MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034183 draft genome

Total Repeats: 32631

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_021028	AAC	2	6	190528	190533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535963
3002	NC_021028	TGAA	2	8	190681	190688	50 %	25 %	25 %	0 %	480535963
3003	NC_021028	TGG	3	9	190768	190776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480535963
3004	NC_021028	AGC	2	6	190793	190798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535963
3005	NC_021028	AAG	2	6	190813	190818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535963
3006	NC_021028	GGA	2	6	190857	190862	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480535963
3007	NC_021028	TGGTC	2	10	190918	190927	0 %	40 %	40 %	20 %	480535964
3008	NC_021028	AGGC	2	8	190928	190935	25 %	0 %	50 %	25 %	480535964
3009	NC_021028	CTT	2	6	190995	191000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535964
3010	NC_021028	GGT	2	6	191041	191046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480535964
3011	NC_021028	ATC	2	6	191116	191121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535964
3012	NC_021028	CAC	2	6	191138	191143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480535964
3013	NC_021028	CTTT	2	8	191197	191204	0 %	75 %	0 %	25 %	480535964
3014	NC_021028	CTT	2	6	191217	191222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535964
3015	NC_021028	GGC	2	6	191274	191279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	480535964
3016	NC_021028	AGCG	2	8	191283	191290	25 %	0 %	50 %	25 %	480535964
3017	NC_021028	GAC	2	6	191355	191360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535964
3018	NC_021028	TTG	2	6	191378	191383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535964
3019	NC_021028	TGG	2	6	191415	191420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480535964
3020	NC_021028	ATAA	2	8	191555	191562	75 %	25 %	0 %	0 %	480535964
3021	NC_021028	A	6	6	191561	191566	100 %	0 %	0 %	0 %	480535964
3022	NC_021028	T	6	6	191610	191615	0 %	100 %	0 %	0 %	480535965
3023	NC_021028	ATG	2	6	191707	191712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535965
3024	NC_021028	AT	3	6	191719	191724	50 %	50 %	0 %	0 %	480535965
3025	NC_021028	AGA	2	6	191746	191751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535965
3026	NC_021028	TGT	2	6	191799	191804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535965
3027	NC_021028	GAAA	2	8	191823	191830	75 %	0 %	25 %	0 %	480535965
3028	NC_021028	TTTGT	2	10	191839	191848	0 %	80 %	20 %	0 %	480535965
3029	NC_021028	AGG	2	6	191884	191889	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480535965
3030	NC_021028	AGGA	3	12	191904	191915	50 %	0 %	50 %	0 %	480535965
3031	NC_021028	CCG	2	6	192022	192027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	480535965
3032	NC_021028	AGGC	2	8	192041	192048	25 %	0 %	50 %	25 %	480535965
3033	NC_021028	AGAT	2	8	192146	192153	50 %	25 %	25 %	0 %	480535965
3034	NC_021028	TTC	2	6	192154	192159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535965
3035	NC_021028	GAT	2	6	192340	192345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535966
3036	NC_021028	CTT	2	6	192355	192360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535966
3037	NC_021028	AGG	2	6	192379	192384	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480535966
3038	NC_021028	TGA	2	6	192420	192425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535966
3039	NC_021028	AGG	2	6	192471	192476	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480535966
3040	NC_021028	TCA	2	6	192586	192591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535966
3041	NC_021028	TAG	2	6	192630	192635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535966
3042	NC_021028	AGC	2	6	192745	192750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535966
3043	NC_021028	TGCC	2	8	192804	192811	0 %	25 %	25 %	50 %	480535966
3044	NC_021028	T	6	6	192818	192823	0 %	100 %	0 %	0 %	480535966
3045	NC_021028	ATC	2	6	192881	192886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535966
3046	NC_021028	TGA	2	6	192958	192963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535967
3047	NC_021028	CT	3	6	192993	192998	0 %	50 %	0 %	50 %	480535967
3048	NC_021028	AG	3	6	193033	193038	50 %	0 %	50 %	0 %	480535967
3049	NC_021028	AGTG	2	8	193064	193071	25 %	25 %	50 %	0 %	480535967
3050	NC_021028	AG	3	6	193089	193094	50 %	0 %	50 %	0 %	480535967
3051	NC_021028	TA	3	6	193215	193220	50 %	50 %	0 %	0 %	480535967
3052	NC_021028	TC	3	6	193225	193230	0 %	50 %	0 %	50 %	480535967
3053	NC_021028	TGA	2	6	193244	193249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535967
3054	NC_021028	CTA	2	6	193321	193326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535967
3055	NC_021028	A	6	6	193345	193350	100 %	0 %	0 %	0 %	480535967
3056	NC_021028	CAG	2	6	193372	193377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535967
3057	NC_021028	CTG	2	6	193453	193458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535967
3058	NC_021028	ATA	2	6	193477	193482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535967
3059	NC_021028	TCAGGT	2	12	193607	193618	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	480535967
3060	NC_021028	TGG	2	6	193759	193764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480535967
3061	NC_021028	TCCA	2	8	193767	193774	25 %	25 %	0 %	50 %	480535967
3062	NC_021028	AAG	2	6	193792	193797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535967
3063	NC_021028	GAC	2	6	193850	193855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535967
3064	NC_021028	AATC	2	8	193952	193959	50 %	25 %	0 %	25 %	480535967
3065	NC_021028	AGT	2	6	194049	194054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535967
3066	NC_021028	CGA	2	6	194075	194080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535967
3067	NC_021028	AG	3	6	194082	194087	50 %	0 %	50 %	0 %	480535967
3068	NC_021028	CTC	2	6	194091	194096	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480535967
3069	NC_021028	AGAT	2	8	194176	194183	50 %	25 %	25 %	0 %	480535967
3070	NC_021028	TGG	2	6	194326	194331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480535967
3071	NC_021028	TAT	2	6	194580	194585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535968
3072	NC_021028	TAG	2	6	194586	194591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535968
3073	NC_021028	ATG	2	6	194592	194597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535968
3074	NC_021028	GTC	2	6	194657	194662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535968
3075	NC_021028	CAGT	2	8	194667	194674	25 %	25 %	25 %	25 %	480535968
3076	NC_021028	TCA	2	6	194721	194726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535968
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3079	NC_021028	CTG	2	6	194912	194917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535968
3080	NC_021028	GA	3	6	194942	194947	50 %	0 %	50 %	0 %	480535968
3081	NC_021028	GAA	2	6	194950	194955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535968
3082	NC_021028	GTTA	2	8	194996	195003	25 %	50 %	25 %	0 %	480535968
3083	NC_021028	TGG	2	6	195023	195028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480535968
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3087	NC_021028	AGA	2	6	195301	195306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535968
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3089	NC_021028	ATTT	2	8	195399	195406	25 %	75 %	0 %	0 %	480535968
3090	NC_021028	TGA	2	6	195421	195426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535968
3091	NC_021028	ATGA	2	8	195527	195534	50 %	25 %	25 %	0 %	480535968
3092	NC_021028	TCTA	2	8	195627	195634	25 %	50 %	0 %	25 %	480535968
3093	NC_021028	AAAC	2	8	195682	195689	75 %	0 %	0 %	25 %	480535968
3094	NC_021028	CAA	2	6	195707	195712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535968
3095	NC_021028	ACTAT	2	10	195845	195854	40 %	40 %	0 %	20 %	480535968
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3100	NC_021028	TAT	2	6	196228	196233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535969
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3102	NC_021028	ACA	2	6	196393	196398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535969
3103	NC_021028	AGA	3	9	196411	196419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535969
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3105	NC_021028	AAGG	2	8	196651	196658	50 %	0 %	50 %	0 %	480535970
3106	NC_021028	T	6	6	196695	196700	0 %	100 %	0 %	0 %	480535970
3107	NC_021028	GAC	2	6	196755	196760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535970
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3109	NC_021028	TAT	2	6	196950	196955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535970
3110	NC_021028	AGA	2	6	197317	197322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535971
3111	NC_021028	AATC	2	8	197342	197349	50 %	25 %	0 %	25 %	480535971
3112	NC_021028	AAG	2	6	197374	197379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535971
3113	NC_021028	AAAG	2	8	197426	197433	75 %	0 %	25 %	0 %	480535971
3114	NC_021028	GAA	2	6	197492	197497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535971
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3117	NC_021028	GA	3	6	197588	197593	50 %	0 %	50 %	0 %	480535971
3118	NC_021028	GA	3	6	197722	197727	50 %	0 %	50 %	0 %	480535971
3119	NC_021028	AGC	2	6	197741	197746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535971
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3121	NC_021028	TCT	2	6	197853	197858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535971
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3123	NC_021028	AGG	2	6	197943	197948	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480535971
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3234	NC_021028	TTAAG	2	10	205390	205399	40 %	40 %	20 %	0 %	480535978
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3240	NC_021028	A	6	6	205655	205660	100 %	0 %	0 %	0 %	480535978
3241	NC_021028	AAT	2	6	205700	205705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535978
3242	NC_021028	GGATTG	2	12	205719	205730	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	480535978
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3244	NC_021028	TCAGG	2	10	206305	206314	20 %	20 %	40 %	20 %	480535979
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3489	NC_021028	AGA	2	6	220153	220158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535994
3490	NC_021028	ATG	2	6	220233	220238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535994
3491	NC_021028	TAA	2	6	220348	220353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535994
3492	NC_021028	ATTG	2	8	220372	220379	25 %	50 %	25 %	0 %	480535994
3493	NC_021028	TGG	2	6	220402	220407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480535994
3494	NC_021028	GA	3	6	220442	220447	50 %	0 %	50 %	0 %	480535994
3495	NC_021028	GAG	2	6	220539	220544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480535994
3496	NC_021028	A	6	6	220655	220660	100 %	0 %	0 %	0 %	480535994
3497	NC_021028	AATC	2	8	220675	220682	50 %	25 %	0 %	25 %	480535994
3498	NC_021028	AAG	2	6	220808	220813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535994
3499	NC_021028	TTCA	2	8	220814	220821	25 %	50 %	0 %	25 %	480535994
3500	NC_021028	GAG	2	6	220833	220838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480535994

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