MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. U288

Total Repeats: 89429

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_021151	CCA	2	6	258220	258225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482902771
5002	NC_021151	TGA	2	6	258226	258231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902771
5003	NC_021151	ATCC	2	8	258300	258307	25 %	25 %	0 %	50 %	482902771
5004	NC_021151	TCAT	2	8	258316	258323	25 %	50 %	0 %	25 %	482902771
5005	NC_021151	ATGGC	2	10	258402	258411	20 %	20 %	40 %	20 %	482902771
5006	NC_021151	GC	3	6	258430	258435	0 %	0 %	50 %	50 %	482902771
5007	NC_021151	GC	3	6	258460	258465	0 %	0 %	50 %	50 %	482902771
5008	NC_021151	GC	3	6	258475	258480	0 %	0 %	50 %	50 %	482902771
5009	NC_021151	GGC	2	6	258539	258544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902771
5010	NC_021151	ACG	2	6	258546	258551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902771
5011	NC_021151	GGAT	2	8	258649	258656	25 %	25 %	50 %	0 %	482902771
5012	NC_021151	CG	3	6	258704	258709	0 %	0 %	50 %	50 %	482902771
5013	NC_021151	TGT	2	6	259063	259068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482902772
5014	NC_021151	AAT	2	6	259124	259129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482902772
5015	NC_021151	ATGG	2	8	259131	259138	25 %	25 %	50 %	0 %	482902772
5016	NC_021151	GTCC	2	8	259202	259209	0 %	25 %	25 %	50 %	482902772
5017	NC_021151	TGC	2	6	259226	259231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902772
5018	NC_021151	TAG	2	6	259268	259273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902772
5019	NC_021151	ACCG	2	8	259285	259292	25 %	0 %	25 %	50 %	482902772
5020	NC_021151	TG	3	6	259325	259330	0 %	50 %	50 %	0 %	482902772
5021	NC_021151	TAT	2	6	259382	259387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482902772
5022	NC_021151	ATA	2	6	259456	259461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482902772
5023	NC_021151	CGG	2	6	259493	259498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902772
5024	NC_021151	TGC	2	6	259555	259560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902772
5025	NC_021151	TGA	2	6	259574	259579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902772
5026	NC_021151	AG	3	6	259580	259585	50 %	0 %	50 %	0 %	482902772
5027	NC_021151	ACTTT	2	10	259697	259706	20 %	60 %	0 %	20 %	482902772
5028	NC_021151	CGT	2	6	259779	259784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902772
5029	NC_021151	CGG	2	6	259787	259792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902772
5030	NC_021151	TGA	2	6	259805	259810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902772
5031	NC_021151	T	7	7	259891	259897	0 %	100 %	0 %	0 %	482902773
5032	NC_021151	GCC	2	6	259901	259906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902773
5033	NC_021151	ATT	2	6	259920	259925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482902773
5034	NC_021151	CGC	2	6	259979	259984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902773
5035	NC_021151	TGGC	2	8	260001	260008	0 %	25 %	50 %	25 %	482902773
5036	NC_021151	TG	3	6	260014	260019	0 %	50 %	50 %	0 %	482902773
5037	NC_021151	TTG	2	6	260046	260051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482902773
5038	NC_021151	ATC	2	6	260059	260064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902773
5039	NC_021151	ACA	2	6	260065	260070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482902773
5040	NC_021151	TGG	2	6	260115	260120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902773
5041	NC_021151	CTG	2	6	260133	260138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902773
5042	NC_021151	CGG	2	6	260158	260163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902773
5043	NC_021151	GC	3	6	260246	260251	0 %	0 %	50 %	50 %	482902773
5044	NC_021151	ATT	2	6	260351	260356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482902773
5045	NC_021151	CGG	2	6	260414	260419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902773
5046	NC_021151	TGG	2	6	260506	260511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902773
5047	NC_021151	GGC	2	6	260604	260609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902773
5048	NC_021151	TGT	2	6	260662	260667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482902773
5049	NC_021151	TCA	2	6	260733	260738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902774
5050	NC_021151	CGT	2	6	260849	260854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902774
5051	NC_021151	GGC	2	6	260900	260905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902774
5052	NC_021151	GC	3	6	260926	260931	0 %	0 %	50 %	50 %	482902774
5053	NC_021151	CGT	2	6	260954	260959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902774
5054	NC_021151	GC	3	6	260989	260994	0 %	0 %	50 %	50 %	482902774
5055	NC_021151	ATT	2	6	260999	261004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482902774
5056	NC_021151	CTGG	2	8	261049	261056	0 %	25 %	50 %	25 %	482902774
5057	NC_021151	ATC	2	6	261062	261067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902774
5058	NC_021151	TGC	2	6	261118	261123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902774
5059	NC_021151	CAG	2	6	261227	261232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902774
5060	NC_021151	ACG	2	6	261233	261238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902774
5061	NC_021151	TCT	2	6	261332	261337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482902774
5062	NC_021151	CGTTAG	2	12	261513	261524	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	482902774
5063	NC_021151	GTG	2	6	261611	261616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902774
5064	NC_021151	ATT	2	6	261623	261628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482902774
5065	NC_021151	TGA	2	6	261711	261716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902774
5066	NC_021151	AAC	2	6	261767	261772	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482902774
5067	NC_021151	TTA	2	6	261832	261837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482902774
5068	NC_021151	G	6	6	261908	261913	0 %	0 %	100 %	0 %	482902774
5069	NC_021151	CTG	2	6	261917	261922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902774
5070	NC_021151	GGGC	2	8	261946	261953	0 %	0 %	75 %	25 %	482902774
5071	NC_021151	GTT	2	6	262009	262014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482902774
5072	NC_021151	TC	3	6	262041	262046	0 %	50 %	0 %	50 %	482902774
5073	NC_021151	AG	3	6	262054	262059	50 %	0 %	50 %	0 %	482902774
5074	NC_021151	GCT	2	6	262115	262120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902775
5075	NC_021151	CAG	2	6	262124	262129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902775
5076	NC_021151	CATT	2	8	262169	262176	25 %	50 %	0 %	25 %	482902775
5077	NC_021151	CTC	2	6	262212	262217	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482902775
5078	NC_021151	ATG	2	6	262249	262254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902775
5079	NC_021151	CAC	2	6	262466	262471	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482902775
5080	NC_021151	GTC	2	6	262545	262550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902775
5081	NC_021151	CGC	2	6	262552	262557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902775
5082	NC_021151	AGG	2	6	262594	262599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482902775
5083	NC_021151	TCG	2	6	262630	262635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902775
5084	NC_021151	GAA	2	6	262656	262661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482902775
5085	NC_021151	GTG	2	6	262697	262702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902775
5086	NC_021151	CGT	2	6	262706	262711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902775
5087	NC_021151	GGCG	2	8	262742	262749	0 %	0 %	75 %	25 %	482902775
5088	NC_021151	CTA	2	6	262769	262774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902775
5089	NC_021151	CG	3	6	262790	262795	0 %	0 %	50 %	50 %	482902775
5090	NC_021151	CG	3	6	263044	263049	0 %	0 %	50 %	50 %	482902775
5091	NC_021151	CTT	2	6	263264	263269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482902775
5092	NC_021151	CGACAC	2	12	263279	263290	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	482902775
5093	NC_021151	GCG	2	6	263392	263397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902775
5094	NC_021151	CAG	2	6	263418	263423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902775
5095	NC_021151	GGT	2	6	263541	263546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902775
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5097	NC_021151	GAC	2	6	263574	263579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902775
5098	NC_021151	CAA	2	6	263600	263605	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482902775
5099	NC_021151	TACGG	2	10	263610	263619	20 %	20 %	40 %	20 %	482902775
5100	NC_021151	ACA	2	6	263650	263655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482902775
5101	NC_021151	CTG	2	6	263749	263754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902775
5102	NC_021151	CAG	2	6	263759	263764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902775
5103	NC_021151	TGA	2	6	263774	263779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902775
5104	NC_021151	GACG	2	8	263834	263841	25 %	0 %	50 %	25 %	482902775
5105	NC_021151	CG	3	6	263845	263850	0 %	0 %	50 %	50 %	482902775
5106	NC_021151	TAC	2	6	263895	263900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902775
5107	NC_021151	GTGG	2	8	263951	263958	0 %	25 %	75 %	0 %	482902775
5108	NC_021151	GGC	2	6	263997	264002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902775
5109	NC_021151	GGT	2	6	264036	264041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902775
5110	NC_021151	CGTG	2	8	264050	264057	0 %	25 %	50 %	25 %	482902775
5111	NC_021151	ATG	2	6	264127	264132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902775
5112	NC_021151	GAT	2	6	264171	264176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902775
5113	NC_021151	GGT	2	6	264183	264188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902775
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5118	NC_021151	TCT	2	6	264418	264423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482902775
5119	NC_021151	TTA	2	6	264635	264640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482902776
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5122	NC_021151	A	6	6	264795	264800	100 %	0 %	0 %	0 %	482902776
5123	NC_021151	TCG	2	6	264940	264945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902776
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5188	NC_021151	GC	3	6	268270	268275	0 %	0 %	50 %	50 %	482902780
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5243	NC_021151	TGC	2	6	271050	271055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902782
5244	NC_021151	CGG	2	6	271071	271076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902782
5245	NC_021151	CG	3	6	271092	271097	0 %	0 %	50 %	50 %	482902782
5246	NC_021151	TGG	2	6	271155	271160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902782
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5252	NC_021151	TGC	2	6	271374	271379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902782
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5362	NC_021151	GGC	2	6	276835	276840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902785
5363	NC_021151	ATG	2	6	276908	276913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902785
5364	NC_021151	GCG	2	6	276965	276970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902785
5365	NC_021151	TGC	2	6	276972	276977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902785
5366	NC_021151	GATT	2	8	276996	277003	25 %	50 %	25 %	0 %	482902785
5367	NC_021151	TGA	2	6	277105	277110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902785
5368	NC_021151	CCGATG	2	12	277158	277169	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	482902785
5369	NC_021151	GATG	2	8	277219	277226	25 %	25 %	50 %	0 %	482902785
5370	NC_021151	CGC	2	6	277258	277263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902785
5371	NC_021151	TGG	2	6	277266	277271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902785
5372	NC_021151	TGA	2	6	277282	277287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902785
5373	NC_021151	GTG	3	9	277295	277303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902785
5374	NC_021151	A	6	6	277305	277310	100 %	0 %	0 %	0 %	482902785
5375	NC_021151	CTG	2	6	277325	277330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902785
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5378	NC_021151	GAT	2	6	277573	277578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902785
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5380	NC_021151	CTG	2	6	277754	277759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902785
5381	NC_021151	TGCTC	2	10	277761	277770	0 %	40 %	20 %	40 %	482902785
5382	NC_021151	TCA	2	6	277946	277951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902786
5383	NC_021151	TCCCT	2	10	278108	278117	0 %	40 %	0 %	60 %	482902786
5384	NC_021151	T	6	6	278267	278272	0 %	100 %	0 %	0 %	482902786
5385	NC_021151	CT	3	6	278408	278413	0 %	50 %	0 %	50 %	482902787
5386	NC_021151	GCG	2	6	278439	278444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902787
5387	NC_021151	TCA	2	6	278527	278532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902787
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5389	NC_021151	GCA	2	6	278722	278727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902787
5390	NC_021151	CTG	2	6	278753	278758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902787
5391	NC_021151	CCGG	2	8	278780	278787	0 %	0 %	50 %	50 %	482902787
5392	NC_021151	CTT	2	6	278831	278836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482902787
5393	NC_021151	GA	3	6	278848	278853	50 %	0 %	50 %	0 %	482902787
5394	NC_021151	T	6	6	278944	278949	0 %	100 %	0 %	0 %	482902787
5395	NC_021151	GC	4	8	278956	278963	0 %	0 %	50 %	50 %	482902787
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5398	NC_021151	GCT	2	6	279043	279048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902787
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5402	NC_021151	CGG	2	6	279137	279142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902787
5403	NC_021151	GCG	2	6	279143	279148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902787
5404	NC_021151	GCTG	2	8	279159	279166	0 %	25 %	50 %	25 %	482902787
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5484	NC_021151	CGT	2	6	284186	284191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902793
5485	NC_021151	GGC	3	9	284261	284269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902793
5486	NC_021151	CCA	2	6	284311	284316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482902793
5487	NC_021151	CCA	2	6	284329	284334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482902793
5488	NC_021151	CT	3	6	284364	284369	0 %	50 %	0 %	50 %	482902793
5489	NC_021151	GCC	2	6	284494	284499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902793
5490	NC_021151	GCC	2	6	284501	284506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902793
5491	NC_021151	TGA	2	6	284517	284522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902793
5492	NC_021151	CGC	2	6	284608	284613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902793
5493	NC_021151	GACCA	2	10	284624	284633	40 %	0 %	20 %	40 %	482902793
5494	NC_021151	GCT	2	6	284702	284707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902793
5495	NC_021151	AGC	2	6	284757	284762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902794
5496	NC_021151	GCA	2	6	284793	284798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902794
5497	NC_021151	GC	3	6	284845	284850	0 %	0 %	50 %	50 %	482902794
5498	NC_021151	CGC	2	6	284898	284903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902794
5499	NC_021151	AAC	2	6	285063	285068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482902794
5500	NC_021151	ATA	2	6	285110	285115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482902794

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