MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN994038 draft genome

Total Repeats: 21483

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021026	TCA	2	6	280	285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480533969
2	NC_021026	AAC	2	6	349	354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480533969
3	NC_021026	ATT	2	6	363	368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480533969
4	NC_021026	GTA	2	6	369	374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533969
5	NC_021026	GAA	2	6	456	461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533969
6	NC_021026	GGA	2	6	648	653	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480533969
7	NC_021026	TTA	2	6	675	680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480533969
8	NC_021026	TTA	2	6	751	756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480533969
9	NC_021026	GAT	2	6	837	842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533969
10	NC_021026	GAA	2	6	879	884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533969
11	NC_021026	GAG	2	6	972	977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480533969
12	NC_021026	TGC	2	6	1214	1219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480533969
13	NC_021026	ATA	2	6	1402	1407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480533969
14	NC_021026	AAT	2	6	1543	1548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480533969
15	NC_021026	TAA	2	6	1723	1728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480533970
16	NC_021026	TAC	2	6	1753	1758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480533970
17	NC_021026	CTT	2	6	1914	1919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480533970
18	NC_021026	CTT	2	6	1931	1936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480533970
19	NC_021026	CTT	2	6	1941	1946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480533970
20	NC_021026	GTA	2	6	1958	1963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533970
21	NC_021026	ATT	2	6	2138	2143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480533970
22	NC_021026	TGC	2	6	2158	2163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480533970
23	NC_021026	TGA	2	6	2293	2298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533970
24	NC_021026	GAT	2	6	2354	2359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533970
25	NC_021026	ACT	2	6	2489	2494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480533970
26	NC_021026	GTT	2	6	2597	2602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480533970
27	NC_021026	GAA	2	6	2642	2647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533970
28	NC_021026	CAG	2	6	2787	2792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480533970
29	NC_021026	TTG	2	6	2926	2931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480533971
30	NC_021026	TGT	2	6	3044	3049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480533971
31	NC_021026	ATG	2	6	3051	3056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533971
32	NC_021026	ATT	2	6	3090	3095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480533971
33	NC_021026	CAG	2	6	3195	3200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480533972
34	NC_021026	GCA	2	6	3269	3274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480533972
35	NC_021026	TGG	2	6	3312	3317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480533972
36	NC_021026	TGA	3	9	3505	3513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533972
37	NC_021026	TTC	2	6	3690	3695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480533972
38	NC_021026	AGA	2	6	3715	3720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533972
39	NC_021026	GAC	2	6	3790	3795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480533972
40	NC_021026	AGT	2	6	3904	3909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533972
41	NC_021026	GAA	2	6	3932	3937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533972
42	NC_021026	GAT	2	6	3950	3955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533972
43	NC_021026	AAG	2	6	4071	4076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533972
44	NC_021026	CTC	2	6	4110	4115	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480533972
45	NC_021026	AGC	2	6	4117	4122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480533972
46	NC_021026	TAT	2	6	4126	4131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480533972
47	NC_021026	AAG	2	6	4218	4223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533972
48	NC_021026	GAA	2	6	4238	4243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533972
49	NC_021026	GAA	2	6	4463	4468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533973
50	NC_021026	TTA	2	6	4599	4604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480533973
51	NC_021026	GAT	2	6	4647	4652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533973
52	NC_021026	CAG	2	6	4696	4701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480533973
53	NC_021026	TAT	2	6	4724	4729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480533973
54	NC_021026	GTT	2	6	4800	4805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480533973
55	NC_021026	CAT	2	6	4806	4811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480533973
56	NC_021026	GAT	2	6	4833	4838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533973
57	NC_021026	ACT	2	6	4885	4890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480533973
58	NC_021026	TTA	2	6	4950	4955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480533974
59	NC_021026	CTA	2	6	5044	5049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480533974
60	NC_021026	AGA	2	6	5081	5086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533974
61	NC_021026	GAT	2	6	5187	5192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533974
62	NC_021026	TGG	2	6	5200	5205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480533974
63	NC_021026	GCA	2	6	5304	5309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480533974
64	NC_021026	GAA	2	6	5373	5378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533974
65	NC_021026	GAG	2	6	5467	5472	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480533974
66	NC_021026	TGA	2	6	5531	5536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533974
67	NC_021026	AGA	2	6	5714	5719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533974
68	NC_021026	TGA	2	6	5840	5845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533974
69	NC_021026	TGA	2	6	5857	5862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533974
70	NC_021026	AGA	2	6	5906	5911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533974
71	NC_021026	AGA	2	6	6101	6106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533974
72	NC_021026	ATT	2	6	6138	6143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480533974
73	NC_021026	GGA	2	6	6179	6184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480533974
74	NC_021026	CGT	2	6	6348	6353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480533974
75	NC_021026	ACA	2	6	6362	6367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480533974
76	NC_021026	TGT	2	6	6422	6427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480533974
77	NC_021026	CAT	2	6	6429	6434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480533974
78	NC_021026	TGA	2	6	6671	6676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533974
79	NC_021026	TGA	4	12	6731	6742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533974
80	NC_021026	TGA	2	6	6755	6760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533974
81	NC_021026	GAT	2	6	6783	6788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533974
82	NC_021026	GTA	2	6	6796	6801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533974
83	NC_021026	CGA	2	6	6946	6951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480533974
84	NC_021026	TGT	2	6	7127	7132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480533974
85	NC_021026	TGA	2	6	7150	7155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533974
86	NC_021026	TGA	2	6	7160	7165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533974
87	NC_021026	GAA	2	6	7211	7216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533974
88	NC_021026	CCG	2	6	7311	7316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	480533974
89	NC_021026	ACA	2	6	7423	7428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480533974
90	NC_021026	GAC	2	6	7574	7579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480533974
91	NC_021026	TAT	2	6	7583	7588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480533974
92	NC_021026	TTA	2	6	7908	7913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480533974
93	NC_021026	GTA	2	6	8136	8141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533974
94	NC_021026	ATA	2	6	8215	8220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480533974
95	NC_021026	ATT	2	6	8272	8277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480533974
96	NC_021026	TTA	2	6	8409	8414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480533974
97	NC_021026	GAA	2	6	8433	8438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533974
98	NC_021026	CGT	2	6	8550	8555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480533975
99	NC_021026	TGC	2	6	8671	8676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480533975
100	NC_021026	GCA	2	6	8721	8726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480533975
101	NC_021026	AGA	2	6	8759	8764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533975
102	NC_021026	AAT	2	6	8791	8796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480533976
103	NC_021026	CGT	2	6	8821	8826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480533976
104	NC_021026	TGA	2	6	8834	8839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533976
105	NC_021026	TAT	2	6	8894	8899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480533976
106	NC_021026	TGA	2	6	8997	9002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533976
107	NC_021026	TGC	2	6	9051	9056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480533976
108	NC_021026	TAT	2	6	9079	9084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480533976
109	NC_021026	TTA	2	6	9149	9154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480533977
110	NC_021026	GAA	2	6	9197	9202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533977
111	NC_021026	ATT	2	6	9220	9225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480533977
112	NC_021026	AAG	2	6	9234	9239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533977
113	NC_021026	ATT	2	6	9270	9275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480533978
114	NC_021026	TTG	2	6	9276	9281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480533978
115	NC_021026	AGT	2	6	9329	9334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533978
116	NC_021026	TTA	2	6	9353	9358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480533978
117	NC_021026	TAG	2	6	9451	9456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533978
118	NC_021026	ATC	2	6	9547	9552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480533978
119	NC_021026	CAA	2	6	9604	9609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480533978
120	NC_021026	AAG	2	6	9667	9672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533978
121	NC_021026	ATC	2	6	9677	9682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480533978
122	NC_021026	GAA	2	6	9789	9794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533978
123	NC_021026	ACT	2	6	9876	9881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480533978
124	NC_021026	AAG	2	6	9886	9891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533978
125	NC_021026	TAT	2	6	9951	9956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480533978
126	NC_021026	ATA	2	6	10081	10086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480533978
127	NC_021026	GAT	2	6	10221	10226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533978
128	NC_021026	TCT	2	6	10251	10256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480533978
129	NC_021026	AAG	2	6	10553	10558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533979
130	NC_021026	TGG	2	6	10600	10605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480533979
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377	NC_021026	TGA	2	6	36871	36876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534011
378	NC_021026	ATG	2	6	36906	36911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534011
379	NC_021026	ATC	2	6	36944	36949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534011
380	NC_021026	TGA	2	6	37123	37128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534011
381	NC_021026	GTG	2	6	37178	37183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534011
382	NC_021026	GAA	2	6	37259	37264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534011
383	NC_021026	TGA	2	6	37360	37365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534011
384	NC_021026	AGA	2	6	37402	37407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534011
385	NC_021026	TGG	2	6	37435	37440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534011
386	NC_021026	GCT	3	9	37472	37480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534011
387	NC_021026	TTC	2	6	37538	37543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534011
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390	NC_021026	TCA	2	6	37668	37673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534011
391	NC_021026	TGC	2	6	37699	37704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534011
392	NC_021026	GAT	2	6	37768	37773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534011
393	NC_021026	GTG	2	6	38025	38030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534011
394	NC_021026	TGA	2	6	38034	38039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534011
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396	NC_021026	GAA	2	6	38741	38746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534013
397	NC_021026	TGA	2	6	38755	38760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534013
398	NC_021026	AGT	2	6	38761	38766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534013
399	NC_021026	TCA	2	6	38775	38780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534013
400	NC_021026	GAA	2	6	38890	38895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534013
401	NC_021026	CAG	2	6	39038	39043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534013
402	NC_021026	CAA	2	6	39157	39162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480534013
403	NC_021026	AAC	2	6	39173	39178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480534013
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406	NC_021026	CAA	2	6	39323	39328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480534013
407	NC_021026	TGC	2	6	39340	39345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534013
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410	NC_021026	TGA	2	6	39575	39580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534014
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412	NC_021026	TGA	2	6	39731	39736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534014
413	NC_021026	ATC	2	6	39756	39761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534014
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483	NC_021026	CAA	2	6	45015	45020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480534023
484	NC_021026	ATC	2	6	45059	45064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534023
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500	NC_021026	GTT	2	6	46180	46185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480534023

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