MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034183 draft genome

Total Repeats: 32631

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021028	AAGA	2	8	31196	31203	75 %	0 %	25 %	0 %	480535819
502	NC_021028	AGG	2	6	31209	31214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480535819
503	NC_021028	TAT	2	6	31264	31269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535820
504	NC_021028	GAA	2	6	31284	31289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535820
505	NC_021028	ACCA	2	8	31304	31311	50 %	0 %	0 %	50 %	480535820
506	NC_021028	TCA	2	6	31314	31319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535820
507	NC_021028	CTTAT	2	10	31406	31415	20 %	60 %	0 %	20 %	480535821
508	NC_021028	AAC	2	6	31429	31434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535821
509	NC_021028	AAG	2	6	31435	31440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535821
510	NC_021028	TG	3	6	31507	31512	0 %	50 %	50 %	0 %	480535821
511	NC_021028	GAA	2	6	31530	31535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535821
512	NC_021028	TGAA	2	8	31549	31556	50 %	25 %	25 %	0 %	480535821
513	NC_021028	GA	3	6	31579	31584	50 %	0 %	50 %	0 %	480535821
514	NC_021028	TC	3	6	31606	31611	0 %	50 %	0 %	50 %	480535821
515	NC_021028	ATG	2	6	31615	31620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535821
516	NC_021028	AAG	2	6	31669	31674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535821
517	NC_021028	AGCT	2	8	31681	31688	25 %	25 %	25 %	25 %	480535821
518	NC_021028	AAC	2	6	31731	31736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535821
519	NC_021028	TTA	2	6	31831	31836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535821
520	NC_021028	TGA	2	6	31852	31857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535821
521	NC_021028	GAT	2	6	31929	31934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535821
522	NC_021028	A	6	6	32041	32046	100 %	0 %	0 %	0 %	480535821
523	NC_021028	ACAA	2	8	32121	32128	75 %	0 %	0 %	25 %	480535821
524	NC_021028	GAT	2	6	32422	32427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535822
525	NC_021028	ATC	2	6	32447	32452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535822
526	NC_021028	GAC	2	6	32508	32513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535822
527	NC_021028	AGG	2	6	32562	32567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480535822
528	NC_021028	AAT	2	6	32570	32575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535822
529	NC_021028	GAA	2	6	32771	32776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535823
530	NC_021028	AAT	2	6	32778	32783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535823
531	NC_021028	A	6	6	32812	32817	100 %	0 %	0 %	0 %	480535823
532	NC_021028	TTA	2	6	32818	32823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535823
533	NC_021028	GAA	2	6	32865	32870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535823
534	NC_021028	TTG	2	6	33102	33107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535824
535	NC_021028	GTC	2	6	33135	33140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535824
536	NC_021028	TGG	2	6	33177	33182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480535824
537	NC_021028	AGA	2	6	33217	33222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535824
538	NC_021028	GAT	2	6	33402	33407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535825
539	NC_021028	A	6	6	33421	33426	100 %	0 %	0 %	0 %	480535825
540	NC_021028	AGA	2	6	33453	33458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535825
541	NC_021028	AGA	2	6	33534	33539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535825
542	NC_021028	TGA	2	6	33579	33584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535825
543	NC_021028	CTA	2	6	33611	33616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535825
544	NC_021028	GTTG	2	8	33620	33627	0 %	50 %	50 %	0 %	480535825
545	NC_021028	TGA	2	6	33645	33650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535825
546	NC_021028	GGA	2	6	33709	33714	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480535825
547	NC_021028	A	6	6	33743	33748	100 %	0 %	0 %	0 %	480535826
548	NC_021028	GAA	2	6	33759	33764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535826
549	NC_021028	AAT	2	6	33766	33771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535826
550	NC_021028	TGAT	2	8	33830	33837	25 %	50 %	25 %	0 %	480535826
551	NC_021028	A	6	6	33976	33981	100 %	0 %	0 %	0 %	480535827
552	NC_021028	CGA	2	6	33987	33992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535827
553	NC_021028	AAG	2	6	34056	34061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535827
554	NC_021028	GAT	2	6	34153	34158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535827
555	NC_021028	ATT	2	6	34192	34197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535827
556	NC_021028	GAA	2	6	34276	34281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535827
557	NC_021028	CAGAA	2	10	34286	34295	60 %	0 %	20 %	20 %	480535827
558	NC_021028	CAT	2	6	34510	34515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535828
559	NC_021028	TTTTG	2	10	34536	34545	0 %	80 %	20 %	0 %	480535828
560	NC_021028	AGG	2	6	34551	34556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480535828
561	NC_021028	ATG	2	6	34590	34595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535828
562	NC_021028	GAATG	2	10	34625	34634	40 %	20 %	40 %	0 %	480535828
563	NC_021028	TAT	2	6	34640	34645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535828
564	NC_021028	TCA	2	6	34653	34658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535828
565	NC_021028	GA	3	6	34738	34743	50 %	0 %	50 %	0 %	480535828
566	NC_021028	AAGA	2	8	34790	34797	75 %	0 %	25 %	0 %	480535828
567	NC_021028	GAG	2	6	34801	34806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480535828
568	NC_021028	TCA	2	6	34828	34833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535828
569	NC_021028	GAGC	2	8	34880	34887	25 %	0 %	50 %	25 %	480535828
570	NC_021028	AGC	2	6	34906	34911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535828
571	NC_021028	GAA	2	6	34913	34918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535828
572	NC_021028	CA	3	6	34939	34944	50 %	0 %	0 %	50 %	480535828
573	NC_021028	ACA	2	6	34977	34982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535828
574	NC_021028	TCA	2	6	35024	35029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535828
575	NC_021028	AGCA	2	8	35061	35068	50 %	0 %	25 %	25 %	480535828
576	NC_021028	TGA	2	6	35074	35079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535828
577	NC_021028	AAG	2	6	35517	35522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535829
578	NC_021028	A	6	6	35688	35693	100 %	0 %	0 %	0 %	480535829
579	NC_021028	AATC	2	8	35729	35736	50 %	25 %	0 %	25 %	480535829
580	NC_021028	A	7	7	35754	35760	100 %	0 %	0 %	0 %	480535829
581	NC_021028	A	7	7	35762	35768	100 %	0 %	0 %	0 %	480535829
582	NC_021028	T	6	6	35780	35785	0 %	100 %	0 %	0 %	480535829
583	NC_021028	TGA	3	9	36212	36220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535830
584	NC_021028	TC	3	6	36229	36234	0 %	50 %	0 %	50 %	480535830
585	NC_021028	GTA	2	6	36241	36246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535830
586	NC_021028	AAG	2	6	36251	36256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535830
587	NC_021028	AAG	3	9	36301	36309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535830
588	NC_021028	GAA	2	6	36377	36382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535831
589	NC_021028	TGC	2	6	36403	36408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535831
590	NC_021028	T	6	6	36415	36420	0 %	100 %	0 %	0 %	480535831
591	NC_021028	GATG	2	8	36448	36455	25 %	25 %	50 %	0 %	480535831
592	NC_021028	TGG	2	6	36462	36467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480535831
593	NC_021028	CAA	2	6	36506	36511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535831
594	NC_021028	GAT	2	6	36515	36520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535831
595	NC_021028	TATC	2	8	36531	36538	25 %	50 %	0 %	25 %	480535831
596	NC_021028	TAC	2	6	36602	36607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535831
597	NC_021028	AAG	2	6	36633	36638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535831
598	NC_021028	TGCT	2	8	36648	36655	0 %	50 %	25 %	25 %	480535831
599	NC_021028	GAA	2	6	36658	36663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535831
600	NC_021028	CTG	2	6	36681	36686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535831
601	NC_021028	CAAG	2	8	36757	36764	50 %	0 %	25 %	25 %	480535831
602	NC_021028	T	6	6	36781	36786	0 %	100 %	0 %	0 %	480535831
603	NC_021028	ATA	2	6	36834	36839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535831
604	NC_021028	TGA	2	6	36871	36876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535831
605	NC_021028	TTCT	2	8	36880	36887	0 %	75 %	0 %	25 %	480535831
606	NC_021028	ATG	2	6	36906	36911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535831
607	NC_021028	ATC	2	6	36944	36949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535831
608	NC_021028	CA	3	6	36962	36967	50 %	0 %	0 %	50 %	480535831
609	NC_021028	A	7	7	36998	37004	100 %	0 %	0 %	0 %	480535831
610	NC_021028	TGA	2	6	37123	37128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535831
611	NC_021028	TCATCT	2	12	37137	37148	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	480535831
612	NC_021028	AATC	2	8	37157	37164	50 %	25 %	0 %	25 %	480535831
613	NC_021028	GTG	2	6	37178	37183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480535831
614	NC_021028	GAA	2	6	37259	37264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535831
615	NC_021028	ATGA	2	8	37277	37284	50 %	25 %	25 %	0 %	480535831
616	NC_021028	TGA	2	6	37360	37365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535831
617	NC_021028	AGA	2	6	37402	37407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535831
618	NC_021028	TGG	2	6	37435	37440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480535831
619	NC_021028	GCT	3	9	37472	37480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535831
620	NC_021028	CT	3	6	37479	37484	0 %	50 %	0 %	50 %	480535831
621	NC_021028	CA	3	6	37528	37533	50 %	0 %	0 %	50 %	480535831
622	NC_021028	TTC	2	6	37538	37543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535831
623	NC_021028	A	6	6	37562	37567	100 %	0 %	0 %	0 %	480535831
624	NC_021028	ATG	2	6	37572	37577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535831
625	NC_021028	GGTT	2	8	37610	37617	0 %	50 %	50 %	0 %	480535831
626	NC_021028	ATG	2	6	37647	37652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535831
627	NC_021028	TCA	2	6	37668	37673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535831
628	NC_021028	TGC	2	6	37699	37704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535831
629	NC_021028	GAT	2	6	37768	37773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535831
630	NC_021028	T	6	6	37788	37793	0 %	100 %	0 %	0 %	480535831
631	NC_021028	TG	3	6	37880	37885	0 %	50 %	50 %	0 %	480535831
632	NC_021028	GTG	2	6	38025	38030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480535831
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638	NC_021028	GA	3	6	38686	38691	50 %	0 %	50 %	0 %	480535833
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662	NC_021028	TGA	2	6	39731	39736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535834
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750	NC_021028	GAATCA	2	12	43721	43732	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	480535842
751	NC_021028	GAA	2	6	43739	43744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535842
752	NC_021028	TC	3	6	43995	44000	0 %	50 %	0 %	50 %	480535843
753	NC_021028	T	7	7	44013	44019	0 %	100 %	0 %	0 %	480535843
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