	2	6	286400	286405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482902796
5522	NC_021151	CCA	2	6	286413	286418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482902796
5523	NC_021151	GGCGC	2	10	286433	286442	0 %	0 %	60 %	40 %	482902796
5524	NC_021151	ATT	2	6	286493	286498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482902796
5525	NC_021151	ATC	2	6	286511	286516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902796
5526	NC_021151	CAG	2	6	286522	286527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902796
5527	NC_021151	GAT	2	6	286528	286533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902796
5528	NC_021151	ACC	2	6	286559	286564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482902796
5529	NC_021151	AG	3	6	286567	286572	50 %	0 %	50 %	0 %	482902796
5530	NC_021151	GAA	2	6	286660	286665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482902796
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5532	NC_021151	TCT	2	6	286797	286802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482902797
5533	NC_021151	CGTGC	2	10	286805	286814	0 %	20 %	40 %	40 %	482902797
5534	NC_021151	CCG	2	6	286845	286850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902797
5535	NC_021151	GC	3	6	286864	286869	0 %	0 %	50 %	50 %	482902797
5536	NC_021151	ATA	2	6	286872	286877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482902797
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5539	NC_021151	AGC	2	6	286914	286919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902797
5540	NC_021151	GCA	2	6	286954	286959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902797
5541	NC_021151	GCG	2	6	287056	287061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902797
5542	NC_021151	GAC	2	6	287194	287199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902797
5543	NC_021151	GC	3	6	287251	287256	0 %	0 %	50 %	50 %	482902797
5544	NC_021151	TGG	2	6	287257	287262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902797
5545	NC_021151	CG	3	6	287300	287305	0 %	0 %	50 %	50 %	482902797
5546	NC_021151	CCG	2	6	287331	287336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902797
5547	NC_021151	CAG	2	6	287387	287392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902797
5548	NC_021151	GT	3	6	287425	287430	0 %	50 %	50 %	0 %	482902797
5549	NC_021151	AG	3	6	287477	287482	50 %	0 %	50 %	0 %	482902797
5550	NC_021151	GTT	2	6	287550	287555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482902797
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5552	NC_021151	AAGT	2	8	287600	287607	50 %	25 %	25 %	0 %	482902797
5553	NC_021151	ATT	2	6	287693	287698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482902797
5554	NC_021151	CTG	2	6	287723	287728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902797
5555	NC_021151	A	8	8	288076	288083	100 %	0 %	0 %	0 %	482902798
5556	NC_021151	TGG	3	9	288096	288104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902798
5557	NC_021151	CG	4	8	288124	288131	0 %	0 %	50 %	50 %	482902798
5558	NC_021151	ATGG	2	8	288169	288176	25 %	25 %	50 %	0 %	482902798
5559	NC_021151	TAT	2	6	288218	288223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482902798
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5570	NC_021151	CAG	2	6	294606	294611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902799
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5582	NC_021151	GCTC	2	8	295244	295251	0 %	25 %	25 %	50 %	482902800
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5587	NC_021151	GGT	2	6	295348	295353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902800
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5589	NC_021151	GCT	2	6	295488	295493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902800
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5593	NC_021151	GCA	2	6	295662	295667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902800
5594	NC_021151	AAG	2	6	295802	295807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482902800
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5597	NC_021151	ATGC	2	8	295939	295946	25 %	25 %	25 %	25 %	482902800
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5599	NC_021151	CTATG	2	10	296045	296054	20 %	40 %	20 %	20 %	482902800
5600	NC_021151	TC	3	6	296091	296096	0 %	50 %	0 %	50 %	482902800
5601	NC_021151	GC	3	6	296147	296152	0 %	0 %	50 %	50 %	482902800
5602	NC_021151	ATTG	2	8	296154	296161	25 %	50 %	25 %	0 %	482902800
5603	NC_021151	GGC	2	6	296269	296274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902800
5604	NC_021151	GTTC	2	8	296321	296328	0 %	50 %	25 %	25 %	482902800
5605	NC_021151	AAAGG	2	10	296389	296398	60 %	0 %	40 %	0 %	482902800
5606	NC_021151	TCCAGC	2	12	296477	296488	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	482902801
5607	NC_021151	GGC	2	6	296501	296506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902801
5608	NC_021151	CGCTG	2	10	296559	296568	0 %	20 %	40 %	40 %	482902801
5609	NC_021151	GA	3	6	296695	296700	50 %	0 %	50 %	0 %	482902801
5610	NC_021151	AAC	2	6	296701	296706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482902801
5611	NC_021151	TAAT	2	8	296791	296798	50 %	50 %	0 %	0 %	482902802
5612	NC_021151	TG	3	6	296897	296902	0 %	50 %	50 %	0 %	482902802
5613	NC_021151	TCCAGA	2	12	296979	296990	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	482902802
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5620	NC_021151	GC	3	6	297175	297180	0 %	0 %	50 %	50 %	482902802
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5622	NC_021151	CTTT	2	8	297253	297260	0 %	75 %	0 %	25 %	482902802
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5987	NC_021151	GGCT	2	8	318482	318489	0 %	25 %	50 %	25 %	482902821
5988	NC_021151	CG	4	8	318549	318556	0 %	0 %	50 %	50 %	482902821
5989	NC_021151	CTT	2	6	318576	318581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482902821
5990	NC_021151	GT	3	6	318602	318607	0 %	50 %	50 %	0 %	482902821
5991	NC_021151	GCG	2	6	318740	318745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902821
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5993	NC_021151	TGC	2	6	318781	318786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902821
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5995	NC_021151	CGAT	2	8	319043	319050	25 %	25 %	25 %	25 %	482902821
5996	NC_021151	T	6	6	319129	319134	0 %	100 %	0 %	0 %	482902821
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