MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034183 draft genome

Total Repeats: 32631

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_021028	TAA	2	6	368442	368447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536128
6002	NC_021028	TTCACG	2	12	368496	368507	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	480536128
6003	NC_021028	AT	3	6	368529	368534	50 %	50 %	0 %	0 %	480536128
6004	NC_021028	TTA	2	6	368568	368573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536128
6005	NC_021028	ACT	2	6	368669	368674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536128
6006	NC_021028	GTA	2	6	368852	368857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536129
6007	NC_021028	A	6	6	368861	368866	100 %	0 %	0 %	0 %	480536129
6008	NC_021028	TTGC	2	8	368879	368886	0 %	50 %	25 %	25 %	480536129
6009	NC_021028	TCG	2	6	368952	368957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536129
6010	NC_021028	CTA	2	6	368996	369001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536129
6011	NC_021028	CTT	2	6	369010	369015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536129
6012	NC_021028	TTGA	2	8	369040	369047	25 %	50 %	25 %	0 %	480536129
6013	NC_021028	CGT	2	6	369079	369084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536129
6014	NC_021028	GAA	2	6	369088	369093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536129
6015	NC_021028	TGG	2	6	369135	369140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536129
6016	NC_021028	TGG	2	6	369177	369182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536129
6017	NC_021028	GAA	2	6	369220	369225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536129
6018	NC_021028	AGA	2	6	369243	369248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536129
6019	NC_021028	TG	3	6	369259	369264	0 %	50 %	50 %	0 %	480536129
6020	NC_021028	TGC	2	6	369525	369530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536129
6021	NC_021028	ATC	2	6	369564	369569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536129
6022	NC_021028	AGA	2	6	369639	369644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536129
6023	NC_021028	ATTG	2	8	369711	369718	25 %	50 %	25 %	0 %	480536129
6024	NC_021028	A	6	6	369719	369724	100 %	0 %	0 %	0 %	480536129
6025	NC_021028	AAC	2	6	369802	369807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536129
6026	NC_021028	ATCT	2	8	369834	369841	25 %	50 %	0 %	25 %	480536129
6027	NC_021028	ATC	2	6	369856	369861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536129
6028	NC_021028	CTT	2	6	369922	369927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536129
6029	NC_021028	CTT	2	6	369939	369944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536129
6030	NC_021028	CAA	2	6	369964	369969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536129
6031	NC_021028	GTGCCA	2	12	370009	370020	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	480536129
6032	NC_021028	CAG	2	6	370028	370033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536129
6033	NC_021028	TTAC	2	8	370037	370044	25 %	50 %	0 %	25 %	480536129
6034	NC_021028	ACT	2	6	370100	370105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536129
6035	NC_021028	AAG	2	6	370136	370141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536129
6036	NC_021028	ACT	2	6	370151	370156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536129
6037	NC_021028	TTA	2	6	370203	370208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536130
6038	NC_021028	T	6	6	370235	370240	0 %	100 %	0 %	0 %	480536130
6039	NC_021028	AGG	2	6	370285	370290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480536130
6040	NC_021028	CAGA	2	8	370317	370324	50 %	0 %	25 %	25 %	480536130
6041	NC_021028	TGATT	2	10	370328	370337	20 %	60 %	20 %	0 %	480536130
6042	NC_021028	ATG	2	6	370362	370367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536130
6043	NC_021028	TCA	2	6	370414	370419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536130
6044	NC_021028	AAG	2	6	370447	370452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536130
6045	NC_021028	GTT	2	6	370461	370466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536130
6046	NC_021028	TGA	2	6	370576	370581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536130
6047	NC_021028	GTG	2	6	370639	370644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536130
6048	NC_021028	GAT	2	6	370649	370654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536130
6049	NC_021028	TTG	2	6	370728	370733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536130
6050	NC_021028	A	6	6	370825	370830	100 %	0 %	0 %	0 %	480536130
6051	NC_021028	GTG	2	6	370849	370854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536130
6052	NC_021028	A	7	7	370988	370994	100 %	0 %	0 %	0 %	480536131
6053	NC_021028	GCTA	2	8	371032	371039	25 %	25 %	25 %	25 %	480536131
6054	NC_021028	TTG	2	6	371076	371081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536131
6055	NC_021028	ATA	2	6	371088	371093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536131
6056	NC_021028	GAT	2	6	371111	371116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536131
6057	NC_021028	GA	3	6	371175	371180	50 %	0 %	50 %	0 %	480536131
6058	NC_021028	AACC	2	8	371243	371250	50 %	0 %	0 %	50 %	480536131
6059	NC_021028	AACA	2	8	371313	371320	75 %	0 %	0 %	25 %	480536131
6060	NC_021028	CTG	2	6	371391	371396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536131
6061	NC_021028	TTA	2	6	371407	371412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536131
6062	NC_021028	ATA	2	6	371418	371423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536131
6063	NC_021028	TAT	2	6	371468	371473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536131
6064	NC_021028	GAT	2	6	371498	371503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536131
6065	NC_021028	TAC	2	6	371600	371605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536131
6066	NC_021028	TAT	2	6	371660	371665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536131
6067	NC_021028	CTC	2	6	371671	371676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480536131
6068	NC_021028	ATA	2	6	371730	371735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536131
6069	NC_021028	TAC	2	6	371783	371788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536131
6070	NC_021028	TCA	2	6	371795	371800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536131
6071	NC_021028	CTGG	2	8	371814	371821	0 %	25 %	50 %	25 %	480536131
6072	NC_021028	TAT	2	6	371906	371911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536131
6073	NC_021028	A	7	7	372029	372035	100 %	0 %	0 %	0 %	480536132
6074	NC_021028	GCTA	2	8	372073	372080	25 %	25 %	25 %	25 %	480536132
6075	NC_021028	TGAT	2	8	372183	372190	25 %	50 %	25 %	0 %	480536132
6076	NC_021028	TAT	2	6	372200	372205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536132
6077	NC_021028	GA	3	6	372222	372227	50 %	0 %	50 %	0 %	480536132
6078	NC_021028	AT	3	6	372244	372249	50 %	50 %	0 %	0 %	480536132
6079	NC_021028	GTA	2	6	372267	372272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536132
6080	NC_021028	TAC	2	6	372329	372334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536132
6081	NC_021028	GTTG	2	8	372365	372372	0 %	50 %	50 %	0 %	480536132
6082	NC_021028	GAA	2	6	372408	372413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536132
6083	NC_021028	AGA	2	6	372439	372444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536132
6084	NC_021028	AGA	2	6	372448	372453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536132
6085	NC_021028	TTA	2	6	372460	372465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536132
6086	NC_021028	TAT	2	6	372533	372538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536132
6087	NC_021028	TGG	2	6	372574	372579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536132
6088	NC_021028	GAT	2	6	372605	372610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536132
6089	NC_021028	CAA	2	6	372633	372638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536132
6090	NC_021028	TAT	2	6	372643	372648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536132
6091	NC_021028	TAA	2	6	372673	372678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536132
6092	NC_021028	TAC	2	6	372683	372688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536132
6093	NC_021028	CTGG	2	8	372714	372721	0 %	25 %	50 %	25 %	480536132
6094	NC_021028	TAT	2	6	372743	372748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536132
6095	NC_021028	TGGT	2	8	372838	372845	0 %	50 %	50 %	0 %	480536132
6096	NC_021028	TAT	2	6	372866	372871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536132
6097	NC_021028	TGGT	2	8	372961	372968	0 %	50 %	50 %	0 %	480536132
6098	NC_021028	TAC	2	6	372989	372994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536132
6099	NC_021028	GGTT	2	8	373025	373032	0 %	50 %	50 %	0 %	480536132
6100	NC_021028	GTTA	2	8	373255	373262	25 %	50 %	25 %	0 %	480536133
6101	NC_021028	CAGAG	2	10	373412	373421	40 %	0 %	40 %	20 %	480536133
6102	NC_021028	GCT	2	6	373464	373469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536133
6103	NC_021028	TGA	2	6	373507	373512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536133
6104	NC_021028	TTA	2	6	373558	373563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536133
6105	NC_021028	CTG	2	6	373629	373634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536133
6106	NC_021028	ATG	3	9	373665	373673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536133
6107	NC_021028	GAG	2	6	373685	373690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480536133
6108	NC_021028	GTC	2	6	373779	373784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536133
6109	NC_021028	AGT	2	6	373791	373796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536133
6110	NC_021028	CAGC	2	8	373825	373832	25 %	0 %	25 %	50 %	480536133
6111	NC_021028	T	6	6	373894	373899	0 %	100 %	0 %	0 %	480536133
6112	NC_021028	GCCA	2	8	374012	374019	25 %	0 %	25 %	50 %	480536133
6113	NC_021028	TCA	2	6	374044	374049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536133
6114	NC_021028	CAT	2	6	374071	374076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536133
6115	NC_021028	GTC	2	6	374081	374086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536133
6116	NC_021028	TCA	2	6	374113	374118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536133
6117	NC_021028	TGA	3	9	374158	374166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536133
6118	NC_021028	GATTTT	2	12	374237	374248	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	480536133
6119	NC_021028	TAG	2	6	374318	374323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536133
6120	NC_021028	ATG	2	6	374425	374430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536133
6121	NC_021028	AGC	2	6	374445	374450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536133
6122	NC_021028	TA	3	6	374458	374463	50 %	50 %	0 %	0 %	480536133
6123	NC_021028	TGT	2	6	374464	374469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536133
6124	NC_021028	AAT	2	6	374478	374483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536133
6125	NC_021028	CAAA	2	8	374572	374579	75 %	0 %	0 %	25 %	480536134
6126	NC_021028	ATC	2	6	374621	374626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536134
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6128	NC_021028	GTA	2	6	374701	374706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536134
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6132	NC_021028	TACA	2	8	374808	374815	50 %	25 %	0 %	25 %	480536134
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6134	NC_021028	TAA	2	6	374900	374905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536134
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6136	NC_021028	CTTT	2	8	375033	375040	0 %	75 %	0 %	25 %	480536134
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6141	NC_021028	AAAT	2	8	375266	375273	75 %	25 %	0 %	0 %	480536134
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6143	NC_021028	ATGT	2	8	375331	375338	25 %	50 %	25 %	0 %	480536134
6144	NC_021028	CTT	2	6	375359	375364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536134
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6146	NC_021028	AG	3	6	375371	375376	50 %	0 %	50 %	0 %	480536134
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6148	NC_021028	ATTT	2	8	375406	375413	25 %	75 %	0 %	0 %	480536134
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6155	NC_021028	A	7	7	376473	376479	100 %	0 %	0 %	0 %	480536136
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6233	NC_021028	T	6	6	380910	380915	0 %	100 %	0 %	0 %	480536140
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6240	NC_021028	A	6	6	381160	381165	100 %	0 %	0 %	0 %	480536141
6241	NC_021028	TTG	2	6	381186	381191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536141
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6244	NC_021028	CAGT	2	8	381469	381476	25 %	25 %	25 %	25 %	480536141
6245	NC_021028	GTT	2	6	381482	381487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536141
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6274	NC_021028	GAA	2	6	385545	385550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536144
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6361	NC_021028	AGAT	2	8	390174	390181	50 %	25 %	25 %	0 %	480536147
6362	NC_021028	GA	3	6	390258	390263	50 %	0 %	50 %	0 %	480536147
6363	NC_021028	T	6	6	390283	390288	0 %	100 %	0 %	0 %	480536147
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6487	NC_021028	TGA	2	6	398222	398227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536154
6488	NC_021028	AGA	2	6	398309	398314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536154
6489	NC_021028	AGCG	2	8	398318	398325	25 %	0 %	50 %	25 %	480536154
6490	NC_021028	TTACC	2	10	398330	398339	20 %	40 %	0 %	40 %	480536154
6491	NC_021028	GTC	2	6	398445	398450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536154
6492	NC_021028	CAG	2	6	398561	398566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536154
6493	NC_021028	GCA	2	6	398581	398586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536154
6494	NC_021028	TTG	2	6	398608	398613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536154
6495	NC_021028	CAG	2	6	398633	398638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536154
6496	NC_021028	ACG	2	6	398688	398693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536154
6497	NC_021028	TTTC	2	8	398705	398712	0 %	75 %	0 %	25 %	480536154
6498	NC_021028	CAG	2	6	398726	398731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536154
6499	NC_021028	T	6	6	399022	399027	0 %	100 %	0 %	0 %	480536155
6500	NC_021028	GAC	2	6	399081	399086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536155

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