MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Streptomyces sp. PAMC26508 plasmid pSP01

Total Repeats: 125

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021056	CA	3	6	1064	1069	50 %	0 %	0 %	50 %	479323915
2	NC_021056	AC	3	6	1292	1297	50 %	0 %	0 %	50 %	479323915
3	NC_021056	GC	3	6	1669	1674	0 %	0 %	50 %	50 %	479323915
4	NC_021056	GA	3	6	2011	2016	50 %	0 %	50 %	0 %	479323916
5	NC_021056	CG	4	8	3554	3561	0 %	0 %	50 %	50 %	479323917
6	NC_021056	GT	3	6	3601	3606	0 %	50 %	50 %	0 %	479323917
7	NC_021056	AC	3	6	3979	3984	50 %	0 %	0 %	50 %	479323917
8	NC_021056	CG	3	6	4212	4217	0 %	0 %	50 %	50 %	479323917
9	NC_021056	GC	3	6	5085	5090	0 %	0 %	50 %	50 %	479323918
10	NC_021056	CG	3	6	5788	5793	0 %	0 %	50 %	50 %	479323918
11	NC_021056	CA	3	6	6107	6112	50 %	0 %	0 %	50 %	479323919
12	NC_021056	CA	3	6	7556	7561	50 %	0 %	0 %	50 %	479323921
13	NC_021056	CG	3	6	8237	8242	0 %	0 %	50 %	50 %	479323921
14	NC_021056	CG	3	6	8342	8347	0 %	0 %	50 %	50 %	479323921
15	NC_021056	AC	3	6	8354	8359	50 %	0 %	0 %	50 %	479323921
16	NC_021056	GC	3	6	8727	8732	0 %	0 %	50 %	50 %	479323921
17	NC_021056	CG	3	6	9069	9074	0 %	0 %	50 %	50 %	479323921
18	NC_021056	CT	3	6	11140	11145	0 %	50 %	0 %	50 %	479323923
19	NC_021056	GC	3	6	11505	11510	0 %	0 %	50 %	50 %	479323924
20	NC_021056	CG	3	6	12520	12525	0 %	0 %	50 %	50 %	479323926
21	NC_021056	GC	3	6	13117	13122	0 %	0 %	50 %	50 %	479323926
22	NC_021056	CG	3	6	14072	14077	0 %	0 %	50 %	50 %	479323926
23	NC_021056	GA	3	6	14727	14732	50 %	0 %	50 %	0 %	479323926
24	NC_021056	GA	3	6	15443	15448	50 %	0 %	50 %	0 %	479323926
25	NC_021056	GC	3	6	15460	15465	0 %	0 %	50 %	50 %	479323926
26	NC_021056	CG	3	6	15880	15885	0 %	0 %	50 %	50 %	479323926
27	NC_021056	CA	3	6	18664	18669	50 %	0 %	0 %	50 %	479323929
28	NC_021056	TG	3	6	19330	19335	0 %	50 %	50 %	0 %	479323929
29	NC_021056	GC	3	6	21062	21067	0 %	0 %	50 %	50 %	479323932
30	NC_021056	TG	3	6	21490	21495	0 %	50 %	50 %	0 %	479323933
31	NC_021056	GC	3	6	23810	23815	0 %	0 %	50 %	50 %	479323935
32	NC_021056	CG	3	6	26051	26056	0 %	0 %	50 %	50 %	479323940
33	NC_021056	CG	3	6	30039	30044	0 %	0 %	50 %	50 %	479323945
34	NC_021056	CG	3	6	30907	30912	0 %	0 %	50 %	50 %	479323946
35	NC_021056	CG	3	6	31160	31165	0 %	0 %	50 %	50 %	479323947
36	NC_021056	CA	3	6	31788	31793	50 %	0 %	0 %	50 %	479323948
37	NC_021056	TG	3	6	32704	32709	0 %	50 %	50 %	0 %	479323949
38	NC_021056	CG	3	6	32760	32765	0 %	0 %	50 %	50 %	479323949
39	NC_021056	GC	3	6	33047	33052	0 %	0 %	50 %	50 %	479323949
40	NC_021056	GT	3	6	33943	33948	0 %	50 %	50 %	0 %	479323949
41	NC_021056	CG	3	6	35401	35406	0 %	0 %	50 %	50 %	479323951
42	NC_021056	CG	3	6	36315	36320	0 %	0 %	50 %	50 %	479323952
43	NC_021056	GC	3	6	37131	37136	0 %	0 %	50 %	50 %	479323953
44	NC_021056	TC	3	6	37420	37425	0 %	50 %	0 %	50 %	479323954
45	NC_021056	GC	3	6	37558	37563	0 %	0 %	50 %	50 %	479323954
46	NC_021056	CG	3	6	38895	38900	0 %	0 %	50 %	50 %	479323954
47	NC_021056	CG	4	8	39363	39370	0 %	0 %	50 %	50 %	479323955
48	NC_021056	GC	3	6	39641	39646	0 %	0 %	50 %	50 %	479323956
49	NC_021056	TG	3	6	42646	42651	0 %	50 %	50 %	0 %	479323962
50	NC_021056	CG	3	6	42778	42783	0 %	0 %	50 %	50 %	479323962
51	NC_021056	CG	3	6	43632	43637	0 %	0 %	50 %	50 %	479323963
52	NC_021056	CG	3	6	44170	44175	0 %	0 %	50 %	50 %	479323963
53	NC_021056	TG	3	6	44486	44491	0 %	50 %	50 %	0 %	479323964
54	NC_021056	AG	3	6	44794	44799	50 %	0 %	50 %	0 %	479323965
55	NC_021056	GC	3	6	46182	46187	0 %	0 %	50 %	50 %	479323966
56	NC_021056	GC	3	6	46856	46861	0 %	0 %	50 %	50 %	479323967
57	NC_021056	CG	3	6	47874	47879	0 %	0 %	50 %	50 %	479323968
58	NC_021056	CT	3	6	48735	48740	0 %	50 %	0 %	50 %	479323970
59	NC_021056	CA	3	6	50508	50513	50 %	0 %	0 %	50 %	479323972
60	NC_021056	CT	4	8	50639	50646	0 %	50 %	0 %	50 %	479323972
61	NC_021056	AG	3	6	51949	51954	50 %	0 %	50 %	0 %	479323973
62	NC_021056	TC	3	6	52650	52655	0 %	50 %	0 %	50 %	479323974
63	NC_021056	GC	3	6	53086	53091	0 %	0 %	50 %	50 %	479323974
64	NC_021056	CG	3	6	56348	56353	0 %	0 %	50 %	50 %	479323978
65	NC_021056	GT	3	6	58035	58040	0 %	50 %	50 %	0 %	479323979
66	NC_021056	GC	3	6	58339	58344	0 %	0 %	50 %	50 %	479323979
67	NC_021056	AG	3	6	58590	58595	50 %	0 %	50 %	0 %	479323979
68	NC_021056	CA	3	6	59470	59475	50 %	0 %	0 %	50 %	479323980
69	NC_021056	CG	3	6	59767	59772	0 %	0 %	50 %	50 %	479323981
70	NC_021056	GA	3	6	61553	61558	50 %	0 %	50 %	0 %	479323983
71	NC_021056	CG	3	6	63221	63226	0 %	0 %	50 %	50 %	479323986
72	NC_021056	CG	3	6	63969	63974	0 %	0 %	50 %	50 %	479323987
73	NC_021056	GC	3	6	64817	64822	0 %	0 %	50 %	50 %	479323988
74	NC_021056	CG	3	6	68373	68378	0 %	0 %	50 %	50 %	479323992
75	NC_021056	GC	3	6	68524	68529	0 %	0 %	50 %	50 %	479323992
76	NC_021056	CG	3	6	68618	68623	0 %	0 %	50 %	50 %	479323992
77	NC_021056	CG	3	6	69249	69254	0 %	0 %	50 %	50 %	479323993
78	NC_021056	CG	3	6	69532	69537	0 %	0 %	50 %	50 %	479323993
79	NC_021056	GC	3	6	69737	69742	0 %	0 %	50 %	50 %	479323993
80	NC_021056	GC	3	6	69744	69749	0 %	0 %	50 %	50 %	479323993
81	NC_021056	TC	3	6	70117	70122	0 %	50 %	0 %	50 %	479323993
82	NC_021056	CG	3	6	71456	71461	0 %	0 %	50 %	50 %	479323994
83	NC_021056	CG	3	6	72548	72553	0 %	0 %	50 %	50 %	479323996
84	NC_021056	GC	3	6	72693	72698	0 %	0 %	50 %	50 %	479323997
85	NC_021056	CG	3	6	73030	73035	0 %	0 %	50 %	50 %	479323997
86	NC_021056	TC	3	6	73301	73306	0 %	50 %	0 %	50 %	479323997
87	NC_021056	CG	3	6	73341	73346	0 %	0 %	50 %	50 %	479323997
88	NC_021056	TG	3	6	74362	74367	0 %	50 %	50 %	0 %	479323997
89	NC_021056	GC	3	6	75248	75253	0 %	0 %	50 %	50 %	479323997
90	NC_021056	GA	3	6	75254	75259	50 %	0 %	50 %	0 %	479323997
91	NC_021056	CG	3	6	75841	75846	0 %	0 %	50 %	50 %	479323997
92	NC_021056	CG	3	6	75966	75971	0 %	0 %	50 %	50 %	479323997
93	NC_021056	CG	3	6	76103	76108	0 %	0 %	50 %	50 %	479323997
94	NC_021056	TC	3	6	76124	76129	0 %	50 %	0 %	50 %	479323997
95	NC_021056	GT	3	6	77010	77015	0 %	50 %	50 %	0 %	479323999
96	NC_021056	GT	3	6	77066	77071	0 %	50 %	50 %	0 %	479323999
97	NC_021056	CG	3	6	77683	77688	0 %	0 %	50 %	50 %	479323999
98	NC_021056	GC	3	6	81208	81213	0 %	0 %	50 %	50 %	479324002
99	NC_021056	GC	3	6	81706	81711	0 %	0 %	50 %	50 %	479324003
100	NC_021056	CG	3	6	82173	82178	0 %	0 %	50 %	50 %	479324003
101	NC_021056	GC	3	6	82411	82416	0 %	0 %	50 %	50 %	479324003
102	NC_021056	GC	3	6	83709	83714	0 %	0 %	50 %	50 %	479324005
103	NC_021056	GC	3	6	84657	84662	0 %	0 %	50 %	50 %	479324005
104	NC_021056	CG	3	6	87258	87263	0 %	0 %	50 %	50 %	479324007
105	NC_021056	GC	3	6	87494	87499	0 %	0 %	50 %	50 %	479324007
106	NC_021056	CG	3	6	88545	88550	0 %	0 %	50 %	50 %	479324007
107	NC_021056	AC	3	6	88952	88957	50 %	0 %	0 %	50 %	479324007
108	NC_021056	CA	3	6	89094	89099	50 %	0 %	0 %	50 %	479324007
109	NC_021056	GC	3	6	89100	89105	0 %	0 %	50 %	50 %	479324007
110	NC_021056	GC	3	6	89827	89832	0 %	0 %	50 %	50 %	479324008
111	NC_021056	TG	3	6	93033	93038	0 %	50 %	50 %	0 %	479324009
112	NC_021056	GA	3	6	94641	94646	50 %	0 %	50 %	0 %	479324009
113	NC_021056	CG	3	6	94702	94707	0 %	0 %	50 %	50 %	479324009
114	NC_021056	CG	3	6	95484	95489	0 %	0 %	50 %	50 %	479324009
115	NC_021056	CT	3	6	95748	95753	0 %	50 %	0 %	50 %	479324010
116	NC_021056	CG	3	6	96837	96842	0 %	0 %	50 %	50 %	479324010
117	NC_021056	AG	3	6	97319	97324	50 %	0 %	50 %	0 %	479324010
118	NC_021056	CG	3	6	97825	97830	0 %	0 %	50 %	50 %	479324011
119	NC_021056	GC	3	6	98173	98178	0 %	0 %	50 %	50 %	479324012
120	NC_021056	CG	3	6	98206	98211	0 %	0 %	50 %	50 %	479324012
121	NC_021056	CG	3	6	99343	99348	0 %	0 %	50 %	50 %	479324013
122	NC_021056	AC	3	6	99861	99866	50 %	0 %	0 %	50 %	479324013
123	NC_021056	AC	4	8	100528	100535	50 %	0 %	0 %	50 %	479324014
124	NC_021056	GC	3	6	100584	100589	0 %	0 %	50 %	50 %	479324014
125	NC_021056	CG	3	6	102773	102778	0 %	0 %	50 %	50 %	479324017

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.