MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034183 draft genome

Total Repeats: 1137

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021028	AAAAG	2	10	530	539	80 %	0 %	20 %	0 %	480535789
2	NC_021028	GAAAT	2	10	691	700	60 %	20 %	20 %	0 %	480535789
3	NC_021028	AAAAT	2	10	1473	1482	80 %	20 %	0 %	0 %	480535789
4	NC_021028	GTAAA	2	10	2631	2640	60 %	20 %	20 %	0 %	480535790
5	NC_021028	AAAAT	2	10	3018	3027	80 %	20 %	0 %	0 %	480535791
6	NC_021028	AAACA	2	10	4420	4429	80 %	0 %	0 %	20 %	480535793
7	NC_021028	TCAAT	2	10	6047	6056	40 %	40 %	0 %	20 %	480535794
8	NC_021028	TTTTC	2	10	6087	6096	0 %	80 %	0 %	20 %	480535794
9	NC_021028	TAAAT	2	10	6605	6614	60 %	40 %	0 %	0 %	480535794
10	NC_021028	ACTCT	2	10	6686	6695	20 %	40 %	0 %	40 %	480535794
11	NC_021028	AAACG	2	10	7929	7938	60 %	0 %	20 %	20 %	480535794
12	NC_021028	TTGGT	2	10	8158	8167	0 %	60 %	40 %	0 %	480535794
13	NC_021028	CAATT	2	10	8227	8236	40 %	40 %	0 %	20 %	480535794
14	NC_021028	AGGAA	2	10	9243	9252	60 %	0 %	40 %	0 %	480535797
15	NC_021028	ATTGA	2	10	10661	10670	40 %	40 %	20 %	0 %	480535799
16	NC_021028	ATTCT	2	10	12794	12803	20 %	60 %	0 %	20 %	480535801
17	NC_021028	ATGGT	2	10	22450	22459	20 %	40 %	40 %	0 %	480535804
18	NC_021028	TAGAT	2	10	30898	30907	40 %	40 %	20 %	0 %	480535819
19	NC_021028	CTTAT	2	10	31406	31415	20 %	60 %	0 %	20 %	480535821
20	NC_021028	CAGAA	2	10	34286	34295	60 %	0 %	20 %	20 %	480535827
21	NC_021028	TTTTG	2	10	34536	34545	0 %	80 %	20 %	0 %	480535828
22	NC_021028	GAATG	2	10	34625	34634	40 %	20 %	40 %	0 %	480535828
23	NC_021028	GAAAC	2	10	38320	38329	60 %	0 %	20 %	20 %	480535833
24	NC_021028	TCTAA	2	10	38663	38672	40 %	40 %	0 %	20 %	480535833
25	NC_021028	CTCTT	2	10	39284	39293	0 %	60 %	0 %	40 %	480535833
26	NC_021028	AGTTG	2	10	40108	40117	20 %	40 %	40 %	0 %	480535835
27	NC_021028	ACAAG	2	10	40486	40495	60 %	0 %	20 %	20 %	480535835
28	NC_021028	GGGTG	2	10	41696	41705	0 %	20 %	80 %	0 %	480535837
29	NC_021028	CCTAT	2	10	42017	42026	20 %	40 %	0 %	40 %	480535838
30	NC_021028	ATGAC	2	10	42743	42752	40 %	20 %	20 %	20 %	480535841
31	NC_021028	AGCTG	2	10	45831	45840	20 %	20 %	40 %	20 %	480535843
32	NC_021028	GGTCA	2	10	47640	47649	20 %	20 %	40 %	20 %	480535844
33	NC_021028	AATCA	2	10	64699	64708	60 %	20 %	0 %	20 %	480535861
34	NC_021028	AGCAG	2	10	65370	65379	40 %	0 %	40 %	20 %	480535862
35	NC_021028	TTGAT	2	10	72808	72817	20 %	60 %	20 %	0 %	480535867
36	NC_021028	CAGAT	2	10	75003	75012	40 %	20 %	20 %	20 %	480535869
37	NC_021028	TTTAC	2	10	75705	75714	20 %	60 %	0 %	20 %	480535869
38	NC_021028	GTGAC	2	10	79336	79345	20 %	20 %	40 %	20 %	480535872
39	NC_021028	GTGAT	2	10	80326	80335	20 %	40 %	40 %	0 %	480535872
40	NC_021028	TGGCT	2	10	83146	83155	0 %	40 %	40 %	20 %	480535873
41	NC_021028	AAATG	2	10	83752	83761	60 %	20 %	20 %	0 %	480535873
42	NC_021028	AGCTA	2	10	84646	84655	40 %	20 %	20 %	20 %	480535874
43	NC_021028	CCTTG	2	10	87536	87545	0 %	40 %	20 %	40 %	480535877
44	NC_021028	TCAAA	2	10	87730	87739	60 %	20 %	0 %	20 %	480535877
45	NC_021028	GCAAG	2	10	89399	89408	40 %	0 %	40 %	20 %	480535878
46	NC_021028	AGTGG	2	10	90097	90106	20 %	20 %	60 %	0 %	480535879
47	NC_021028	GGGTG	2	10	90135	90144	0 %	20 %	80 %	0 %	480535879
48	NC_021028	CTATT	2	10	91111	91120	20 %	60 %	0 %	20 %	480535880
49	NC_021028	GAAGC	2	10	91301	91310	40 %	0 %	40 %	20 %	480535880
50	NC_021028	GCTTG	2	10	91756	91765	0 %	40 %	40 %	20 %	480535882
51	NC_021028	GCTTT	2	10	93185	93194	0 %	60 %	20 %	20 %	480535883
52	NC_021028	TCTGG	2	10	93779	93788	0 %	40 %	40 %	20 %	480535883
53	NC_021028	AGCAT	2	10	94733	94742	40 %	20 %	20 %	20 %	480535883
54	NC_021028	TACCA	2	10	95431	95440	40 %	20 %	0 %	40 %	480535883
55	NC_021028	TTCCT	2	10	96448	96457	0 %	60 %	0 %	40 %	480535883
56	NC_021028	TTGGT	2	10	100404	100413	0 %	60 %	40 %	0 %	480535886
57	NC_021028	CTTCA	2	10	101459	101468	20 %	40 %	0 %	40 %	480535887
58	NC_021028	AATCA	2	10	101571	101580	60 %	20 %	0 %	20 %	480535888
59	NC_021028	AGCTC	2	10	103789	103798	20 %	20 %	20 %	40 %	480535890
60	NC_021028	GCTCC	2	10	108024	108033	0 %	20 %	20 %	60 %	480535895
61	NC_021028	GCTGT	2	10	108342	108351	0 %	40 %	40 %	20 %	480535895
62	NC_021028	TCTAT	2	10	109500	109509	20 %	60 %	0 %	20 %	480535896
63	NC_021028	AGAAA	2	10	110425	110434	80 %	0 %	20 %	0 %	480535896
64	NC_021028	TGACT	2	10	113471	113480	20 %	40 %	20 %	20 %	480535898
65	NC_021028	AGGGC	2	10	116906	116915	20 %	0 %	60 %	20 %	480535900
66	NC_021028	ATTCT	2	10	119475	119484	20 %	60 %	0 %	20 %	480535902
67	NC_021028	TTACT	2	10	123118	123127	20 %	60 %	0 %	20 %	480535905
68	NC_021028	TGGGA	2	10	123772	123781	20 %	20 %	60 %	0 %	480535905
69	NC_021028	TGCTT	2	10	124645	124654	0 %	60 %	20 %	20 %	480535906
70	NC_021028	TGGCT	2	10	124828	124837	0 %	40 %	40 %	20 %	480535906
71	NC_021028	AGATA	2	10	128900	128909	60 %	20 %	20 %	0 %	480535911
72	NC_021028	GTTTG	2	10	129067	129076	0 %	60 %	40 %	0 %	480535911
73	NC_021028	TATTT	2	10	131016	131025	20 %	80 %	0 %	0 %	480535913
74	NC_021028	AAAGC	2	10	133926	133935	60 %	0 %	20 %	20 %	480535915
75	NC_021028	CACAA	2	10	135689	135698	60 %	0 %	0 %	40 %	480535917
76	NC_021028	GGAAT	2	10	138596	138605	40 %	20 %	40 %	0 %	480535920
77	NC_021028	AGGAT	2	10	139161	139170	40 %	20 %	40 %	0 %	480535921
78	NC_021028	CTTTG	2	10	140470	140479	0 %	60 %	20 %	20 %	480535921
79	NC_021028	GGCTT	2	10	140723	140732	0 %	40 %	40 %	20 %	480535921
80	NC_021028	ACAGT	2	10	150295	150304	40 %	20 %	20 %	20 %	480535928
81	NC_021028	AATAA	2	10	151039	151048	80 %	20 %	0 %	0 %	480535929
82	NC_021028	ATTTT	2	10	153419	153428	20 %	80 %	0 %	0 %	480535933
83	NC_021028	CAAAG	2	10	158670	158679	60 %	0 %	20 %	20 %	480535938
84	NC_021028	ACTAA	2	10	160674	160683	60 %	20 %	0 %	20 %	480535942
85	NC_021028	CGTGG	2	10	163522	163531	0 %	20 %	60 %	20 %	480535943
86	NC_021028	GTGAA	2	10	164524	164533	40 %	20 %	40 %	0 %	480535944
87	NC_021028	AAGCA	2	10	168169	168178	60 %	0 %	20 %	20 %	480535946
88	NC_021028	TTGGA	2	10	170451	170460	20 %	40 %	40 %	0 %	480535950
89	NC_021028	GTCTA	2	10	170582	170591	20 %	40 %	20 %	20 %	480535950
90	NC_021028	TTAGT	2	10	184150	184159	20 %	60 %	20 %	0 %	480535957
91	NC_021028	CTTGC	2	10	184506	184515	0 %	40 %	20 %	40 %	480535957
92	NC_021028	GGCCT	2	10	185460	185469	0 %	20 %	40 %	40 %	480535958
93	NC_021028	CTGTT	2	10	186028	186037	0 %	60 %	20 %	20 %	480535958
94	NC_021028	AGAAA	2	10	187564	187573	80 %	0 %	20 %	0 %	480535961
95	NC_021028	TATAC	2	10	189525	189534	40 %	40 %	0 %	20 %	480535962
96	NC_021028	AGATC	2	10	189830	189839	40 %	20 %	20 %	20 %	480535963
97	NC_021028	TGGTC	2	10	190918	190927	0 %	40 %	40 %	20 %	480535964
98	NC_021028	TTTGT	2	10	191839	191848	0 %	80 %	20 %	0 %	480535965
99	NC_021028	ACTAT	2	10	195845	195854	40 %	40 %	0 %	20 %	480535968
100	NC_021028	TTGAG	2	10	198425	198434	20 %	40 %	40 %	0 %	480535971
101	NC_021028	GCCTT	2	10	200399	200408	0 %	40 %	20 %	40 %	480535974
102	NC_021028	AAGTA	2	10	203181	203190	60 %	20 %	20 %	0 %	480535976
103	NC_021028	TTGAT	2	10	204340	204349	20 %	60 %	20 %	0 %	480535977
104	NC_021028	TCACT	2	10	204715	204724	20 %	40 %	0 %	40 %	480535978
105	NC_021028	ATTTT	2	10	205038	205047	20 %	80 %	0 %	0 %	480535978
106	NC_021028	TTAAG	2	10	205390	205399	40 %	40 %	20 %	0 %	480535978
107	NC_021028	TCAGG	2	10	206305	206314	20 %	20 %	40 %	20 %	480535979
108	NC_021028	GCCTT	2	10	207919	207928	0 %	40 %	20 %	40 %	480535981
109	NC_021028	TTCCC	2	10	208493	208502	0 %	40 %	0 %	60 %	480535982
110	NC_021028	TCTCT	2	10	212040	212049	0 %	60 %	0 %	40 %	480535985
111	NC_021028	GAAAG	2	10	214056	214065	60 %	0 %	40 %	0 %	480535985
112	NC_021028	AGTTA	2	10	215336	215345	40 %	40 %	20 %	0 %	480535987
113	NC_021028	AAATC	2	10	216568	216577	60 %	20 %	0 %	20 %	480535989
114	NC_021028	GCAGA	2	10	218234	218243	40 %	0 %	40 %	20 %	480535992
115	NC_021028	AAGGA	2	10	218496	218505	60 %	0 %	40 %	0 %	480535992
116	NC_021028	GTAGA	2	10	221417	221426	40 %	20 %	40 %	0 %	480535995
117	NC_021028	TTTAG	2	10	221902	221911	20 %	60 %	20 %	0 %	480535995
118	NC_021028	CTTTT	2	10	222376	222385	0 %	80 %	0 %	20 %	480535995
119	NC_021028	GTCTG	2	10	222853	222862	0 %	40 %	40 %	20 %	480535995
120	NC_021028	AGCAG	2	10	225882	225891	40 %	0 %	40 %	20 %	480535998
121	NC_021028	GGGAG	2	10	226221	226230	20 %	0 %	80 %	0 %	480535999
122	NC_021028	CCTTG	2	10	226823	226832	0 %	40 %	20 %	40 %	480536000
123	NC_021028	ACTTA	2	10	227163	227172	40 %	40 %	0 %	20 %	480536000
124	NC_021028	TACAC	2	10	229827	229836	40 %	20 %	0 %	40 %	480536005
125	NC_021028	TTTGG	2	10	230972	230981	0 %	60 %	40 %	0 %	480536007
126	NC_021028	TTCAC	2	10	231328	231337	20 %	40 %	0 %	40 %	480536008
127	NC_021028	GACAA	2	10	232499	232508	60 %	0 %	20 %	20 %	480536011
128	NC_021028	TCCAA	2	10	238223	238232	40 %	20 %	0 %	40 %	480536022
129	NC_021028	ACAGA	2	10	238789	238798	60 %	0 %	20 %	20 %	480536022
130	NC_021028	GAGAT	2	10	243140	243149	40 %	20 %	40 %	0 %	480536030
131	NC_021028	ATTCC	2	10	243158	243167	20 %	40 %	0 %	40 %	480536030
132	NC_021028	TGGTG	2	10	243414	243423	0 %	40 %	60 %	0 %	480536030
133	NC_021028	TCTGT	2	10	243833	243842	0 %	60 %	20 %	20 %	480536030
134	NC_021028	TGGAT	2	10	243843	243852	20 %	40 %	40 %	0 %	480536030
135	NC_021028	AAGAT	2	10	245346	245355	60 %	20 %	20 %	0 %	480536032
136	NC_021028	ATACC	2	10	245826	245835	40 %	20 %	0 %	40 %	480536032
137	NC_021028	AAGTC	2	10	251040	251049	40 %	20 %	20 %	20 %	480536037
138	NC_021028	TTAAT	2	10	252592	252601	40 %	60 %	0 %	0 %	480536039
139	NC_021028	GTTTG	2	10	253414	253423	0 %	60 %	40 %	0 %	480536041
140	NC_021028	GCCAT	2	10	257512	257521	20 %	20 %	20 %	40 %	480536043
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142	NC_021028	GCAAC	2	10	259806	259815	40 %	0 %	20 %	40 %	480536045
143	NC_021028	ACAGA	2	10	262961	262970	60 %	0 %	20 %	20 %	480536046
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145	NC_021028	TTTTG	2	10	270961	270970	0 %	80 %	20 %	0 %	480536052
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149	NC_021028	AAGAC	2	10	277087	277096	60 %	0 %	20 %	20 %	480536055
150	NC_021028	TGAAG	2	10	277208	277217	40 %	20 %	40 %	0 %	480536055
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155	NC_021028	GTCTG	2	10	286521	286530	0 %	40 %	40 %	20 %	480536059
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164	NC_021028	ATTAG	2	10	295197	295206	40 %	40 %	20 %	0 %	480536070
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167	NC_021028	TGATT	2	10	298537	298546	20 %	60 %	20 %	0 %	480536072
168	NC_021028	TCATG	2	10	298918	298927	20 %	40 %	20 %	20 %	480536072
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248	NC_021028	CTTTT	2	10	430931	430940	0 %	80 %	0 %	20 %	480536187
249	NC_021028	TGTAG	2	10	431716	431725	20 %	40 %	40 %	0 %	480536188
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253	NC_021028	TTCAC	2	10	439422	439431	20 %	40 %	0 %	40 %	480536192
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256	NC_021028	CATAG	2	10	444947	444956	40 %	20 %	20 %	20 %	480536195
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259	NC_021028	GTCAG	2	10	450052	450061	20 %	20 %	40 %	20 %	480536199
260	NC_021028	TGGAT	2	10	452348	452357	20 %	40 %	40 %	0 %	480536201
261	NC_021028	ATGGT	2	10	455592	455601	20 %	40 %	40 %	0 %	480536206
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