MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034183 draft genome

Total Repeats: 32631

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_021028	GTG	2	6	280209	280214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536057
4502	NC_021028	AC	3	6	280216	280221	50 %	0 %	0 %	50 %	480536057
4503	NC_021028	TGC	2	6	280255	280260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536057
4504	NC_021028	AAC	2	6	280262	280267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536057
4505	NC_021028	GCA	2	6	280274	280279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536057
4506	NC_021028	A	6	6	280795	280800	100 %	0 %	0 %	0 %	480536058
4507	NC_021028	ACA	2	6	280842	280847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536058
4508	NC_021028	ACT	2	6	280848	280853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536058
4509	NC_021028	TAC	2	6	280866	280871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536058
4510	NC_021028	TGGA	2	8	280926	280933	25 %	25 %	50 %	0 %	480536058
4511	NC_021028	GCAAGA	2	12	280934	280945	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	480536058
4512	NC_021028	CTG	2	6	280966	280971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536058
4513	NC_021028	ACA	2	6	280974	280979	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536058
4514	NC_021028	AAC	2	6	280989	280994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536058
4515	NC_021028	CAT	2	6	281006	281011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536058
4516	NC_021028	AC	3	6	281014	281019	50 %	0 %	0 %	50 %	480536058
4517	NC_021028	CGTAT	2	10	281160	281169	20 %	40 %	20 %	20 %	480536058
4518	NC_021028	CAA	2	6	281174	281179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536058
4519	NC_021028	CCAAT	2	10	281253	281262	40 %	20 %	0 %	40 %	480536058
4520	NC_021028	GAA	2	6	281358	281363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536058
4521	NC_021028	ATTG	2	8	281411	281418	25 %	50 %	25 %	0 %	480536058
4522	NC_021028	GAA	2	6	281439	281444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536058
4523	NC_021028	TGA	3	9	281446	281454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536058
4524	NC_021028	GAA	2	6	281469	281474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536058
4525	NC_021028	GAA	2	6	281484	281489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536058
4526	NC_021028	TTC	2	6	281529	281534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536058
4527	NC_021028	TG	3	6	281542	281547	0 %	50 %	50 %	0 %	480536058
4528	NC_021028	GAA	2	6	281661	281666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536058
4529	NC_021028	TGAC	2	8	281719	281726	25 %	25 %	25 %	25 %	480536058
4530	NC_021028	TTC	2	6	281748	281753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536058
4531	NC_021028	TTC	2	6	281770	281775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536058
4532	NC_021028	GCT	2	6	281892	281897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536058
4533	NC_021028	TAC	2	6	281915	281920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536058
4534	NC_021028	ATC	2	6	281955	281960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536058
4535	NC_021028	TCAA	2	8	281967	281974	50 %	25 %	0 %	25 %	480536058
4536	NC_021028	CAAGA	2	10	282027	282036	60 %	0 %	20 %	20 %	480536058
4537	NC_021028	GAA	2	6	282063	282068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536058
4538	NC_021028	AAAC	2	8	282088	282095	75 %	0 %	0 %	25 %	480536058
4539	NC_021028	TTG	2	6	282151	282156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536058
4540	NC_021028	CGT	2	6	282165	282170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536058
4541	NC_021028	CTC	2	6	282199	282204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480536058
4542	NC_021028	TTC	2	6	282252	282257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536058
4543	NC_021028	TGG	2	6	282269	282274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536058
4544	NC_021028	GAA	2	6	282318	282323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536058
4545	NC_021028	ATTCGA	2	12	282332	282343	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	480536058
4546	NC_021028	TCG	2	6	282352	282357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536058
4547	NC_021028	GTG	2	6	282358	282363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536058
4548	NC_021028	ATG	2	6	282469	282474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536058
4549	NC_021028	GCT	2	6	282543	282548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536058
4550	NC_021028	ATG	2	6	282579	282584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536058
4551	NC_021028	AGA	2	6	282605	282610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536058
4552	NC_021028	TCG	2	6	282644	282649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536058
4553	NC_021028	TCGT	2	8	282691	282698	0 %	50 %	25 %	25 %	480536058
4554	NC_021028	TTC	2	6	282739	282744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536058
4555	NC_021028	ATG	2	6	282774	282779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536058
4556	NC_021028	AAG	2	6	282817	282822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536058
4557	NC_021028	ATT	2	6	282825	282830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536058
4558	NC_021028	AATG	2	8	282953	282960	50 %	25 %	25 %	0 %	480536059
4559	NC_021028	TGA	2	6	282980	282985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536059
4560	NC_021028	CTG	2	6	283001	283006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536059
4561	NC_021028	AAAG	2	8	283134	283141	75 %	0 %	25 %	0 %	480536059
4562	NC_021028	GAA	2	6	283150	283155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536059
4563	NC_021028	CTA	2	6	283233	283238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536059
4564	NC_021028	TATT	2	8	283328	283335	25 %	75 %	0 %	0 %	480536059
4565	NC_021028	AAG	2	6	283369	283374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536059
4566	NC_021028	ATC	2	6	283376	283381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536059
4567	NC_021028	AAC	2	6	283397	283402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536059
4568	NC_021028	AGA	2	6	283442	283447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536059
4569	NC_021028	ATG	2	6	283448	283453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536059
4570	NC_021028	AAC	2	6	283541	283546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536059
4571	NC_021028	CCT	2	6	283561	283566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480536059
4572	NC_021028	A	6	6	283603	283608	100 %	0 %	0 %	0 %	480536059
4573	NC_021028	GAC	2	6	283662	283667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536059
4574	NC_021028	GTT	2	6	283696	283701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536059
4575	NC_021028	TCA	2	6	283829	283834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536059
4576	NC_021028	AGA	2	6	283835	283840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536059
4577	NC_021028	GTT	2	6	283924	283929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536059
4578	NC_021028	TTG	2	6	284033	284038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536059
4579	NC_021028	GCT	2	6	284044	284049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536059
4580	NC_021028	GGC	2	6	284118	284123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	480536059
4581	NC_021028	GGA	2	6	284172	284177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480536059
4582	NC_021028	ACG	2	6	284251	284256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536059
4583	NC_021028	CTAT	2	8	284267	284274	25 %	50 %	0 %	25 %	480536059
4584	NC_021028	TGA	2	6	284334	284339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536059
4585	NC_021028	TAC	2	6	284373	284378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536059
4586	NC_021028	GAT	2	6	284398	284403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536059
4587	NC_021028	CAC	2	6	284656	284661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480536059
4588	NC_021028	GTC	2	6	284690	284695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536059
4589	NC_021028	A	6	6	284788	284793	100 %	0 %	0 %	0 %	480536059
4590	NC_021028	AGGT	2	8	284831	284838	25 %	25 %	50 %	0 %	480536059
4591	NC_021028	A	6	6	284841	284846	100 %	0 %	0 %	0 %	480536059
4592	NC_021028	GCG	2	6	285004	285009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	480536059
4593	NC_021028	TAT	2	6	285025	285030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536059
4594	NC_021028	CTAT	2	8	285056	285063	25 %	50 %	0 %	25 %	480536059
4595	NC_021028	GGA	2	6	285099	285104	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480536059
4596	NC_021028	GAA	2	6	285196	285201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536059
4597	NC_021028	GAT	2	6	285246	285251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536059
4598	NC_021028	GAA	2	6	285466	285471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536059
4599	NC_021028	TTG	2	6	285533	285538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536059
4600	NC_021028	TGGT	2	8	285644	285651	0 %	50 %	50 %	0 %	480536059
4601	NC_021028	CT	4	8	285713	285720	0 %	50 %	0 %	50 %	480536059
4602	NC_021028	GTCAGT	2	12	285737	285748	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	480536059
4603	NC_021028	CCTT	2	8	285863	285870	0 %	50 %	0 %	50 %	480536059
4604	NC_021028	GAA	2	6	285964	285969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536059
4605	NC_021028	CGAG	2	8	286038	286045	25 %	0 %	50 %	25 %	480536059
4606	NC_021028	GCG	2	6	286096	286101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	480536059
4607	NC_021028	ACA	2	6	286114	286119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536059
4608	NC_021028	G	6	6	286131	286136	0 %	0 %	100 %	0 %	480536059
4609	NC_021028	GTT	2	6	286141	286146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536059
4610	NC_021028	CAG	2	6	286193	286198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536059
4611	NC_021028	ATG	2	6	286199	286204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536059
4612	NC_021028	CACT	2	8	286224	286231	25 %	25 %	0 %	50 %	480536059
4613	NC_021028	ATG	2	6	286283	286288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536059
4614	NC_021028	TAA	2	6	286335	286340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536059
4615	NC_021028	GTCTG	2	10	286521	286530	0 %	40 %	40 %	20 %	480536059
4616	NC_021028	TTGG	2	8	286548	286555	0 %	50 %	50 %	0 %	480536059
4617	NC_021028	GAC	2	6	286618	286623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536059
4618	NC_021028	CATG	2	8	286638	286645	25 %	25 %	25 %	25 %	480536059
4619	NC_021028	AGA	2	6	286716	286721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536059
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4621	NC_021028	TAA	2	6	286755	286760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536059
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4988	NC_021028	CTG	2	6	306126	306131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536082
4989	NC_021028	GTC	2	6	306132	306137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536082
4990	NC_021028	ATC	2	6	306213	306218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536082
4991	NC_021028	AGA	2	6	306226	306231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536082
4992	NC_021028	CT	3	6	306274	306279	0 %	50 %	0 %	50 %	480536082
4993	NC_021028	TGA	2	6	306307	306312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536082
4994	NC_021028	GAA	2	6	306326	306331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536082
4995	NC_021028	TGA	2	6	306358	306363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536082
4996	NC_021028	TCA	2	6	306390	306395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536082
4997	NC_021028	TGG	2	6	306439	306444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536082
4998	NC_021028	ATTG	2	8	306460	306467	25 %	50 %	25 %	0 %	480536082
4999	NC_021028	AAT	2	6	306548	306553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536082
5000	NC_021028	ATA	2	6	306618	306623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536082

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