MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptomyces sp. PAMC26508 plasmid pSP01

Total Repeats: 2122

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_021056	GCC	2	6	98038	98043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479324011
2002	NC_021056	ACC	2	6	98065	98070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479324011
2003	NC_021056	GAC	2	6	98163	98168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479324012
2004	NC_021056	GC	3	6	98173	98178	0 %	0 %	50 %	50 %	479324012
2005	NC_021056	CG	3	6	98206	98211	0 %	0 %	50 %	50 %	479324012
2006	NC_021056	CCAG	2	8	98221	98228	25 %	0 %	25 %	50 %	479324012
2007	NC_021056	CGA	2	6	98261	98266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479324012
2008	NC_021056	CTG	2	6	98271	98276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479324012
2009	NC_021056	GAA	2	6	98303	98308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479324012
2010	NC_021056	CGC	2	6	98324	98329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479324012
2011	NC_021056	TCGA	2	8	98352	98359	25 %	25 %	25 %	25 %	479324012
2012	NC_021056	CGA	2	6	98384	98389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479324012
2013	NC_021056	GGAGCC	2	12	98456	98467	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	479324012
2014	NC_021056	GCCAAG	2	12	98586	98597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479324012
2015	NC_021056	CAC	2	6	98613	98618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479324012
2016	NC_021056	CCG	2	6	98659	98664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479324012
2017	NC_021056	CGC	2	6	98678	98683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479324012
2018	NC_021056	TAC	2	6	98736	98741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479324012
2019	NC_021056	GAC	2	6	98751	98756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479324012
2020	NC_021056	GAG	2	6	98769	98774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479324012
2021	NC_021056	TCG	2	6	98811	98816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479324012
2022	NC_021056	GCC	2	6	98832	98837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479324012
2023	NC_021056	CGC	2	6	98855	98860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479324012
2024	NC_021056	CAC	2	6	98897	98902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479324012
2025	NC_021056	GCG	2	6	98909	98914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479324012
2026	NC_021056	CAC	2	6	98982	98987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479324012
2027	NC_021056	CAC	2	6	99020	99025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479324012
2028	NC_021056	CGA	2	6	99146	99151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479324012
2029	NC_021056	TCG	2	6	99241	99246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479324012
2030	NC_021056	G	6	6	99333	99338	0 %	0 %	100 %	0 %	479324013
2031	NC_021056	CG	3	6	99343	99348	0 %	0 %	50 %	50 %	479324013
2032	NC_021056	CAC	2	6	99361	99366	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479324013
2033	NC_021056	CGC	2	6	99406	99411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479324013
2034	NC_021056	CGA	2	6	99433	99438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479324013
2035	NC_021056	GATC	2	8	99481	99488	25 %	25 %	25 %	25 %	479324013
2036	NC_021056	TCG	2	6	99588	99593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479324013
2037	NC_021056	CCG	2	6	99594	99599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479324013
2038	NC_021056	CCGGC	2	10	99689	99698	0 %	0 %	40 %	60 %	479324013
2039	NC_021056	GCC	2	6	99725	99730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479324013
2040	NC_021056	CGG	2	6	99793	99798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479324013
2041	NC_021056	CGGA	2	8	99800	99807	25 %	0 %	50 %	25 %	479324013
2042	NC_021056	AC	3	6	99861	99866	50 %	0 %	0 %	50 %	479324013
2043	NC_021056	GCC	2	6	99890	99895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479324013
2044	NC_021056	CCG	2	6	99901	99906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479324013
2045	NC_021056	GCA	2	6	99918	99923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479324013
2046	NC_021056	GCT	2	6	100065	100070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479324014
2047	NC_021056	CTTC	2	8	100106	100113	0 %	50 %	0 %	50 %	479324014
2048	NC_021056	GCT	2	6	100119	100124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479324014
2049	NC_021056	GTG	2	6	100207	100212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479324014
2050	NC_021056	CCGG	2	8	100221	100228	0 %	0 %	50 %	50 %	479324014
2051	NC_021056	TCG	2	6	100241	100246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479324014
2052	NC_021056	CGC	2	6	100263	100268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479324014
2053	NC_021056	CCA	2	6	100271	100276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479324014
2054	NC_021056	GCC	2	6	100298	100303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479324014
2055	NC_021056	CCA	2	6	100374	100379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479324014
2056	NC_021056	CGA	2	6	100395	100400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479324014
2057	NC_021056	CCA	2	6	100403	100408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479324014
2058	NC_021056	CCGA	2	8	100499	100506	25 %	0 %	25 %	50 %	479324014
2059	NC_021056	AC	4	8	100528	100535	50 %	0 %	0 %	50 %	479324014
2060	NC_021056	CAC	2	6	100546	100551	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479324014
2061	NC_021056	CGAT	2	8	100554	100561	25 %	25 %	25 %	25 %	479324014
2062	NC_021056	GC	3	6	100584	100589	0 %	0 %	50 %	50 %	479324014
2063	NC_021056	GTCACC	2	12	100654	100665	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	479324014
2064	NC_021056	AAGGCG	2	12	100732	100743	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	479324014
2065	NC_021056	CAG	2	6	100781	100786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479324014
2066	NC_021056	TGA	2	6	100794	100799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479324015
2067	NC_021056	CGC	2	6	100811	100816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479324015
2068	NC_021056	CGT	2	6	100885	100890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479324015
2069	NC_021056	CCG	2	6	100914	100919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479324015
2070	NC_021056	CAC	2	6	100933	100938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479324015
2071	NC_021056	CTC	2	6	100970	100975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479324015
2072	NC_021056	CCA	2	6	100996	101001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479324015
2073	NC_021056	GCC	2	6	101030	101035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479324015
2074	NC_021056	CTG	2	6	101038	101043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479324015
2075	NC_021056	CTA	2	6	101065	101070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479324015
2076	NC_021056	CGG	2	6	101074	101079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479324015
2077	NC_021056	CTC	2	6	101222	101227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479324015
2078	NC_021056	GCC	2	6	101238	101243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479324015
2079	NC_021056	GCC	2	6	101298	101303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479324015
2080	NC_021056	CAG	2	6	101323	101328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479324015
2081	NC_021056	GCC	2	6	101360	101365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479324015
2082	NC_021056	GTC	2	6	101393	101398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479324015
2083	NC_021056	CGAGGA	2	12	101524	101535	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	479324015
2084	NC_021056	CCG	2	6	101554	101559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479324015
2085	NC_021056	CCT	2	6	101590	101595	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479324015
2086	NC_021056	CTC	3	9	101624	101632	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479324015
2087	NC_021056	ACGA	2	8	101660	101667	50 %	0 %	25 %	25 %	479324015
2088	NC_021056	CGT	2	6	101677	101682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479324015
2089	NC_021056	GAC	2	6	101761	101766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479324015
2090	NC_021056	GCTG	2	8	101825	101832	0 %	25 %	50 %	25 %	479324016
2091	NC_021056	CCG	2	6	101843	101848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479324016
2092	NC_021056	TCG	2	6	101855	101860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479324016
2093	NC_021056	CGCA	2	8	101871	101878	25 %	0 %	25 %	50 %	479324016
2094	NC_021056	CTG	2	6	101887	101892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479324016
2095	NC_021056	CAC	2	6	101943	101948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479324016
2096	NC_021056	AAC	2	6	101950	101955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479324016
2097	NC_021056	CCG	2	6	102027	102032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479324016
2098	NC_021056	CGT	2	6	102097	102102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479324016
2099	NC_021056	CGG	2	6	102112	102117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479324016
2100	NC_021056	GTC	2	6	102301	102306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479324017
2101	NC_021056	GTA	2	6	102307	102312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479324017
2102	NC_021056	CTG	2	6	102397	102402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479324017
2103	NC_021056	CTT	2	6	102457	102462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479324017
2104	NC_021056	CGG	2	6	102463	102468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479324017
2105	NC_021056	CCG	2	6	102579	102584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479324017
2106	NC_021056	CGGCC	2	10	102599	102608	0 %	0 %	40 %	60 %	479324017
2107	NC_021056	TGA	2	6	102648	102653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479324017
2108	NC_021056	CTT	2	6	102661	102666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479324017
2109	NC_021056	CGG	2	6	102701	102706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479324017
2110	NC_021056	CG	3	6	102773	102778	0 %	0 %	50 %	50 %	479324017
2111	NC_021056	GCGG	2	8	102861	102868	0 %	0 %	75 %	25 %	479324017
2112	NC_021056	TGG	2	6	102891	102896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479324017
2113	NC_021056	CCTC	2	8	103007	103014	0 %	25 %	0 %	75 %	479324017
2114	NC_021056	GATGC	2	10	103132	103141	20 %	20 %	40 %	20 %	479324017
2115	NC_021056	GACG	2	8	103162	103169	25 %	0 %	50 %	25 %	479324017
2116	NC_021056	CAC	2	6	103298	103303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479324018
2117	NC_021056	CGT	2	6	103314	103319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479324018
2118	NC_021056	CCA	2	6	103333	103338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479324018
2119	NC_021056	CGG	3	9	103388	103396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479324018
2120	NC_021056	CAC	2	6	103417	103422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479324018
2121	NC_021056	AACGC	2	10	103458	103467	40 %	0 %	20 %	40 %	479324018
2122	NC_021056	CGA	2	6	103500	103505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479324018

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.