MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034183 draft genome

Total Repeats: 32631

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1502	NC_021028	GCTTG	2	10	91756	91765	0 %	40 %	40 %	20 %	480535882
1503	NC_021028	CT	3	6	91777	91782	0 %	50 %	0 %	50 %	480535882
1504	NC_021028	AAG	2	6	91840	91845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535882
1505	NC_021028	TGG	2	6	91901	91906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480535882
1506	NC_021028	GTG	2	6	91981	91986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480535882
1507	NC_021028	CAT	2	6	92025	92030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535882
1508	NC_021028	CGT	2	6	92032	92037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535882
1509	NC_021028	ATC	2	6	92059	92064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535882
1510	NC_021028	CAT	2	6	92094	92099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535882
1511	NC_021028	GCT	2	6	92206	92211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535882
1512	NC_021028	CCA	2	6	92263	92268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480535882
1513	NC_021028	TCCT	2	8	92330	92337	0 %	50 %	0 %	50 %	480535882
1514	NC_021028	AGA	2	6	92445	92450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535882
1515	NC_021028	CT	3	6	92579	92584	0 %	50 %	0 %	50 %	480535882
1516	NC_021028	TCA	2	6	92608	92613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535882
1517	NC_021028	ATC	2	6	92623	92628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535882
1518	NC_021028	TTGA	2	8	92647	92654	25 %	50 %	25 %	0 %	480535882
1519	NC_021028	ATTG	2	8	92772	92779	25 %	50 %	25 %	0 %	480535882
1520	NC_021028	CTT	2	6	92866	92871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535882
1521	NC_021028	CA	3	6	92901	92906	50 %	0 %	0 %	50 %	480535882
1522	NC_021028	AGA	2	6	92907	92912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535882
1523	NC_021028	TTA	2	6	92937	92942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535882
1524	NC_021028	GAT	2	6	92956	92961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535882
1525	NC_021028	ATTA	2	8	92987	92994	50 %	50 %	0 %	0 %	480535882
1526	NC_021028	TCT	2	6	93050	93055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535883
1527	NC_021028	GCT	2	6	93077	93082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535883
1528	NC_021028	ACT	2	6	93104	93109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535883
1529	NC_021028	T	6	6	93145	93150	0 %	100 %	0 %	0 %	480535883
1530	NC_021028	GCTTT	2	10	93185	93194	0 %	60 %	20 %	20 %	480535883
1531	NC_021028	CAG	2	6	93198	93203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535883
1532	NC_021028	TTC	2	6	93238	93243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535883
1533	NC_021028	TCT	3	9	93485	93493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535883
1534	NC_021028	AGT	2	6	93520	93525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535883
1535	NC_021028	TCA	2	6	93542	93547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535883
1536	NC_021028	CTT	2	6	93594	93599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535883
1537	NC_021028	TGT	2	6	93628	93633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535883
1538	NC_021028	GTTC	2	8	93668	93675	0 %	50 %	25 %	25 %	480535883
1539	NC_021028	CTG	2	6	93687	93692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535883
1540	NC_021028	ATA	2	6	93695	93700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535883
1541	NC_021028	TCTT	2	8	93731	93738	0 %	75 %	0 %	25 %	480535883
1542	NC_021028	TTC	2	6	93757	93762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535883
1543	NC_021028	TGA	2	6	93771	93776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535883
1544	NC_021028	TCTGG	2	10	93779	93788	0 %	40 %	40 %	20 %	480535883
1545	NC_021028	TTA	2	6	93905	93910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535883
1546	NC_021028	CTTT	2	8	93962	93969	0 %	75 %	0 %	25 %	480535883
1547	NC_021028	TTC	2	6	94006	94011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535883
1548	NC_021028	AGT	2	6	94038	94043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535883
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1550	NC_021028	TTGA	2	8	94183	94190	25 %	50 %	25 %	0 %	480535883
1551	NC_021028	ACC	3	9	94231	94239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480535883
1552	NC_021028	TCT	2	6	94241	94246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535883
1553	NC_021028	GTA	2	6	94264	94269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535883
1554	NC_021028	TGCT	2	8	94305	94312	0 %	50 %	25 %	25 %	480535883
1555	NC_021028	CCA	2	6	94342	94347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480535883
1556	NC_021028	TAG	2	6	94409	94414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535883
1557	NC_021028	CTTT	2	8	94448	94455	0 %	75 %	0 %	25 %	480535883
1558	NC_021028	GTA	2	6	94519	94524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535883
1559	NC_021028	AAG	2	6	94598	94603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535883
1560	NC_021028	CTT	2	6	94644	94649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535883
1561	NC_021028	GTT	2	6	94667	94672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535883
1562	NC_021028	AGCAT	2	10	94733	94742	40 %	20 %	20 %	20 %	480535883
1563	NC_021028	TCG	2	6	94850	94855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535883
1564	NC_021028	ATA	2	6	94877	94882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535883
1565	NC_021028	T	6	6	94885	94890	0 %	100 %	0 %	0 %	480535883
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1571	NC_021028	GA	3	6	95221	95226	50 %	0 %	50 %	0 %	480535883
1572	NC_021028	CTT	2	6	95244	95249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535883
1573	NC_021028	TGCT	2	8	95308	95315	0 %	50 %	25 %	25 %	480535883
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1583	NC_021028	GAT	2	6	95668	95673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535883
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1591	NC_021028	TAA	2	6	96191	96196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535883
1592	NC_021028	CAT	2	6	96294	96299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535883
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1596	NC_021028	T	6	6	96499	96504	0 %	100 %	0 %	0 %	480535883
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1606	NC_021028	GGTT	2	8	96836	96843	0 %	50 %	50 %	0 %	480535883
1607	NC_021028	GTA	3	9	96848	96856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535883
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1611	NC_021028	GTA	2	6	97324	97329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535884
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1613	NC_021028	TCA	2	6	97493	97498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535884
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1615	NC_021028	AT	3	6	97577	97582	50 %	50 %	0 %	0 %	480535884
1616	NC_021028	GTA	2	6	97651	97656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535884
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1622	NC_021028	GAT	2	6	98373	98378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535885
1623	NC_021028	CATT	2	8	98420	98427	25 %	50 %	0 %	25 %	480535885
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1625	NC_021028	CGTC	2	8	98619	98626	0 %	25 %	25 %	50 %	480535885
1626	NC_021028	AT	3	6	98714	98719	50 %	50 %	0 %	0 %	480535885
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1633	NC_021028	GGT	2	6	99186	99191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480535885
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1647	NC_021028	AAGG	2	8	100029	100036	50 %	0 %	50 %	0 %	480535885
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1990	NC_021028	AC	3	6	123509	123514	50 %	0 %	0 %	50 %	480535905
1991	NC_021028	ACA	2	6	123605	123610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535905
1992	NC_021028	GGA	2	6	123724	123729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480535905
1993	NC_021028	TGGGA	2	10	123772	123781	20 %	20 %	60 %	0 %	480535905
1994	NC_021028	CGT	2	6	123910	123915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535905
1995	NC_021028	AGA	2	6	123927	123932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535905
1996	NC_021028	A	6	6	124002	124007	100 %	0 %	0 %	0 %	480535905
1997	NC_021028	T	6	6	124370	124375	0 %	100 %	0 %	0 %	480535906
1998	NC_021028	ATG	2	6	124467	124472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535906
1999	NC_021028	AT	3	6	124507	124512	50 %	50 %	0 %	0 %	480535906
2000	NC_021028	CTA	2	6	124601	124606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535906

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