MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Streptomyces sp. PAMC26508 plasmid pSP01

Total Repeats: 80

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021056	GACGA	2	10	3789	3798	40 %	0 %	40 %	20 %	479323917
2	NC_021056	GGCGA	2	10	11471	11480	20 %	0 %	60 %	20 %	479323924
3	NC_021056	CAGAG	2	10	12016	12025	40 %	0 %	40 %	20 %	479323924
4	NC_021056	CGACG	2	10	14563	14572	20 %	0 %	40 %	40 %	479323926
5	NC_021056	GCACA	2	10	21586	21595	40 %	0 %	20 %	40 %	479323933
6	NC_021056	AGGCC	2	10	21706	21715	20 %	0 %	40 %	40 %	479323933
7	NC_021056	GCCGA	2	10	24615	24624	20 %	0 %	40 %	40 %	479323937
8	NC_021056	GGTCG	2	10	24986	24995	0 %	20 %	60 %	20 %	479323937
9	NC_021056	GTGCC	2	10	28503	28512	0 %	20 %	40 %	40 %	479323943
10	NC_021056	CGAGG	2	10	28547	28556	20 %	0 %	60 %	20 %	479323943
11	NC_021056	CCTCC	2	10	30193	30202	0 %	20 %	0 %	80 %	479323945
12	NC_021056	CGGAG	2	10	33549	33558	20 %	0 %	60 %	20 %	479323949
13	NC_021056	GTGGG	2	10	35135	35144	0 %	20 %	80 %	0 %	479323951
14	NC_021056	GCCCC	2	10	36438	36447	0 %	0 %	20 %	80 %	479323952
15	NC_021056	ACCGC	2	10	37329	37338	20 %	0 %	20 %	60 %	479323953
16	NC_021056	CCGAC	2	10	37431	37440	20 %	0 %	20 %	60 %	479323954
17	NC_021056	CGGCC	2	10	37638	37647	0 %	0 %	40 %	60 %	479323954
18	NC_021056	CCTCG	2	10	39225	39234	0 %	20 %	20 %	60 %	479323955
19	NC_021056	GATCG	2	10	39846	39855	20 %	20 %	40 %	20 %	479323956
20	NC_021056	CCGCA	2	10	41690	41699	20 %	0 %	20 %	60 %	479323959
21	NC_021056	GTCCG	2	10	42468	42477	0 %	20 %	40 %	40 %	479323962
22	NC_021056	GACCG	2	10	44101	44110	20 %	0 %	40 %	40 %	479323963
23	NC_021056	CCGGC	2	10	46039	46048	0 %	0 %	40 %	60 %	479323966
24	NC_021056	GCCGG	2	10	46469	46478	0 %	0 %	60 %	40 %	479323966
25	NC_021056	GTGCG	2	10	47228	47237	0 %	20 %	60 %	20 %	479323967
26	NC_021056	GACAT	2	10	47709	47718	40 %	20 %	20 %	20 %	479323968
27	NC_021056	GCGTC	2	10	48019	48028	0 %	20 %	40 %	40 %	479323968
28	NC_021056	CGTTC	2	10	50248	50257	0 %	40 %	20 %	40 %	479323972
29	NC_021056	GCCGG	2	10	51521	51530	0 %	0 %	60 %	40 %	479323973
30	NC_021056	CCGCT	2	10	51873	51882	0 %	20 %	20 %	60 %	479323973
31	NC_021056	ACAGC	2	10	53547	53556	40 %	0 %	20 %	40 %	479323974
32	NC_021056	GCCCA	2	10	54491	54500	20 %	0 %	20 %	60 %	479323976
33	NC_021056	CGGCC	2	10	55024	55033	0 %	0 %	40 %	60 %	479323977
34	NC_021056	CAGGA	2	10	55066	55075	40 %	0 %	40 %	20 %	479323977
35	NC_021056	TCGTC	2	10	55085	55094	0 %	40 %	20 %	40 %	479323977
36	NC_021056	CGTCC	2	10	56407	56416	0 %	20 %	20 %	60 %	479323978
37	NC_021056	CAGGG	2	10	56672	56681	20 %	0 %	60 %	20 %	479323978
38	NC_021056	CGGCG	2	10	57757	57766	0 %	0 %	60 %	40 %	479323979
39	NC_021056	CCGGT	2	10	59711	59720	0 %	20 %	40 %	40 %	479323981
40	NC_021056	CGCAC	2	10	60381	60390	20 %	0 %	20 %	60 %	479323982
41	NC_021056	GGCCA	2	10	61353	61362	20 %	0 %	40 %	40 %	479323983
42	NC_021056	CTCAA	2	10	62072	62081	40 %	20 %	0 %	40 %	479323984
43	NC_021056	AGGGC	2	10	62267	62276	20 %	0 %	60 %	20 %	479323984
44	NC_021056	CGGTC	2	10	62519	62528	0 %	20 %	40 %	40 %	479323984
45	NC_021056	GCCCC	2	10	63886	63895	0 %	0 %	20 %	80 %	479323987
46	NC_021056	CCACA	2	10	67882	67891	40 %	0 %	0 %	60 %	479323991
47	NC_021056	ACCGC	2	10	69172	69181	20 %	0 %	20 %	60 %	479323992
48	NC_021056	GCCTG	2	10	69386	69395	0 %	20 %	40 %	40 %	479323993
49	NC_021056	CCGGA	2	10	70942	70951	20 %	0 %	40 %	40 %	479323993
50	NC_021056	TCCGG	2	10	71373	71382	0 %	20 %	40 %	40 %	479323994
51	NC_021056	CTGCT	2	10	73218	73227	0 %	40 %	20 %	40 %	479323997
52	NC_021056	CTCGG	2	10	73248	73257	0 %	20 %	40 %	40 %	479323997
53	NC_021056	GGACA	2	10	73950	73959	40 %	0 %	40 %	20 %	479323997
54	NC_021056	GGTGG	2	10	74388	74397	0 %	20 %	80 %	0 %	479323997
55	NC_021056	CCGGG	2	10	75371	75380	0 %	0 %	60 %	40 %	479323997
56	NC_021056	CTGTC	2	10	77741	77750	0 %	40 %	20 %	40 %	479323999
57	NC_021056	GGCGA	2	10	80621	80630	20 %	0 %	60 %	20 %	479324002
58	NC_021056	GTCAT	2	10	81227	81236	20 %	40 %	20 %	20 %	479324002
59	NC_021056	TTCGG	2	10	81406	81415	0 %	40 %	40 %	20 %	479324003
60	NC_021056	CGCAG	2	10	81571	81580	20 %	0 %	40 %	40 %	479324003
61	NC_021056	CCCCG	2	10	82080	82089	0 %	0 %	20 %	80 %	479324003
62	NC_021056	CTCGG	2	10	82146	82155	0 %	20 %	40 %	40 %	479324003
63	NC_021056	GAACG	2	10	83605	83614	40 %	0 %	40 %	20 %	479324005
64	NC_021056	TCGGT	2	10	83943	83952	0 %	40 %	40 %	20 %	479324005
65	NC_021056	CGTCC	2	10	86234	86243	0 %	20 %	20 %	60 %	479324006
66	NC_021056	CCGGC	2	10	87647	87656	0 %	0 %	40 %	60 %	479324007
67	NC_021056	CGAAC	2	10	88462	88471	40 %	0 %	20 %	40 %	479324007
68	NC_021056	GCGGT	2	10	89794	89803	0 %	20 %	60 %	20 %	479324007
69	NC_021056	CTGAC	2	10	89871	89880	20 %	20 %	20 %	40 %	479324008
70	NC_021056	GGCAA	2	10	93061	93070	40 %	0 %	40 %	20 %	479324009
71	NC_021056	GGCTG	2	10	93229	93238	0 %	20 %	60 %	20 %	479324009
72	NC_021056	CGTCC	2	10	93691	93700	0 %	20 %	20 %	60 %	479324009
73	NC_021056	CCGTG	2	10	96982	96991	0 %	20 %	40 %	40 %	479324010
74	NC_021056	TGGCA	2	10	97155	97164	20 %	20 %	40 %	20 %	479324010
75	NC_021056	CGCGG	2	10	97537	97546	0 %	0 %	60 %	40 %	479324011
76	NC_021056	GCACC	2	10	97832	97841	20 %	0 %	20 %	60 %	479324011
77	NC_021056	CCGGC	2	10	99689	99698	0 %	0 %	40 %	60 %	479324013
78	NC_021056	CGGCC	2	10	102599	102608	0 %	0 %	40 %	60 %	479324017
79	NC_021056	GATGC	2	10	103132	103141	20 %	20 %	40 %	20 %	479324017
80	NC_021056	AACGC	2	10	103458	103467	40 %	0 %	20 %	40 %	479324018

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.