MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034183 draft genome

Total Repeats: 32631

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21002	NC_021028	TGA	2	6	1311289	1311294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536958
21003	NC_021028	CTTG	2	8	1311300	1311307	0 %	50 %	25 %	25 %	480536958
21004	NC_021028	CTT	2	6	1311361	1311366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536958
21005	NC_021028	TTC	2	6	1311442	1311447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536958
21006	NC_021028	CT	3	6	1311470	1311475	0 %	50 %	0 %	50 %	480536958
21007	NC_021028	TGA	2	6	1311542	1311547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536958
21008	NC_021028	TTG	2	6	1311667	1311672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536959
21009	NC_021028	TTG	2	6	1311676	1311681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536959
21010	NC_021028	ATCA	2	8	1311694	1311701	50 %	25 %	0 %	25 %	480536959
21011	NC_021028	CCG	2	6	1311728	1311733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	480536959
21012	NC_021028	TTAT	2	8	1311830	1311837	25 %	75 %	0 %	0 %	480536959
21013	NC_021028	CAT	2	6	1311982	1311987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536959
21014	NC_021028	CTT	2	6	1312083	1312088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536959
21015	NC_021028	AAC	2	6	1312113	1312118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536959
21016	NC_021028	A	6	6	1312206	1312211	100 %	0 %	0 %	0 %	480536959
21017	NC_021028	AGA	2	6	1312229	1312234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536959
21018	NC_021028	GCA	2	6	1312311	1312316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536959
21019	NC_021028	TGA	2	6	1312427	1312432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536959
21020	NC_021028	CAA	2	6	1312433	1312438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536959
21021	NC_021028	CTA	2	6	1312448	1312453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536959
21022	NC_021028	CAA	2	6	1312454	1312459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536959
21023	NC_021028	ACC	2	6	1312499	1312504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480536959
21024	NC_021028	CCA	2	6	1312545	1312550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480536959
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21031	NC_021028	CTT	2	6	1313213	1313218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536960
21032	NC_021028	GCG	2	6	1313259	1313264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	480536960
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21037	NC_021028	TTTA	2	8	1313425	1313432	25 %	75 %	0 %	0 %	480536961
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21042	NC_021028	TGC	2	6	1313783	1313788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536961
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21054	NC_021028	CAA	2	6	1314272	1314277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536961
21055	NC_021028	GCT	2	6	1314294	1314299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536961
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21112	NC_021028	AT	3	6	1317147	1317152	50 %	50 %	0 %	0 %	480536963
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21117	NC_021028	TAA	2	6	1317418	1317423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536963
21118	NC_021028	AGC	2	6	1317431	1317436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536963
21119	NC_021028	A	6	6	1317495	1317500	100 %	0 %	0 %	0 %	480536963
21120	NC_021028	TAC	2	6	1317533	1317538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536963
21121	NC_021028	CAT	2	6	1317879	1317884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536964
21122	NC_021028	TC	4	8	1317929	1317936	0 %	50 %	0 %	50 %	480536964
21123	NC_021028	TGC	2	6	1318072	1318077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536964
21124	NC_021028	CTTG	2	8	1318089	1318096	0 %	50 %	25 %	25 %	480536964
21125	NC_021028	CTTGAT	2	12	1318173	1318184	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	480536964
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21128	NC_021028	CAAG	2	8	1318239	1318246	50 %	0 %	25 %	25 %	480536964
21129	NC_021028	ATG	2	6	1318255	1318260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536964
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21133	NC_021028	TTC	2	6	1318507	1318512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536964
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21143	NC_021028	TCAGTA	2	12	1319170	1319181	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	480536965
21144	NC_021028	TCA	2	6	1319197	1319202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536965
21145	NC_021028	AG	4	8	1319203	1319210	50 %	0 %	50 %	0 %	480536965
21146	NC_021028	GA	3	6	1319215	1319220	50 %	0 %	50 %	0 %	480536965
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21154	NC_021028	T	7	7	1319645	1319651	0 %	100 %	0 %	0 %	480536965
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21220	NC_021028	GTA	2	6	1324785	1324790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536969
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21227	NC_021028	GT	3	6	1324998	1325003	0 %	50 %	50 %	0 %	480536969
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21231	NC_021028	GTT	2	6	1325110	1325115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536969
21232	NC_021028	AAC	2	6	1325138	1325143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536969
21233	NC_021028	TCT	2	6	1325157	1325162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536969
21234	NC_021028	CGATTT	2	12	1325173	1325184	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	480536969
21235	NC_021028	CGT	2	6	1325185	1325190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536969
21236	NC_021028	GAA	2	6	1325269	1325274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536969
21237	NC_021028	GTTCTG	2	12	1325296	1325307	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	480536969
21238	NC_021028	TCA	2	6	1325316	1325321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536969
21239	NC_021028	TCA	2	6	1325329	1325334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536969
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21241	NC_021028	GTC	2	6	1325480	1325485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536969
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21248	NC_021028	TGA	2	6	1325789	1325794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536969
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21351	NC_021028	AGAT	2	8	1336283	1336290	50 %	25 %	25 %	0 %	480536977
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21464	NC_021028	GCA	2	6	1342617	1342622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536983
21465	NC_021028	CTT	2	6	1342633	1342638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536983
21466	NC_021028	AAG	2	6	1342695	1342700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536983
21467	NC_021028	ATC	2	6	1342730	1342735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536983
21468	NC_021028	GTT	2	6	1342819	1342824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536983
21469	NC_021028	ACG	2	6	1342841	1342846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536983
21470	NC_021028	TGC	2	6	1342871	1342876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536983
21471	NC_021028	CTT	2	6	1342955	1342960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536983
21472	NC_021028	ACC	2	6	1342982	1342987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480536983
21473	NC_021028	GTTG	2	8	1343087	1343094	0 %	50 %	50 %	0 %	480536983
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21475	NC_021028	TCA	2	6	1343166	1343171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536983
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21478	NC_021028	ATC	2	6	1343300	1343305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536983
21479	NC_021028	TTC	2	6	1343342	1343347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536983
21480	NC_021028	GTT	2	6	1343556	1343561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536983
21481	NC_021028	GAC	2	6	1343746	1343751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536983
21482	NC_021028	CGG	2	6	1343817	1343822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	480536983
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21490	NC_021028	GTT	3	9	1344129	1344137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536984
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21492	NC_021028	T	7	7	1344237	1344243	0 %	100 %	0 %	0 %	480536984
21493	NC_021028	TCAA	2	8	1344245	1344252	50 %	25 %	0 %	25 %	480536984
21494	NC_021028	TCT	2	6	1344267	1344272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536984
21495	NC_021028	TCA	2	6	1344275	1344280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536984
21496	NC_021028	CAT	2	6	1344360	1344365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536984
21497	NC_021028	A	6	6	1344366	1344371	100 %	0 %	0 %	0 %	480536984
21498	NC_021028	TAA	2	6	1344415	1344420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536984
21499	NC_021028	A	6	6	1344440	1344445	100 %	0 %	0 %	0 %	480536984
21500	NC_021028	T	6	6	1344453	1344458	0 %	100 %	0 %	0 %	480536984

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