MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN994038 draft genome

Total Repeats: 1143

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021026	AAAAG	2	10	530	539	80 %	0 %	20 %	0 %	480533969
2	NC_021026	GAAAT	2	10	691	700	60 %	20 %	20 %	0 %	480533969
3	NC_021026	AAAAT	2	10	1473	1482	80 %	20 %	0 %	0 %	480533969
4	NC_021026	GTAAA	2	10	2631	2640	60 %	20 %	20 %	0 %	480533970
5	NC_021026	AAAAT	2	10	3018	3027	80 %	20 %	0 %	0 %	480533971
6	NC_021026	AAACA	2	10	4420	4429	80 %	0 %	0 %	20 %	480533973
7	NC_021026	TCAAT	2	10	6047	6056	40 %	40 %	0 %	20 %	480533974
8	NC_021026	TTTTC	2	10	6087	6096	0 %	80 %	0 %	20 %	480533974
9	NC_021026	TAAAT	2	10	6605	6614	60 %	40 %	0 %	0 %	480533974
10	NC_021026	ACTCT	2	10	6686	6695	20 %	40 %	0 %	40 %	480533974
11	NC_021026	AAACG	2	10	7929	7938	60 %	0 %	20 %	20 %	480533974
12	NC_021026	TTGGT	2	10	8158	8167	0 %	60 %	40 %	0 %	480533974
13	NC_021026	CAATT	2	10	8227	8236	40 %	40 %	0 %	20 %	480533974
14	NC_021026	AGGAA	2	10	9243	9252	60 %	0 %	40 %	0 %	480533977
15	NC_021026	ATTGA	2	10	10661	10670	40 %	40 %	20 %	0 %	480533979
16	NC_021026	ATTCT	2	10	12794	12803	20 %	60 %	0 %	20 %	480533981
17	NC_021026	ATGGT	2	10	22450	22459	20 %	40 %	40 %	0 %	480533984
18	NC_021026	TAGAT	2	10	30898	30907	40 %	40 %	20 %	0 %	480533999
19	NC_021026	CTTAT	2	10	31406	31415	20 %	60 %	0 %	20 %	480534001
20	NC_021026	CAGAA	2	10	34286	34295	60 %	0 %	20 %	20 %	480534007
21	NC_021026	TTTTG	2	10	34536	34545	0 %	80 %	20 %	0 %	480534008
22	NC_021026	GAATG	2	10	34625	34634	40 %	20 %	40 %	0 %	480534008
23	NC_021026	GAAAC	2	10	38320	38329	60 %	0 %	20 %	20 %	480534013
24	NC_021026	TCTAA	2	10	38663	38672	40 %	40 %	0 %	20 %	480534013
25	NC_021026	CTCTT	2	10	39284	39293	0 %	60 %	0 %	40 %	480534013
26	NC_021026	AGTTG	2	10	40108	40117	20 %	40 %	40 %	0 %	480534015
27	NC_021026	ACAAG	2	10	40486	40495	60 %	0 %	20 %	20 %	480534015
28	NC_021026	GGGTG	2	10	41696	41705	0 %	20 %	80 %	0 %	480534017
29	NC_021026	CCTAT	2	10	42017	42026	20 %	40 %	0 %	40 %	480534018
30	NC_021026	ATGAC	2	10	42743	42752	40 %	20 %	20 %	20 %	480534021
31	NC_021026	AGCTG	2	10	45831	45840	20 %	20 %	40 %	20 %	480534023
32	NC_021026	GGTCA	2	10	47640	47649	20 %	20 %	40 %	20 %	480534024
33	NC_021026	AATCA	2	10	64699	64708	60 %	20 %	0 %	20 %	480534041
34	NC_021026	AGCAG	2	10	65370	65379	40 %	0 %	40 %	20 %	480534042
35	NC_021026	TTGAT	2	10	72854	72863	20 %	60 %	20 %	0 %	480534048
36	NC_021026	CAGAT	2	10	75049	75058	40 %	20 %	20 %	20 %	480534050
37	NC_021026	TTTAC	2	10	75751	75760	20 %	60 %	0 %	20 %	480534050
38	NC_021026	GTGAC	2	10	79382	79391	20 %	20 %	40 %	20 %	480534053
39	NC_021026	GTGAT	2	10	80372	80381	20 %	40 %	40 %	0 %	480534053
40	NC_021026	TGGCT	2	10	83192	83201	0 %	40 %	40 %	20 %	480534054
41	NC_021026	AAATG	2	10	83798	83807	60 %	20 %	20 %	0 %	480534054
42	NC_021026	AGCTA	2	10	84692	84701	40 %	20 %	20 %	20 %	480534055
43	NC_021026	CCTTG	2	10	87582	87591	0 %	40 %	20 %	40 %	480534058
44	NC_021026	TCAAA	2	10	87776	87785	60 %	20 %	0 %	20 %	480534058
45	NC_021026	GCAAG	2	10	89445	89454	40 %	0 %	40 %	20 %	480534059
46	NC_021026	AGTGG	2	10	90143	90152	20 %	20 %	60 %	0 %	480534060
47	NC_021026	GGGTG	2	10	90181	90190	0 %	20 %	80 %	0 %	480534060
48	NC_021026	CTATT	2	10	91157	91166	20 %	60 %	0 %	20 %	480534061
49	NC_021026	GAAGC	2	10	91347	91356	40 %	0 %	40 %	20 %	480534061
50	NC_021026	GCTTG	2	10	91802	91811	0 %	40 %	40 %	20 %	480534063
51	NC_021026	GCTTT	2	10	93231	93240	0 %	60 %	20 %	20 %	480534064
52	NC_021026	TCTGG	2	10	93825	93834	0 %	40 %	40 %	20 %	480534064
53	NC_021026	AGCAT	2	10	94779	94788	40 %	20 %	20 %	20 %	480534064
54	NC_021026	TACCA	2	10	95477	95486	40 %	20 %	0 %	40 %	480534064
55	NC_021026	TTCCT	2	10	96494	96503	0 %	60 %	0 %	40 %	480534064
56	NC_021026	TTGGT	2	10	100450	100459	0 %	60 %	40 %	0 %	480534067
57	NC_021026	CTTCA	2	10	101505	101514	20 %	40 %	0 %	40 %	480534068
58	NC_021026	AATCA	2	10	101617	101626	60 %	20 %	0 %	20 %	480534069
59	NC_021026	AGCTC	2	10	103835	103844	20 %	20 %	20 %	40 %	480534071
60	NC_021026	GCTCC	2	10	108070	108079	0 %	20 %	20 %	60 %	480534076
61	NC_021026	GCTGT	2	10	108388	108397	0 %	40 %	40 %	20 %	480534076
62	NC_021026	TCTAT	2	10	109546	109555	20 %	60 %	0 %	20 %	480534077
63	NC_021026	AGAAA	2	10	110471	110480	80 %	0 %	20 %	0 %	480534077
64	NC_021026	TGACT	2	10	113517	113526	20 %	40 %	20 %	20 %	480534079
65	NC_021026	AGGGC	2	10	116952	116961	20 %	0 %	60 %	20 %	480534081
66	NC_021026	ATTCT	2	10	119521	119530	20 %	60 %	0 %	20 %	480534083
67	NC_021026	TTACT	2	10	123164	123173	20 %	60 %	0 %	20 %	480534086
68	NC_021026	TGGGA	2	10	123818	123827	20 %	20 %	60 %	0 %	480534086
69	NC_021026	TGCTT	2	10	124691	124700	0 %	60 %	20 %	20 %	480534087
70	NC_021026	TGGCT	2	10	124874	124883	0 %	40 %	40 %	20 %	480534087
71	NC_021026	AGATA	2	10	128946	128955	60 %	20 %	20 %	0 %	480534092
72	NC_021026	GTTTG	2	10	129113	129122	0 %	60 %	40 %	0 %	480534092
73	NC_021026	TATTT	2	10	131062	131071	20 %	80 %	0 %	0 %	480534094
74	NC_021026	AAAGC	2	10	133972	133981	60 %	0 %	20 %	20 %	480534096
75	NC_021026	CACAA	2	10	135735	135744	60 %	0 %	0 %	40 %	480534098
76	NC_021026	ACAGT	2	10	140010	140019	40 %	20 %	20 %	20 %	480534101
77	NC_021026	AATAA	2	10	140754	140763	80 %	20 %	0 %	0 %	480534102
78	NC_021026	ATTTT	2	10	143134	143143	20 %	80 %	0 %	0 %	480534106
79	NC_021026	CAAAG	2	10	148385	148394	60 %	0 %	20 %	20 %	480534111
80	NC_021026	ACTAA	2	10	150389	150398	60 %	20 %	0 %	20 %	480534115
81	NC_021026	CGTGG	2	10	153099	153108	0 %	20 %	60 %	20 %	480534116
82	NC_021026	GTGAA	2	10	154101	154110	40 %	20 %	40 %	0 %	480534117
83	NC_021026	AAGCA	2	10	157746	157755	60 %	0 %	20 %	20 %	480534119
84	NC_021026	TTGGA	2	10	160028	160037	20 %	40 %	40 %	0 %	480534123
85	NC_021026	GTCTA	2	10	160159	160168	20 %	40 %	20 %	20 %	480534123
86	NC_021026	TTAGT	2	10	173727	173736	20 %	60 %	20 %	0 %	480534130
87	NC_021026	CTTGC	2	10	174083	174092	0 %	40 %	20 %	40 %	480534130
88	NC_021026	GGCCT	2	10	175037	175046	0 %	20 %	40 %	40 %	480534131
89	NC_021026	CTGTT	2	10	175605	175614	0 %	60 %	20 %	20 %	480534131
90	NC_021026	AGAAA	2	10	177141	177150	80 %	0 %	20 %	0 %	480534134
91	NC_021026	TATAC	2	10	179102	179111	40 %	40 %	0 %	20 %	480534135
92	NC_021026	AGATC	2	10	179407	179416	40 %	20 %	20 %	20 %	480534136
93	NC_021026	TGGTC	2	10	180495	180504	0 %	40 %	40 %	20 %	480534137
94	NC_021026	TTTGT	2	10	181416	181425	0 %	80 %	20 %	0 %	480534138
95	NC_021026	ACTAT	2	10	185422	185431	40 %	40 %	0 %	20 %	480534141
96	NC_021026	TTGAG	2	10	188002	188011	20 %	40 %	40 %	0 %	480534144
97	NC_021026	GCCTT	2	10	189976	189985	0 %	40 %	20 %	40 %	480534147
98	NC_021026	AAGTA	2	10	192758	192767	60 %	20 %	20 %	0 %	480534149
99	NC_021026	TTGAT	2	10	193917	193926	20 %	60 %	20 %	0 %	480534150
100	NC_021026	TCACT	2	10	194292	194301	20 %	40 %	0 %	40 %	480534151
101	NC_021026	ATTTT	2	10	194615	194624	20 %	80 %	0 %	0 %	480534151
102	NC_021026	TTAAG	2	10	194967	194976	40 %	40 %	20 %	0 %	480534151
103	NC_021026	TCAGG	2	10	195882	195891	20 %	20 %	40 %	20 %	480534152
104	NC_021026	GCCTT	2	10	197496	197505	0 %	40 %	20 %	40 %	480534154
105	NC_021026	TTCCC	2	10	198070	198079	0 %	40 %	0 %	60 %	480534155
106	NC_021026	TCTCT	2	10	201617	201626	0 %	60 %	0 %	40 %	480534158
107	NC_021026	GAAAG	2	10	203633	203642	60 %	0 %	40 %	0 %	480534158
108	NC_021026	AGTTA	2	10	204913	204922	40 %	40 %	20 %	0 %	480534160
109	NC_021026	AAATC	2	10	206145	206154	60 %	20 %	0 %	20 %	480534162
110	NC_021026	GCAGA	2	10	207811	207820	40 %	0 %	40 %	20 %	480534165
111	NC_021026	AAGGA	2	10	208073	208082	60 %	0 %	40 %	0 %	480534165
112	NC_021026	GTAGA	2	10	210994	211003	40 %	20 %	40 %	0 %	480534168
113	NC_021026	TTTAG	2	10	211479	211488	20 %	60 %	20 %	0 %	480534168
114	NC_021026	CTTTT	2	10	211953	211962	0 %	80 %	0 %	20 %	480534168
115	NC_021026	GTCTG	2	10	212430	212439	0 %	40 %	40 %	20 %	480534168
116	NC_021026	AGCAG	2	10	215459	215468	40 %	0 %	40 %	20 %	480534171
117	NC_021026	GGGAG	2	10	215798	215807	20 %	0 %	80 %	0 %	480534172
118	NC_021026	CCTTG	2	10	216400	216409	0 %	40 %	20 %	40 %	480534173
119	NC_021026	ACTTA	2	10	216740	216749	40 %	40 %	0 %	20 %	480534173
120	NC_021026	TACAC	2	10	219404	219413	40 %	20 %	0 %	40 %	480534178
121	NC_021026	TTTGG	2	10	220549	220558	0 %	60 %	40 %	0 %	480534180
122	NC_021026	TTCAC	2	10	220905	220914	20 %	40 %	0 %	40 %	480534181
123	NC_021026	GACAA	2	10	222076	222085	60 %	0 %	20 %	20 %	480534184
124	NC_021026	TCCAA	2	10	227800	227809	40 %	20 %	0 %	40 %	480534195
125	NC_021026	ACAGA	2	10	228366	228375	60 %	0 %	20 %	20 %	480534195
126	NC_021026	GAGAT	2	10	232718	232727	40 %	20 %	40 %	0 %	480534203
127	NC_021026	ATTCC	2	10	232736	232745	20 %	40 %	0 %	40 %	480534203
128	NC_021026	TGGTG	2	10	232992	233001	0 %	40 %	60 %	0 %	480534203
129	NC_021026	TCTGT	2	10	233411	233420	0 %	60 %	20 %	20 %	480534203
130	NC_021026	TGGAT	2	10	233421	233430	20 %	40 %	40 %	0 %	480534203
131	NC_021026	AAGAT	2	10	234924	234933	60 %	20 %	20 %	0 %	480534205
132	NC_021026	ATACC	2	10	235404	235413	40 %	20 %	0 %	40 %	480534205
133	NC_021026	AAGTC	2	10	240618	240627	40 %	20 %	20 %	20 %	480534210
134	NC_021026	TTAAT	2	10	242170	242179	40 %	60 %	0 %	0 %	480534212
135	NC_021026	GTTTG	2	10	242992	243001	0 %	60 %	40 %	0 %	480534214
136	NC_021026	GCCAT	2	10	247090	247099	20 %	20 %	20 %	40 %	480534216
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139	NC_021026	ACAGA	2	10	252539	252548	60 %	0 %	20 %	20 %	480534219
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