MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034183 draft genome

Total Repeats: 32631

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_021028	CTT	2	6	220850	220855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535994
3502	NC_021028	CTG	2	6	220857	220862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535994
3503	NC_021028	GGT	2	6	220933	220938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480535994
3504	NC_021028	CAAT	2	8	220944	220951	50 %	25 %	0 %	25 %	480535994
3505	NC_021028	AT	3	6	221043	221048	50 %	50 %	0 %	0 %	480535994
3506	NC_021028	GT	3	6	221408	221413	0 %	50 %	50 %	0 %	480535995
3507	NC_021028	GTAGA	2	10	221417	221426	40 %	20 %	40 %	0 %	480535995
3508	NC_021028	CAT	2	6	221482	221487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535995
3509	NC_021028	GTC	2	6	221498	221503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535995
3510	NC_021028	AAG	2	6	221591	221596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535995
3511	NC_021028	TCA	2	6	221625	221630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535995
3512	NC_021028	TAT	2	6	221653	221658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535995
3513	NC_021028	TAT	2	6	221677	221682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535995
3514	NC_021028	AGG	2	6	221748	221753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480535995
3515	NC_021028	T	6	6	221822	221827	0 %	100 %	0 %	0 %	480535995
3516	NC_021028	TGG	2	6	221853	221858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480535995
3517	NC_021028	TTTAG	2	10	221902	221911	20 %	60 %	20 %	0 %	480535995
3518	NC_021028	ATC	2	6	222000	222005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535995
3519	NC_021028	TTG	2	6	222037	222042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535995
3520	NC_021028	CTA	2	6	222135	222140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535995
3521	NC_021028	TGC	2	6	222144	222149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535995
3522	NC_021028	T	7	7	222241	222247	0 %	100 %	0 %	0 %	480535995
3523	NC_021028	TTG	2	6	222253	222258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535995
3524	NC_021028	CTTTT	2	10	222376	222385	0 %	80 %	0 %	20 %	480535995
3525	NC_021028	CTT	2	6	222404	222409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535995
3526	NC_021028	GTC	2	6	222418	222423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535995
3527	NC_021028	AGA	2	6	222487	222492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535995
3528	NC_021028	TTC	2	6	222529	222534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535995
3529	NC_021028	T	6	6	222588	222593	0 %	100 %	0 %	0 %	480535995
3530	NC_021028	CTAT	2	8	222680	222687	25 %	50 %	0 %	25 %	480535995
3531	NC_021028	GAT	2	6	222694	222699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535995
3532	NC_021028	TAA	2	6	222786	222791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535995
3533	NC_021028	GAAA	2	8	222807	222814	75 %	0 %	25 %	0 %	480535995
3534	NC_021028	AAC	2	6	222815	222820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535995
3535	NC_021028	GTCTG	2	10	222853	222862	0 %	40 %	40 %	20 %	480535995
3536	NC_021028	CAA	2	6	222892	222897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535995
3537	NC_021028	AGA	2	6	223073	223078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535996
3538	NC_021028	A	6	6	223078	223083	100 %	0 %	0 %	0 %	480535996
3539	NC_021028	CT	3	6	223099	223104	0 %	50 %	0 %	50 %	480535996
3540	NC_021028	TCG	2	6	223105	223110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535996
3541	NC_021028	CTGA	2	8	223227	223234	25 %	25 %	25 %	25 %	480535996
3542	NC_021028	GA	3	6	223233	223238	50 %	0 %	50 %	0 %	480535996
3543	NC_021028	ATT	2	6	223239	223244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535996
3544	NC_021028	GCTG	2	8	223337	223344	0 %	25 %	50 %	25 %	480535996
3545	NC_021028	CAA	2	6	223427	223432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535996
3546	NC_021028	TAA	2	6	223460	223465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535996
3547	NC_021028	CAG	2	6	223501	223506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535996
3548	NC_021028	TTG	2	6	223510	223515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535996
3549	NC_021028	AATC	2	8	223519	223526	50 %	25 %	0 %	25 %	480535996
3550	NC_021028	CCA	2	6	223562	223567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480535996
3551	NC_021028	CTG	2	6	223625	223630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535996
3552	NC_021028	TGAT	2	8	223633	223640	25 %	50 %	25 %	0 %	480535996
3553	NC_021028	AG	3	6	223688	223693	50 %	0 %	50 %	0 %	480535996
3554	NC_021028	AGA	2	6	223813	223818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535996
3555	NC_021028	AGA	2	6	223844	223849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535996
3556	NC_021028	GAA	2	6	223886	223891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535996
3557	NC_021028	CT	3	6	223945	223950	0 %	50 %	0 %	50 %	480535996
3558	NC_021028	AGGA	2	8	224128	224135	50 %	0 %	50 %	0 %	480535996
3559	NC_021028	TTG	2	6	224218	224223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535996
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3562	NC_021028	AGA	2	6	224420	224425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535996
3563	NC_021028	AGA	2	6	224522	224527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535996
3564	NC_021028	TCG	2	6	224552	224557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535996
3565	NC_021028	CAT	2	6	224660	224665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535996
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3567	NC_021028	TCTA	2	8	224721	224728	25 %	50 %	0 %	25 %	480535996
3568	NC_021028	TAC	2	6	224817	224822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535996
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3573	NC_021028	AGAA	2	8	225268	225275	75 %	0 %	25 %	0 %	480535996
3574	NC_021028	GC	3	6	225310	225315	0 %	0 %	50 %	50 %	480535997
3575	NC_021028	AAGA	2	8	225362	225369	75 %	0 %	25 %	0 %	480535997
3576	NC_021028	GCTT	2	8	225372	225379	0 %	50 %	25 %	25 %	480535997
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3579	NC_021028	ATG	2	6	225513	225518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535998
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3581	NC_021028	CAGGAA	2	12	225606	225617	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	480535998
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3590	NC_021028	CT	4	8	226068	226075	0 %	50 %	0 %	50 %	480535999
3591	NC_021028	CAG	2	6	226154	226159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535999
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3593	NC_021028	GGGAG	2	10	226221	226230	20 %	0 %	80 %	0 %	480535999
3594	NC_021028	GAA	2	6	226327	226332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535999
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3598	NC_021028	AG	3	6	226544	226549	50 %	0 %	50 %	0 %	480535999
3599	NC_021028	GAA	2	6	226553	226558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535999
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3603	NC_021028	AG	3	6	226813	226818	50 %	0 %	50 %	0 %	480536000
3604	NC_021028	CCTTG	2	10	226823	226832	0 %	40 %	20 %	40 %	480536000
3605	NC_021028	GAA	2	6	226860	226865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536000
3606	NC_021028	A	6	6	226957	226962	100 %	0 %	0 %	0 %	480536000
3607	NC_021028	GAG	2	6	226983	226988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480536000
3608	NC_021028	ATCA	2	8	227131	227138	50 %	25 %	0 %	25 %	480536000
3609	NC_021028	ACTTA	2	10	227163	227172	40 %	40 %	0 %	20 %	480536000
3610	NC_021028	CAAA	2	8	227438	227445	75 %	0 %	0 %	25 %	480536001
3611	NC_021028	A	7	7	227443	227449	100 %	0 %	0 %	0 %	480536001
3612	NC_021028	AC	3	6	227638	227643	50 %	0 %	0 %	50 %	480536001
3613	NC_021028	A	6	6	227675	227680	100 %	0 %	0 %	0 %	480536001
3614	NC_021028	TGA	2	6	227693	227698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536001
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3617	NC_021028	GTT	2	6	228058	228063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536002
3618	NC_021028	CAA	2	6	228141	228146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536002
3619	NC_021028	TGT	2	6	228270	228275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536002
3620	NC_021028	TAAAGG	2	12	228294	228305	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	480536002
3621	NC_021028	ACC	2	6	228368	228373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480536002
3622	NC_021028	GTC	2	6	228374	228379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536002
3623	NC_021028	GTG	2	6	228446	228451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536002
3624	NC_021028	GTT	2	6	228487	228492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536002
3625	NC_021028	CAG	2	6	228563	228568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536002
3626	NC_021028	ATA	2	6	228582	228587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536002
3627	NC_021028	ATT	2	6	228624	228629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536003
3628	NC_021028	AAG	2	6	228644	228649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536003
3629	NC_021028	GTT	2	6	228658	228663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536003
3630	NC_021028	ATC	2	6	228718	228723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536003
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3647	NC_021028	CAAG	2	8	229346	229353	50 %	0 %	25 %	25 %	480536004
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3653	NC_021028	AAT	2	6	229525	229530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536004
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3656	NC_021028	CAA	2	6	229620	229625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536005
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3662	NC_021028	TACAC	2	10	229827	229836	40 %	20 %	0 %	40 %	480536005
3663	NC_021028	CAT	2	6	229855	229860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536005
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3683	NC_021028	ATC	2	6	230924	230929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536007
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3710	NC_021028	A	6	6	232373	232378	100 %	0 %	0 %	0 %	480536010
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3727	NC_021028	A	6	6	232887	232892	100 %	0 %	0 %	0 %	480536012
3728	NC_021028	GTT	2	6	232899	232904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536012
3729	NC_021028	TCGT	2	8	232915	232922	0 %	50 %	25 %	25 %	480536012
3730	NC_021028	TCG	2	6	232937	232942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536012
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3732	NC_021028	ATC	2	6	232986	232991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536012
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3736	NC_021028	TGT	2	6	233239	233244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536013
3737	NC_021028	GGT	2	6	233336	233341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536013
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3741	NC_021028	ACA	2	6	233451	233456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536013
3742	NC_021028	A	6	6	233456	233461	100 %	0 %	0 %	0 %	480536013
3743	NC_021028	AGT	2	6	233541	233546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536014
3744	NC_021028	ACT	2	6	233570	233575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536014
3745	NC_021028	GCT	2	6	233665	233670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536014
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3748	NC_021028	GTG	2	6	233783	233788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536014
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3761	NC_021028	A	6	6	234757	234762	100 %	0 %	0 %	0 %	480536016
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3866	NC_021028	TCG	2	6	240291	240296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536025
3867	NC_021028	CGT	2	6	240358	240363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536025
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3871	NC_021028	CGT	2	6	240489	240494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536026
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3882	NC_021028	TCG	2	6	241007	241012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536027
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3885	NC_021028	A	6	6	241168	241173	100 %	0 %	0 %	0 %	480536027
3886	NC_021028	CTG	2	6	241198	241203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536027
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3893	NC_021028	TGA	2	6	241594	241599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536027
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3968	NC_021028	TAGG	2	8	245692	245699	25 %	25 %	50 %	0 %	480536032
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3972	NC_021028	T	7	7	245943	245949	0 %	100 %	0 %	0 %	480536032
3973	NC_021028	TGGA	2	8	245959	245966	25 %	25 %	50 %	0 %	480536032
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3977	NC_021028	GCT	2	6	246181	246186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536033
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3979	NC_021028	GCT	2	6	246259	246264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536033
3980	NC_021028	TGA	2	6	246413	246418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536033
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3982	NC_021028	CATA	2	8	246524	246531	50 %	25 %	0 %	25 %	480536033
3983	NC_021028	T	6	6	246774	246779	0 %	100 %	0 %	0 %	480536034
3984	NC_021028	TTC	3	9	246886	246894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536034
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3986	NC_021028	CTC	2	6	247057	247062	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480536034
3987	NC_021028	ATA	2	6	247151	247156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536034
3988	NC_021028	TTG	2	6	247228	247233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536034
3989	NC_021028	CTT	3	9	247281	247289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536034
3990	NC_021028	GAG	2	6	247402	247407	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480536034
3991	NC_021028	GTT	3	9	247449	247457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536034
3992	NC_021028	CCA	2	6	247460	247465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480536034
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3994	NC_021028	TTC	2	6	247543	247548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536034
3995	NC_021028	CTT	2	6	247558	247563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536034
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3997	NC_021028	ATC	2	6	247678	247683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536034
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