MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034183 draft genome

Total Repeats: 32631

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_021028	TTC	2	6	249231	249236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536035
4003	NC_021028	AT	3	6	249398	249403	50 %	50 %	0 %	0 %	480536035
4004	NC_021028	TGG	2	6	249511	249516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536036
4005	NC_021028	TCCA	2	8	249570	249577	25 %	25 %	0 %	50 %	480536036
4006	NC_021028	TAA	2	6	249594	249599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536036
4007	NC_021028	TGA	2	6	249622	249627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536036
4008	NC_021028	AGT	2	6	249634	249639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536036
4009	NC_021028	AATG	2	8	249764	249771	50 %	25 %	25 %	0 %	480536036
4010	NC_021028	TAA	2	6	249776	249781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536036
4011	NC_021028	T	6	6	249807	249812	0 %	100 %	0 %	0 %	480536036
4012	NC_021028	CAA	2	6	249893	249898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536036
4013	NC_021028	AGT	2	6	249903	249908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536036
4014	NC_021028	GT	3	6	249919	249924	0 %	50 %	50 %	0 %	480536036
4015	NC_021028	CCT	2	6	249988	249993	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480536036
4016	NC_021028	TTC	2	6	250017	250022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536036
4017	NC_021028	TAA	2	6	250052	250057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536036
4018	NC_021028	TCT	2	6	250060	250065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536036
4019	NC_021028	TTC	2	6	250074	250079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536036
4020	NC_021028	TC	3	6	250097	250102	0 %	50 %	0 %	50 %	480536036
4021	NC_021028	T	6	6	250118	250123	0 %	100 %	0 %	0 %	480536036
4022	NC_021028	A	7	7	250186	250192	100 %	0 %	0 %	0 %	480536036
4023	NC_021028	AAT	2	6	250245	250250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536036
4024	NC_021028	ATT	2	6	250408	250413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536037
4025	NC_021028	TTA	2	6	250522	250527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536037
4026	NC_021028	AG	3	6	250531	250536	50 %	0 %	50 %	0 %	480536037
4027	NC_021028	AATT	2	8	250587	250594	50 %	50 %	0 %	0 %	480536037
4028	NC_021028	AAT	2	6	250653	250658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536037
4029	NC_021028	GCAA	2	8	250703	250710	50 %	0 %	25 %	25 %	480536037
4030	NC_021028	A	6	6	250709	250714	100 %	0 %	0 %	0 %	480536037
4031	NC_021028	T	6	6	250741	250746	0 %	100 %	0 %	0 %	480536037
4032	NC_021028	TGG	2	6	250794	250799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536037
4033	NC_021028	TTA	2	6	250837	250842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536037
4034	NC_021028	TG	3	6	250866	250871	0 %	50 %	50 %	0 %	480536037
4035	NC_021028	TTG	2	6	250880	250885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536037
4036	NC_021028	AT	3	6	250953	250958	50 %	50 %	0 %	0 %	480536037
4037	NC_021028	CAG	2	6	250961	250966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536037
4038	NC_021028	AAG	2	6	251025	251030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536037
4039	NC_021028	AAGTC	2	10	251040	251049	40 %	20 %	20 %	20 %	480536037
4040	NC_021028	TAA	2	6	251057	251062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536037
4041	NC_021028	TAT	2	6	251194	251199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536038
4042	NC_021028	AGC	2	6	251226	251231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536038
4043	NC_021028	TAG	2	6	251259	251264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536038
4044	NC_021028	ATT	2	6	251383	251388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536038
4045	NC_021028	TGA	2	6	251400	251405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536038
4046	NC_021028	CAA	2	6	251411	251416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536038
4047	NC_021028	GCA	2	6	251443	251448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536038
4048	NC_021028	TGA	2	6	251469	251474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536038
4049	NC_021028	TAG	2	6	251519	251524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536038
4050	NC_021028	GGT	2	6	251575	251580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536038
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4052	NC_021028	TGT	2	6	251875	251880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536038
4053	NC_021028	T	6	6	251884	251889	0 %	100 %	0 %	0 %	480536038
4054	NC_021028	AAG	2	6	251903	251908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536038
4055	NC_021028	A	6	6	251958	251963	100 %	0 %	0 %	0 %	480536038
4056	NC_021028	TTCT	2	8	252014	252021	0 %	75 %	0 %	25 %	480536038
4057	NC_021028	GAA	2	6	252085	252090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536038
4058	NC_021028	AG	3	6	252109	252114	50 %	0 %	50 %	0 %	480536038
4059	NC_021028	GTGA	2	8	252122	252129	25 %	25 %	50 %	0 %	480536038
4060	NC_021028	ATT	2	6	252330	252335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536039
4061	NC_021028	ACA	2	6	252386	252391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536039
4062	NC_021028	GAA	3	9	252441	252449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536039
4063	NC_021028	GCC	2	6	252465	252470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	480536039
4064	NC_021028	TTA	2	6	252471	252476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536039
4065	NC_021028	ACAA	2	8	252491	252498	75 %	0 %	0 %	25 %	480536039
4066	NC_021028	CT	3	6	252544	252549	0 %	50 %	0 %	50 %	480536039
4067	NC_021028	TTCA	2	8	252553	252560	25 %	50 %	0 %	25 %	480536039
4068	NC_021028	ATC	2	6	252565	252570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536039
4069	NC_021028	TTAAT	2	10	252592	252601	40 %	60 %	0 %	0 %	480536039
4070	NC_021028	ATT	2	6	252609	252614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536039
4071	NC_021028	A	6	6	252636	252641	100 %	0 %	0 %	0 %	480536039
4072	NC_021028	GTTT	2	8	252703	252710	0 %	75 %	25 %	0 %	480536040
4073	NC_021028	GCA	2	6	252714	252719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536040
4074	NC_021028	ATA	2	6	252745	252750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536040
4075	NC_021028	GAT	2	6	252929	252934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536040
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4077	NC_021028	TAT	2	6	253011	253016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536041
4078	NC_021028	GATG	2	8	253023	253030	25 %	25 %	50 %	0 %	480536041
4079	NC_021028	GAT	2	6	253050	253055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536041
4080	NC_021028	AGT	2	6	253122	253127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536041
4081	NC_021028	TAT	2	6	253248	253253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536041
4082	NC_021028	TATCTG	2	12	253331	253342	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	480536041
4083	NC_021028	ATC	2	6	253362	253367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536041
4084	NC_021028	GTTTG	2	10	253414	253423	0 %	60 %	40 %	0 %	480536041
4085	NC_021028	GTA	2	6	253462	253467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536041
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4087	NC_021028	TTA	2	6	253505	253510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536041
4088	NC_021028	TCT	2	6	253585	253590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536041
4089	NC_021028	TA	3	6	253598	253603	50 %	50 %	0 %	0 %	480536041
4090	NC_021028	TGG	2	6	253735	253740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536041
4091	NC_021028	GTA	2	6	253762	253767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536041
4092	NC_021028	AGT	2	6	253773	253778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536041
4093	NC_021028	TAA	2	6	253809	253814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536041
4094	NC_021028	CAA	2	6	253870	253875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536041
4095	NC_021028	GCA	2	6	253945	253950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536041
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4100	NC_021028	A	6	6	254560	254565	100 %	0 %	0 %	0 %	480536042
4101	NC_021028	GA	3	6	254581	254586	50 %	0 %	50 %	0 %	480536042
4102	NC_021028	AAC	2	6	254624	254629	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536042
4103	NC_021028	AT	3	6	254649	254654	50 %	50 %	0 %	0 %	480536042
4104	NC_021028	GAAA	2	8	254658	254665	75 %	0 %	25 %	0 %	480536042
4105	NC_021028	TCTA	2	8	254680	254687	25 %	50 %	0 %	25 %	480536042
4106	NC_021028	GAA	3	9	254692	254700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536042
4107	NC_021028	CTT	2	6	254723	254728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536042
4108	NC_021028	AGA	2	6	254829	254834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536042
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4110	NC_021028	ATA	2	6	254876	254881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536042
4111	NC_021028	TTA	2	6	254905	254910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536042
4112	NC_021028	GAA	2	6	254914	254919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536042
4113	NC_021028	TTC	2	6	254944	254949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536042
4114	NC_021028	TTG	2	6	255158	255163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536042
4115	NC_021028	AAGA	2	8	255205	255212	75 %	0 %	25 %	0 %	480536042
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4118	NC_021028	AT	3	6	255360	255365	50 %	50 %	0 %	0 %	480536042
4119	NC_021028	AT	3	6	255372	255377	50 %	50 %	0 %	0 %	480536042
4120	NC_021028	AGA	2	6	255408	255413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536042
4121	NC_021028	TTG	2	6	255419	255424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536042
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4233	NC_021028	TC	3	6	261241	261246	0 %	50 %	0 %	50 %	480536045
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4242	NC_021028	TTG	2	6	261638	261643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536045
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4246	NC_021028	TTGG	2	8	262823	262830	0 %	50 %	50 %	0 %	480536046
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4367	NC_021028	CAGA	2	8	272446	272453	50 %	0 %	25 %	25 %	480536053
4368	NC_021028	GAA	3	9	272491	272499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536053
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4370	NC_021028	CAT	2	6	272538	272543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536053
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4373	NC_021028	ATG	2	6	272759	272764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536053
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4375	NC_021028	ACTTG	2	10	272799	272808	20 %	40 %	20 %	20 %	480536053
4376	NC_021028	TAC	2	6	272836	272841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536053
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4389	NC_021028	CT	3	6	273635	273640	0 %	50 %	0 %	50 %	480536053
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4392	NC_021028	CGA	2	6	273747	273752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536053
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4394	NC_021028	GCTG	2	8	274123	274130	0 %	25 %	50 %	25 %	480536054
4395	NC_021028	GGTT	2	8	274135	274142	0 %	50 %	50 %	0 %	480536054
4396	NC_021028	CT	3	6	274408	274413	0 %	50 %	0 %	50 %	480536054
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4490	NC_021028	GTG	2	6	279718	279723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536056
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